CuGenDBv2

Gene ID	Tan0001446
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	DUF1279 domain-containing protein
Genome location	LG05:10014836..10015729
RNA-Seq Expression	Tan0001446
Synteny	Tan0001446
Gene Ontology terms	GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domains	IPR009688 - Protein FAM210A/B-like domain

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6604946.1 hypothetical protein SDJN03_02263, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

2.8e-65

90.79

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNN+DVESLL+KLHMDGFSSKD PQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTS IQST+ + PR +
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PIT+ALTPPIARLLARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

XP_022146083.1 uncharacterized protein LOC111015379 [Momordica charantia]

1.6e-63

90.13

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKDQPQT PSE TSS DDGFVIEERP SE QST  Q PR +
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPIT+ALTPPI+RLLARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

XP_022947464.1 uncharacterized protein LOC111451320 [Cucurbita moschata]

1.7e-65

91.45

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKD PQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTS IQST+ + PR +
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PIT+ALTPPIARLLARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

XP_022971121.1 uncharacterized protein LOC111469888 [Cucurbita maxima]

6.3e-65

91.45

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKD PQTSPSEIT SVDDGFVIEERPTS IQST+ + PR +
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPIT+ALTPPIARLLARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

XP_023533856.1 uncharacterized protein LOC111795580 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.7e-66

91.45

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVS+ASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKD PQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQST+ + PR +
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PIT+ALTPPIARLLARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1CXM4 uncharacterized protein LOC111015379

7.5e-64

90.13

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKDQPQT PSE TSS DDGFVIEERP SE QST  Q PR +
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPIT+ALTPPI+RLLARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

A0A6J1FU56 uncharacterized protein LOC111448454

5.6e-59

84.87

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKDQ QTSP       DDG VIEE P S+IQST++Q PRT+
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPIT+ LTPPIAR+LARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

A0A6J1G6W3 uncharacterized protein LOC111451320

8.0e-66

91.45

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKD PQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTS IQST+ + PR +
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIR+PIT+ALTPPIARLLARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

A0A6J1I2F7 uncharacterized protein LOC111469888

3.1e-65

91.45

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKD PQTSPSEIT SVDDGFVIEERPTS IQST+ + PR +
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPIT+ALTPPIARLLARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

A0A6J1JD52 uncharacterized protein LOC111483951

1.4e-62

87.5

Show/hide

Query:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK
        MAFF GGGRFRELL+KYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLL+KLHMDGFSSKDQ QTSP E  SSVDDG VIEE P SE QST++Q PRT+
Subjt:  MAFF-GGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTK

Query:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPIT+ LTPPIAR+LARRGIM+SG
Subjt:  NRTAELAASTGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G20940.1 Protein of unknown function (DUF1279)

4.0e-33

53.47

Show/hide

Query:  RFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTKNRTAELAA
        R +E+++KYGKVA+GVHFSVS  SI+G Y+AIKNNVDVESLLEK  +  FSSK+ P                    P+ +++     +  + N+T +LA 
Subjt:  RFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTKNRTAELAA

Query:  STGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG
        S GGALALAVLCNKAL PIR+PIT+ALTPPIAR L +R I+K+G
Subjt:  STGGALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCTTTCTTCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGTACGGAAAGGTCGCAATCGGAGTTCATTTCTCCGTGTCGGCGGCTTCGATCACTGGCCTCTATGT
CGCCATCAAGAATAATGTCGATGTCGAATCGCTACTCGAAAAATTACACATGGATGGATTCTCTTCCAAAGATCAGCCGCAGACGAGCCCCTCCGAAATCACATCTTCCG
TAGATGATGGATTTGTGATCGAGGAAAGACCTACGTCAGAAATTCAATCGACGTTGTCGCAGGCGCCGAGGACGAAGAATCGTACAGCCGAGCTCGCAGCGTCGACTGGC
GGCGCGTTGGCTTTGGCAGTTCTTTGCAACAAGGCGTTGCTGCCGATTCGAATTCCGATCACGGTTGCGCTCACGCCGCCGATTGCGAGGCTGCTGGCGAGGCGAGGGAT
TATGAAAAGTGGTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AATTTCAAAACGTTGTCGTATTCACAAAACGCCTCACTCGAAAATAAATTCCTAACAAAAGGAAGGATTTTGAAACCCCACGCCCAGAAACTTCGAAACCCTAGTCTTCA
CCCTCCACCGCAAGCTCCGACGCGCCGCCTCCCCTTCCCGGACCTTTTCCCTTCTCTTTCATCAATGGCTTTCTTCGGCGGCGGCCGATTCCGCGAGCTTCTCAGGAAGT
ACGGAAAGGTCGCAATCGGAGTTCATTTCTCCGTGTCGGCGGCTTCGATCACTGGCCTCTATGTCGCCATCAAGAATAATGTCGATGTCGAATCGCTACTCGAAAAATTA
CACATGGATGGATTCTCTTCCAAAGATCAGCCGCAGACGAGCCCCTCCGAAATCACATCTTCCGTAGATGATGGATTTGTGATCGAGGAAAGACCTACGTCAGAAATTCA
ATCGACGTTGTCGCAGGCGCCGAGGACGAAGAATCGTACAGCCGAGCTCGCAGCGTCGACTGGCGGCGCGTTGGCTTTGGCAGTTCTTTGCAACAAGGCGTTGCTGCCGA
TTCGAATTCCGATCACGGTTGCGCTCACGCCGCCGATTGCGAGGCTGCTGGCGAGGCGAGGGATTATGAAAAGTGGTTAACAAACTGAATCCATCTCATTTCTTCTTTAT
CTTTCTTGTATGTTGGATCGGCGATGGTAGATTAGAATTGAGCTTTCATGGCTGTGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCGCGATCAGCGGAGTATTGTGATCCATTTTC
TACCTTCTTTCTGGATTTTTTTCAAGAAAGATTTGTTGTTGTGTTGATTTTAAGACACATTCAGAAAAAAAGATATTTCTGTTCACCTTGTTAAAATACCAAATAAATAA
AATCTCACTCCTTG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAFFGGGRFRELLRKYGKVAIGVHFSVSAASITGLYVAIKNNVDVESLLEKLHMDGFSSKDQPQTSPSEITSSVDDGFVIEERPTSEIQSTLSQAPRTKNRTAELAASTG
GALALAVLCNKALLPIRIPITVALTPPIARLLARRGIMKSG

Tan0001446 (gene) of Snake gourd v1 genome