; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg039648 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg039648
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionDUF4283 domain-containing protein
Genome locationscaffold10:47068937..47082120
RNA-Seq ExpressionSpg039648
SyntenySpg039648
Gene Ontology termsGO:0006281 - DNA repair (biological process)
GO:0090305 - nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis (biological process)
GO:0004518 - nuclease activity (molecular function)
InterPro domainsIPR004808 - AP endonuclease 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0063088.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold623G00050 [Cucumis melo var. makuwa]1.5e-2365.85Show/hide
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TYJ98683.1 hypothetical protein E5676_scaffold429G00120 [Cucumis melo var. makuwa]5.6e-2660.78Show/hide
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TYJ98837.1 putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X5 [Cucumis melo var. makuwa]6.4e-2246.22Show/hide
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        GKW   G+ HLKI+RW N KH  P + + YGG + IKNLPL YW R   E IG HF GL  I+ +TLNL + S A I+V++N+C F+P+ I++     RN
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          L FGD   L+ +G  ++
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XP_038876676.1 uncharacterized protein LOC120069076 [Benincasa hispida]1.9e-2164.63Show/hide
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XP_038904899.1 uncharacterized protein LOC120091119 isoform X2 [Benincasa hispida]1.3e-2740.54Show/hide
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        +N  GKW   G  HLK +RW+N  H  P  ++ YGG ISIKNLPL YW +  FEAIG++FGGL  I+ + LNLI    A+I+V+EN+C F+PA I+V   
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           +  L FGDI   +   + +   G L   DFTN +DL R+N+V   E ++   L  K + + +    I+ S++P ++  N  S
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TTX5 Uncharacterized protein2.6e-2151.58Show/hide
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        LIK+LWS  +IG  F+E+ G+S G+L MWDES++SV E +KG + LS+KC T+CKK CW++NVYGP  ++ER+ +WLEL   + L L     +KL
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A0A5A7V639 Uncharacterized protein7.4e-2465.85Show/hide
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A0A5D3BHE3 Uncharacterized protein2.7e-2660.78Show/hide
