; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg038962 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg038962
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDUF4283 domain-containing protein
Genome locationscaffold12:2989930..2997831
RNA-Seq ExpressionSpg038962
SyntenySpg038962
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR025558 - Domain of unknown function DUF4283


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0051433.1 hypothetical protein E6C27_scaffold55G001850 [Cucumis melo var. makuwa]7.7e-1839.71Show/hide
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        +P    + LI+    + YGGW+ I+NLPL+ W R + E I  + GGL   +S TLNL + +EA+I+V+KN CGF+P  I +    +    L FGD   L 
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          N    S      +DF+NS+D +RV+ V+LDE++D
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KAA0062494.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold130G00900 [Cucumis melo var. makuwa]3.5e-1838.69Show/hide
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        ++DF NS+D ++++ V+LDE++D+ +    LN S  +
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KAA0063414.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold508G00510 [Cucumis melo var. makuwa]1.8e-2731.58Show/hide
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        W   C VWP +GGR  + +P G N++GW  F  MI+DF L + + +       ++ LE LPA         F  S  E     G                
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Query:  IVTEEAYWVRKNWDVLKIDLESSLVVSRLMAHYSWKNVKIALEDFFKSSVLINPFMDDKALIQPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLV
           + + WV KN +VL+ D +S L V                                        +K YGGWI+I+NLPL+ W  D ++AIG   GG  
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        SIS  T+NL++CSEA I+V +N CGF+PA + ++   +    L FGDI  LE   +       L ++  +N +D++R+ QV+LDE
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TYK10355.1 hypothetical protein E5676_scaffold367G00330 [Cucumis melo var. makuwa]7.7e-1827.27Show/hide
Query:  QWFENVLVELLQNP-VSYFFHQKIKEDFGVIRLIKFFSDKEWFFECAVWPSTGGRRTIQVPAGLNKKGWYVFWEMIRDFSLKIHSYENQSNRLFLNNLEG
        +W ++    LL  P  + FF +K  ED+  + + K ++ K +  E       G +  I VP G  K GW  F  ++     K  S    + R  LN    
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             ++S       SYAE V +G S         S       T       K+      + E ++V++R   H  W+ +   L +   ++V   PF  DK
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Query:  ALI------------------------------------QPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNF
        ALI                                     PK+I SYGGWI +R +PL+ W+ +SF  IG   GG + ++  T  L D  EA I ++ N+
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Query:  CGFIPADINVKIGNKFEFS
         GFIPA I  K+ +K E S
Subjt:  CGFIPADINVKIGNKFEFS

XP_031738083.1 uncharacterized protein LOC116402658 [Cucumis sativus]2.4e-1931.09Show/hide
Query:  MDDKALIQPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNFCGFIPADINVKIGNKFEFSLRFGDINALEDKN
        MD+    +P ++K YGGW+ ++NLPL+LW R  FEAIG + GG + I++ TLNL +CSEA I+V++N CGF+ +   +    +    L FG+   L    
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Query:  LKFDSSRKLSVND-FSNSLDVIRVKQVILDEEVDL--------VNEGVRLNESSFISCYQ--EEFNAAMGSPKVASMHDEHINYTGCN---ESPSKMIND
            S +  SV+D + NSLD +R+++ + DE  DL        V + V        S +Q  + F A   +P+  +   + +         E PS +IND
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Query:  S---NYNLKDDIQQRSSN---INSENGLIQSKEFGLVEFSKKKSALFLEKNFNANGKLYNAICSDFN
        +   +  LK  +     N   INS  G++ S+E       +K S + + +N++ + K+    CS  N
Subjt:  S---NYNLKDDIQQRSSN---INSENGLIQSKEFGLVEFSKKKSALFLEKNFNANGKLYNAICSDFN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U6A9 Uncharacterized protein3.7e-1839.71Show/hide
Query:  NPFMDDKALIQPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNFCGFIPADINVKIGNKFEFSLRFGDINALE
        +P    + LI+    + YGGW+ I+NLPL+ W R + E I  + GGL   +S TLNL + +EA+I+V+KN CGF+P  I +    +    L FGD   L 
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          N    S      +DF+NS+D +RV+ V+LDE++D
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A0A5A7V878 DUF4283 domain-containing protein8.9e-2831.58Show/hide
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        W   C VWP +GGR  + +P G N++GW  F  MI+DF L + + +       ++ LE LPA         F  S  E     G                
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Query:  IVTEEAYWVRKNWDVLKIDLESSLVVSRLMAHYSWKNVKIALEDFFKSSVLINPFMDDKALIQPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLV
           + + WV KN +VL+ D +S L V                                        +K YGGWI+I+NLPL+ W  D ++AIG   GG  
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A0A5D3CFS8 DUF4283 domain-containing protein3.7e-1827.27Show/hide
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        +W ++    LL  P  + FF +K  ED+  + + K ++ K +  E       G +  I VP G  K GW  F  ++     K  S    + R  LN    
Subjt:  QWFENVLVELLQNP-VSYFFHQKIKEDFGVIRLIKFFSDKEWFFECAVWPSTGGRRTIQVPAGLNKKGWYVFWEMIRDFSLKIHSYENQSNRLFLNNLEG

