CuGenDBv2

Gene ID	Tan0001854
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	leucine-rich repeat extensin-like protein 3
Genome location	LG11:9809563..9810654
RNA-Seq Expression	Tan0001854
Synteny	Tan0001854
Gene Ontology terms	GO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR044950 - Protein TRACHEARY ELEMENT DIFFERENTIATION-RELATED 6/7

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0058883.1 basic salivary proline-rich protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]

1.3e-82

67.34

Show/hide

Query:  MASINNNSDYYFPYFP----LPPYHPFRPP------------PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-----------PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRK
        MASI NNS+YY+P+FP     PP++P  PP            PP  KP  PPP PP  PP KPI            PPP KPIV PP PQKPTAPPPPRK
Subjt:  MASINNNSDYYFPYFP----LPPYHPFRPP------------PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-----------PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRK

Query:  PFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPI------------------APPPPPQKPTTPPPPRKPIA-PPPPKKPIAP-
        P  P PPPPQKP  PPPP KPI P PPPQ+PTAPPPPRKPIAPPPP+KP+                  APPPPP+KP  PPPP+KP A PPPPKKP+AP 
Subjt:  PFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPI------------------APPPPPQKPTTPPPPRKPIA-PPPPKKPIAP-

Query:  ----PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVL--PPPPPPHHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEG
            P+TPPPPHKPI  PPPPYKPISPPSP+L  PPPPPPHHHPTVII+VF+SLGG+CL+ FMAAALFCFV+KRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEG
Subjt:  ----PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVL--PPPPPPHHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEG

Query:  PHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQK-GLHRTHEPGDPTTI
        PHGSC+TVVLSVEDDIHVNEEII  +K+G+K  LH T+E GDP TI
Subjt:  PHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQK-GLHRTHEPGDPTTI

XP_022939566.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 isoform X4 [Cucurbita moschata]

3.2e-81

69.62

Show/hide

Query:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPP-PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRKPFTP--SPPPPQKPI----TPPPPA
        MAS+N +    +PYFPLPPYHPF PP PP  KP  PPP PP  PP +P   PPP KPI  PP P+KPTAPPPPRKP  P  +PPPP+KPI     PPPP 
Subjt:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPP-PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRKPFTP--SPPPPQKPI----TPPPPA

Query:  KPITPAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP-----PLTPPPPHKPITPPPP----------PYKPISPP
        KPI P PPP KPTAPPPPRKPIAPPPP+KP+A PPPP+KP  PPPP+KP+APPPP+KPIAP     P+ PPPP KPITPPPP          PYKPISPP
Subjt:  KPITPAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP-----PLTPPPPHKPITPPPP----------PYKPISPP

Query:  SPVLPPPPPP-HHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVG
        SP+LPPPPPP +HHPTVIIIV +S+GG+ L+AFMAAA FCFV+KRKEK++EETEIIHIDEHRKIKEAIV GPHGSCET VLSVEDDIH+ EEI+ ++KVG
Subjt:  SPVLPPPPPP-HHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVG

Query:  QKGLHRTHEPGDPTTI
        +KGLH  HE GDP++I
Subjt:  QKGLHRTHEPGDPTTI

XP_022939570.1 basic salivary proline-rich protein 1-like isoform X8 [Cucurbita moschata]

1.2e-80

72.54

Show/hide

Query:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPP-PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPA
        MAS+N +    +PYFPLPPYHPF PP PP  KP  PPP PP  PP +P   PPP KPI  PP PQKPTAPPPP KP    PPPP KP  PPPP KPI P 
Subjt:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPP-PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPA

Query:  PPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAPPLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVLPPPPPP-HHHPTVIIIV
        PPP+KP APPPPRKPIAPPPP+KP+A PPPP+KP  PPPP+KP+APPPP+KPI PP  PPPPHKPI  PP PYKPISPPSP+LPPPPPP +HHPTVIIIV
Subjt:  PPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAPPLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVLPPPPPP-HHHPTVIIIV

Query:  FISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQKGLHRTHEPGDPTTI
         +S+GG+ L+AFMAAA FCFV+KRKEK++EETEIIHIDEHRKIKEAIV GPHGSCET VLSVEDDIH+ EEI+ ++KVG+KGLH  HE GDP++I
Subjt:  FISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQKGLHRTHEPGDPTTI

XP_022993902.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 isoform X4 [Cucurbita maxima]

