; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Spg039753 (gene) of Sponge gourd (cylindrica) v1 genome

Gene IDSpg039753
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Descriptionthylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic
Genome locationscaffold10:46219205..46221321
RNA-Seq ExpressionSpg039753
SyntenySpg039753
Gene Ontology termsGO:0009534 - chloroplast thylakoid (cellular component)
InterPro domainsIPR001646 - Pentapeptide repeat
IPR044213 - Thylakoid lumenal 15kDa protein 1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602651.1 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-9782.92Show/hide
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XP_022991097.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X2 [Cucurbita maxima]6.9e-9883.33Show/hide
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XP_023552471.1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.6e-9783.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1BVJ8 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X13.7e-9783.33Show/hide
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A0A6J1GU31 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X12.8e-9783.33Show/hide
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A0A6J1GWM1 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X29.7e-9883.75Show/hide
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A0A6J1JKT4 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X23.3e-9883.33Show/hide
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A0A6J1JPS6 thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic isoform X19.7e-9882.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B1WVN5 Pentapeptide repeat protein Rfr321.1e-1037.84Show/hide
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        L G+DFSGK+L    F  + L  +NF  A L GA F  + L GADL  ADL      L +   A+L+NA L  A+    T F  + I GAD         
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                L + D  +V       + LC  ADGVNP TG +TRE+L C
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O22160 Thylakoid lumenal 15 kDa protein 1, chloroplastic2.3e-7267.52Show/hide
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        SL S +SR     H P+  S  +    +V+  PL   R +V S+GE  SK S  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDL+GKDFSG+TLI+QD
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        FKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GA                      DFT
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        DVPLR+DQR YLCKVADGVN TTGNATR+TLLCN
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P73709 Uncharacterized protein slr18194.4e-0738.05Show/hide
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        G DL G D SG TL         ++Q+ K        +IL +A+ +GA + G     ADL+ A+L +A+LR  D     + KA+LS ANL+GAL T + +
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Query:  FRGSTINGADVKN
          G+ +NGAD++N
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P74297 Serine/threonine-protein kinase B4.9e-0644Show/hide
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        +LT  +F    L + DF  + L+   FKGA L  A F  ADL GADL  A+L G +F  AN+  AN S A+L  A
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Q9SE95 FH protein interacting protein FIP22.9e-0636.89Show/hide
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        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A +
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Query:  KNV
        ++V
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12250.2 Pentapeptide repeat-containing protein3.0e-0628.22Show/hide
Query:  GPYGAGVTR---GQDLTGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATGNTSFRGS
        G +G G        DL+    S +   + +F ++ +R+++F G+   GA    A    A+ S ADL         + +ANL+NA L  ++ T  +   G+
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         I GA                      DF+D  +   Q++ LCK A G NP TG  TR++L C
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AT2G44920.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein8.2e-5770.79Show/hide
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        SL S +SR     H P+  S  +    +V+  PL   R +V S+GE  SK S  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDL+GKDFSG+TLI+QD
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        FKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLS+ADLRGADFSLANVTK NL+NANLEGA  TGNTSF+GS I GA  K
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AT2G44920.2 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.6e-7367.52Show/hide
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        SL S +SR     H P+  S  +    +V+  PL   R +V S+GE  SK S  AL+SASLF  DPALAFKGGGPYG GVTRGQDL+GKDFSG+TLI+QD
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        DVPLR+DQR YLCKVADGVN TTGNATR+TLLCN
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AT5G55000.1 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein2.0e-0736.89Show/hide
Query:  RGQDLTGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTINGADV
        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A +
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        ++V
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AT5G55000.2 potassium channel tetramerisation domain-containing protein / pentapeptide repeat-containing protein2.0e-0736.89Show/hide
Query:  RGQDLTGKDFSGKTLIKQDFKTSILRQANFKGAKLLGASFFDADLTGADLSDADLRGADFSLANVTKANLSNANLEGALATG----NTSFRGSTINGADV
        R  D  G  F    L + +F ++ LR A   G  L  A+  DA L G     ADLR A    A++T ANL  ANLEGA   G    N +F+G+ +  A +
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Query:  KNV
        ++V
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCTGCTCAACGCTTCATTATGTTCTTCCACTTCCAGAATTCCTCCCAGACTTCACCTTCCTCTTCCTCCCTCCGTTCCCGCCTCTTCTACCACTCAGGTACTCAA
GCAGCCATTGGAAGCTTCTCGGATTTTGGTTCTTTCCATTGGAGAATCCGCCTCCAAAGCCAGCTTCCTCGCTTTGCTTTCCGCCTCTTTGTTCCTCGCCGATCCTGCGC
TTGCTTTCAAGGGCGGAGGTCCTTACGGTGCTGGGGTCACTAGAGGCCAGGATCTCACTGGGAAAGATTTCAGTGGGAAGACGTTAATCAAGCAAGATTTCAAAACGTCT
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TTCTCTGGCCAATGTTACAAAGGCAAACTTAAGCAATGCCAACTTAGAAGGTGCACTCGCCACAGGAAACACTTCTTTCCGTGGATCAACAATAAATGGTGCTGACGTAA
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GTTGCAGATGGGGTGAACCCAACAACTGGAAATGCAACCCGGGAGACCTTGCTCTGCAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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VADGVNPTTGNATRETLLCN