; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0001327 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0001327
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionblue copper protein-like
Genome locationLG01:103067165..103072111
RNA-Seq ExpressionTan0001327
SyntenyTan0001327
Gene Ontology termsGO:0022900 - electron transport chain (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608264.1 hypothetical protein SDJN03_01606, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.7e-8990.86Show/hide
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XP_022940502.1 blue copper protein-like [Cucurbita moschata]4.4e-9091.37Show/hide
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XP_022980897.1 blue copper protein-like [Cucurbita maxima]2.6e-9092.39Show/hide
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XP_023524383.1 blue copper protein-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-8790.36Show/hide
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XP_038897888.1 blue copper protein-like [Benincasa hispida]2.9e-8687.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CQN2 blue copper protein-like4.0e-8182.91Show/hide
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A0A5A7T903 Blue copper protein-like4.0e-8182.91Show/hide
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A0A6J1E4U3 blue copper protein-like8.0e-8283.25Show/hide
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        HYFICS+MGHCDGGMKLSVTV AGG  TSPSSGG SS+TPASPASDTPS TGTTPA TTPTTKLPAGS NS  S +P FY A++ ILVGSWA A+ Y
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A0A6J1FJS8 blue copper protein-like2.1e-9091.37Show/hide
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A0A6J1ISI5 blue copper protein-like1.2e-9092.39Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80517 Uclacyanin-24.5e-2143.53Show/hide
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        L+L   +V   +A  +T+     W+ GVDY  WA+GKTF +GD L F YG  HTVD V  + Y  C A +S  + S G T I LKT G +YFICS+ GHC
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          +GGMKL+V V  G+ GP  +P+    +  TP +P S  PS    TP T TP   +T  P     SG+S
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O82081 Uclacyanin 15.6e-1637.21Show/hide
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        L+ + VL   ++   +AT HT+G  SGW++G    TWA+G+TF +GD L FSY    H V EVT  ++ +C A   + + ++G++ + L T G  YFIC 
Subjt:  LVYLLVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGG-HTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFICS

Query:  SMGHCDGGMKLSVTV--------GAGGPSTSPS--SGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPATTTPTTKLPAGS
          GHC  GMKL V V         A  P+T PS  +   SS  P  P      V   +P+++TP   LP+ S
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Q07488 Blue copper protein3.4e-1337.31Show/hide
Query:  VYLLVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVD---YGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGG-HTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFI
        V  LVL F  V    A  + VGD + W+  +D   Y TWA+GKTF +GD+L F +  G H V  V+ + ++ C     I+  +     I L T G  YFI
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Query:  CSSMGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTP----ATTTPT----TKLPAG---SSNSGSSCIPNFYAAILAI
        C+   HC  G KLS+TV A G +   + G  ++  P S    TPS  GTTP     TTTP+    T  PAG   SS  G++ +  F +A++A+
Subjt:  CSSMGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTP----ATTTPT----TKLPAG---SSNSGSSCIPNFYAAILAI

Q41001 Blue copper protein1.1e-3553.85Show/hide
Query:  MASFHAGLVYLLVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYG-GGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAG
        MA  +A ++  L+    M  P+LATV+TVGDTSGW +G DY TWAS KTF +GD L F+YG G HTVDEV  SDYK+CT+GNSI++DS+G+TTI LK AG
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Query:  THYFICSSMGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPAS-DTPSVTGTTPATTTPTTKLPAGSSNSGSSCIPNFY
         HYFIC   GH  GGMKLS+ V A   S++  S   SS+   SP+S DTP+ T T   TTTP TK    S+ S S  +  F+
Subjt:  THYFICSSMGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPAS-DTPSVTGTTPATTTPTTKLPAGSSNSGSSCIPNFY

Q96316 Uclacyanin-39.3e-1941.51Show/hide
Query:  LVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFICSSMGHC
        L+L    V    A    VGD SGW+  +DY  W +GKTF +GD L F YG  H+V  V  + Y  C +  +  + + G T I L T GT +F+C + GHC
Subjt:  LVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFICSSMGHC

Query:  DGGMKLSVTVGAGGPSTS-PSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPA-TTTPTTKLPAGS
          GMKL+V V A  PS S PSS   + +TP+SP S TPS   + P+  + P+  LP  S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G22480.1 Cupredoxin superfamily protein4.7e-2650.33Show/hide
Query:  LVYLLVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFICSS
        L+  LVL F MV    A   +   T  WSLG DY    +GKTF +GD + F+YG GHTVDEV+ +DYK+CT GNSITSDSSG+TTI L T G  YFIC  
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Query:  MGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPATT
         GHC  GMKL+VTV +   S++  +GG ++ TP      T    G  P TT
Subjt:  MGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPATT

AT1G72230.1 Cupredoxin superfamily protein7.1e-3048.99Show/hide
Query:  MASFHAGLVYLLVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGT
        MA+    + +L+++ F +  P  +  H V     WSLG DY + A+GK+F +GD + F+YG GHTVDEV+ SDYK+CT GN+I+SDSSG+T+I LKT G 
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Query:  HYFICSSMGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPS
        HYFIC   GHC GGMKLSV V A     S   G     TP      TPS
Subjt:  HYFICSSMGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPS

AT2G44790.1 uclacyanin 23.2e-2243.53Show/hide
Query:  LVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFICSSMGHC
        L+L   +V   +A  +T+     W+ GVDY  WA+GKTF +GD L F YG  HTVD V  + Y  C A +S  + S G T I LKT G +YFICS+ GHC
Subjt:  LVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFICSSMGHC