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        P HL+    N QG+  +  LIKSLWSSK+IGW  VE++G+  G+L MWD SK+ V+E LKGGY+LSI  +T CKK CW+TNVYGP DY+ERRF+WL L S
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Query:  LS
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A0A5D3BI91 Putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X53.1e-2246.22Show/hide
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          L FGD   L+ +G  ++
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A0A5D3E3A5 Ulp1-like peptidase4.2e-1931.15Show/hide
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        G+    +  S  GW L+     F G    VHV +   K  +    +S +  +    HE +  +S +  F  R  R  + L S++ +    L +  S + +
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           LE+ F+  I+INPF D++A  + + G  +  +    KW   G  HL  ++W    H  P  I+ + G +SIKNLPL  W+R  FE IG HFGGL   
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        +  TLNLI C+ A I+V +N+       + V G   R F++  G
Subjt:  SSQTLNLIDCSAAVIEVEENICDFIPAEIDVKGGNIRNFSLCFG

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATGGTTCTTTGAATGTGCGGTATGGCCTTCCACGGGTGGGAGAAGATAAAATTTCCAAAGGTCATGTTTCTCCTAATTCTTATGTTGAAGTTGTTAGGCGTGGTGT
TTTGATGAAGAAATCATTCTCCTTGGAAAATTCAGTTAGAAATGATAAGTTTGTTAATAAGGAAGCTTACTGGGTTCAAAAGAACTGGGATGTGCTGAAAATAGATTTGG
AAAGCTCTCTTGTTGTTTCTAGATTGATGGCCCATGATTCTTGGAAGGAGGTTAAGCTTGTCCTTGAGGATTTCTTCAAATCTTCAGTCTTGATCAATCCTTTTATGGAT
GATAAAACTTTGATTCAGGTGGCTGATTGTAGTTTGGATCCTTCTGTGAATGCTATTGGAAAAAACCTTGGTGGGTTGGTTAGTATTTCTTCCAAGACTCTCAATTTATT
GGACTGTTCGGAAGCTTTTATTGAAGTAGAAATTTTTTTTTGTGGATTTATCCCGGCTAATATTCATGTTAAGATTGGCAATAAGTGTGAATTTTCTTTAAGATTTGGGG
ATATTAAGGCACTAGATGATAGAAATTTGAATTTTGATTCAAGTAGAAAGTTATCCGTTGATGACTTTTCAAATTCCTTAGACGTTACTAGGATCAGGCAAGCTGTTTTG
GATGATAATTTGATTCTGGACAATGAAGAGGAAAGGATGAATGAAGTTCCTTCTTGTTCTCGGTCTCAGGGAAAAATTAATGAGGTGTTGGGTTCTCCAAAGGGTGCTTT
GTTGCATGAAGAGGGCATTAATAACATTGGTTGTATGGGCTTTAATGATAGCACTCAAGAGATGGATCCTATTCTCTCTCCTTTTAATGTTATTTATGATAATATTTCCA
CCAGCCCTAAGGAATTCCAGCAGCCACTGTCTATTGATTATTCTCCTAAAAATATTAATGCTAGCATTGGAAAAGTGGGTAATCAACCAGCAGCTTTCGTAAGTATTATT
AATAGCATTGAAAATGTTTATTCTCCTAAAAATATTAATGCTGGCATTGGAAAAGTGGGTAATCAGCCAGCAGCTTCCGAAAGTGTTATTAATAGCATTGAAAATGAGTG
TATCCAGCAGGCAGCTTTAAAGACTTACTCTCGGAAAAAGGGGTCTCGGTTATTGGTTGAAAAGGCCAATATTAATGCTGATCATTTGGAATCTGAATGTACTAATATGA