3.2e-81

69.4

Show/hide

Query:  NNSDYYFPYFPLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPI-----------TPPPHKPIVPPSP----QKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPP
        N SD+  PYFPLPPYHPF        PPLPPP  P+ PPYKP+            PPP +PIVPP P    +KPTAPPPPRKP  P+ PPP KP  PPPP
Subjt:  NNSDYYFPYFPLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPI-----------TPPPHKPIVPPSP----QKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPP

Query:  AKPITPAPPPQKPTAPPPPRKPI----------APPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP-----PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISP
         KPI P PPPQKPTAPPPPRKPI          APPPPRKPI  PPPP KPT PPPPRKPIAPPPPKKP+AP     P+TPPPPHKPI  PP PYKPISP
Subjt:  AKPITPAPPPQKPTAPPPPRKPI----------APPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP-----PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISP

Query:  PSPVLPPPPPP-HHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKV
        PSP+LPPPPPP +HHPTVIIIV +SLGG+ L+AFMAAA FCFV+KRKEK++EETEIIHIDEHRKIKEA V GPHGSCET+VLSVEDDIH+ EEI+ ++KV
Subjt:  PSPVLPPPPPP-HHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKV

Query:  GQKGLHRTHEPGDPTTI
        G KGLH THE GDP++I
Subjt:  GQKGLHRTHEPGDPTTI

XP_038884025.1 basic salivary proline-rich protein 2-like [Benincasa hispida]

2.1e-93

68.25

Show/hide

Query:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT---------------------PPPHKPIVP------------------PSP
        MASI NNSDYYFP+FP PPYHPF+PPP     P+ PPSPPLFPP+KPIT                     PPP KPIVP                  P P
Subjt:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT---------------------PPPHKPIVP------------------PSP

Query:  QKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPAPPPQKPTAPPPPRK-----PIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP----
        QKPTAPPPPRKP  PS PPPQKPI PPPP KPI P PPPQKP APPPPRK     PIAPPPPRKP+ PPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPP+KPIAP    
Subjt:  QKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPAPPPQKPTAPPPPRK-----PIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP----

Query:  -------------------PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVL-PPPPPPHHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIH
                           P TPPPPHKPI  PPPPYKPISPPSP+L PPPPPPHHHPTVIIIVF+SLGG+ L+AFMAAALFCFV+KR+EK+VEETEIIH
Subjt:  -------------------PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVL-PPPPPPHHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIH

Query:  IDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQKGLHRTHEPGDPTTI
        IDEHRKIKEAIVEGPHGSC+TVVLSVEDDIHV EEI+ T+K+G+K LHRTHE GDP+TI
Subjt:  IDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQKGLHRTHEPGDPTTI

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KFA4 Carboxypeptidase

3.5e-81

73.51

Show/hide

Query:  PLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKP----ITPPPHKPIV--PPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPIT-PAPPPQKPTAPPP
        P PP  P  PPPP      PPP  PL PP  P      PPP KPIV  PP PQKPTAPPPPRKP  P PPPPQKP  PPPP KPI  P PPPQKPTAPPP
Subjt:  PLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKP----ITPPPHKPIV--PPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPIT-PAPPPQKPTAPPP

Query:  PRKPI-----------APPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP------PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVL-PPPPPPHHHP
        PRKPI           APPPPRKPI PPPPPQKPT PPPPRKPIAPPPPKKP AP      P+ PPPPHKPI  PPPPYKPISPPSP+L PPPPPPHHHP
Subjt:  PRKPI-----------APPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP------PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVL-PPPPPPHHHP

Query:  TVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKV-GQKGLHRTHEPGDPT
        TVIIIVF+SLGG+CL+ FMAAALFCFV+KRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSC+TVVLSVEDDIHVNEEII  +K+ G++ LH T+E GDP+
Subjt:  TVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKV-GQKGLHRTHEPGDPT

Query:  TI
        +I
Subjt:  TI

A0A5A7USI7 Basic salivary proline-rich protein 2

6.3e-83

67.34

Show/hide

Query:  MASINNNSDYYFPYFP----LPPYHPFRPP------------PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-----------PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRK
        MASI NNS+YY+P+FP     PP++P  PP            PP  KP  PPP PP  PP KPI            PPP KPIV PP PQKPTAPPPPRK
Subjt:  MASINNNSDYYFPYFP----LPPYHPFRPP------------PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-----------PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRK

