; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg038306 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg038306
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionLarge-conductance mechanosensitive channel
Genome locationscaffold12:39321478..39322065
RNA-Seq ExpressionSpg038306
SyntenySpg038306
Gene Ontology termsGO:0110165 - cellular anatomical structure (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
OVA15712.1 hypothetical protein BVC80_1315g24 [Macleaya cordata]7.0e-0838.41Show/hide
Query:  RGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVG-GGSKLGRIGGRIGCGF------ELRIDIG
        RGGR+  G E+G+ +GVG G ++G  +GG +G G    + +GVG G ++G  +GG +G G  + + +GVG GG+  G +GG +G G       E+   +G
Subjt:  RGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVG-GGSKLGRIGGRIGCGF------ELRIDIG

Query:  VG-GGSKLGRIGGRIGCGFELRIDI--GVGGGSKPGGE
        VG GG+  G +GG +G G  +  ++  GVG G   GGE
Subjt:  VG-GGSKLGRIGGRIGCGFELRIDI--GVGGGSKPGGE

QBZ58637.1 hypothetical protein PoMZ_03593 [Pyricularia oryzae]4.1e-0837.04Show/hide
Query:  GSVGVRGGRIDSGF--ELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG--RIGGRIGCGFELR--IDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRID
        G +G  GG   +G     G+D GVGGG+  G  G   G G    +D GVGGG+  G   +GG  G G  +   +  GVGGG+  G  G   G G    + 
Subjt:  GSVGVRGGRIDSGF--ELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG--RIGGRIGCGFELR--IDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRID

Query:  IGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPG
         GVG G+  G  G   G G    +  GVGGG+  G
Subjt:  IGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPG

TMW69080.1 hypothetical protein Poli38472_001236 [Pythium oligandrum]6.3e-0938.81Show/hide
Query:  VEGSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGG--SKLGR---IGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFEL--
        V+G VG+ GG++ +G  +G  +GVG     K+G    +  +IG G  L   +GVG G K+G + G+IG G  L   +GVG G K+G + G+IG G  +  
Subjt:  VEGSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGG--SKLGR---IGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFEL--

Query:  RIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGG
        +I  GVG G+ +G + G++G G +L + +GVG G
Subjt:  RIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGG

WP_197748440.1 IniB N-terminal domain-containing protein [Mycolicibacterium anyangense]9.8e-1034.23Show/hide
Query:  SVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKL-----GRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-----RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-----RIGGRIG
        S G++ G +++G  LG  +G+GGG+++     G IG  +G G  L    G+GGG+++G      +G  +G G  L    G+GGG+++G      +G  +G
Subjt:  SVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKL-----GRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-----RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-----RIGGRIG

Query:  CGFELRIDIGVGGGSKLGR-----IGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG
         G  L    GVGGG+++G      IG  +G G      +GVGGG++ GG
Subjt:  CGFELRIDIGVGGGSKLGR-----IGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG

XP_009026434.1 hypothetical protein HELRODRAFT_179349 [Helobdella robusta]7.5e-1044.12Show/hide
Query:  GSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRID
        GS+GV+G   D G   G+ +GVGGG KLG    +GG  G G   +I IG G GS  G +GG +G        +GVGGG KLG    +GG  G G   +I 
Subjt:  GSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRID

Query:  IGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG
        IG G GS  G +GG +G        +GVGGG K GG
Subjt:  IGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A200QZ40 Uncharacterized protein3.4e-0838.41Show/hide
Query:  RGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVG-GGSKLGRIGGRIGCGF------ELRIDIG
        RGGR+  G E+G+ +GVG G ++G  +GG +G G    + +GVG G ++G  +GG +G G  + + +GVG GG+  G +GG +G G       E+   +G
Subjt:  RGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVG-GGSKLGRIGGRIGCGF------ELRIDIG

Query:  VG-GGSKLGRIGGRIGCGFELRIDI--GVGGGSKPGGE
        VG GG+  G +GG +G G  +  ++  GVG G   GGE
Subjt:  VG-GGSKLGRIGGRIGCGFELRIDI--GVGGGSKPGGE

A0A3M0KQ05 Uncharacterized protein4.4e-0843.28Show/hide
Query:  VGVR-GGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELR------IDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFE
        +G+R G RI  G  +GI I +G G ++G RIG  IG G  +R      I IG+  G ++G   RIG RIG G  + I IG+  G ++   IG RIG G  
Subjt:  VGVR-GGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELR------IDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFE

Query:  LRIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVG
        +RI IG+G   ++G  IG RIG G  +RI IG+G
Subjt:  LRIDIGVGGGSKLG-RIGGRIGCGFELRIDIGVG