TTATTTCAAATAAGGCATTGGGATTCTCCAAAACAGTGGTGAAAATAGACTTTCCAAGGCATTTATTGAATCGTCTGTGCAATTTCCAGGGGAAACCAAACAATCGAAAA
TTGATTAAATCTTTATGGAGTTCAAAGGAAATTGGATGGACTTTTGTGGAAGCTTATGGGAAATCAAGAGGTCTTCTTATTATGTGGGATGAGAGCAAATTATCAGTGCT
GGAATTCTTAAAGGGTGGTTATACTCTTTCAATTAAATGTCTTACTCTTTGTAAAAAAGTTTGTTGGGTCACCAATGTTTATGGTCCGAATGACTACAAGGAAAGGAGAT
TCTTATGGCTTGAATTGCGTTCCCTCTCTCTCTTACTATTGCACGGATCCATGTCCAAGAAATTAATGGAATCCTCCCTTCAGAGTCCAAGGGTAATAGACCTTTTAAAA
GAGGCGTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCTTTTTTGCATGAAGAGTGTATTAATAACGCTGTCTGTAAAGATATTAATGGGGAAATTAATGAGGTTTTGGGTTCTCCAAAGGG
TGCTTTGATGCATGAAGAGGGCATTAATATCGATGGTTGTATGAGCTTTAATGATTGCATTCAAGAGATGGATCCCATTCTCTCTCCTTCTAATGTTATTAATGATCATA
TTTGTTTTAGCCCTAAGGAAGTCCAGCTGCTGTTGTCTTTTGTTTCTCCTCCCAAAGATATTAAGGGGGTGTTTGGGGCAATGAGCTGTGAAGTTGGAGTTGGTTACTAT
ATTCGGAAAGTTTCAGCCATTACTTGGATACTCCGTCTGAAGCTCGTCTCAAAGCTTTGTTATGGAGTCCGTTGTCCAAGATTTATTCAACCTTCTCTATTCAGAATATT
TGCCTTACTTGAGATCAATGTTTTAAAAGGCATTAAAGGCGTAAGCCTTGAGGCGCGCCTTGAGATTCTCACATTTGGTCCCTTGAGAATTCGGGACTGTATTCGGTTAA
CATTTGTTCTTCGATTGCGTTTATTCCTATCAGTGTTGGGGGAAGCTATTGTCTATCTTCAAGCTTCAATGGGTTTTGTATGGGATCGTGCGCCTTTGAGTGTGTGGAAT
TTTGTGGACAAGTCTGGTCTAGGAGAGCTTGCCCAACGCTCTCGAATGGCTGGGGTCATTCATCACCGTCGTCCAGTCTTCATTCTCCGTCGTCTTTCCTCCGTCGTTCG
CCGTTCGCTTTCTTTGCTACTTTTCGCCGGTTTTTTAGCCGTTTTCTTCCGTCGTCGCGTTGGTTCGTTTTCAGTCGTCATTTTGTTCGTCGTCAGTCGTCCGTTGTCTT
TCCTCCGTCGTTTGGTTCGTTTTCAGTCCAGTGTCGCTGTGTTTTCATCTGCCGTCAGTCTGGTCTGTTCACCGTCATTCATCCGTCGGTCCGATTTTCTCGTCAAAACG
TTCGATAACTACTTGATATTCGTGGTTTTCTTTGGATTGTGGTTGAGTTCTAGTTTATGGTTCTATGGAAGTGCTGGAAGAGATGAGTTGTTATCTGTTGAGGGTTGGCA
TTTGAAAAGCGCAGTATGGCCTTTTTATGGAGGAAGGAAGAATGTTCATGTTCCTGCGAGTTTTGATAAGATAGAGTTTTCTGAGTTGGATTTATCCGATCGAACTGAGA
AAGTTGATACGCCTCATGAAGATGTGGTGAAATCCTCTGAGATTTCCTCCTTTTGGGTAAGGAAAGAGAGAGAAGTTATGGATTTGAATTCCAATTCCATTCTCGTGGTT
TCTAGGTTGTTTGCTCATTACTCCTGGAAAGATGTTCAAATCGCTTTAGAAAATCATTTTCAAAATGGAATTTCAATTAATCCTTTTATGGATGATAAAGCGTTGATTAG
GTTTGATGTGGGTCTTTCTGATTTGAATTTTGATGGAAAGTGGAGTCTTGTTGGTGACCTTCATCTGAAAATTAAGCGTTGGTCCAATGAAAAGCATTTTCACCCGGAAA
TCATCCAGAGTTATGGAGGTCGGATATCTATAAAGAATTTGCCTTTGATTTATTGGAAACGACCATGTTTTGAAGCTATTGGGCAGCATTTTGGTGGATTGATTATTATT
TCCTCTCAAACACTTAACTTAATTGATTGTTCAGCAGCAGTAATTGAAGTGGAGGAAAACATTTGTGACTTCATTCCAGCTGAGATTGATGTTAAAGGCGGGAACATCAG
AAATTTCTCTCTCTGTTTTGGTGACATAGTTCCTCTTGACCTTTCAGGTGAGTGTCGTTTGAATTTTGGAATTTTATCCTCACAAGATTTTACTAATTCAGTGGATTTAA
