; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg039177 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg039177
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationscaffold10:41370314..41372497
RNA-Seq ExpressionSpg039177
SyntenySpg039177
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.0e-4795.05Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]2.0e-4796.04Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.7e-4795.05Show/hide
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XP_038884392.1 ribosomal protein S14, mitochondrial [Benincasa hispida]1.2e-4797.03Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein6.2e-4286.14Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial9.6e-4387.13Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S149.6e-4387.13Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067332.6e-4898.02Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449969.9e-4896.04Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.7e-3673.47Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.0e-3773.47Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial2.1e-3170.21Show/hide
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        I DH RR L AK+ELKR  YKAIC D +LPN +R E  +KLSKLPRNSS TR+RNRCIFTGRPR+VY+LFR+SRIVFR+LASKG ++G+ KS W
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.8e-2056.52Show/hide
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        D  RR+L  K+E KR LYKA+ +D +L  D+R     KL+KLPRNSS  R++NRCI TGR  +VY+  R+SRI FRDLA++GLI G  KSSW
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.2e-3470.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S146.6e-3671.13Show/hide
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S142.6e-0840Show/hide
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        R++L  K+ L +R   K I   PSL    + +   KL   PRNS+ TRL  RC  TGRPRA Y+ F +S  + R++    L+ G  +SSW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGCTCTCTTCCATCGCCCTCACTTTTCTCTGGTCGAACGGAATGTCGGAGGACAAGCGGAACATTCTTGACCACTATCGCCGACAGCTTGCTGCGAAGTTTGAGTT
GAAGCGGAAGCTCTACAAAGCCATTTGCAATGATCCGAGTCTTCCCAATGATGTGCGTGAAGAGCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCCAGAAATAGTTCGTTCACTC
GACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACTGGTCGACCTAGGGCTGTCTACCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATTGTCTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGT
GTCAAGAAATCTTCTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGCTCTCTTCCATCGCCCTCACTTTTCTCTGGTCGAACGGAATGTCGGAGGACAAGCGGAACATTCTTGACCACTATCGCCGACAGCTTGCTGCGAAGTTTGAGTT
GAAGCGGAAGCTCTACAAAGCCATTTGCAATGATCCGAGTCTTCCCAATGATGTGCGTGAAGAGCAGCGTTATAAGCTGTCGAAGTTGCCCAGAAATAGTTCGTTCACTC
GACTGAGGAATCGCTGCATTTTCACTGGTCGACCTAGGGCTGTCTACCAGCTTTTCCGTGTTTCTCGTATTGTCTTCCGTGATCTGGCGTCCAAAGGTCTTATAATGGGT
GTCAAGAAATCTTCTTGGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VKKSSW