A0A4P7N7G6 Uncharacterized protein2.0e-0837.04Show/hide
Query:  GSVGVRGGRIDSGF--ELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG--RIGGRIGCGFELR--IDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRID
        G +G  GG   +G     G+D GVGGG+  G  G   G G    +D GVGGG+  G   +GG  G G  +   +  GVGGG+  G  G   G G    + 
Subjt:  GSVGVRGGRIDSGF--ELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG--RIGGRIGCGFELR--IDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRID

Query:  IGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPG
         GVG G+  G  G   G G    +  GVGGG+  G
Subjt:  IGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPG

T1FEL1 Uncharacterized protein3.6e-1044.12Show/hide
Query:  GSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRID
        GS+GV+G   D G   G+ +GVGGG KLG    +GG  G G   +I IG G GS  G +GG +G        +GVGGG KLG    +GG  G G   +I 
Subjt:  GSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG---RIGGRIGCGFELRID

Query:  IGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG
        IG G GS  G +GG +G        +GVGGG K GG
Subjt:  IGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG

U3KL76 Uncharacterized protein7.6e-0846.15Show/hide
Query:  IDSGFELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-RIGG
        I  G  +GI IG+G G ++G IG  IG   E+ I IG+G G  +G +G  I  G E RI IG+G G ++G IG  IG G E+ I IG+G G  +G  IG 
Subjt:  IDSGFELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLG-RIGG

Query:  RIGCGFELRIDIGVGGG
         +G GF++RI IG+G G
Subjt:  RIGCGFELRIDIGVGGG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04660.1 glycine-rich protein8.5e-0443.28Show/hide
Query:  VEGSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGG-SKLGRIGGRIGCGFELRIDIGV
        V G  GV G     G  + +  G+GG  K G IGG  G G    I  GVGG   LG +GG +G G       GVGGG   LG +GG  G G  L    GV
Subjt:  VEGSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGG-SKLGRIGGRIGCGFELRIDIGV

Query:  GGG-SKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG
        GGG  K G IGG  G G       GVGG  K GG
Subjt:  GGG-SKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG

AT4G01985.1 unknown protein5.9e-0536.73Show/hide
Query:  GSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVG-GGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIG------VGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRI
        G +GV GG    G  +G   GVG GG   G  GG IG G       G       GGG   G +GG +G G      +G GGG   G  GG IG G     
Subjt:  GSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVG-GGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIG------VGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRI

Query:  DIGVGGGSK----------LGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG
          GVGGG K           G +GG +G G      +G GGG   GG
Subjt:  DIGVGGGSK----------LGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAGTGCAACACGACGTTACAGGTGGTTCGCCAAGAATGACTTTGAGCAAATCCTCGTTGAGCAACTTTGCGCATATGCCTATCTTAATAGCATCTCGAGGACATTT
TCCAGTGACAGTTGAAGGAAGTGTTGGAGTCAGAGGAGGAAGAATAGATTCTGGGTTCGAACTTGGAATTGATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACTAGGGCGAATAG
GCGGAAGAATAGGTTGTGGGTTCGAACTTAGAATTGATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACTAGGGCGAATAGGCGGAAGAATAGGTTGTGGGTTCGAACTTAGAATT
GATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACTAGGGCGAATAGGCGGAAGAATAGGTTGTGGGTTTGAACTTAGAATTGATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACTAGGACG
AATAGGCGGAAGAATAGGTTGTGGGTTCGAACTTAGAATTGATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACCGGGGGGAGAAAAACTTGAACAAGTGGACATAACAAACATAG
AGAAGAGAAGATTCAAGGAGAAGAAGAAAGCAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAGTGCAACACGACGTTACAGGTGGTTCGCCAAGAATGACTTTGAGCAAATCCTCGTTGAGCAACTTTGCGCATATGCCTATCTTAATAGCATCTCGAGGACATTT
TCCAGTGACAGTTGAAGGAAGTGTTGGAGTCAGAGGAGGAAGAATAGATTCTGGGTTCGAACTTGGAATTGATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACTAGGGCGAATAG
GCGGAAGAATAGGTTGTGGGTTCGAACTTAGAATTGATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACTAGGGCGAATAGGCGGAAGAATAGGTTGTGGGTTCGAACTTAGAATT
GATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACTAGGGCGAATAGGCGGAAGAATAGGTTGTGGGTTTGAACTTAGAATTGATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACTAGGACG
AATAGGCGGAAGAATAGGTTGTGGGTTCGAACTTAGAATTGATATTGGAGTTGGAGGTGGTTCAAAACCGGGGGGAGAAAAACTTGAACAAGTGGACATAACAAACATAG
AGAAGAGAAGATTCAAGGAGAAGAAGAAAGCAAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRVQHDVTGGSPRMTLSKSSLSNFAHMPILIASRGHFPVTVEGSVGVRGGRIDSGFELGIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRI
DIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKLGRIGGRIGCGFELRIDIGVGGGSKPGGEKLEQVDITNIEKRRFKEKKKAK