; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg038607 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg038607
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionTHO complex subunit 4D-like
Genome locationscaffold12:2359744..2372731
RNA-Seq ExpressionSpg038607
SyntenySpg038607
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR025715 - Chromatin target of PRMT1 protein, C-terminal
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581189.1 THO complex subunit 4C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-12162.79Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGG+ VVIGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-------------GLGGGGRGRGR-------
                                   SESGRTG+SNAVNPFPGPSHRGGLR+  GRGRGRGGWSRGLG             GLGGGGRGRGR       
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-------------GLGGGGRGRGR-------

Query:  -GRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
         G G GRG+GQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt:  -GRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT

XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata]1.9e-12465.17Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKP
                                   SESGRTG+S+AVNPFPGPSHRGGLR+  GRGRGRGGWSRGLG     GLGGGGRGRGRG G GRG+GQGRKKP
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKP

Query:  VEKSSDELDKELENYHAEAMQT
        VEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt:  VEKSSDELDKELENYHAEAMQT

XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima]1.3e-12363.89Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGG-----------GGRGRGRGR------GRG
                                   SESGRTG+SNAVNPFPGPSHRGGLR+GRGRGRGGWSRGLGG GG           GGRGRGRGR      G G
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGG-----------GGRGRGRGR------GRG

Query:  RGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
        RG+GQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt:  RGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT

XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.1e-12565.4Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKP
                                   SESGRTG+SNAVNPFPGPSHRGGLR+  GRGRGRGGWSRGLG     GLGGGGRGRGRG G GRG+GQGRKKP
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKP

Query:  VEKSSDELDKELENYHAEAMQT
        VEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt:  VEKSSDELDKELENYHAEAMQT

XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida]1.1e-12264.58Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        MATPLDMSLEDVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVV+GSVRRGPL INAR SAYSI KPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGV+KEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDNAE+PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDE
                                    ESGRT +SN VNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW+RG G  GGGG   GRGRGRGRG+GQGRKKPVEKSSDE
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDE

Query:  LDKELENYHAEAMQT
        LDKELENYHAEAMQT
Subjt:  LDKELENYHAEAMQT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L717 RRM domain-containing protein3.6e-10094.5Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPL INAR SAYSI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE+PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

A0A1S3C452 THO complex subunit 4D1.6e-11963.61Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPL INAR SAYSI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE+PVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDE
                                    ESGR    N VNPFPGPSHRGGLRN RGRGRG W+RG+ GLGG G GRGRGRGRGR  GQGRKKPVEKSSDE
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDE

Query:  LDKELENYHAEAMQT
        LDKELENYHAEAMQT
Subjt:  LDKELENYHAEAMQT

A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like1.0e-11562.65Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR VVIGS+RRGPLSIN RPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDNAE+PVSARINVTG+NGRSRRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDE
                                   SESGRT +S  VN FPGPS+RG LR GRGRGRGGWSRG G +GG     GRGRGRGRG+G GRKK VEKSSDE
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDE

Query:  LDKELENYHAEAMQT
        LDK+LENYHAEAMQT
Subjt:  LDKELENYHAEAMQT

A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like9.4e-12565.17Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKP
                                   SESGRTG+S+AVNPFPGPSHRGGLR+  GRGRGRGGWSRGLG     GLGGGGRGRGRG G GRG+GQGRKKP
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKP

Query:  VEKSSDELDKELENYHAEAMQT
        VEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt:  VEKSSDELDKELENYHAEAMQT

A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like6.1e-12463.89Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
        MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR VVIGSVRRGPL INARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY

Query:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
        VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNA+ PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt:  VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT

Query:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW
                                                                                                            
Subjt:  LTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHW

Query:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGG-----------GGRGRGRGR------GRG
                                   SESGRTG+SNAVNPFPGPSHRGGLR+GRGRGRGGWSRGLGG GG           GGRGRGRGR      G G
Subjt:  RTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGG-----------GGRGRGRGR------GRG

Query:  RGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
        RG+GQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt:  RGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
B5FXN8 THO complex subunit 49.0e-3244.86Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNG---GRGVVIGS------VRRGPLSINA----RPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRA
        MA  +DMSL+D+IK N  ++  +RG  R GRG GG+  G   GRG V G       VR  P+        RP+ YS    P+++   +WQHDLF+    A
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNG---GRGVVIGS------VRRGPLSINA----RPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRA

Query:  SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML
           +G+E G KL VSNLD+GV+  DI+ELF+E G LK+ A+HYD++GR  G+A+V + R++DA  A+K+YN V LDG+PM I+++
Subjt:  SGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEML

