; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0000003 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0000003
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationLG01:100498752..100499673
RNA-Seq ExpressionTan0000003
SyntenyTan0000003
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8649934.1 hypothetical protein Csa_012580 [Cucumis sativus]2.5e-7177.78Show/hide
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             SP HT R+DSPV  PVTPLA ESLFF RP V SPLSPPVTAEDKAIAD GFYLHPS    PR+SQPPELLNLFPS  P  ++ +
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XP_004145579.1 VQ motif-containing protein 11 [Cucumis sativus]1.9e-7180.33Show/hide
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             SP HT R+DSPV  PVTPLA ESLFF RP V SPLSPPVTAEDKAIAD GFYLHPS    PR+SQPPELLNLFPS  P
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XP_008452821.1 PREDICTED: VQ motif-containing protein 31-like [Cucumis melo]1.0e-7282.78Show/hide
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        MEKH I  SSPPP TSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGF+GDSEKLPVTHLSKLSSSKPFP + AD+ TGPRRSPFKLQERRHTI+KLEIKL LTGPFKNS
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             SP HT R+DSPV SPVTPLA ESLFF RP VASPL+PPVTAEDKAIADG FYLHPS    PR+SQPPELLNLFPS
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XP_022138667.1 VQ motif-containing protein 4-like [Momordica charantia]4.6e-8181.54Show/hide
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        ME+H+  ++ PPPP      TSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLS SKP P  ADHLTGPRRSPFKLQERRHT++KLEIKLGLT 
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         F+NSPPS  SP    R DSPV SPVTPLATESL FLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSP++TPRN QPPELLNLFPSNSP++QSQNA
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XP_038899085.1 VQ motif-containing protein 4-like [Benincasa hispida]1.3e-7583.33Show/hide
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        MEKHLI  SSPPP TSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGF+GDSEKLPVTHLSKLSSSKPF PS  D+LTGPRRSPFKLQERRHTI+KLEI LG TGPFKN 
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Query:  PPSLNSPCHTYRLDSPVQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPS
        PPSL SP  T R+DSPV SPVTPLA +SLFF +P +ASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPS    PR+SQPPELLNLFP+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L104 VQ domain-containing protein9.4e-7280.33Show/hide
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        ME+H+IT SSPPP TSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGF+GDSEKLPVTHLSKLSSSKPF P  AD+ TGPRRSPFKLQERRHTI+KLEI+L LT PFKNS
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             SP HT R+DSPV  PVTPLA ESLFF RP V SPLSPPVTAEDKAIAD GFYLHPS    PR+SQPPELLNLFPS  P
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A0A1S3BVZ0 VQ motif-containing protein 31-like5.0e-7382.78Show/hide
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        MEKH I  SSPPP TSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGF+GDSEKLPVTHLSKLSSSKPFP + AD+ TGPRRSPFKLQERRHTI+KLEIKL LTGPFKNS
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             SP HT R+DSPV SPVTPLA ESLFF RP VASPL+PPVTAEDKAIADG FYLHPS    PR+SQPPELLNLFPS
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A0A5A7VC76 VQ motif-containing protein 31-like5.0e-7382.78Show/hide
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        MEKH I  SSPPP TSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGF+GDSEKLPVTHLSKLSSSKPFP + AD+ TGPRRSPFKLQERRHTI+KLEIKL LTGPFKNS
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             SP HT R+DSPV SPVTPLA ESLFF RP VASPL+PPVTAEDKAIADG FYLHPS    PR+SQPPELLNLFPS
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A0A6J1CBS5 VQ motif-containing protein 4-like2.2e-8181.54Show/hide
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        ME+H+  ++ PPPP      TSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLS SKP P  ADHLTGPRRSPFKLQERRHT++KLEIKLGLT 
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         F+NSPPS  SP    R DSPV SPVTPLATESL FLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSP++TPRN QPPELLNLFPSNSP++QSQNA
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A0A6J1IP36 VQ motif-containing protein 11-like2.6e-6978.69Show/hide
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        MEKHL TVSSPPPP    TSPTTFVQAD NSFRDLVQKLTGFSG SEKLPVTHLSKLSSS P P   DH TGPRRSPFKLQERRHTI+KLEIKLG TG F
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Query:  KNSPPSLNSPCHTYRLDSPVQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPS
        K      NSP H  R DSP+ SPVTPLA E LF  +PGVASPL+PPVTAEDKAIADGGFYLHPS    PR+SQPPELLNLFPS
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 131.2e-1034.13Show/hide
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        TTF++ D +SF+ +VQ LTG   +    P        S  P  +V +     + S F+L ERR++++  L I      P  + PP + +P       +  
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Query:  QSPVTPLATESLFFLRPGVASPL---SPPVTAED--KAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFP
         SP TPL ++   F RPG  S     S P   +D  ++I + GFYL PSP  TPR+++ P LL+LFP
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Q5M750 VQ motif-containing protein 42.7e-1537.81Show/hide
Query:  KHLITVSSPPPPTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFS-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKPFP-SVADHLTGPRR-------SPFKLQERRHTIQKLEIK
        +H+ T S    P  PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG +     G S K   TH      S P   S+      P +       S F+L ERR++++ L+I 
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Query:  ------LGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP--VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNS
                +   F    P + SP     LD P  V SPVTPL  +   F R G ++     + AE+KA+ + GFYLHPSP  TP + + P LL LFP  S
Subjt:  ------LGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP--VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNS

Query:  P
        P
Subjt:  P

Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 334.6e-1539.13Show/hide
Query:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDS-------EKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRHT-----------IQKLEI----KLGLTG
        PTTFVQADT++F+ +VQ LTG S D+          PV + +K  SS   P +       + + FKL ERR             I  L +    +L  TG
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Query:  -----------PFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP---VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLS-PPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPS
                     +NS  S N       LD P   + SPVTPL +    F +   +SPLS    + EDKAIAD GFYLHPSP++TPR+SQ P LL LFP 
Subjt:  -----------PFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP---VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLS-PPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPS

Query:  NSPTDQS
         SP   S
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 314.0e-1134.88Show/hide
Query:  TTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRHTIQ-KLEI-KLGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP
        TTFVQ DTN+FR++VQ+LTG + ++        + + ++             +R   KL ERR  ++ KLEI K  L+     + PS  S  +T  L SP
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Query:  VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNSPTDQSQ
        V +P +  +  SL     G     +  +  E+KAI +  FYLHPSP + P  ++ PELL LFP  SP    +
Subjt:  VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNSPTDQSQ

Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 197.3e-1337.25Show/hide
Query:  MEKHLITVSSPPPPTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSG----DSEKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRH------------TIQ
        +  H+IT S       PTTFVQAD++SF+ +VQ LTG S     DS + P T   K +   P    A      + S  KL ERR              I 
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Query:  KLEIKLGLTGPFKNSPPS---LNSPCHTYRLDSP---VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFP
         L I  G  G  + SP +   L+  C    LD P   + SPVTPL   +      G       P++ E++ IAD G+YLH SPI+TPR+S+ P+LL LFP
Subjt:  KLEIKLGLTGPFKNSPPS---LNSPCHTYRLDSP---VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFP

Query:  SNSP
          SP
Subjt:  SNSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.9e-1637.81Show/hide
Query:  KHLITVSSPPPPTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFS-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKPFP-SVADHLTGPRR-------SPFKLQERRHTIQKLEIK
        +H+ T S    P  PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG +     G S K   TH      S P   S+      P +       S F+L ERR++++ L+I 
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Query:  ------LGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP--VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNS
                +   F    P + SP     LD P  V SPVTPL  +   F R G ++     + AE+KA+ + GFYLHPSP  TP + + P LL LFP  S
Subjt:  ------LGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP--VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNS

Query:  P
        P
Subjt:  P

AT1G28280.2 VQ motif-containing protein1.9e-1637.81Show/hide
Query:  KHLITVSSPPPPTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFS-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKPFP-SVADHLTGPRR-------SPFKLQERRHTIQKLEIK
        +H+ T S    P  PTTFVQADT+SF+ +VQ LTG +     G S K   TH      S P   S+      P +       S F+L ERR++++ L+I 
Subjt:  KHLITVSSPPPPTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFS-----GDSEKLPVTHLSKLSSSKPFP-SVADHLTGPRR-------SPFKLQERRHTIQKLEIK

Query:  ------LGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP--VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNS
                +   F    P + SP     LD P  V SPVTPL  +   F R G ++     + AE+KA+ + GFYLHPSP  TP + + P LL LFP  S
Subjt:  ------LGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP--VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNS

Query:  P
        P
Subjt:  P

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein5.2e-1437.25Show/hide
Query:  MEKHLITVSSPPPPTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSG----DSEKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRH------------TIQ
        +  H+IT S       PTTFVQAD++SF+ +VQ LTG S     DS + P T   K +   P    A      + S  KL ERR              I 
Subjt:  MEKHLITVSSPPPPTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSG----DSEKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRH------------TIQ

Query:  KLEIKLGLTGPFKNSPPS---LNSPCHTYRLDSP---VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFP
         L I  G  G  + SP +   L+  C    LD P   + SPVTPL   +      G       P++ E++ IAD G+YLH SPI+TPR+S+ P+LL LFP
Subjt:  KLEIKLGLTGPFKNSPPS---LNSPCHTYRLDSP---VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFP

Query:  SNSP
          SP
Subjt:  SNSP

AT5G08480.2 VQ motif-containing protein2.8e-1234.88Show/hide
Query:  TTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRHTIQ-KLEI-KLGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP
        TTFVQ DTN+FR++VQ+LTG + ++        + + ++             +R   KL ERR  ++ KLEI K  L+     + PS  S  +T  L SP
Subjt:  TTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRHTIQ-KLEI-KLGLTGPFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP

Query:  VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNSPTDQSQ
        V +P +  +  SL     G     +  +  E+KAI +  FYLHPSP + P  ++ PELL LFP  SP    +
Subjt:  VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNSPTDQSQ

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein3.2e-1639.13Show/hide
Query:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDS-------EKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRHT-----------IQKLEI----KLGLTG
        PTTFVQADT++F+ +VQ LTG S D+          PV + +K  SS   P +       + + FKL ERR             I  L +    +L  TG
Subjt:  PTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDS-------EKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRHT-----------IQKLEI----KLGLTG

Query:  -----------PFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP---VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLS-PPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPS
                     +NS  S N       LD P   + SPVTPL +    F +   +SPLS    + EDKAIAD GFYLHPSP++TPR+SQ P LL LFP 
Subjt:  -----------PFKNSPPSLNSPCHTYRLDSP---VQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLS-PPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPS

Query:  NSPTDQS
         SP   S
Subjt:  NSPTDQS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAAACATCTAATCACCGTCTCATCGCCGCCGCCGCCAACTTCTCCGACCACCTTCGTCCAAGCCGACACCAATTCCTTCAGAGACCTCGTCCAGAAGCTCACCGG
CTTTTCCGGTGACTCCGAAAAGCTTCCGGTCACCCACCTCTCTAAGCTTTCCTCCTCCAAGCCCTTCCCTTCCGTCGCCGACCACCTTACCGGACCCCGCCGGTCTCCGT
TCAAGCTCCAAGAGCGCCGTCACACCATCCAAAAGCTGGAGATCAAACTCGGCCTCACCGGACCTTTCAAAAACTCGCCGCCGAGTCTTAATTCGCCGTGTCACACTTAC
CGGTTGGATTCGCCCGTTCAGAGTCCTGTTACGCCTCTCGCCACCGAGTCGCTGTTTTTTCTGAGGCCCGGCGTGGCCTCGCCGCTGTCACCGCCGGTCACGGCGGAGGA
TAAGGCTATAGCAGATGGAGGGTTTTATCTTCACCCGTCGCCGATTAATACTCCGAGGAATTCTCAGCCACCGGAGCTCTTGAATTTGTTCCCTTCCAATTCGCCAACGG
ATCAATCTCAAAATGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTGATTGGTACCGTTATAAAAATCATCCACAGAGCTCGAAGAATAACTTCCAAAAGCTCAAAAGCACTCACTCACTTTTCTCTCTTCGCACCCACTCTACTCTCTCTCTC
CATAATGGAAAAACATCTAATCACCGTCTCATCGCCGCCGCCGCCAACTTCTCCGACCACCTTCGTCCAAGCCGACACCAATTCCTTCAGAGACCTCGTCCAGAAGCTCA
CCGGCTTTTCCGGTGACTCCGAAAAGCTTCCGGTCACCCACCTCTCTAAGCTTTCCTCCTCCAAGCCCTTCCCTTCCGTCGCCGACCACCTTACCGGACCCCGCCGGTCT
CCGTTCAAGCTCCAAGAGCGCCGTCACACCATCCAAAAGCTGGAGATCAAACTCGGCCTCACCGGACCTTTCAAAAACTCGCCGCCGAGTCTTAATTCGCCGTGTCACAC
TTACCGGTTGGATTCGCCCGTTCAGAGTCCTGTTACGCCTCTCGCCACCGAGTCGCTGTTTTTTCTGAGGCCCGGCGTGGCCTCGCCGCTGTCACCGCCGGTCACGGCGG
AGGATAAGGCTATAGCAGATGGAGGGTTTTATCTTCACCCGTCGCCGATTAATACTCCGAGGAATTCTCAGCCACCGGAGCTCTTGAATTTGTTCCCTTCCAATTCGCCA
ACGGATCAATCTCAAAATGCATAAAAGGACAAAAATGGAAATTAGTTTTGTTTTTTGGGGAGTAATGTCTCTCTCTCTATATTTTTTATTTTCGTGCTATTTTTTAATTT
CAAGCATTCTGAAGCTGGTCCATTGGAGTTATTGAATTTTATTTAGTTCCATTACTATGGTCAATTTCTGCATTCATGTTTTTATTTCCCCTTTTCCCTTTTTTAAAAAA
ACAACTATATATCATTGGAAAAAAAATCAATTTTCTGGATTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKHLITVSSPPPPTSPTTFVQADTNSFRDLVQKLTGFSGDSEKLPVTHLSKLSSSKPFPSVADHLTGPRRSPFKLQERRHTIQKLEIKLGLTGPFKNSPPSLNSPCHTY
RLDSPVQSPVTPLATESLFFLRPGVASPLSPPVTAEDKAIADGGFYLHPSPINTPRNSQPPELLNLFPSNSPTDQSQNA