Query:  PFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPI------------------APPPPPQKPTTPPPPRKPIA-PPPPKKPIAP-
        P  P PPPPQKP  PPPP KPI P PPPQ+PTAPPPPRKPIAPPPP+KP+                  APPPPP+KP  PPPP+KP A PPPPKKP+AP 
Subjt:  PFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPI------------------APPPPPQKPTTPPPPRKPIA-PPPPKKPIAP-

Query:  ----PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVL--PPPPPPHHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEG
            P+TPPPPHKPI  PPPPYKPISPPSP+L  PPPPPPHHHPTVII+VF+SLGG+CL+ FMAAALFCFV+KRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEG
Subjt:  ----PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVL--PPPPPPHHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEG

Query:  PHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQK-GLHRTHEPGDPTTI
        PHGSC+TVVLSVEDDIHVNEEII  +K+G+K  LH T+E GDP TI
Subjt:  PHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQK-GLHRTHEPGDPTTI

A0A6J1FGA1 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 isoform X4

1.6e-81

69.62

Show/hide

Query:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPP-PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRKPFTP--SPPPPQKPI----TPPPPA
        MAS+N +    +PYFPLPPYHPF PP PP  KP  PPP PP  PP +P   PPP KPI  PP P+KPTAPPPPRKP  P  +PPPP+KPI     PPPP 
Subjt:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPP-PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRKPFTP--SPPPPQKPI----TPPPPA

Query:  KPITPAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP-----PLTPPPPHKPITPPPP----------PYKPISPP
        KPI P PPP KPTAPPPPRKPIAPPPP+KP+A PPPP+KP  PPPP+KP+APPPP+KPIAP     P+ PPPP KPITPPPP          PYKPISPP
Subjt:  KPITPAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP-----PLTPPPPHKPITPPPP----------PYKPISPP

Query:  SPVLPPPPPP-HHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVG
        SP+LPPPPPP +HHPTVIIIV +S+GG+ L+AFMAAA FCFV+KRKEK++EETEIIHIDEHRKIKEAIV GPHGSCET VLSVEDDIH+ EEI+ ++KVG
Subjt:  SPVLPPPPPP-HHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVG

Query:  QKGLHRTHEPGDPTTI
        +KGLH  HE GDP++I
Subjt:  QKGLHRTHEPGDPTTI

A0A6J1FN35 basic salivary proline-rich protein 1-like isoform X8

5.9e-81

72.54

Show/hide

Query:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPP-PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPA
        MAS+N +    +PYFPLPPYHPF PP PP  KP  PPP PP  PP +P   PPP KPI  PP PQKPTAPPPP KP    PPPP KP  PPPP KPI P 
Subjt:  MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPP-PPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPIT-PPPHKPIV-PPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPA

Query:  PPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAPPLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVLPPPPPP-HHHPTVIIIV
        PPP+KP APPPPRKPIAPPPP+KP+A PPPP+KP  PPPP+KP+APPPP+KPI PP  PPPPHKPI  PP PYKPISPPSP+LPPPPPP +HHPTVIIIV
Subjt:  PPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAPPLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVLPPPPPP-HHHPTVIIIV

Query:  FISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQKGLHRTHEPGDPTTI
         +S+GG+ L+AFMAAA FCFV+KRKEK++EETEIIHIDEHRKIKEAIV GPHGSCET VLSVEDDIH+ EEI+ ++KVG+KGLH  HE GDP++I
Subjt:  FISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQKGLHRTHEPGDPTTI

A0A6J1JU70 leucine-rich repeat extensin-like protein 3 isoform X4

1.6e-81

69.4

Show/hide

Query:  NNSDYYFPYFPLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPI-----------TPPPHKPIVPPSP----QKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPP
        N SD+  PYFPLPPYHPF        PPLPPP  P+ PPYKP+            PPP +PIVPP P    +KPTAPPPPRKP  P+ PPP KP  PPPP
Subjt:  NNSDYYFPYFPLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPI-----------TPPPHKPIVPPSP----QKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPP

Query:  AKPITPAPPPQKPTAPPPPRKPI----------APPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP-----PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISP
         KPI P PPPQKPTAPPPPRKPI          APPPPRKPI  PPPP KPT PPPPRKPIAPPPPKKP+AP     P+TPPPPHKPI  PP PYKPISP
Subjt:  AKPITPAPPPQKPTAPPPPRKPI----------APPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAP-----PLTPPPPHKPITPPPPPYKPISP

