CuGenDBv2

Gene ID	Spg038208
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	scaffold12:38938678..38940724
RNA-Seq Expression	Spg038208
Synteny	Spg038208
Gene Ontology terms	GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008437135.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103482648 [Cucumis melo]

1.9e-108

89.63

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAALSFGFTA  IH+ S SI  RSRP P+TITC+GWDPEGLFG PQTGH+AR EFKRRLEKDAEAREAFER VREEKERR+ALRESR+IP+NVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRL EEFFSH+KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQ ELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKY+TA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

XP_022958721.1 uncharacterized protein LOC111459862 [Cucurbita moschata]

2.4e-114

92.12

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAAL FGFTA  IHVSS SILTR+RPNPKTITCVGWDPEG+FGPPQTGH+ARREFKRRLE+DAEAREAFERQVREEKERR+ LR SR++PNNVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFS +KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKYMTA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

XP_022996178.1 uncharacterized protein LOC111491485 [Cucurbita maxima]

2.9e-112

90.87

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAAL FGFTA  IHVSS SILTR+RP PKTITCVGWDPEG+FGPPQTGH+AR+EFKRRLE+DAEAREAFE QVREEKERR+ LR SR++PNNVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFS +KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKYMTA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

XP_023532969.1 uncharacterized protein LOC111794981 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.6e-113

91.29

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAAL FGFTA  IHVSS SILTR+RPNPKTITCVGWDPEG+FGPPQTGH+ARREF RRLE+DAEAREAFER+VREEKERR+ LR SR++PNNVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFS +KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKYMTA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

XP_038874696.1 uncharacterized protein LOC120067243 [Benincasa hispida]

1.7e-112

91.29

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAALSFGFTA  IH  S+SILTRSRP+P+TITC+GWDPEGLFG PQTGH+AR EFKRRLEKDAEAREAFER VREEKERR+ALRESR+IP+NVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRL EEFFSH+KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKYMTA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KKI9 Uncharacterized protein

7.4e-106

88.38

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAALSFGFT   IH+ S SI  RSR  P+TITCVGWDPEGLFG PQTGH+AR EFKRRLEKDAEAREAFER VREEKERR+ LRESR+IP NVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRL EEFFS +KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQ ELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+M+ERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKYMTA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

A0A1S3AT96 uncharacterized protein LOC103482648

9.4e-109

89.63

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAALSFGFTA  IH+ S SI  RSRP P+TITC+GWDPEGLFG PQTGH+AR EFKRRLEKDAEAREAFER VREEKERR+ALRESR+IP+NVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRL EEFFSH+KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQ ELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKY+TA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

A0A5A7TDT6 Uncharacterized protein

3.6e-108

89.21

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAALSFGFTA  IH+ S SI  RSRP P+TITC+GWDPEGLFG PQTGH+AR EFKRRLEKDAEAREAFER VREEKERR+ALRESR+ P+NVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRL EEFFSH+KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQ ELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKY+TA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

A0A6J1H2V9 uncharacterized protein LOC111459862

1.1e-114

92.12

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAAL FGFTA  IHVSS SILTR+RPNPKTITCVGWDPEG+FGPPQTGH+ARREFKRRLE+DAEAREAFERQVREEKERR+ LR SR++PNNVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFS +KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKYMTA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

A0A6J1KA41 uncharacterized protein LOC111491485

1.4e-112

90.87

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MAAL FGFTA  IHVSS SILTR+RP PKTITCVGWDPEG+FGPPQTGH+AR+EFKRRLE+DAEAREAFE QVREEKERR+ LR SR++PNNVTGLIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFS +KLELGELRFAV KTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLL+MVERNE
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA
        LNRSLLALLDENIANAQ GNQK+AAAFMEKVRGAVLKYMTA
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G62780.1 unknown protein

9.7e-82

66.25

Show/hide

Query:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF
        MA LSFG  A A  V +   + R       ITC  WDP+G+ GP QTGH+AR EFKRRLE+D+EAREAF++Q+REEKERR+ALR+SR++P+    LIEYF
Subjt:  MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYF

Query:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE
        LDTEAQ+IE+EIARLR RL +EFF+ ++LE+G++RFAVTKT  +EDR+IELE LQKALEEGIEAYDKMQ EL+ A   LTK+LTS D+K TLL+MVE+N+
Subjt:  LDTEAQDIEFEIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNE

Query:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMT
        +NRSLLALLDENIANA KGNQKEA  +MEK+R +VLKY+T
Subjt:  LNRSLLALLDENIANAQKGNQKEAAAFMEKVRGAVLKYMT

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCGCTCTTAGCTTCGGCTTCACCGCCGGCGCCATCCACGTTTCATCTGCTTCGATTCTCACCCGCTCTCGCCCCAATCCCAAGACCATAACCTGCGTCGGATGGGA
CCCAGAAGGCCTCTTCGGACCGCCCCAGACCGGCCATCTCGCTCGGAGAGAGTTCAAGAGGCGGCTGGAGAAGGACGCCGAAGCTCGCGAGGCTTTCGAGCGCCAAGTCC
GGGAAGAGAAAGAGCGCCGCAGAGCGCTTCGAGAGTCTCGCATAATTCCGAACAATGTGACTGGCCTGATTGAGTATTTTCTTGACACTGAAGCTCAGGATATTGAATTT
GAAATCGCCAGGTTGAGGCCCAGGCTGACAGAGGAGTTTTTTTCACATTTAAAACTTGAGCTGGGTGAGCTTAGATTTGCTGTTACAAAAACTGAGGCAATGGAAGATAG
AGTGATTGAGTTAGAAGCATTACAGAAAGCGCTTGAAGAAGGAATAGAAGCCTATGATAAAATGCAAGGTGAACTGGTAAAGGCAAGGGAAGGCTTAACCAAAATTTTAA
CATCAAAGGATGTAAAAGCTACTTTGTTAGAGATGGTAGAGCGAAACGAGCTCAATAGATCGTTATTAGCCCTTCTCGACGAAAACATAGCCAATGCACAAAAGGGTAAC
CAGAAAGAAGCTGCTGCTTTCATGGAAAAGGTTCGAGGGGCTGTTCTCAAGTATATGACAGCCTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAALSFGFTAGAIHVSSASILTRSRPNPKTITCVGWDPEGLFGPPQTGHLARREFKRRLEKDAEAREAFERQVREEKERRRALRESRIIPNNVTGLIEYFLDTEAQDIEF
EIARLRPRLTEEFFSHLKLELGELRFAVTKTEAMEDRVIELEALQKALEEGIEAYDKMQGELVKAREGLTKILTSKDVKATLLEMVERNELNRSLLALLDENIANAQKGN
QKEAAAFMEKVRGAVLKYMTA

Spg038208 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome