; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0001541 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0001541
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUbiquitin-specific protease family C19-related protein
Genome locationLG04:88012821..88018191
RNA-Seq ExpressionTan0001541
SyntenyTan0001541
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036386.1 putative membrane protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.9e-26594.95Show/hide
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XP_022148284.1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like [Momordica charantia]3.2e-26796.71Show/hide
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XP_022948724.1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like isoform X1 [Cucurbita moschata]2.7e-26696.49Show/hide
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XP_023523761.1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-26796.91Show/hide
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XP_038894482.1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like [Benincasa hispida]2.9e-26596.08Show/hide
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A0A1S3CC62 uncharacterized membrane protein At1g16860-like1.6e-26495.67Show/hide
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A0A6J1D4X9 uncharacterized membrane protein At1g16860-like1.5e-26796.71Show/hide
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A0A6J1GAR9 uncharacterized membrane protein At1g16860-like isoform X11.3e-26696.49Show/hide
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A0A6J1GVZ4 uncharacterized membrane protein At1g16860-like2.1e-26495.67Show/hide
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A0A6J1K8U1 uncharacterized membrane protein At1g16860-like isoform X17.8e-26495.26Show/hide
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        GSL SQGIS SASL+KSNSGPLSKHGEPVKKLSGPQS GVTPTGRQNSGPLPP LPATGLITSGPISSGPLNSSGAPRKVSGPLES+GS+KLQGSAAHSH
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        +VTTLTYDDDYSFAKNFPKIVLWSLILLFVMGFIAGGFILGAVH+AILLIVVV+LFGAVCTLFIWNTYWGRRA  GFI+RYPDSELRTAKNGQFVKVSGV
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        VTCGNMPLESSFQKVPRCVYTSTSLYEYR WSSKAANPTHRRFTWGLRSLERHVVDFYISDFQSGLRALVKTGYGARVTPYVDDPIVIDVNPVNEELSPD
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        FIRWLGERNLSSDGRVMRLREG+IKEGSTVSVMGVVQRNENVLMIVPPPDPIA GCEWSKCIFP SIEG+VLQCED SKNDVIPV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FZ45 Uncharacterized membrane protein At1g168601.8e-19371.6Show/hide
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        M SR PSHQLSNGL+VSGRPEQPKE+ P MS+VAMPYTGGDIK+SGELGKMFDIP DG+KS+KSGPI G   RSGSF G A  SGP  P AT R     S
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Query:  GSLPSQGISSSASLKKSNSGPLSKHGEPVKKLSGPQSGGVTPTGRQNSGPLPPVLPATGLITSGPISSGPLNSSGAPRKVSGPLESMGSMKL-QGSAAHS
        GSL S G   S S+KK+NSGPLSKHGEP+KK SGPQSGGVT   RQNSG + P+LPATGLITSGPI+SGPLNSSGAPRKVSGPL+S G MK    +  H+
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         AVTTL  +DD+S  K+FPK VLW ++L+F+MGF+AGGFILGAVHN ILL+VV +LF  V  LFIWN  WGRR I  FIARYPD++LRTAKNGQ VKV+G
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        VVTCGN+PLESSF +VPRCVYTST LYEYRGW SK AN +HR FTWGLRS ERHVVDFYISDFQSGLRALVKTG GA+VTP VDD +VID    +E++SP
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        DF+RWLG++NL+SD R+MRL+EGYIKEGSTVSV+GVVQRN+NVLMIVP  +P+A+G +W +C FP S+EG+VL+CED+S  D IPV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G16860.1 Ubiquitin-specific protease family C19-related protein1.3e-19471.6Show/hide
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        M SR PSHQLSNGL+VSGRPEQPKE+ P MS+VAMPYTGGDIK+SGELGKMFDIP DG+KS+KSGPI G   RSGSF G A  SGP  P AT R     S
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Query:  GSLPSQGISSSASLKKSNSGPLSKHGEPVKKLSGPQSGGVTPTGRQNSGPLPPVLPATGLITSGPISSGPLNSSGAPRKVSGPLESMGSMKL-QGSAAHS
        GSL S G   S S+KK+NSGPLSKHGEP+KK SGPQSGGVT   RQNSG + P+LPATGLITSGPI+SGPLNSSGAPRKVSGPL+S G MK    +  H+
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         AVTTL  +DD+S  K+FPK VLW ++L+F+MGF+AGGFILGAVHN ILL+VV +LF  V  LFIWN  WGRR I  FIARYPD++LRTAKNGQ VKV+G
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        VVTCGN+PLESSF +VPRCVYTST LYEYRGW SK AN +HR FTWGLRS ERHVVDFYISDFQSGLRALVKTG GA+VTP VDD +VID    +E++SP
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        DF+RWLG++NL+SD R+MRL+EGYIKEGSTVSV+GVVQRN+NVLMIVP  +P+A+G +W +C FP S+EG+VL+CED+S  D IPV
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AT1G78880.1 Ubiquitin-specific protease family C19-related protein6.3e-19773.46Show/hide