B5FXN8 THO complex subunit 42.2e+0247.62Show/hide
Query:  RNGRGRGRGGWSRG---LGGLGGGGRGRG-RGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
        R  +   RGG +R    LGG GGGG  RG RG  RGRG+G GR    + S++ELD +L+ Y+A
Subjt:  RNGRGRGRGGWSRG---LGGLGGGGRGRG-RGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA

Q6NQ72 THO complex subunit 4D2.3e-5940.48Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
        M+  L+M+L++++K+    +   RG +R RGRG GG   GGRG   G  RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ WQ  LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL

Query:  YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEIPVSAR--INVTGVNGRSRR
        +V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N  +E P+S R  +NVTG+NGR +R
Subjt:  YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEIPVSAR--INVTGVNGRSRR

Query:  TVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIAS
        TVV                                                                                                 
Subjt:  TVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIAS

Query:  EMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVE
                     + +  G +G+ +          GR G      P P  S R  + N +G   GG   G GG    GRG G GRGRG G+G G KKPVE
Subjt:  EMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVE

Query:  KSSDELDKELENYHAEAMQT
        KS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt:  KSSDELDKELENYHAEAMQT

Q8L719 THO complex subunit 4B4.0e-4049.74Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
        M+  LDMSL+D+I K+NR+   +RGR   G G      GG G   G  RR    + AR + YS     ++  +  WQ+D+F  + S+ A+          
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------

Query:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIP
        G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR  G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N   P
Subjt:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIP

Q8L719 THO complex subunit 4B3.8e+0248.35Show/hide
Query:  SGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW---SRGLGGLGGGGRGRGRG-RGR-GRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
        +G  GN N    F G  +     N RGRGRGG+    RG GG GGG    GRG RGR GRG G GR +    S+++LD EL+ YH EAM+T
Subjt:  SGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW---SRGLGGLGGGGRGRGRG-RGR-GRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT

Q8L773 THO complex subunit 4A1.4e-3748.07Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIG
        M+T LDMSL+D+I KN     ++RG A   RG G     G      + R  P   + R + Y  +K P       W HD+F    ED       +GIE G
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIEIG

Query:  TKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE
        TKLY+SNLDYGV  EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++GR  G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N +
Subjt:  TKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE

Q8L773 THO complex subunit 4A5.5e+0334.9Show/hide
Query:  ETVKALAAIASEM----VHWRTKSPSSGVTEASGSK------GKEKESDTQNESESGR---TGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGR----GRGRGGWSRGLG
        E +K L A   E+    VH+     S G  E   S+        +K +D Q + +  +    G +      P      G  NG     G+GRGG  RG G
Subjt:  ETVKALAAIASEM----VHWRTKSPSSGVTEASGSK------GKEKESDTQNESESGR---TGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGR----GRGRGGWSRGLG

Query:  GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
        G GGGGRG   G GRGR  G+G   P EK S+++LD +L+ YH+  M+T
Subjt:  GLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT

Q94EH8 THO complex subunit 4C1.7e-5438.97Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
        M+  L+M+L++++KK+  E+  A     +G +R+ GRG GG      GGRG   G VRRGPL++N RP S++SI+K  RR +++ W  Q+DL+E++LRA 
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS

Query:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-IPVSARINVT
        G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA  A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E  PV+AR+NVT
Subjt:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-IPVSARINVT

Query:  GVNGRSRRTVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETV
        G+NGR +R        SVFI   +                          GR+G+                                             
Subjt:  GVNGRSRRTVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETV

Query:  KALAAIASEMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQG
                                 SG  G+      QN+                               +GG + G GG  G GRG G GRG   G G
Subjt:  KALAAIASEMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQG

Query:  QGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
        +G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHAEAM
Subjt:  QGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.2e-5538.97Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
        M+  L+M+L++++KK+  E+  A     +G +R+ GRG GG      GGRG   G VRRGPL++N RP S++SI+K  RR +++ W  Q+DL+E++LRA 
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS

Query:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-IPVSARINVT
        G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA  A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E  PV+AR+NVT
Subjt:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-IPVSARINVT

Query:  GVNGRSRRTVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETV
        G+NGR +R        SVFI   +                          GR+G+                                             
Subjt:  GVNGRSRRTVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETV

Query:  KALAAIASEMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQG
                                 SG  G+      QN+                               +GG + G GG  G GRG G GRG   G G
Subjt:  KALAAIASEMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQG

Query:  QGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
        +G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHAEAM
Subjt:  QGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM

AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.2e-5538.97Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS
        M+  L+M+L++++KK+  E+  A     +G +R+ GRG GG      GGRG   G VRRGPL++N RP S++SI+K  RR +++ W  Q+DL+E++LRA 
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGS---FNGGRGVVIGSVRRGPLSINARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRAS

Query:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-IPVSARINVT
        G+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+AIHYDKNGRPSGSAEVVY RRSDA  A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E  PV+AR+NVT
Subjt:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAE-IPVSARINVT

Query:  GVNGRSRRTVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETV
        G+NGR +R        SVFI   +                          GR+G+                                             
Subjt:  GVNGRSRRTVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETV

Query:  KALAAIASEMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQG
                                 SG  G+      QN+                               +GG + G GG  G GRG G GRG   G G
Subjt:  KALAAIASEMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQG

Query:  QGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM
        +G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHAEAM
Subjt:  QGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAM

AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein2.9e-4149.74Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
        M+  LDMSL+D+I K+NR+   +RGR   G G      GG G   G  RR    + AR + YS     ++  +  WQ+D+F  + S+ A+          
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------

Query:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIP
        G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ IHYD++GR  G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N   P
Subjt:  GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIP

AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein2.7e+0148.35Show/hide
Query:  SGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW---SRGLGGLGGGGRGRGRG-RGR-GRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
        +G  GN N    F G  +     N RGRGRGG+    RG GG GGG    GRG RGR GRG G GR +    S+++LD EL+ YH EAM+T
Subjt:  SGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW---SRGLGGLGGGGRGRGRG-RGR-GRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT

AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 41.6e-6040.48Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
        M+  L+M+L++++K+    +   RG +R RGRG GG   GGRG   G  RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ WQ  LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL

Query:  YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEIPVSAR--INVTGVNGRSRR
        +V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N  +E P+S R  +NVTG+NGR +R
Subjt:  YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEIPVSAR--INVTGVNGRSRR

Query:  TVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIAS
        TVV                                                                                                 
Subjt:  TVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIAS

Query:  EMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVE
                     + +  G +G+ +          GR G      P P  S R  + N +G   GG   G GG    GRG G GRGRG G+G G KKPVE
Subjt:  EMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVE

Query:  KSSDELDKELENYHAEAMQT
        KS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt:  KSSDELDKELENYHAEAMQT

AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 42.5e-6140Show/hide
Query:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
        M+  L+M+L++++K+    +   RG +R RGRG GG   GGRG   G  RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ WQ  LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt:  MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL

Query:  YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEIPVSAR--INVTGVNGRSRR
        +V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+AIHYDKNGRPSG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N  +E P+S R  +NVTG+NGR +R
Subjt:  YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--AEIPVSAR--INVTGVNGRSRR

Query:  TVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIAS
        TVV                       I + G           GR G+     +  RL + + +                                     
Subjt:  TVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNSRINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIAS

Query:  EMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVE
                                                             GG+R GRG  R        G G GGRGRG GRG G       KKPVE
Subjt:  EMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESESGRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVE

Query:  KSSDELDKELENYHAEAMQT
        KS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt:  KSSDELDKELENYHAEAMQT