Query:  --DGGMKLSVTV--GAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPATTTP---TTKLPAGSSNSGSS
          +GGMKL+V V  G+ GP  +P+    +  TP +P S  PS    TP T TP   +T  P     SG+S
Subjt:  --DGGMKLSVTV--GAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPATTTP---TTKLPAGSSNSGSS

AT3G60270.1 Cupredoxin superfamily protein1.8e-1739.07Show/hide
Query:  AGLVYLLVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFIC
        A    LL+L    V    A    VGD  GW++GV+Y +W S KTF +GD L F YG  H+V  V  +DY  C       S S G T I L   G  +F+C
Subjt:  AGLVYLLVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFIC

Query:  SSMGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPA
         + GHC  GMKL+V V A      P S    S +P++P S +PS    +P+
Subjt:  SSMGHCDGGMKLSVTVGAGGPSTSPSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPA

AT3G60280.1 uclacyanin 36.6e-2041.51Show/hide
Query:  LVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFICSSMGHC
        L+L    V    A    VGD SGW+  +DY  W +GKTF +GD L F YG  H+V  V  + Y  C +  +  + + G T I L T GT +F+C + GHC
Subjt:  LVLGFCMVQPNLATVHTVGDTSGWSLGVDYGTWASGKTFVIGDKLAFSYGGGHTVDEVTASDYKACTAGNSITSDSSGSTTITLKTAGTHYFICSSMGHC

Query:  DGGMKLSVTVGAGGPSTS-PSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPA-TTTPTTKLPAGS
          GMKL+V V A  PS S PSS   + +TP+SP S TPS   + P+  + P+  LP  S
Subjt:  DGGMKLSVTVGAGGPSTS-PSSGGDSSTTPASPASDTPSVTGTTPA-TTTPTTKLPAGS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAGCTTCCATGCCGGACTTGTTTACCTCCTAGTACTTGGATTCTGCATGGTGCAGCCGAACTTGGCCACAGTTCACACCGTCGGAGATACTTCCGGTTGGTCCCT
CGGTGTCGATTATGGCACATGGGCTTCTGGGAAGACCTTCGTCATCGGCGACAAACTTGCGTTCAGCTATGGAGGAGGCCACACAGTGGACGAAGTTACCGCCAGTGACT
ACAAAGCATGCACGGCCGGAAACTCCATAACTTCCGACAGTTCAGGATCCACCACCATCACCCTAAAGACCGCCGGAACTCACTACTTCATTTGCAGCTCCATGGGGCAC
TGCGACGGCGGCATGAAACTCTCCGTCACAGTCGGCGCCGGAGGACCGTCCACTTCTCCATCTTCAGGGGGCGACAGCTCCACCACTCCGGCGTCGCCGGCAAGTGACAC
CCCTTCAGTCACCGGAACCACGCCGGCGACGACCACGCCGACGACGAAGCTTCCAGCCGGTTCGTCGAATTCAGGGTCGTCTTGTATCCCCAATTTCTACGCTGCCATTT
TGGCGATTTTGGTAGGTTCATGGGCGTCGGCTTTAGGTTATTATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCATGAACACTTCAGATTTTTAACTCCTTTTTGTGGGTCCCATGGACTTCTTTACTCCTACTCCTTACAACTCCTACTCCCCCAACTCCTCAATCCAAACGGCCCCTAA
TTGGCATCTTGGCCCCTAATTGGCATCTTATGATCATGAGCTGTGTCCTTTTCCTGTCTTCCAATATTTTCCCTCGAGTTCTATATCGCATAGTCGCAGTATTGTACTGA
TTCATGATTCAAGAACAAGGACAATCGGTGCAATTTGATCTTTACGTATTTGCTTTATATAGAATCGGTGGGTGGGAGAATGCAATTCCAAGATGCATTTTTGTTCATGC
GTACTATTTTGCATGGTCGTAGTGTTGTACTTGCCTTCACATTCATGTGTACTAACTGTACTAACCGAGAACATTAAAGGACAATCTGTGCAATTTGATTTTTGGCTTTA
AATAGATAAGTGGGGAGTGGGGACACAATTCCTATGTGCATTCTCATTCATGTGTTCTATATATTGCATAATCACAGGTTTCTGCTGAATCGAGAACATTCAAGAACAGT
CTGCAATTTGTTTTTTTAGATAATTGCTTTATATGCTTGAAGTAATAAGTGCTTTTGAGCTGCTGCATGTGTCATAAATGCTGGCAATCCCCTCAGTGTGAAGATGAAAT
GGACGTCGAGTCCTTGAATTTCATCGCTTCATTCAGTTATTTGAACGATGTAATAATGGGGTTTCCCTGTCCGGAGCAAGTAATGAAGATGCCAGATATTATCCTCAACT
GCAGTGTTGACTGTTTATTCTTTGTTCAAGCCATGATAAGTTTGACCTTGTTCTAAAGAGCTTCATAAATTCTTCATATTACTTTATTGTGTCTCTATTCTCGTTCTCTT
CTTTTAGGTTGACATGAAAAGGAAGACACGCTTGGTAAAGAGAAAACGTGTAATCTGCCGCAAAGTTGAAAAGCATCCTTGAAATGCTTTTGCTTTAACGGTTGAAACAT
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GTCTGATTGAGTACATAGCACAATTTAACTGGTTAAGGTATACATCTTTAATGAAGTTTGAACCTCTTCATCCAACAAGTTAGACTCAGAATTAGAATTAAGAAAACTCA
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