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        M SR  SHQLSNGL+VSGRPEQPKEK P MSSVAMPYTGGDIKKSGELGKMFDIP DG+KS+KSGPITGGS RSG      + SGP+ PNAT R     S
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Query:  GSLPSQGISSSASLKKSNSGPLSKHGEPVKKLSGPQSGGVTPTGRQNSGPLPPVLPATGLITSGPISSGPLNSSGAPRKVSGPLESMGSMKL-QGSAAHS
        G+L S G   S S+KK+NSGPLSKHGEP+KK SGPQSGGVT   RQNSGP+ P+LP TGLITSGPI+SGPLNSSGAPRK+SGPL+  GSMK    S  H+
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Query:  HAVTTLTYDDDYSFAKNFPKIVLWSLILLFVMGFIAGGFILGAVHNAILLIVVVVLFGAVCTLFIWNTYWGRRAIRGFIARYPDSELRTAKNGQFVKVSG
         AVTTL  +DD+S  K+FPK VLW +IL+FVMGF+AGGFILGAVHNAILLIVV VLF  V  LFIWN    RR I  FIARYPD++LRTAKNGQ+VKV+G
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        VVTCGN+PLESSF +VPRCVYTST LYEYRGW SK AN +HRRFTWGLRS ERHVVDFYISDFQSGLRALVKTG GA+VTP VDD +VID  P NE+ SP
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        DF+RWLG++NL++D R+MRL+EGYIKEGSTVSV+GVVQRN+NVLMIVP  +P+A+G +WSKC FPAS+EG+VL+CED+S  D IPV
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AT4G22290.1 Ubiquitin-specific protease family C19-related protein1.2e-11547.95Show/hide
Query:  MSSRIPSHQLSNGLYVSGRPEQPKEKTPMMSSVAMPYTGGDIKKSGELGKMFDIPVDGSKSKKSGP--ITGGSLRSGSFGGVASHSGPIMPNATARTMYT
        M+ RI SHQL NGLYVSG+ EQPKE+ P M++ A+PYTGGDIKKSGELG+MFDI V  S S +  P  I GG+    S GG +    P  P  +  +   
Subjt:  MSSRIPSHQLSNGLYVSGRPEQPKEKTPMMSSVAMPYTGGDIKKSGELGKMFDIPVDGSKSKKSGP--ITGGSLRSGSFGGVASHSGPIMPNATARTMYT

Query:  TSGSLPSQGISSSASLKKSNSGPLSKHGEPVKKLSGPQSGGVTPTGRQNSGPLPPVLPATGLITSGPI-SSGPLNSSGAPRKVSGPLESMGSMKLQGSAA
         SGS+                             SGP SG V    ++ SGPL  + P TGLITSG + SSGP+  SG+ R  SG L+   S        
Subjt:  TSGSLPSQGISSSASLKKSNSGPLSKHGEPVKKLSGPQSGGVTPTGRQNSGPLPPVLPATGLITSGPI-SSGPLNSSGAPRKVSGPLESMGSMKLQGSAA

Query:  HSHAVTTLTYDDDYSFAKNFPKIVLWSLILLFVMGFIAGGFILGAVHNAILLIVVVVLFGAVCTLFIWNTYWGRRAIRGFIARYPDSELRTAKNGQFVKV
        +  +VT+L   D        PK ++W+++++  MG + G F+  AV   +++  V+        + +WN  W R+ +  FI +YPD+ELR A +GQFVKV
Subjt:  HSHAVTTLTYDDDYSFAKNFPKIVLWSLILLFVMGFIAGGFILGAVHNAILLIVVVVLFGAVCTLFIWNTYWGRRAIRGFIARYPDSELRTAKNGQFVKV

Query:  SGVVTCGNMPLESSFQKVPRCVYTSTSLYEYRGWSSKAANPTHRRFTWGLRSLERHVVDFYISDFQSGLRALVKTGYGARVTPYVDDPIVIDVNPVNEEL
        +GVVTCG++PLESSFQ+ PRCVY ST LYEY+G+  K+ANP HR F+WG R  E++V DFYISDFQSGLRALVK GYG++V+P+V    V +V   N++L