Query:  LPALVNDSEGQVFPNSYAEVVKRGGSMKNSFSLEDSARNVKIVTEEAYWVRKNWDVLKIDLESSLVVSRLMAHYSWKNVKIALEDFFKSSVLINPFMDDK
             ++S       SYAE V +G S         S       T       K+      + E ++V++R   H  W+ +   L +   ++V   PF  DK
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Query:  ALI------------------------------------QPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNF
        ALI                                     PK+I SYGGWI +R +PL+ W+ +SF  IG   GG + ++  T  L D  EA I ++ N+
Subjt:  ALI------------------------------------QPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNF

Query:  CGFIPADINVKIGNKFEFS
         GFIPA I  K+ +K E S
Subjt:  CGFIPADINVKIGNKFEFS

A0A5D3DCX6 DUF4283 domain-containing protein6.4e-1828.43Show/hide
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        FF +K  E++G + + K ++ K +  E       G +  I VP G  K GW  F  ++ D   K  S +     L ++  + + +  +DS+ +    SY 
Subjt:  FFHQKIKEDFGVIRLIKFFSDKEWFFECAVWPSTGGRRTIQVPAGLNKKGWYVFWEMIRDFSLKIHSYENQSNRLFLNNLEGLPALVNDSEGQVFPNSYA

Query:  EVVKRGGSMKNSFSLEDSARNVKIVTEEAYWVRKNWDVLKIDLESSLVVSRLMAHYSWKNVKIALEDFFKSSVLINPFMDDKALI---------------
        EVV +G S     S EDS    +I +       K+     I+ E ++V++R   H  W+N+   L++   ++V   PF  DKALI               
Subjt:  EVVKRGGSMKNSFSLEDSARNVKIVTEEAYWVRKNWDVLKIDLESSLVVSRLMAHYSWKNVKIALEDFFKSSVLINPFMDDKALI---------------

Query:  ---------------------QPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNFCGFIPADINVKIGNKFEF
                              PK++ SYGGWI +R L L+ W  +SF  IG   GG + ++  T  L D  EA I V+ N+  FIP  I  K+ +K E 
Subjt:  ---------------------QPKLIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNFCGFIPADINVKIGNKFEF

Query:  SLRFGDINALEDK
        S     I   E+K
Subjt:  SLRFGDINALEDK

A0A5D3DVS9 Uncharacterized protein1.7e-1838.69Show/hide
Query:  LIKSYGGWIAIRNLPLNLWHRDSFEAIGKNLGGLVSISSNTLNLLDCSEAFIEVEKNFCGFIPADINVKIGNKFEFSLRFGDINALEDKNLKFDSSRKLS
        ++K Y GW+ I+NLPL+ W R +FE IG +L GL+ I+  TLNL +CS+A I+V+KN CGF+ +   +    +    L FGD   L   N    S   + 
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Query:  VNDFSNSLDVIRVKQVILDEEVDLVNEGVRLNESSFI
        ++DF NS+D ++++ V+LDE++D+ +    LN S  +
Subjt:  VNDFSNSLDVIRVKQVILDEEVDLVNEGVRLNESSFI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATTTGAAACTGGAACTTTGGTCTCCTGAGAATCACTCCCAACCGAAATTTATGAAAAGCTATGGAGGATGGATTGCAATCAGGAATTTACCTTTAAATTTGTGGAGTCGT
GCATCCTTTGAAACTATTGGAAAGAATCTTGGAGGGCTGATTGGTAATAAGCTCAAATTCTCTCTTCATTATGGTGATATTAACGCACTAGAGACTAGGAATTCAAAGTT
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TCAAATTCCCTGGATTTACTAAGGGTCAAGCAAGTTGTGTTGGACGACGAATTGACTATTTTTAATGAAGGAGAGAGGGAGGCTGAATTGCCAACAAATCAAGAGGTATT
TAATGAGGCTTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCATCTTTGCATGTTGAGTGCATTAATAACGTTGGCTGGGTGAAAGACCCTTTTATCAGAGGTATTGCCAATTCTCCCAATC
ATAAAATCCATTCTCCGGTGGATTCAGATGATGAGTCTGTGGTCAGTGTAAGTAGTGAGGATTCAGAGCAAATGAATGTTAATGAAGATGGGGTGGAGCATTTTTCAGAA
GACCAAATTGGCCAGAGTATTTTGGGTCTTTCTCCTTCAGGGAGGTGGCAGTGGTTTGAAAATGTTCTAGTTGAGTTATTGCAGAATCCTGTTTCTTATTTCTTTCATCA
GAAAATTAAGGAAGACTTTGGAGTCATTAGGTTGATTAAGTTCTTTTCGGATAAAGAATGGTTCTTTGAATGCGCTGTTTGGCCTTCCACGGGTGGGAGGAGGACTATTC
AAGTTCCAGCGGGCTTGAATAAGAAAGGTTGGTATGTATTTTGGGAAATGATTAGGGATTTCTCTCTCAAAATTCACTCTTATGAGAATCAGTCAAATCGGTTATTTTTG
AACAATTTGGAGGGTCTTCCTGCTTTAGTTAATGACTCAGAAGGTCAAGTCTTTCCTAACTCCTATGCTGAAGTGGTTAAGCGAGGTGGCTCTATGAAGAATTCATTCTC
CTTGGAAGATTCAGCTAGAAATGTTAAGATTGTTACTGAAGAAGCTTACTGGGTTCGTAAGAATTGGGATGTGCTGAAAATAGACTTGGAAAGTTCACTCGTTGTTTCTA
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TATTTCATCCAATACGCTTAATTTATTAGATTGTTCTGAAGCCTTCATTGAAGTAGAAAAGAATTTTTGTGGCTTTATCCCTGCTGATATTAATGTTAAGATTGGTAATA
AGTTTGAATTCTCTTTAAGATTTGGTGATATTAATGCATTAGAGGACAAAAATTTGAAGTTTGATTCAAGTAGAAAGTTAAGTGTCAATGACTTTTCAAATTCCCTGGAT
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ATGATATACAGCAGCGTTCGTCAAATATCAATTCTGAAAATGGGTTAATTCAGTCCAAAGAATTTGGGTTGGTTGAATTTTCAAAGAAGAAAAGTGCTTTGTTTCTGGAG
AAGAATTTTAATGCCAACGGTAAGCTTTATAATGCCATCTGTTCAGATTTTAATGGAGCATTTTCTGATGGTGTTGTGCATGAGTCCCAAGATTTATTATCCACGCCTTT
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AGATTTCACGTTCCAAGGAAGCATTAATGGAAGAAGTTAGTGTTAATTTCATTGGGCCGGTTGAGTTTTCAAAGGAGAAAAGTGCTTTGTTGCTGGAGAATGATTTTAAT
GCCAACGGTAAGGTTTTTAATGGCATCAATTCAGAGATTAGCAAAGCATTTACTGATGGTGCTTTGCATGAGTCCCAGGTTTTATTATTCTCGCCTATTCAAGACATTCC
TTCGGGTTTGAAGTGCTCTAATGCAGTGGGCTTGGAACCAAATGAACCGTTTGTTCCTAAGGCTTTAAAGAAGAAATATGAATCATTTCCTCTTCATTATTCTCGAAGGA
AATATGAAAAGTCAGAAATTTTGGACTCAATTCCCATTAATTCCAATTATAACCCTGATGTTATTGAAGAATCTTGTTCTCAATCTTTACTTCCTGCTTTGAATCAGTCT
AGATGCTGCCAAACTAATCTTAATGAGTTATCAAATTCCACATCATCCAATCAGTATATTCTTTCAAACATTCAATCTGACCCTTCTTTAACAAAGGGAGTTTTTATTCC
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GCATCCTTTGAAACTATTGGAAAGAATCTTGGAGGGCTGATTGGTAATAAGCTCAAATTCTCTCTTCATTATGGTGATATTAACGCACTAGAGACTAGGAATTCAAAGTT
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