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTACTCCTTTAGATATGTCACTTGAGGATGTGATAAAGAAGAATAACCGTGAGAAGCTTAGAGCACGAGGTAGGGCCCGTCGTGGGCGTGGAGCAGGTGGGTCTTT
TAATGGTGGAAGAGGAGTAGTGATAGGGTCAGTTCGTAGAGGTCCTCTCAGCATAAATGCACGCCCATCTGCTTACTCAATTAGCAAGCCTCCACGCAGAATGAAGAATG
TTCAATGGCAGCATGATTTATTTGAAGATAGTCTTAGAGCTTCAGGGATTTCTGGAATTGAAATTGGCACAAAGTTGTACGTTTCCAACTTGGATTATGGGGTGACCAAA
GAAGATATAAGGGAGTTGTTCTCTGAGATTGGAGACCTGAAAAGATTTGCAATTCATTATGACAAAAATGGCCGTCCAAGTGGCTCGGCAGAGGTGGTATATACTCGTAG
AAGTGATGCATTTGCTGCTCTGAAGCGTTATAACAATGTGTTACTGGATGGGAAGCCAATGAAGATTGAAATGCTTGGTGATAATGCTGAAATACCGGTTTCTGCACGTA
TAAATGTTACTGGAGTGAATGGAAGAAGCAGGAGGACAGTTGTTCTAACATTAACAGACTCCGTTTTTATAGCCAATGAAATAGCTGATGCTGATAAGGAGCAAAACTCA
AGGATAAATCTTGAAGGTTCGACATGGAAGAGACCTAGCACGTTCACCCTGGGAAGACTAGGCAAAATGGCACAGAAAAGGATCGAGGAAAGACTGGATGTAACGGACAC
TGAGCTGGAAGGAATGAAGAAGGAAATGCAGAAGTTACCTGCGATCGAGAGGAACTTAGCGAAGCTTTCGCAAACTTCTGAGGAAACGGTCAAGGCTCTGGCGGCGATTG
CGAGCGAGATGGTTCACTGGCGAACCAAATCTCCTTCCTCCGGCGTCACAGAGGCATCGGGTTCGAAAGGGAAGGAAAAAGAGAGTGACACACAAAATGAGTCTGAATCT
GGTCGTACCGGTAACTCCAACGCGGTCAACCCTTTTCCTGGTCCAAGCCATCGTGGAGGGCTGAGGAATGGCCGTGGCCGTGGGCGAGGAGGCTGGAGTCGTGGTCTAGG
AGGTCTAGGTGGAGGAGGCCGGGGCCGAGGGCGTGGTCGTGGTCGTGGCCGTGGTCAGGGCCAGGGAAGAAAGAAACCCGTGGAGAAGTCCTCAGATGAACTTGACAAGG
AGCTTGAAAACTATCATGCAGAAGCCATGCAAACCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTACTCCTTTAGATATGTCACTTGAGGATGTGATAAAGAAGAATAACCGTGAGAAGCTTAGAGCACGAGGTAGGGCCCGTCGTGGGCGTGGAGCAGGTGGGTCTTT
TAATGGTGGAAGAGGAGTAGTGATAGGGTCAGTTCGTAGAGGTCCTCTCAGCATAAATGCACGCCCATCTGCTTACTCAATTAGCAAGCCTCCACGCAGAATGAAGAATG
TTCAATGGCAGCATGATTTATTTGAAGATAGTCTTAGAGCTTCAGGGATTTCTGGAATTGAAATTGGCACAAAGTTGTACGTTTCCAACTTGGATTATGGGGTGACCAAA
GAAGATATAAGGGAGTTGTTCTCTGAGATTGGAGACCTGAAAAGATTTGCAATTCATTATGACAAAAATGGCCGTCCAAGTGGCTCGGCAGAGGTGGTATATACTCGTAG
AAGTGATGCATTTGCTGCTCTGAAGCGTTATAACAATGTGTTACTGGATGGGAAGCCAATGAAGATTGAAATGCTTGGTGATAATGCTGAAATACCGGTTTCTGCACGTA
TAAATGTTACTGGAGTGAATGGAAGAAGCAGGAGGACAGTTGTTCTAACATTAACAGACTCCGTTTTTATAGCCAATGAAATAGCTGATGCTGATAAGGAGCAAAACTCA
AGGATAAATCTTGAAGGTTCGACATGGAAGAGACCTAGCACGTTCACCCTGGGAAGACTAGGCAAAATGGCACAGAAAAGGATCGAGGAAAGACTGGATGTAACGGACAC
TGAGCTGGAAGGAATGAAGAAGGAAATGCAGAAGTTACCTGCGATCGAGAGGAACTTAGCGAAGCTTTCGCAAACTTCTGAGGAAACGGTCAAGGCTCTGGCGGCGATTG
CGAGCGAGATGGTTCACTGGCGAACCAAATCTCCTTCCTCCGGCGTCACAGAGGCATCGGGTTCGAAAGGGAAGGAAAAAGAGAGTGACACACAAAATGAGTCTGAATCT
GGTCGTACCGGTAACTCCAACGCGGTCAACCCTTTTCCTGGTCCAAGCCATCGTGGAGGGCTGAGGAATGGCCGTGGCCGTGGGCGAGGAGGCTGGAGTCGTGGTCTAGG
AGGTCTAGGTGGAGGAGGCCGGGGCCGAGGGCGTGGTCGTGGTCGTGGCCGTGGTCAGGGCCAGGGAAGAAAGAAACCCGTGGAGAAGTCCTCAGATGAACTTGACAAGG
AGCTTGAAAACTATCATGCAGAAGCCATGCAAACCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVVIGSVRRGPLSINARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLYVSNLDYGVTK
EDIRELFSEIGDLKRFAIHYDKNGRPSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNAEIPVSARINVTGVNGRSRRTVVLTLTDSVFIANEIADADKEQNS
RINLEGSTWKRPSTFTLGRLGKMAQKRIEERLDVTDTELEGMKKEMQKLPAIERNLAKLSQTSEETVKALAAIASEMVHWRTKSPSSGVTEASGSKGKEKESDTQNESES
GRTGNSNAVNPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGRGQGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT