; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0000125 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0000125
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionProtein no-on-transient A-like
Genome locationLG06:7926795..7927154
RNA-Seq ExpressionTan0000125
SyntenyTan0000125
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0068047.1 protein no-on-transient A-like [Cucumis melo var. makuwa]9.9e-0542.5Show/hide
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KAG6575858.1 hypothetical protein SDJN03_26497, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-0542.98Show/hide
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KAG6575859.1 hypothetical protein SDJN03_26498, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.7e-0743.33Show/hide
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XP_022954099.1 uncharacterized protein LOC111456466 [Cucurbita moschata]5.2e-0643.33Show/hide
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XP_022992473.1 uncharacterized protein LOC111488793 isoform X1 [Cucurbita maxima]4.0e-0643.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAQ7 Uncharacterized protein1.8e-0440.83Show/hide
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A0A5A7VLE5 Protein no-on-transient A-like4.8e-0542.5Show/hide
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A0A5D3D3Y6 E3 ubiquitin-protein ligase MIEL1-like5.3e-0441.46Show/hide
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A0A6J1GRX2 uncharacterized protein LOC1114564662.5e-0643.33Show/hide
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A0A6J1JZB1 uncharacterized protein LOC111488793 isoform X11.9e-0643.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTGCGATTAAATCCCTAATTTCCATAGCTCTTGTCGCTCTTCTCTTGCTCTCCGAATCCCTAGCCACTTCCGCCGCCGATCGCGGCGAGGCTTCAGATTCTCCAGC
CGGAATGCATCGCCGGAGCACCGTTGAGACGGTGGCTCATCAGATCACGAGAGATAATAATGGTGAGTCCTCCTCCTTCGAAGGGAAATATATGAAAAAGGGGATCCGAC
CACCAGTCCAACGACGGCCACCAATAGTAATCGTTGGCCATACACCGGCGGCGAATCGGAACCGTACATCGGTGGGGAATCGGAGCCGAGTGGCGGGATATGTGCTGTAT
ATCTGCACCTTTTTTGGATTGTTCTTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ICTFFGLFL