CuGenDBv2

Gene ID	Spg039242
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Chlorophyll A-B binding protein
Genome location	scaffold10:42364767..42365321
RNA-Seq Expression	Spg039242
Synteny	Spg039242
Gene Ontology terms	GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]

1.1e-79

88.65

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKSHKP+ LTF+TRAADPES  +D E PG DGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAI+LIQ+YFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

XP_008463533.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103501667 [Cucumis melo]

3.2e-79

88.11

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKSHKP+ LTF+TRAADPES  +D E PG DGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAI+LIQ+YFVAAV A+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

XP_022133568.1 uncharacterized protein LOC111006119 [Momordica charantia]

1.4e-82

88.71

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL   SNSK HK KPLTFVTRAADPE+PAADPEPG DGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAI+LIQ+YFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

XP_023550096.1 uncharacterized protein LOC111808391 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.8e-80

89.67

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSLA  SNSK HKPK LTFVTRAADPESPAAD EP  DGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGSTAAASSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAI+LIQ+YFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]

1.5e-81

91.85

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSL L       KPK LTFVTRAADPESPAAD E G DGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAA SSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAI+LIQ+YFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KS45 Uncharacterized protein

1.6e-79

88.65

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSK  KPK LTF+TRAADPESPA D E PG DGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GST AASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAI+LIQ+YFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC103501667

1.6e-79

88.11

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKSHKP+ LTF+TRAADPES  +D E PG DGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAI+LIQ+YFVAAV A+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein

5.3e-80

88.65

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL L SNSKSHKP+ LTF+TRAADPES  +D E PG DGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPE-PGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAI+LIQ+YFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC111006119

6.8e-83

88.71

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL   SNSK HK KPLTFVTRAADPE+PAADPEPG DGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAI+LIQ+YFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

A0A6J1JUJ1 uncharacterized protein LOC111489022

3.5e-79

89.13

Show/hide

Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSLAL SNSK HKPK LTFV RAADPESPAAD EP  DGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGSTAAASSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+ ALVLVELATGKGVINYHTPAI+LIQ YFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G12345.1 unknown protein

3.1e-48

64.19

Show/hide

Query:  TRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISAL
        T    P+      E G D D FE RL+ +RLRYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPV LKEAVSGGLKVE GFSP+SERING IA LG++AL
Subjt:  TRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISAL

Query:  VLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD
        +LVELATGK V+NYHTP++V +Q+YFVAAV+A+++K EKEKVSVWP D
Subjt:  VLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCTCTGCAATTCCCAAATTCTCTCGCACTCATTTCCAATTCAAAGTCTCACAAGCCGAAGCCACTCACCTTCGTAACCAGAGCAGCAGA
TCCGGAATCCCCTGCCGCCGATCCAGAGCCTGGACCGGACGGTGACGACTTCGAGGACCGACTGGCTAAGGTCCGACTCCGATACCGAAGCGGAACCGGAAAGAAGGCAG
AAATACGGAAGGCAAGGAAGTCCAAGAAAGGATCCACCGCCGCCGCGTCCTCGGTGTACCTCCCGCCGGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTCTCCGGCGGCCTGAAGGTGGAA
TTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATCAATGGATGGATTGCGATCCTCGGAATATCGGCTCTGGTTCTGGTGGAATTGGCCACCGGAAAAGGCGTCATCAATTACCA
CACGCCGGCGATTGTACTGATTCAGATGTATTTTGTAGCGGCGGTTGCTGCTCTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCCGGATGAAATTAAGA
ATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAAIPSSSLQFPNSLALISNSKSHKPKPLTFVTRAADPESPAADPEPGPDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVE
FGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIVLIQMYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN

Spg039242 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome