; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0000146 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0000146
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationLG04:79175991..79176505
RNA-Seq ExpressionTan0000146
SyntenyTan0000146
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-4682.64Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]7.9e-4581.97Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.0e-4481.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein4.5e-4682.11Show/hide
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 339.1e-4782.64Show/hide
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A0A5B6YRQ5 Uncharacterized protein1.1e-2866.67Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 11.6e-4683.61Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 13.8e-4581.97Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 332.1e-2452.14Show/hide
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        A+ANPY RGC+AITRCR
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Q945T0 Rapid alkalinization factor2.1e-2452.94Show/hide
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        P  L L     AFFIS       A + D     W++   +   C G SI EC+  + EF++DSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRG+SYYNC+P
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.3e-2175Show/hide
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Q9MA62 Protein RALF-like 225.4e-2061.33Show/hide
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        C G SI+EC+  + E + DS+I+RRILA   YISY +++ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.8e-2353.04Show/hide
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        L L    +  FI SS       ++D   ++W       + C+G SI+EC+   E +MDSEINRRILAT+ YISY+SLK N++PCSRRG+SYYNCQ GA+A
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        NPY RGC+ I RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.3e-2453.04Show/hide
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        NPY RGC+ I RCRS
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AT2G33775.1 ralf-like 199.7e-1745.26Show/hide
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        L   A  ++ +  +W L ++  NG+       ++++ MDSE NRR LA   SYISY +L+ NN+PCSRRG SYY+C+    ANPY+RGC+ IT C
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AT3G05490.1 ralf-like 223.8e-2161.33Show/hide
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        C G SI+EC+  + E + DS+I+RRILA   YISY +++ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 239.1e-2375Show/hide
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AT4G15800.1 ralf-like 331.5e-2552.14Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGAAGCCAACCATGGGAAACTTTTCTTTTCCTCCTGCCTTATGTTTGCTCTTTTTCACCATAGCCTTCTTCATCTCTTCGTCCTCTTTAACGGTCACGGCAACGAG
TAGCGACCGTAGTACTCTTAGCTGGCTCTTGGCAGAAGCTCGATGCAATGGGCGTTCGATAAGCGAATGCATGATGGACGTTGAGTTTGACATGGATTCTGAGATCAATC
GTCGCATCTTAGCTACTTCGAGTTACATAAGTTACAAGTCATTGAAGGCGAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAGCCCGGGGCCGAA
GCTAACCCGTATCAGCGGGGTTGCAACGCCATTACTCGTTGCAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCAAGTTTAAAGTAATGAAGAAGCCAACCATGGGAAACTTTTCTTTTCCTCCTGCCTTATGTTTGCTCTTTTTCACCATAGCCTTCTTCATCTCTTCGTCCTCTTTAACG
GTCACGGCAACGAGTAGCGACCGTAGTACTCTTAGCTGGCTCTTGGCAGAAGCTCGATGCAATGGGCGTTCGATAAGCGAATGCATGATGGACGTTGAGTTTGACATGGA
TTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAGCTACTTCGAGTTACATAAGTTACAAGTCATTGAAGGCGAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCC
AGCCCGGGGCCGAAGCTAACCCGTATCAGCGGGGTTGCAACGCCATTACTCGTTGCAGAAGCTAAGCAAAACTCATTTTCATGTTCTTGTCTTTGTAACATAGAATAAAT
TTGAGAAAGGAAGTTGCCATGTTTGTGTTTATTATGGAGTGTGTGTTTAATTGGTCTTGCACTTTCATTGTGACC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKKPTMGNFSFPPALCLLFFTIAFFISSSSLTVTATSSDRSTLSWLLAEARCNGRSISECMMDVEFDMDSEINRRILATSSYISYKSLKANNIPCSRRGSSYYNCQPGAE
ANPYQRGCNAITRCRS