; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg038854 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg038854
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionGamma-tubulin complex component
Genome locationscaffold12:3984499..3992706
RNA-Seq ExpressionSpg038854
SyntenySpg038854
Gene Ontology termsGO:0007020 - microtubule nucleation (biological process)
GO:0000922 - spindle pole (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0005815 - microtubule organizing center (cellular component)
GO:0005874 - microtubule (cellular component)
GO:0043015 - gamma-tubulin binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007259 - Gamma-tubulin complex component protein
IPR041470 - Gamma tubulin complex component protein, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6581271.1 Gamma-tubulin complex component 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.4e-7293.55Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYN LGLNHL PDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRS NGS L NS E
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK+KTE PSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

XP_022155312.1 gamma-tubulin complex component 4 homolog isoform X1 [Momordica charantia]1.2e-7294.19Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHL PDAPISGE TFKLA DISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGS LA SAE
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK KTENPSVYRRAIANGIVEILS+YRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

XP_022934806.1 gamma-tubulin complex component 4 homolog [Cucurbita moschata]3.4e-7293.55Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYN LGLNHL PDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRS NGS L NS E
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK+KTE PSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

XP_023528229.1 gamma-tubulin complex component 4 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.9e-7292.9Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYN LGLNHL PDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIV GFYYRELDRFATKSRNLSWIRS NGS L NS E
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK+KTE PSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

XP_038879485.1 gamma-tubulin complex component 4 homolog [Benincasa hispida]3.4e-7292.9Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLL+LLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHL  DAPISGEPTF LAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGS LANS E
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK+K ENPSVYRRAIANGIVEILS+YRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E5X5 Gamma-tubulin complex component5.3e-7192.26Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLN+L  DAPISGEPTFKLA DISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGN S LANS E
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK+K ENPSVYRRAIANGIVEILS+YRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

A0A5A7SW23 Gamma-tubulin complex component5.3e-7192.26Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLN+L  DAPISGEPTFKLA DISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGN S LANS E
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK+K ENPSVYRRAIANGIVEILS+YRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

A0A5D3DFQ5 Gamma-tubulin complex component5.3e-7192.26Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLN+L  DAPISGEPTFKLA DISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGN S LANS E
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK+K ENPSVYRRAIANGIVEILS+YRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

A0A6J1DP06 Gamma-tubulin complex component5.7e-7394.19Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHL PDAPISGE TFKLA DISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGS LA SAE
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK KTENPSVYRRAIANGIVEILS+YRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

A0A6J1F2V2 Gamma-tubulin complex component1.7e-7293.55Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYN LGLNHL PDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRS NGS L NS E
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        SSK+KTE PSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLL+ETVPILA+VTQGLDK
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9D4F8 Gamma-tubulin complex component 47.0e-0426.92Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        M+HELLLAL GY G +    +                 SG    +++ D  FL PSE  ++ R+  LG  Y     F         I    G +      
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTEN-PSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
          ++       +Y RA   G+  +L  YR A+L +EQ+ LA+    ++ V   LD+
Subjt:  SSKEKTEN-PSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

Q9M350 Gamma-tubulin complex component 41.8e-5273.25Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNG-SLLANSA
        MLHELLLALLG+TGDLI+DERE   +LGL     D+P+S E TFKLAPDISF+EPSERDLI+R+I LGFYYRELDRFA KSRNLSWIRS      L  + 
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNG-SLLANSA

Query:  ESSKEKTE-NPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        E SK+  E  PSVYRRAIANGI EILSVYRSAVLH+EQKLLAET PILA VT+GL+K
Subjt:  ESSKEKTE-NPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK

Q9SC88 Gamma-tubulin complex component 4 homolog2.5e-4964.81Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE
        MLHELLLALLGYTGDLIID R+       N+L+ + PIS E TFKLAPDISF++PS+R+LI+RII LGFYYREL+RF+ KSRNL+WIRS N + L N   
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAE

Query:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDKVGSKMMP
              E PSVYRRA+ANGIVEIL+VY S++LH+EQ LL+ET+PILA VTQGL+K  S + P
Subjt:  SSKEKTENPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDKVGSKMMP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53760.1 GAMMA-TUBULIN COMPLEX PROTEIN 41.3e-5373.25Show/hide
Query:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNG-SLLANSA
        MLHELLLALLG+TGDLI+DERE   +LGL     D+P+S E TFKLAPDISF+EPSERDLI+R+I LGFYYRELDRFA KSRNLSWIRS      L  + 
Subjt:  MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNG-SLLANSA

Query:  ESSKEKTE-NPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK
        E SK+  E  PSVYRRAIANGI EILSVYRSAVLH+EQKLLAET PILA VT+GL+K
Subjt:  ESSKEKTE-NPSVYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTACACGAGCTTCTACTTGCTCTACTGGGTTACACCGGCGATCTGATAATCGACGAAAGAGAGCATTACAACTCTCTAGGGCTGAATCACTTAACTCCCGATGCCCC
CATTTCCGGCGAACCCACATTCAAGCTCGCCCCCGATATCTCCTTTCTCGAACCGAGCGAAAGGGATCTAATTCAGAGGATCATTGTGTTAGGATTTTACTATAGAGAGC
TCGACCGCTTTGCTACTAAGTCTAGGAATTTGAGTTGGATTCGTTCTGGTAATGGGTCTTTGTTAGCCAATTCTGCGGAGTCGTCTAAAGAAAAAACTGAAAACCCAAGT
GTGTATAGGAGGGCCATAGCTAATGGCATTGTAGAGATACTGTCTGTTTATAGATCTGCTGTTCTTCATGTGGAGCAGAAACTGTTGGCTGAAACGGTACCAATTTTGGC
AGTAGTCACGCAGGGCCTCGATAAGGTTGGTTCTAAGATGATGCCCTTTGCTCTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTACACGAGCTTCTACTTGCTCTACTGGGTTACACCGGCGATCTGATAATCGACGAAAGAGAGCATTACAACTCTCTAGGGCTGAATCACTTAACTCCCGATGCCCC
CATTTCCGGCGAACCCACATTCAAGCTCGCCCCCGATATCTCCTTTCTCGAACCGAGCGAAAGGGATCTAATTCAGAGGATCATTGTGTTAGGATTTTACTATAGAGAGC
TCGACCGCTTTGCTACTAAGTCTAGGAATTTGAGTTGGATTCGTTCTGGTAATGGGTCTTTGTTAGCCAATTCTGCGGAGTCGTCTAAAGAAAAAACTGAAAACCCAAGT
GTGTATAGGAGGGCCATAGCTAATGGCATTGTAGAGATACTGTCTGTTTATAGATCTGCTGTTCTTCATGTGGAGCAGAAACTGTTGGCTGAAACGGTACCAATTTTGGC
AGTAGTCACGCAGGGCCTCGATAAGGTTGGTTCTAAGATGATGCCCTTTGCTCTGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLHELLLALLGYTGDLIIDEREHYNSLGLNHLTPDAPISGEPTFKLAPDISFLEPSERDLIQRIIVLGFYYRELDRFATKSRNLSWIRSGNGSLLANSAESSKEKTENPS
VYRRAIANGIVEILSVYRSAVLHVEQKLLAETVPILAVVTQGLDKVGSKMMPFAL