; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg039489 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg039489
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionProtein of unknown function (DUF1997)
Genome locationscaffold10:41499548..41502948
RNA-Seq ExpressionSpg039489
SyntenySpg039489
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR018971 - Protein of unknown function DUF1997


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578788.1 hypothetical protein SDJN03_23236, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.9e-10574.58Show/hide
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XP_022939661.1 uncharacterized protein LOC111445487 isoform X1 [Cucurbita moschata]1.3e-10574.92Show/hide
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XP_022939662.1 uncharacterized protein LOC111445487 isoform X2 [Cucurbita moschata]1.8e-10775.17Show/hide
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XP_022992978.1 uncharacterized protein LOC111489142 isoform X2 [Cucurbita maxima]9.1e-10774.5Show/hide
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XP_038883978.1 uncharacterized protein SYNPCC7002_A1590 isoform X1 [Benincasa hispida]5.7e-10974.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPW1 Uncharacterized protein2.0e-10472.15Show/hide
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A0A6J1FGJ8 uncharacterized protein LOC111445487 isoform X16.3e-10674.92Show/hide
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A0A6J1FHF9 uncharacterized protein LOC111445487 isoform X28.9e-10875.17Show/hide
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A0A6J1JRG4 uncharacterized protein LOC111489142 isoform X13.1e-10574.24Show/hide
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A0A6J1K0U6 uncharacterized protein LOC111489142 isoform X24.4e-10774.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G31115.1 Protein of unknown function (DUF1997)4.8e-1326.34Show/hide
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AT4G31115.2 Protein of unknown function (DUF1997)4.8e-1326.34Show/hide
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AT5G04440.1 Protein of unknown function (DUF1997)1.6e-7755.27Show/hide
Query:  SNALMALSSCSPSS--ISLPCRSPRTSFSLTHRSYVIASSAEDSTRPS----------LRISANSNPKARFVARRSESVTVRQLARPLSNGILCLDDADE
        S+A + L+S S S+   +   R+P  SF++T      +SS ++S +PS          +R+S++S PKARF+AR+ +SV+VRQL RPL           E
Subjt:  SNALMALSSCSPSS--ISLPCRSPRTSFSLTHRSYVIASSAEDSTRPS----------LRISANSNPKARFVARRSESVTVRQLARPLSNGILCLDDADE

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        YMSLPASQYSVLDAERIERVDD+TFRCYVY FKFF FEVCPVL+VRVE QPNGCCIKLLSCK              LEGSP+VVAQNDKFD         
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                               A MVN+VS D  +  S  Q++TSD VIEVNIEIPFAFR  PV AIE+ GTQVL+QILK+MLPRF +QL KDY AWAS
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Query:  GDTSRQPLGTGEI
        GDTSRQPLGTGEI
Subjt:  GDTSRQPLGTGEI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTATGTATTCTCGACCCTGGGATCAGCAATGCAATCCTAGAAAACCGCTGTGGCATTTTCCCACTGTCTTATCCTCCTCTGCTTCTTACTGTCTTCACTGAAAGCCT
CAAACATCAGTATCCATTCCAATTCTTCTCTGCAAAATCCTCCAACGCTTTAATGGCGTTGAGTTCTTGCTCTCCGAGCTCCATTTCACTGCCCTGCAGAAGCCCTAGAA
CTTCGTTTTCTCTCACGCACAGATCGTATGTCATCGCTTCCTCTGCTGAAGATTCTACCAGGCCTTCGCTTCGAATCTCCGCGAATTCGAATCCAAAAGCGCGCTTCGTT
GCCCGGAGGAGCGAGTCCGTCACGGTCCGGCAGCTGGCACGGCCTCTAAGTAATGGAATTTTGTGTTTGGATGATGCAGATGAGTATATGAGTTTGCCGGCGAGTCAGTA
CTCGGTGTTGGATGCGGAGAGGATTGAGCGGGTTGATGATAGCACTTTTAGGTGCTATGTTTATAGATTTAAGTTCTTTGCTTTTGAGGTTTGCCCTGTTTTGATTGTTA
GAGTTGAAGTGCAGCCCAATGGGTGTTGCATCAAGCTGCTGTCGTGTAAGGTTTGGAAAATTTTGCGTTTCTGTTTGCTCTCGCTCTCGTTCCTTGAGGGCTCGCCAATC
GTAGTTGCACAGAATGATAAATTCGACGACAACCGCTTGACACTAGTACATTTGGTTGCAAAAGAAACTTATATGATATTAAATCCTAGGACTGCTTTGACATTGATTTG
GTGTCGGAATGCAGCTTATATGGTGAACCAGGTTTCTTATGATGTCGATCGAGGCAACTCACCCTTGCAGAAACTCACATCGGATACTGTCATTGAGGTTAACATTGAGA
TTCCTTTCGCCTTCCGTGCAATTCCTGTACAAGCAATTGAATCAGCTGGGACCCAAGTCCTGGAACAAATACTGAAAATTATGCTTCCCCGCTTCACAGCCCAGCTTGTG
AAGGACTATCAAGCATGGGCCTCCGGTGATACATCAAGGCAACCTCTTGGGACAGGTGAGATCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTATGTATTCTCGACCCTGGGATCAGCAATGCAATCCTAGAAAACCGCTGTGGCATTTTCCCACTGTCTTATCCTCCTCTGCTTCTTACTGTCTTCACTGAAAGCCT
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CTCGGTGTTGGATGCGGAGAGGATTGAGCGGGTTGATGATAGCACTTTTAGGTGCTATGTTTATAGATTTAAGTTCTTTGCTTTTGAGGTTTGCCCTGTTTTGATTGTTA
GAGTTGAAGTGCAGCCCAATGGGTGTTGCATCAAGCTGCTGTCGTGTAAGGTTTGGAAAATTTTGCGTTTCTGTTTGCTCTCGCTCTCGTTCCTTGAGGGCTCGCCAATC
GTAGTTGCACAGAATGATAAATTCGACGACAACCGCTTGACACTAGTACATTTGGTTGCAAAAGAAACTTATATGATATTAAATCCTAGGACTGCTTTGACATTGATTTG
GTGTCGGAATGCAGCTTATATGGTGAACCAGGTTTCTTATGATGTCGATCGAGGCAACTCACCCTTGCAGAAACTCACATCGGATACTGTCATTGAGGTTAACATTGAGA
TTCCTTTCGCCTTCCGTGCAATTCCTGTACAAGCAATTGAATCAGCTGGGACCCAAGTCCTGGAACAAATACTGAAAATTATGCTTCCCCGCTTCACAGCCCAGCTTGTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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