Subjt:  SGVVTCGNMPLESSFQKVPRCVYTSTSLYEYRGWSSKAANPTHRRFTWGLRSLERHVVDFYISDFQSGLRALVKTGYGARVTPYVDDPIVIDVNPVNEEL

Query:  SPDFIRWLGERNLSSDGRVMRLREGYIKEGSTVSVMGVVQRNENVLMIVPPPDPIASGCEWSKCIFPASIEGVVLQCEDTSKNDVIPV
        SP F++WL +RNLS+D RVMRL+EGYIKEGSTVSVMG+V+R++NVLMIVPP + ++SGC W  C+FP   +G+++ C+D    DVIPV
Subjt:  SPDFIRWLGERNLSSDGRVMRLREGYIKEGSTVSVMGVVQRNENVLMIVPPPDPIASGCEWSKCIFPASIEGVVLQCEDTSKNDVIPV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTTCCAGAATACCATCTCATCAGCTTAGCAATGGCCTCTACGTATCAGGGAGGCCTGAGCAGCCTAAGGAGAAAACTCCAATGATGAGCTCTGTAGCCATGCCCTA
TACTGGTGGAGATATTAAGAAATCGGGAGAGCTAGGGAAGATGTTTGATATTCCTGTGGATGGCTCCAAGTCCAAGAAGTCAGGACCTATAACTGGTGGCTCGTTGAGGT
CTGGATCTTTCGGAGGTGTTGCATCTCATTCTGGACCTATCATGCCTAATGCTACAGCTCGCACCATGTATACCACTTCAGGTTCTTTACCTTCTCAAGGCATTTCTAGT
TCTGCTTCATTAAAGAAATCAAATTCTGGACCTCTGAGTAAGCATGGGGAACCTGTAAAGAAGTTGTCTGGTCCACAGTCTGGTGGAGTAACACCTACTGGTCGTCAAAA
CTCTGGGCCTCTTCCTCCTGTACTACCTGCAACGGGCCTTATCACATCAGGACCCATTTCTTCCGGCCCTCTAAATTCTTCTGGAGCTCCACGGAAGGTTTCTGGTCCTT
TAGAATCAATGGGATCCATGAAATTACAGGGTTCTGCAGCTCATAGTCATGCTGTGACTACTCTTACTTATGATGATGATTATTCATTTGCAAAGAACTTCCCAAAGATA
GTATTATGGTCATTAATTCTTCTATTTGTGATGGGCTTTATTGCTGGGGGATTTATTCTTGGAGCTGTCCATAATGCGATCCTCCTCATTGTGGTTGTGGTTCTTTTTGG
TGCCGTTTGTACACTTTTCATTTGGAATACTTACTGGGGAAGAAGAGCAATTAGGGGTTTCATTGCTCGCTATCCAGATTCCGAACTTAGAACTGCAAAGAATGGACAAT
TTGTGAAGGTCTCTGGGGTGGTTACCTGCGGTAACATGCCTCTTGAGTCTTCCTTCCAAAAGGTTCCAAGATGTGTATATACGTCAACGAGTTTATATGAGTACCGTGGG
TGGAGTTCCAAAGCTGCTAATCCTACACATCGCCGTTTTACTTGGGGGCTCAGATCACTAGAAAGACATGTGGTTGACTTCTACATCTCTGATTTTCAATCTGGATTAAG
AGCATTGGTTAAGACTGGTTATGGTGCGAGGGTGACTCCTTATGTTGACGATCCAATTGTTATTGATGTTAATCCAGTAAACGAAGAATTGTCTCCAGACTTCATCAGGT
GGTTAGGAGAAAGAAATCTTTCAAGTGATGGTCGAGTAATGCGTTTAAGAGAAGGGTATATCAAGGAAGGAAGCACTGTCAGTGTAATGGGAGTTGTTCAGAGAAACGAA
AATGTGCTGATGATCGTCCCTCCGCCGGATCCAATCGCAAGTGGGTGTGAATGGAGCAAGTGTATTTTTCCAGCTAGTATTGAAGGTGTTGTTTTGCAATGTGAAGACAC
GTCGAAGAACGATGTGATACCTGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAGGACGGTACTGAATAGCGATGATTACCAATAATTACAAAATTAATTATTTCCAATTCTGTTTAGATTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTGGGGAGGGGCTGTCAAA
ACCCACCAGTCGATGCGGTTCTCCGCAGGGAGAGGGAGAGCGACGGAAGTCAGATAGCGAGCGGGCGAGCGAGCGAGAGAGGAAACTAACTGTTGTCTTTGAGACACATT
CTTAGAGAGAGGAATTGAGATTGAGACGGAGATTTGGATTGGTTTTGGAAGTTTCTGTTTTCGACGCATTATGTTTCCTAATCTCTGGATTTCTGCTATTACAGCTACTG
TCACTGCTTTTCCTACTGGAGAGACTTGAGTATTACATCGGCTGCTGATATTTCTGTTGGGTTAATTCCTGTGGATTATTTTGAAGTGGCAAGATGAGTTCCAGAATACC
