; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0002379 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0002379
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionrhomboid-like protein 20
Genome locationLG10:26300057..26319298
RNA-Seq ExpressionTan0002379
SyntenyTan0002379
Gene Ontology termsGO:0006508 - proteolysis (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0004252 - serine-type endopeptidase activity (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR009060 - UBA-like superfamily
IPR015940 - Ubiquitin-associated domain
IPR022764 - Peptidase S54, rhomboid domain
IPR035952 - Rhomboid-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596983.1 Rhomboid-like protein 20, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.9e-14994.56Show/hide
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XP_022936013.1 rhomboid-like protein 20 [Cucurbita moschata]1.1e-14994.9Show/hide
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XP_038904170.1 rhomboid-like protein 20 isoform X1 [Benincasa hispida]1.9e-14995.88Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LG81 UBA domain-containing protein1.8e-14894.85Show/hide
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A0A1S3CMQ9 rhomboid-like protein 209.3e-15095.19Show/hide
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A0A5D3D5B1 Rhomboid-like protein 209.3e-15095.19Show/hide
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A0A6J1DN01 rhomboid-like protein 204.5e-15296.92Show/hide
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A0A6J1FC34 rhomboid-like protein 205.5e-15094.9Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q4R910 Ubiquitin-associated domain-containing protein 21.3e-1524.35Show/hide
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        +    P +++ FFS    P   +  + P  + R  M +            + RQ+                      R + P+                 
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         P   E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q5ZJQ8 Ubiquitin-associated domain-containing protein 21.3e-1825.81Show/hide
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        G +G   AP++++ ++  +  +I   +  +  +   +Y    +K   + W+LV          +      L+Y FR+FER+ GS K+S F+L +   S L
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        F++L +   +      +N + SG  G +FA FVPF+  IP     +V G    ++K+ +Y+ GLQLL S     IL  L G+++G  Y  ++  + +   
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         P +++  FS    P   +  A P  ++R  M +            + RQ+                      R + P+                  P  
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        TE  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8NBM4 Ubiquitin-associated domain-containing protein 21.3e-1524.85Show/hide
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        F+ L I  ++      A + + SG    +FA FVPF+  IP     ++ G +  ++K+ IY+ GLQL  S    W    +  + G+++G  Y   +F + 
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        +    P +++ FFS    P  S   P +                                    R  +G M ++            +  Q  R   P   
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Query:  ATEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQALVRARNDVNMATNILLE
          E  E+ +A L+ MGF R  A +AL  + ND+N+ATN LL+
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Q8RXQ2 Rhomboid-like protein 189.1e-11069.86Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT+ F+IA+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K R WKL++S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP  NL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  G+CGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S FSRFSLPS+ +    P R      P+ +GRQ  R Y  P+P+ TEP E++IATLVSMGFD+N+ARQALV ARNDVN ATNILLE+ SH
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Q9LET3 Rhomboid-like protein 204.6e-12275.09Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K R WKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD   NL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PG+CGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        ++SFFSR S PS GN PP AP+R++ G +    GR+ ER+   P+P++ EP E++I TLVSMGFDRN+ARQALV ARNDVN ATNILLE+QSH