Query:  PSPVLPPPPPP-HHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKV
        PSP+LPPPPPP +HHPTVIIIV +SLGG+ L+AFMAAA FCFV+KRKEK++EETEIIHIDEHRKIKEA V GPHGSCET+VLSVEDDIH+ EEI+ ++KV
Subjt:  PSPVLPPPPPP-HHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKV

Query:  GQKGLHRTHEPGDPTTI
        G KGLH THE GDP++I
Subjt:  GQKGLHRTHEPGDPTTI

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

C1PGW1 Protein TRACHEARY ELEMENT DIFFERENTIATION-RELATED 7A

1.9e-20

43.46

Show/hide

Query:  SDYYFPYFPLP---------PYHPFRPPPPAVKPP---LPPPSPPLFPPYKPITPPPHKPIVPPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPIT
        S   FP+FP P         P  P  PPP  + PP   +PPPSPP         PPP  P+ PPSP  P +PPP   P    PP P  P++PPP      
Subjt:  SDYYFPYFPLP---------PYHPFRPPPPAVKPP---LPPPSPPLFPPYKPITPPPHKPIVPPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPIT

Query:  PAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAPPLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSP-VLPPPPP-PHHHPTVI
        P P P  P  PPP       PPP     PPPP   P   PP   P  PPPP     PP T PPP  P    PPP   +SPP P ++PPPPP P +H T I
Subjt:  PAPPPQKPTAPPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAPPLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSP-VLPPPPP-PHHHPTVI

Query:  IIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVG-QKGLHRTH------EPG
        +++F+S GGV  +AF  AAL+CF++K+K+K V++ E IH DEHRK+ E I +GPHG+ ET +LSVEDDIH+ E+I  ++    +KGLH  +      + G
Subjt:  IIVFISLGGVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVG-QKGLHRTH------EPG

Query:  DPTTIF
         P++ F
Subjt:  DPTTIF

Q9FI79 Protein TRACHEARY ELEMENT DIFFERENTIATION-RELATED 7

1.3e-13

49.71

Show/hide

Query:  APPPPRKPI-APPPPPQKPTTPPPPRKPIAPP--PPKKPIAPPLTPPP---PHKPITPPPPPY-KPISPPSP--VLPPPPP---PHHHPTVIIIVFISLG
        +PP  + P+ +P PPP    +PPPP  P +PP  PP    +PP  PPP   PH P  PPP PY  P  PP P  VLPPPPP   P HH  VII+V ISLG
Subjt:  APPPPRKPI-APPPPPQKPTTPPPPRKPIAPP--PPKKPIAPPLTPPP---PHKPITPPPPPY-KPISPPSP--VLPPPPP---PHHHPTVIIIVFISLG

Query:  GVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQ
         +  +AF+AAALFC+++KR+ KS  + EII  DEH K++E IV+GPHG  +T V+ +E+DIH+ E+I  T+K+ +
Subjt:  GVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQ

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G48920.1 tracheary element differentiation-related 7

9.5e-15

49.71

Show/hide

Query:  APPPPRKPI-APPPPPQKPTTPPPPRKPIAPP--PPKKPIAPPLTPPP---PHKPITPPPPPY-KPISPPSP--VLPPPPP---PHHHPTVIIIVFISLG
        +PP  + P+ +P PPP    +PPPP  P +PP  PP    +PP  PPP   PH P  PPP PY  P  PP P  VLPPPPP   P HH  VII+V ISLG
Subjt:  APPPPRKPI-APPPPPQKPTTPPPPRKPIAPP--PPKKPIAPPLTPPP---PHKPITPPPPPY-KPISPPSP--VLPPPPP---PHHHPTVIIIVFISLG

