; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg038463 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg038463
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionsirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic
Genome locationscaffold12:1196107..1200877
RNA-Seq ExpressionSpg038463
SyntenySpg038463
Gene Ontology termsGO:0006979 - response to oxidative stress (biological process)
GO:0019354 - siroheme biosynthetic process (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0042802 - identical protein binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051266 - sirohydrochlorin ferrochelatase activity (molecular function)
GO:0051536 - iron-sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002762 - Sirohydrochlorin cobaltochelatase CbiX-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0037556.1 sirohydrochlorin ferrochelatase [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-9686.12Show/hide
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KAG7033101.1 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.7e-9988.1Show/hide
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XP_023548507.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.4e-9786.67Show/hide
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XP_038890885.1 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]3.5e-10184.72Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KP17 Uncharacterized protein1.6e-9484.21Show/hide
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A0A1S3C8S9 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic9.7e-9786.12Show/hide
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A0A5D3BY55 Sirohydrochlorin ferrochelatase9.7e-9786.12Show/hide
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A0A6J1FHT5 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like1.1e-9585.78Show/hide
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A0A6J1K384 sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic-like9.7e-9786.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A6UWT5 Sirohydrochlorin cobaltochelatase2.7e-1128.99Show/hide
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        +A++++ HGSR   S  ++ +     ++K  Y IVE   ME  EP+I  +    + +GAK+II+ P FL  G H ++DIP +    E  + H        
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                       G+  I   P+G  +++VD+V DR
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P61817 Sirohydrochlorin ferrochelatase6.2e-1635.34Show/hide
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        DAV+ V HGSR +E       F+   +     PI E   +ELA P+I   F +C+EQGA RI + P  L    H + DIP    +  + +P +  +   P
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         G+ E++VD++ +RIN
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P61819 Sirohydrochlorin cobaltochelatase2.2e-1329.08Show/hide
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        +A+++V HGSR   S  ++ E     + +  Y IVE   ME  EP+I  +    ++ GAK++IV+P FL PG H ++DIP +        E    H    
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Query:  ---------------PGISYIITAPLGLHEQLVDVVNDRIN
                        G+  +   P+G  ++++D+V DR N
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Q58380 Sirohydrochlorin cobaltochelatase1.4e-1232.61Show/hide
