; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg039713 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg039713
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationscaffold10:45590877..45595253
RNA-Seq ExpressionSpg039713
SyntenySpg039713
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8646577.1 hypothetical protein Csa_005771 [Cucumis sativus]1.5e-8885.09Show/hide
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XP_011656432.1 putative protein TPRXL [Cucumis sativus]3.8e-8985.15Show/hide
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XP_016901982.1 PREDICTED: putative uncharacterized protein DDB_G0277255 [Cucumis melo]1.5e-8884.78Show/hide
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XP_022134140.1 putative protein TPRXL [Momordica charantia]6.8e-7877.63Show/hide
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XP_038885974.1 putative protein TPRXL [Benincasa hispida]5.9e-9085.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K7T8 Uncharacterized protein1.9e-8985.15Show/hide
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A0A1S4E178 Uncharacterized protein7.1e-8984.78Show/hide
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A0A5A7UC51 Putative serine-rich protein7.1e-8984.78Show/hide
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A0A6J1BX95 Uncharacterized protein3.3e-7877.63Show/hide
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        SSIFPRL PR+SR S S SFSS +S SSS +SWSSSRSSS SSP    +  FFKRRR   D+PSLPFE++FDD DGDE  GSSNSPTSTLCFGG+SS  +
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A0A6J1HHB7 uncharacterized protein LOC1114629254.7e-7773.89Show/hide
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        MQ+ NYDQ+SQK L+IKHED  F +R +SK+PNSAANSSFRVYYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSETSIPPLTPPPSYYSS SHST K+SSKPTLLSS
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Query:  IFPRLTPRKSRTSSSFSFSSGSSSSSSLASWSSSRSSSCSSPSPFVRPKFFKRRRR-SLDSPSLPFEHNFDDNDGDEAVGSSNSPTSTLCFGGSSSRASL
        IFPR T                     L+S+S+S SSSCSSPSPFVRPKFFKRRRR SLDS SLP E+N +DNDG+EA+GSSNSPTSTL +GG S R S 
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         GGCYQLVSVKNALL+IVGHGS +RG
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein3.9e-0738.76Show/hide
Query:  YYGGAAGAIPFRWESRPGTPK-----------HTFSETSIP---PLTPPPSYYSSSHSTSKSSSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTSSSFSFSSGSSSSSSLA
        YYGG++ A+PF+WES+PGTP+           ++ S+ + P   PLTPPPSY+ +S S++K              ++P+K+ T  S   S   S  SS A
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Query:  SWSSSRSSSCSSPSPFVRPKFFKRRRRSL
          SSS SSS S PS  +R      RRRS+
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AT2G40475.1 unknown protein6.4e-1840.28Show/hide
Query:  KPLQIKHEDGFFTRALSKEPNSAANSSFRVYYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHT-FSET-SIPPLTPPPSYYSSSHSTSKSSSKP-TLLSSIFPRLTPRKS
        K +     +G  +  +  + +S  NSS R+YY G A ++PF WE+RPGTPKH  FSE+  +PPLTPPPSYYSSS S+    SK  T+  + F +    + 