AGAGGGTTAATAAGGTTCTGGAAGATGAAAGTCTCTTTTTACCACACAAAGATGATTTGGTAATGGCTATTGAGGATTCAAAGACCCCTTCGTTGTATGACAAGAATCTT
AATTCAAATGGTCCTTCTTTGGATGGGCATGCAAATGTTAACTCCCTTGAGCTGGTGTCTCCTTGCTATCGAAACAAAGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATGGTTCTTTGAATGTGCGGTATGGCCTTCCACGGGTGGGAGAAGATAAAATTTCCAAAGGTCATGTTTCTCCTAATTCTTATGTTGAAGTTGTTAGGCGTGGTGT
TTTGATGAAGAAATCATTCTCCTTGGAAAATTCAGTTAGAAATGATAAGTTTGTTAATAAGGAAGCTTACTGGGTTCAAAAGAACTGGGATGTGCTGAAAATAGATTTGG
AAAGCTCTCTTGTTGTTTCTAGATTGATGGCCCATGATTCTTGGAAGGAGGTTAAGCTTGTCCTTGAGGATTTCTTCAAATCTTCAGTCTTGATCAATCCTTTTATGGAT
GATAAAACTTTGATTCAGGTGGCTGATTGTAGTTTGGATCCTTCTGTGAATGCTATTGGAAAAAACCTTGGTGGGTTGGTTAGTATTTCTTCCAAGACTCTCAATTTATT
GGACTGTTCGGAAGCTTTTATTGAAGTAGAAATTTTTTTTTGTGGATTTATCCCGGCTAATATTCATGTTAAGATTGGCAATAAGTGTGAATTTTCTTTAAGATTTGGGG
ATATTAAGGCACTAGATGATAGAAATTTGAATTTTGATTCAAGTAGAAAGTTATCCGTTGATGACTTTTCAAATTCCTTAGACGTTACTAGGATCAGGCAAGCTGTTTTG
GATGATAATTTGATTCTGGACAATGAAGAGGAAAGGATGAATGAAGTTCCTTCTTGTTCTCGGTCTCAGGGAAAAATTAATGAGGTGTTGGGTTCTCCAAAGGGTGCTTT
GTTGCATGAAGAGGGCATTAATAACATTGGTTGTATGGGCTTTAATGATAGCACTCAAGAGATGGATCCTATTCTCTCTCCTTTTAATGTTATTTATGATAATATTTCCA
CCAGCCCTAAGGAATTCCAGCAGCCACTGTCTATTGATTATTCTCCTAAAAATATTAATGCTAGCATTGGAAAAGTGGGTAATCAACCAGCAGCTTTCGTAAGTATTATT
AATAGCATTGAAAATGTTTATTCTCCTAAAAATATTAATGCTGGCATTGGAAAAGTGGGTAATCAGCCAGCAGCTTCCGAAAGTGTTATTAATAGCATTGAAAATGAGTG
TATCCAGCAGGCAGCTTTAAAGACTTACTCTCGGAAAAAGGGGTCTCGGTTATTGGTTGAAAAGGCCAATATTAATGCTGATCATTTGGAATCTGAATGTACTAATATGA
TTATTTCAAATAAGGCATTGGGATTCTCCAAAACAGTGGTGAAAATAGACTTTCCAAGGCATTTATTGAATCGTCTGTGCAATTTCCAGGGGAAACCAAACAATCGAAAA
TTGATTAAATCTTTATGGAGTTCAAAGGAAATTGGATGGACTTTTGTGGAAGCTTATGGGAAATCAAGAGGTCTTCTTATTATGTGGGATGAGAGCAAATTATCAGTGCT
GGAATTCTTAAAGGGTGGTTATACTCTTTCAATTAAATGTCTTACTCTTTGTAAAAAAGTTTGTTGGGTCACCAATGTTTATGGTCCGAATGACTACAAGGAAAGGAGAT
TCTTATGGCTTGAATTGCGTTCCCTCTCTCTCTTACTATTGCACGGATCCATGTCCAAGAAATTAATGGAATCCTCCCTTCAGAGTCCAAGGGTAATAGACCTTTTAAAA
GAGGCGTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCTTTTTTGCATGAAGAGTGTATTAATAACGCTGTCTGTAAAGATATTAATGGGGAAATTAATGAGGTTTTGGGTTCTCCAAAGGG
TGCTTTGATGCATGAAGAGGGCATTAATATCGATGGTTGTATGAGCTTTAATGATTGCATTCAAGAGATGGATCCCATTCTCTCTCCTTCTAATGTTATTAATGATCATA
TTTGTTTTAGCCCTAAGGAAGTCCAGCTGCTGTTGTCTTTTGTTTCTCCTCCCAAAGATATTAAGGGGGTGTTTGGGGCAATGAGCTGTGAAGTTGGAGTTGGTTACTAT
ATTCGGAAAGTTTCAGCCATTACTTGGATACTCCGTCTGAAGCTCGTCTCAAAGCTTTGTTATGGAGTCCGTTGTCCAAGATTTATTCAACCTTCTCTATTCAGAATATT
TGCCTTACTTGAGATCAATGTTTTAAAAGGCATTAAAGGCGTAAGCCTTGAGGCGCGCCTTGAGATTCTCACATTTGGTCCCTTGAGAATTCGGGACTGTATTCGGTTAA
CATTTGTTCTTCGATTGCGTTTATTCCTATCAGTGTTGGGGGAAGCTATTGTCTATCTTCAAGCTTCAATGGGTTTTGTATGGGATCGTGCGCCTTTGAGTGTGTGGAAT
TTTGTGGACAAGTCTGGTCTAGGAGAGCTTGCCCAACGCTCTCGAATGGCTGGGGTCATTCATCACCGTCGTCCAGTCTTCATTCTCCGTCGTCTTTCCTCCGTCGTTCG
CCGTTCGCTTTCTTTGCTACTTTTCGCCGGTTTTTTAGCCGTTTTCTTCCGTCGTCGCGTTGGTTCGTTTTCAGTCGTCATTTTGTTCGTCGTCAGTCGTCCGTTGTCTT
TCCTCCGTCGTTTGGTTCGTTTTCAGTCCAGTGTCGCTGTGTTTTCATCTGCCGTCAGTCTGGTCTGTTCACCGTCATTCATCCGTCGGTCCGATTTTCTCGTCAAAACG
TTCGATAACTACTTGATATTCGTGGTTTTCTTTGGATTGTGGTTGAGTTCTAGTTTATGGTTCTATGGAAGTGCTGGAAGAGATGAGTTGTTATCTGTTGAGGGTTGGCA
TTTGAAAAGCGCAGTATGGCCTTTTTATGGAGGAAGGAAGAATGTTCATGTTCCTGCGAGTTTTGATAAGATAGAGTTTTCTGAGTTGGATTTATCCGATCGAACTGAGA
AAGTTGATACGCCTCATGAAGATGTGGTGAAATCCTCTGAGATTTCCTCCTTTTGGGTAAGGAAAGAGAGAGAAGTTATGGATTTGAATTCCAATTCCATTCTCGTGGTT
TCTAGGTTGTTTGCTCATTACTCCTGGAAAGATGTTCAAATCGCTTTAGAAAATCATTTTCAAAATGGAATTTCAATTAATCCTTTTATGGATGATAAAGCGTTGATTAG
GTTTGATGTGGGTCTTTCTGATTTGAATTTTGATGGAAAGTGGAGTCTTGTTGGTGACCTTCATCTGAAAATTAAGCGTTGGTCCAATGAAAAGCATTTTCACCCGGAAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNGSLNVRYGLPRVGEDKISKGHVSPNSYVEVVRRGVLMKKSFSLENSVRNDKFVNKEAYWVQKNWDVLKIDLESSLVVSRLMAHDSWKEVKLVLEDFFKSSVLINPFMD
DKTLIQVADCSLDPSVNAIGKNLGGLVSISSKTLNLLDCSEAFIEVEIFFCGFIPANIHVKIGNKCEFSLRFGDIKALDDRNLNFDSSRKLSVDDFSNSLDVTRIRQAVL
DDNLILDNEEERMNEVPSCSRSQGKINEVLGSPKGALLHEEGINNIGCMGFNDSTQEMDPILSPFNVIYDNISTSPKEFQQPLSIDYSPKNINASIGKVGNQPAAFVSII
NSIENVYSPKNINAGIGKVGNQPAASESVINSIENECIQQAALKTYSRKKGSRLLVEKANINADHLESECTNMIISNKALGFSKTVVKIDFPRHLLNRLCNFQGKPNNRK
LIKSLWSSKEIGWTFVEAYGKSRGLLIMWDESKLSVLEFLKGGYTLSIKCLTLCKKVCWVTNVYGPNDYKERRFLWLELRSLSLLLLHGSMSKKLMESSLQSPRVIDLLK
EALGSPKGAFLHEECINNAVCKDINGEINEVLGSPKGALMHEEGINIDGCMSFNDCIQEMDPILSPSNVINDHICFSPKEVQLLLSFVSPPKDIKGVFGAMSCEVGVGYY
IRKVSAITWILRLKLVSKLCYGVRCPRFIQPSLFRIFALLEINVLKGIKGVSLEARLEILTFGPLRIRDCIRLTFVLRLRLFLSVLGEAIVYLQASMGFVWDRAPLSVWN
FVDKSGLGELAQRSRMAGVIHHRRPVFILRRLSSVVRRSLSLLLFAGFLAVFFRRRVGSFSVVILFVVSRPLSFLRRLVRFQSSVAVFSSAVSLVCSPSFIRRSDFLVKT
FDNYLIFVVFFGLWLSSSLWFYGSAGRDELLSVEGWHLKSAVWPFYGGRKNVHVPASFDKIEFSELDLSDRTEKVDTPHEDVVKSSEISSFWVRKEREVMDLNSNSILVV
SRLFAHYSWKDVQIALENHFQNGISINPFMDDKALIRFDVGLSDLNFDGKWSLVGDLHLKIKRWSNEKHFHPEIIQSYGGRISIKNLPLIYWKRPCFEAIGQHFGGLIII
SSQTLNLIDCSAAVIEVEENICDFIPAEIDVKGGNIRNFSLCFGDIVPLDLSGECRLNFGILSSQDFTNSVDLKRVNKVLEDESLFLPHKDDLVMAIEDSKTPSLYDKNL
NSNGPSLDGHANVNSLELVSPCYRNKV