; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0000353 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0000353
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionChlorophyll A-B binding protein
Genome locationLG11:6599192..6600191
RNA-Seq ExpressionTan0000353
SyntenyTan0000353
Gene Ontology termsGO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK05751.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G002400 [Cucumis melo var. makuwa]1.0e-8090.27Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSK HKP  LTFLTRAADP+S  +D E PGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_004149820.1 uncharacterized protein LOC101221723 [Cucumis sativus]2.0e-8190.81Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSKP KP  LTFLTRAADP+SPA D E PGSDGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GST AASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_022133568.1 uncharacterized protein LOC111006119 [Momordica charantia]4.3e-8489.78Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKPHK  PLTF+TRAADP++PAADPEPGSDGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_023550096.1 uncharacterized protein LOC111808391 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-8090.22Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSLA  SNSKPHKP  LTF+TRAADP+SPAAD EP SDGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGSTAAASSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+SALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
XP_038890345.1 uncharacterized protein LOC120079944 [Benincasa hispida]4.1e-8292.39Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSL L     P KP  LTF+TRAADP+SPAAD E GSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAA SSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS45 Uncharacterized protein9.7e-8290.81Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSKP KP  LTFLTRAADP+SPA D E PGSDGDDFEDRLAKVR+RYRSGTGKKAEIRKARKSK+GST AASSVYLPPV L
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A1S3CJX9 uncharacterized protein LOC1035016671.4e-8089.73Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSK HKP  LTFLTRAADP+S  +D E PGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAV A+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A5D3C1D6 Uncharacterized protein4.8e-8190.27Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL
        MAAIPSSSLQFPNSL LPSNSK HKP  LTFLTRAADP+S  +D E PGSDGDDFEDRLAKVR RYRSGTGKKAEIRKARKSKKGST AASSVYLPPVPL
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPE-PGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPL

Query:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        KE VSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGK VI+YHTPAIILIQVYFVAAVAA+YIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  KEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A6J1BZH5 uncharacterized protein LOC1110061192.1e-8489.78Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP
        MAAIPSSSLQFPNSL  PSNSKPHK  PLTF+TRAADP++PAADPEPGSDGDDFE+RLAKVRL+YRSGTGKKAEIRKARKS KGSTA A  SSVYLPPVP
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAA--SSVYLPPVP

Query:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        LKEAVSGGLKVEFGFSP+SERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAA+Y+K+EKEKVSVWPP+E+KN
Subjt:  LKEAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
A0A6J1JUJ1 uncharacterized protein LOC1114890222.0e-7989.13Show/hide
Query:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK
        MAAIPSSSLQFPNSLAL SNSKPHKP  LTF+ RAADP+SPAAD EP SDGDDFEDRLA  RL+ R GTGKKAEIRKARKS+KGSTAAASSVYLPPVPLK
Subjt:  MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLK

Query:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
        EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILG+ ALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQ YFVAA AALYIKYEKEKVSVWP DEIK+
Subjt:  EAVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G12345.1 unknown protein6.3e-4957.54Show/hide
Query:  FPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAA---------DPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKE
        FP+   +P+     KPN L   T  A          PD      E G+D D FE RL+ +RLRYRSGTGKKAE+RK++K   GS +  + +YLPPV LKE
Subjt:  FPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAA---------DPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKE

Query:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD
        AVSGGLKVE GFSP+SERING IA LG++AL+LVELATGK V+NYHTP+++ +Q+YFVAAV+A+++K EKEKVSVWP D
Subjt:  AVSGGLKVEFGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPD

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCCCTGCAATTCCCAAACTCTCTCGCACTCCCTTCCAATTCAAAACCTCACAAGCCGAATCCCCTCACCTTCTTAACCAGAGCAGCAGA
TCCAGATTCCCCAGCCGCCGATCCCGAACCTGGATCGGATGGCGATGATTTCGAGGACCGACTGGCCAAGGTCCGGCTCCGATACCGAAGCGGAACGGGAAAGAAGGCGG
AGATACGGAAGGCTCGAAAGTCCAAGAAAGGATCCACCGCCGCCGCCTCGTCGGTGTACCTTCCGCCGGTGCCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGTCTAAAAGTGGAA
TTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATAAATGGATGGATTGCGATCCTCGGAATATCGGCCCTGGTTTTGGTGGAATTGGCCACCGGAAAAGGCGTCATCAATTACCA
CACGCCGGCGATTATACTGATTCAGGTGTATTTTGTAGCGGCGGTTGCTGCTCTGTATATCAAATACGAGAAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCCGGACGAAATTAAGA
ATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGAGAATTTTAAATATAAAAATAAGCAAATAGAAACCACAAATATAAAGAACGAAAAAAATAGAAAACAAAAAACAAAATATAAGGCCCAAACGGTTACAGCGAACACAC
AGAGGGGTCATTTTATCCTCAAACTCAGATTTCTCCATCCATGGCGGCCATTCCATCTTCCTCCCTGCAATTCCCAAACTCTCTCGCACTCCCTTCCAATTCAAAACCTC
ACAAGCCGAATCCCCTCACCTTCTTAACCAGAGCAGCAGATCCAGATTCCCCAGCCGCCGATCCCGAACCTGGATCGGATGGCGATGATTTCGAGGACCGACTGGCCAAG
GTCCGGCTCCGATACCGAAGCGGAACGGGAAAGAAGGCGGAGATACGGAAGGCTCGAAAGTCCAAGAAAGGATCCACCGCCGCCGCCTCGTCGGTGTACCTTCCGCCGGT
GCCGCTGAAGGAGGCGGTTTCCGGCGGTCTAAAAGTGGAATTCGGATTCAGTCCGTACAGCGAGAGGATAAATGGATGGATTGCGATCCTCGGAATATCGGCCCTGGTTT
TGGTGGAATTGGCCACCGGAAAAGGCGTCATCAATTACCACACGCCGGCGATTATACTGATTCAGGTGTATTTTGTAGCGGCGGTTGCTGCTCTGTATATCAAATACGAG
AAGGAGAAGGTTAGCGTTTGGCCGCCGGACGAAATTAAGAATTAGAATTCAATCGACAGTATCTTTAGCTTGTTTTTCCACTCAGCGTTTCGAATTCACTTGTTAAATGT
TGACATTGAAGCAATGTTTGAGTTATAAATGAATGTGATAGATGTGCATCGTTGAAGGAAACATTCTTGTTTTTTTTTTTTTTCAAGCTCCATAAAAATATTTTTGGAGA
GTTTTAAAATAAAATGAAATTAGATATGATTGAAAATTTGGGCATAGCTAAAGTGGATCAAGACACCCTTTATCATTCAAAAGGGGGTTTAATTCTCACTTCGGTTGAAC
ATTAATTGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAIPSSSLQFPNSLALPSNSKPHKPNPLTFLTRAADPDSPAADPEPGSDGDDFEDRLAKVRLRYRSGTGKKAEIRKARKSKKGSTAAASSVYLPPVPLKEAVSGGLKVE
FGFSPYSERINGWIAILGISALVLVELATGKGVINYHTPAIILIQVYFVAAVAALYIKYEKEKVSVWPPDEIKN