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Query:  RTSSSFSFSSGSSSSSSLASWSSSRSSSCSSPSPFVRPKFFKRRRRSLDSPSLPFEHNFDDNDGDEAVGSSNSPTSTLCF--GGSSSRASLFGGCYQLVS
         +  SFS+SS SSSS          SSS SS SP   P   + R R   S S  +     ++D +E V  S+SPTSTLC+  G SSS  S+         
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Query:  VKNALLSIVGHGSASR
         K AL S++ HGS+ +
Subjt:  VKNALLSIVGHGSASR

AT3G56260.2 unknown protein3.2e-0940.11Show/hide
Query:  EPNSAANSSFRVYYGGAAGAIPFRWESRPGTPK-HTFSETSIP-PLTPPPSYYSSS-HSTSKSSSKPTLLSSIFPRLTPRKSRTSSSFSFSSGSSSSSSL
        E + A +     YYGGA  +IPF WESRPGTPK H  S++S+P PLTPPPSYYSS   ST ++ SK     S F   +       S+      +SSS   
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Query:  ASWSSSRSSSCSSPSPFVRPKFFKRRRRSLDSPSLPFEHNFDDNDGDEAVGSSNSPTSTLCFGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLS
         SWSS+ SSS  S SP   P   K +R S D  S     N+++++        +SPTSTLC     S     G    + SV  AL S
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AT5G01790.1 unknown protein9.0e-1261.29Show/hide
Query:  SAANSSFRV-YYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSE-TSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKSSSK
        SAA  SFR+ YY GAAGA+PF WES PGTPKH  SE  ++PPLTPPPS++S S    +  SK
Subjt:  SAANSSFRV-YYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSE-TSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKSSSK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAAGTGGAAACTACGACCAAATCTCTCAAAAACCCCTTCAAATCAAACATGAAGATGGATTCTTCACAAGGGCTCTATCCAAAGAGCCTAATTCCGCCGCCAACTC
TTCTTTTAGAGTCTACTACGGCGGCGCCGCCGGTGCAATTCCGTTCAGGTGGGAGTCCCGGCCGGGCACTCCAAAGCATACTTTTTCAGAAACTTCAATCCCTCCTCTTA
CTCCTCCTCCTTCTTACTATTCCTCTTCACATTCTACCTCCAAGTCCTCTTCCAAACCAACCCTTTTGAGCTCGATTTTTCCCCGGCTCACGCCGAGGAAATCTCGAACC
TCCTCGTCATTCTCCTTCTCCTCTGGCTCTTCCTCCTCTTCGTCCTTGGCGTCGTGGTCGTCCTCTCGCTCTTCGTCCTGCTCGTCGCCATCGCCTTTCGTGAGACCGAA
ATTCTTCAAGCGTCGTCGGCGCTCCTTGGATTCTCCGAGCCTGCCGTTCGAGCATAATTTCGACGACAACGACGGGGACGAGGCGGTGGGGAGCTCGAATTCTCCGACGT
CGACTTTGTGCTTTGGTGGCTCTTCAAGTAGAGCTTCATTATTCGGAGGTTGTTACCAGTTAGTGAGTGTGAAGAATGCTTTGTTGTCCATTGTTGGCCATGGATCTGCA
AGCCGAGGAACTCCAGAAGAAAGCAGCTTCGAACCCATTCCAAACCGGCCCACGAGGAGAAGGAAGCCCAAGAGGAGAGCTGCCCAACATTCTCCTCGGCCTCGGCCCAA
TGCCGAGGCCAACCAGGGTTCAAAGCCCAGCCACTACCTGGGTCAATGTGGAGGGTCCTCCAAGGCCCGGGAGGACGAGGTTCATGGGGCAGAAGTCAATCGACGACGAG
GAGAAGGGGAAAACCCTAATCTAAAGGAAGGTATAAAAGGTCCTCTTGGGACCCATGTTACGTCTTCCCCGTATTCAATAAATTCACTGTTGGTGTCACGTGAAGGTCAG
GTGAGTGCTTGGCCGGATTTTGCCATCAATAGATATAAATTTGAAAGTCGTGTAATGGAACTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAAGTGGAAACTACGACCAAATCTCTCAAAAACCCCTTCAAATCAAACATGAAGATGGATTCTTCACAAGGGCTCTATCCAAAGAGCCTAATTCCGCCGCCAACTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQSGNYDQISQKPLQIKHEDGFFTRALSKEPNSAANSSFRVYYGGAAGAIPFRWESRPGTPKHTFSETSIPPLTPPPSYYSSSHSTSKSSSKPTLLSSIFPRLTPRKSRT
SSSFSFSSGSSSSSSLASWSSSRSSSCSSPSPFVRPKFFKRRRRSLDSPSLPFEHNFDDNDGDEAVGSSNSPTSTLCFGGSSSRASLFGGCYQLVSVKNALLSIVGHGSA
SRGTPEESSFEPIPNRPTRRRKPKRRAAQHSPRPRPNAEANQGSKPSHYLGQCGGSSKAREDEVHGAEVNRRRGEGENPNLKEGIKGPLGTHVTSSPYSINSLLVSREGQ
VSAWPDFAINRYKFESRVMEL