ATCTCATCAGCTTAGCAATGGCCTCTACGTATCAGGGAGGCCTGAGCAGCCTAAGGAGAAAACTCCAATGATGAGCTCTGTAGCCATGCCCTATACTGGTGGAGATATTA
AGAAATCGGGAGAGCTAGGGAAGATGTTTGATATTCCTGTGGATGGCTCCAAGTCCAAGAAGTCAGGACCTATAACTGGTGGCTCGTTGAGGTCTGGATCTTTCGGAGGT
GTTGCATCTCATTCTGGACCTATCATGCCTAATGCTACAGCTCGCACCATGTATACCACTTCAGGTTCTTTACCTTCTCAAGGCATTTCTAGTTCTGCTTCATTAAAGAA
ATCAAATTCTGGACCTCTGAGTAAGCATGGGGAACCTGTAAAGAAGTTGTCTGGTCCACAGTCTGGTGGAGTAACACCTACTGGTCGTCAAAACTCTGGGCCTCTTCCTC
CTGTACTACCTGCAACGGGCCTTATCACATCAGGACCCATTTCTTCCGGCCCTCTAAATTCTTCTGGAGCTCCACGGAAGGTTTCTGGTCCTTTAGAATCAATGGGATCC
ATGAAATTACAGGGTTCTGCAGCTCATAGTCATGCTGTGACTACTCTTACTTATGATGATGATTATTCATTTGCAAAGAACTTCCCAAAGATAGTATTATGGTCATTAAT
TCTTCTATTTGTGATGGGCTTTATTGCTGGGGGATTTATTCTTGGAGCTGTCCATAATGCGATCCTCCTCATTGTGGTTGTGGTTCTTTTTGGTGCCGTTTGTACACTTT
TCATTTGGAATACTTACTGGGGAAGAAGAGCAATTAGGGGTTTCATTGCTCGCTATCCAGATTCCGAACTTAGAACTGCAAAGAATGGACAATTTGTGAAGGTCTCTGGG
GTGGTTACCTGCGGTAACATGCCTCTTGAGTCTTCCTTCCAAAAGGTTCCAAGATGTGTATATACGTCAACGAGTTTATATGAGTACCGTGGGTGGAGTTCCAAAGCTGC
TAATCCTACACATCGCCGTTTTACTTGGGGGCTCAGATCACTAGAAAGACATGTGGTTGACTTCTACATCTCTGATTTTCAATCTGGATTAAGAGCATTGGTTAAGACTG
GTTATGGTGCGAGGGTGACTCCTTATGTTGACGATCCAATTGTTATTGATGTTAATCCAGTAAACGAAGAATTGTCTCCAGACTTCATCAGGTGGTTAGGAGAAAGAAAT
CTTTCAAGTGATGGTCGAGTAATGCGTTTAAGAGAAGGGTATATCAAGGAAGGAAGCACTGTCAGTGTAATGGGAGTTGTTCAGAGAAACGAAAATGTGCTGATGATCGT
CCCTCCGCCGGATCCAATCGCAAGTGGGTGTGAATGGAGCAAGTGTATTTTTCCAGCTAGTATTGAAGGTGTTGTTTTGCAATGTGAAGACACGTCGAAGAACGATGTGA
TACCTGTTTAGCATCATGAACTCGTTTGACTTACTGAGCCTTTGCTCACATAAGAATCTTCTTTCCTCATTTAATATTTGCTTTGTTGGTGGTGGAGATTGTAGGTAGGT
AGGTTAGGACTGATGAATTGACAGAGATTGCGATGGATGGGATGGTGTTGTTTTTAGTTTTGGTGTATAGTTTTCGAGGGTTTCTTTTCCATGTTTTTGGTGGAGGGAAA
GGGCATGAGAAAGCTTCTTGTAATAGGGAATGGGGCTTGGTGCTTGTGGAGAATTCAACTAGTTTAAGAAGATTGACGACTTAATGTTAAATAGAATGAAAATGTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSRIPSHQLSNGLYVSGRPEQPKEKTPMMSSVAMPYTGGDIKKSGELGKMFDIPVDGSKSKKSGPITGGSLRSGSFGGVASHSGPIMPNATARTMYTTSGSLPSQGISS
SASLKKSNSGPLSKHGEPVKKLSGPQSGGVTPTGRQNSGPLPPVLPATGLITSGPISSGPLNSSGAPRKVSGPLESMGSMKLQGSAAHSHAVTTLTYDDDYSFAKNFPKI
VLWSLILLFVMGFIAGGFILGAVHNAILLIVVVVLFGAVCTLFIWNTYWGRRAIRGFIARYPDSELRTAKNGQFVKVSGVVTCGNMPLESSFQKVPRCVYTSTSLYEYRG
WSSKAANPTHRRFTWGLRSLERHVVDFYISDFQSGLRALVKTGYGARVTPYVDDPIVIDVNPVNEELSPDFIRWLGERNLSSDGRVMRLREGYIKEGSTVSVMGVVQRNE
NVLMIVPPPDPIASGCEWSKCIFPASIEGVVLQCEDTSKNDVIPV