Query:  GVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQ
         +  +AF+AAALFC+++KR+ KS  + EII  DEH K++E IV+GPHG  +T V+ +E+DIH+ E+I  T+K+ +
Subjt:  GVCLVAFMAAALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCTCTATCAATAATAATAGCGACTACTACTTCCCCTATTTTCCTCTGCCACCTTATCATCCTTTTCGGCCACCACCCCCCGCCGTTAAGCCGCCTCTGCCA
CCGCCGTCTCCTCCGTTGTTTCCGCCGTATAAACCAATTACTCCACCACCTCACAAGCCAATTGTGCCACCATCACCTCAAAAGCCAACTGCTCCTCCACCACCA
CGTAAGCCATTTACACCGTCGCCGCCACCACCTCAAAAGCCAATTACTCCACCGCCACCAGCCAAGCCAATTACGCCAGCGCCGCCACCTCAGAAGCCAACTGCG
CCACCGCCACCACGCAAGCCAATTGCTCCTCCACCACCACGCAAACCAATTGCGCCACCGCCACCACCTCAGAAGCCAACTACTCCTCCGCCACCACGTAAGCCA
ATTGCGCCACCGCCACCCAAAAAACCAATTGCTCCACCACTCACACCTCCGCCACCGCACAAGCCAATCACTCCTCCTCCACCACCATACAAGCCAATATCTCCC
CCATCTCCGGTCCTTCCGCCGCCGCCGCCACCTCACCACCACCCGACAGTAATCATAATAGTATTTATCTCATTGGGTGGAGTTTGCCTGGTTGCATTCATGGCA
GCAGCACTGTTCTGTTTCGTGAGAAAGAGAAAGGAGAAAAGTGTGGAAGAAACCGAGATCATCCACATTGACGAACACAGAAAAATCAAAGAAGCCATAGTTGAA
GGACCCCATGGATCATGCGAAACTGTGGTGTTATCAGTTGAAGATGACATCCATGTAAATGAAGAAATCATAAGCACCCAGAAGGTTGGACAAAAAGGGTTGCAT
CGTACGCACGAACCAGGCGATCCAACCACCATCTTCCACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAGACTTTTGTGATATTGATTTCCTTCTAATGGCCTCTATCAATAATAATAGCGACTACTACTTCCCCTATTTTCCTCTGCCACCTTATCATCCTTTTCGGCCAC
CACCCCCCGCCGTTAAGCCGCCTCTGCCACCGCCGTCTCCTCCGTTGTTTCCGCCGTATAAACCAATTACTCCACCACCTCACAAGCCAATTGTGCCACCATCAC
CTCAAAAGCCAACTGCTCCTCCACCACCACGTAAGCCATTTACACCGTCGCCGCCACCACCTCAAAAGCCAATTACTCCACCGCCACCAGCCAAGCCAATTACGC
CAGCGCCGCCACCTCAGAAGCCAACTGCGCCACCGCCACCACGCAAGCCAATTGCTCCTCCACCACCACGCAAACCAATTGCGCCACCGCCACCACCTCAGAAGC
CAACTACTCCTCCGCCACCACGTAAGCCAATTGCGCCACCGCCACCCAAAAAACCAATTGCTCCACCACTCACACCTCCGCCACCGCACAAGCCAATCACTCCTC
CTCCACCACCATACAAGCCAATATCTCCCCCATCTCCGGTCCTTCCGCCGCCGCCGCCACCTCACCACCACCCGACAGTAATCATAATAGTATTTATCTCATTGG
GTGGAGTTTGCCTGGTTGCATTCATGGCAGCAGCACTGTTCTGTTTCGTGAGAAAGAGAAAGGAGAAAAGTGTGGAAGAAACCGAGATCATCCACATTGACGAAC
ACAGAAAAATCAAAGAAGCCATAGTTGAAGGACCCCATGGATCATGCGAAACTGTGGTGTTATCAGTTGAAGATGACATCCATGTAAATGAAGAAATCATAAGCA
CCCAGAAGGTTGGACAAAAAGGGTTGCATCGTACGCACGAACCAGGCGATCCAACCACCATCTTCCACTGATCATCATCTTCATTAAAACCATTCCTAAGCACAA
AAACTTTGGCATTTTGGAATCAACATGAACAATTGAATAAAATAAACGAAACCCAATTAAGTAATATATATATATGTGTGATTATTCGCACTGATAATTAAAAAA
AATTGAATTGATTTTTTCTTCTTCATTTTCCAGAAAATGTGC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MASINNNSDYYFPYFPLPPYHPFRPPPPAVKPPLPPPSPPLFPPYKPITPPPHKPIVPPSPQKPTAPPPPRKPFTPSPPPPQKPITPPPPAKPITPAPPPQKPTA
PPPPRKPIAPPPPRKPIAPPPPPQKPTTPPPPRKPIAPPPPKKPIAPPLTPPPPHKPITPPPPPYKPISPPSPVLPPPPPPHHHPTVIIIVFISLGGVCLVAFMA
AALFCFVRKRKEKSVEETEIIHIDEHRKIKEAIVEGPHGSCETVVLSVEDDIHVNEEIISTQKVGQKGLHRTHEPGDPTTIFH

Tan0001854 (gene) of Snake gourd v1 genome