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        +A+++V HGSR   S  +L +     +++  +PIVE   ME +EP+I  +    +EQGAKRIIV P FL  G H  +DIP L        E   EH    
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                        +  I   P+G  +++VD++ DR
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Q84JH7 Sirohydrochlorin ferrochelatase, chloroplastic2.6e-6275.34Show/hide
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        SY+ITAPLG H  L+DVVNDRI HCLSH  G ADEC VCAGT KC+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G50170.1 sirohydrochlorin ferrochelatase B1.8e-6375.34Show/hide
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        ++ IG  D +IIVDHGSRR+ESNLML EFV MF++KTGYPIVEPAHMELAEPSI+D+F+ CV+QGAKR++VSPFFLFPGRHW  DIPSLTA+AAKE  GI
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        SY+ITAPLG H  L+DVVNDRI HCLSH  G ADEC VCAGT KC+
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATTCTAAAGCTCCAGGAATCAGATCTAGGTGCTAAACGAGTTAGCAAGTTTAGACCAACTAGTCTTACTACAGGCGTTTATAAGCTGATCATTGAAGTTCTTGCCGA
ACGTGTTATTACAAGGTATCCAAACTGTAACGTCGCCAATTTAAAATTGGATAAGCTTGATGACAATTTTGCAATTCAACCATTGGCCACACCGTTCTCCTCCATCACCG
ATTGTCTTCTCCGACAACAGCAAAACAGAGGCGGTGGTGGTTTCCGAGCAGTCCTTCGCGTGGCCAACAACGTCTTGTGCGTGGTTAAGTGTTTTCTTTCCTCGGTTTTG
GTTGTTTCTCAAGCCGATCTCTCTCCCTTTTCCTTGCCTAAGGCCTTGGAGTTAAGGAATTTTGAAAAGGATTTAGCAAATATTGTTTGGCAAAGGGCTGATAGAACCCA
ATTTTTAGGCACGTTATCGTGTTCAGAAGGCTATCTTCGATCGGAACTCATGAGATTGTTATCCATCACTCCTCAAATTACAGTAAAGAGTCCCTCAGCAAGCGAAACTA
GAAGGACATTCACAATCAGCGCATCTCAGAAATCTCCGATTCTGATCGGACGGCCATCGAGATTCAAGAATTTCACATTGCGGTTCCGCATGAGTGTCGATAATGGAAGC
CCTAATCGGAGTCGAGATCGGATCGGTGCCGGAGATGCCGTCATCATCGTCGACCATGGCTCTCGCCGCCAGGAATCTAATCTGATGCTGAATGAGTTCGTTGCTATGTT
TAGGGATAAAACTGGTTACCCTATTGTGGAGCCTGCTCACATGGAGCTGGCCGAACCGTCGATAAGAGACTCGTTTGCATCATGTGTCGAACAAGGGGCCAAACGAATCA
TTGTAAGCCCATTCTTCCTCTTCCCTGGTCGACATTGGCAACAGGACATTCCTTCCTTAACAGCTGAAGCAGCAAAGGAGCACCCTGGAATATCATATATAATAACTGCT
CCTCTTGGTCTTCATGAACAACTAGTGGATGTTGTGAATGATAGAATAAATCACTGCTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGCAGATGAATGTGAAGTTTGCGCTGGAACAGG
CAAATGCAGATTTAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATTGTCTTCTCCGACAACAGCAAAACAGAGGCGGTGGTGGTTTCCGAGCAGTCCTTCGCGTGGCCAACAACGTCTTGTGCGTGGTTAAGTGTTTTCTTTCCTCGGTTTTG
GTTGTTTCTCAAGCCGATCTCTCTCCCTTTTCCTTGCCTAAGGCCTTGGAGTTAAGGAATTTTGAAAAGGATTTAGCAAATATTGTTTGGCAAAGGGCTGATAGAACCCA
ATTTTTAGGCACGTTATCGTGTTCAGAAGGCTATCTTCGATCGGAACTCATGAGATTGTTATCCATCACTCCTCAAATTACAGTAAAGAGTCCCTCAGCAAGCGAAACTA
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CCTAATCGGAGTCGAGATCGGATCGGTGCCGGAGATGCCGTCATCATCGTCGACCATGGCTCTCGCCGCCAGGAATCTAATCTGATGCTGAATGAGTTCGTTGCTATGTT
TAGGGATAAAACTGGTTACCCTATTGTGGAGCCTGCTCACATGGAGCTGGCCGAACCGTCGATAAGAGACTCGTTTGCATCATGTGTCGAACAAGGGGCCAAACGAATCA
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CCTCTTGGTCTTCATGAACAACTAGTGGATGTTGTGAATGATAGAATAAATCACTGCTTAAGCCATGCTGCTGGAGTTGCAGATGAATGTGAAGTTTGCGCTGGAACAGG
CAAATGCAGATTTAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MILKLQESDLGAKRVSKFRPTSLTTGVYKLIIEVLAERVITRYPNCNVANLKLDKLDDNFAIQPLATPFSSITDCLLRQQQNRGGGGFRAVLRVANNVLCVVKCFLSSVL
VVSQADLSPFSLPKALELRNFEKDLANIVWQRADRTQFLGTLSCSEGYLRSELMRLLSITPQITVKSPSASETRRTFTISASQKSPILIGRPSRFKNFTLRFRMSVDNGS
PNRSRDRIGAGDAVIIVDHGSRRQESNLMLNEFVAMFRDKTGYPIVEPAHMELAEPSIRDSFASCVEQGAKRIIVSPFFLFPGRHWQQDIPSLTAEAAKEHPGISYIITA
PLGLHEQLVDVVNDRINHCLSHAAGVADECEVCAGTGKCRFN