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41160.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein6.5e-11169.86Show/hide
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        MNGGPSGFNNAPVT+ F+IA+ALFT+FFGI+G S KLGLSYQD+  K R WKL++S FAFSST +L+ GL+LLY+FRVFERQIGSNKYSVFI FS   SL
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        + E + +SL KDP  NL+TSGPY L+FASFVPFF DIPV+ RF V GV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI  G+CGI+AGSLYRLN+FGIRKAKFPEF
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        ++S FSRFSLPS+ +    P R      P+ +GRQ  R Y  P+P+ TEP E++IATLVSMGFD+N+ARQALV ARNDVN ATNILLE+ SH
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AT3G56740.1 Ubiquitin-associated (UBA) protein3.3e-12375.09Show/hide
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        MNGGPSGF+NAPVT+ F+I SALFT+FFGIQGRS KLGLSYQD+  K R WKL+MS FAFSSTPELMFGL+LLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFS   SL
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        L EV+ +SLLKD   NL+TSGPYGL+FASF+PF+ DIPVSTRFRVFGV FSDKSFIYLAG+QLLLSSW+RSI PG+CGI+AGSLYRLN+ GIRKAKFPEF
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        ++SFFSR S PS GN PP AP+R++ G +    GR+ ER+   P+P++ EP E++I TLVSMGFDRN+ARQALV ARNDVN ATNILLE+QSH
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGAAGAACTCCCAAGAAATAAAAAATAGAAATGATACTTTCCAACAGAAAGAACGCAGAGAAATCAAATTCCAGTCCAAAGCTCCCAACAGACAACAAATCAAAAT
CAAAATCAAAATTAAACAGAGAAAGCCTCTGACCGTCTGGGAGGGTCGTTGCTTCCTCTCTGAGACGATGAACGGCGGCCCGTCTGGTTTCAACAATGCCCCTGTCACCC
GGACCTTCATCATTGCCTCCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGCTCAATTAAGCTTGGCTTGTCCTATCAGGATGTGATTGTGAAGCTTCGCTTTTGG
AAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTTTATTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAGATTGGTTCCAACAAATA
TTCGGTCTTTATCTTGTTCTCTATAATAACCTCCTTACTCTTTGAGGTCCTTGCAATATCATTACTTAAAGATCCTGCAGTGAATCTTGTCACTTCTGGACCTTATGGTC
TTTTATTCGCTTCCTTTGTACCATTCTTCTTTGATATCCCTGTTTCAACTCGGTTTCGTGTGTTTGGAGTCCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCATATATCTGGCTGGTCTT
CAGCTCCTTCTGTCCTCGTGGAGAAGGTCCATCTTACCAGGGTTATGCGGCATTCTTGCTGGTTCCTTATACCGTTTGAATGTATTTGGCATCCGCAAGGCCAAGTTTCC
AGAGTTCATCAGTTCATTTTTTTCGCGATTTTCTTTGCCATCTGTGGGGAATCCTCCAGCAGCCCCAAATAGAGACGTCAGAGGAAATATGCCATCTTTTATGGGCCGCC
AGGTTGAGAGGAACTATACTCCTGTGCCAACTGCCACAGAACCACCTGAGGACTCCATTGCTACCCTTGTTTCGATGGGCTTTGACAGAAACTCAGCCAGGCAGGCTCTT
GTGCGGGCCAGAAATGACGTTAACATGGCAACGAACATCCTTCTTGAATCACAATCGCACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTTGTTGAAGTATTTATGTGGAAGAACTCCCAAGAAATAAAAAATAGAAATGATACTTTCCAACAGAAAGAACGCAGAGAAATCAAATTCCAGTCCAAAGCTCCCAAC
AGACAACAAATCAAAATCAAAATCAAAATTAAACAGAGAAAGCCTCTGACCGTCTGGGAGGGTCGTTGCTTCCTCTCTGAGACGATGAACGGCGGCCCGTCTGGTTTCAA
CAATGCCCCTGTCACCCGGACCTTCATCATTGCCTCCGCTCTTTTCACCATTTTCTTCGGGATCCAAGGCCGCTCAATTAAGCTTGGCTTGTCCTATCAGGATGTGATTG
TGAAGCTTCGCTTTTGGAAGTTAGTAATGTCAGTTTTTGCCTTTTCATCTACTCCTGAATTGATGTTCGGACTGTTTCTGCTTTATTACTTCAGAGTATTTGAGAGACAG
ATTGGTTCCAACAAATATTCGGTCTTTATCTTGTTCTCTATAATAACCTCCTTACTCTTTGAGGTCCTTGCAATATCATTACTTAAAGATCCTGCAGTGAATCTTGTCAC
TTCTGGACCTTATGGTCTTTTATTCGCTTCCTTTGTACCATTCTTCTTTGATATCCCTGTTTCAACTCGGTTTCGTGTGTTTGGAGTCCGTTTCTCTGACAAGTCTTTCA
TATATCTGGCTGGTCTTCAGCTCCTTCTGTCCTCGTGGAGAAGGTCCATCTTACCAGGGTTATGCGGCATTCTTGCTGGTTCCTTATACCGTTTGAATGTATTTGGCATC
CGCAAGGCCAAGTTTCCAGAGTTCATCAGTTCATTTTTTTCGCGATTTTCTTTGCCATCTGTGGGGAATCCTCCAGCAGCCCCAAATAGAGACGTCAGAGGAAATATGCC
ATCTTTTATGGGCCGCCAGGTTGAGAGGAACTATACTCCTGTGCCAACTGCCACAGAACCACCTGAGGACTCCATTGCTACCCTTGTTTCGATGGGCTTTGACAGAAACT
CAGCCAGGCAGGCTCTTGTGCGGGCCAGAAATGACGTTAACATGGCAACGAACATCCTTCTTGAATCACAATCGCACTAATGTCATGAAAAGTTTTCTGGGTATATGAAA
CATTTGATGTCGACAATTCCAAGAACAATCGAATTCAGTATCAACGGGATGATGGTCCGACAAACTTGCAATTTGCTGACAACTGAGTTTTGATAGGTTGCAGGAACTCA
CCAGGCTGTTTTTCTTAACTCTTACCGGTTCTCCTTTTGTTCCTCTATCGTAGCTGTCAAATTCTCTTGATACTTGATGTTGATTACAAAAGTTTACTTAGTCTGTACGT
ATTAAGTTAAGCTGCTAGAGATATTTGTGGAAGCAGAATGTGCAGAATTCTTTTGTTCTCTGATATCTATATAAACATTGCAGATTCTTACAGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWKNSQEIKNRNDTFQQKERREIKFQSKAPNRQQIKIKIKIKQRKPLTVWEGRCFLSETMNGGPSGFNNAPVTRTFIIASALFTIFFGIQGRSIKLGLSYQDVIVKLRFW
KLVMSVFAFSSTPELMFGLFLLYYFRVFERQIGSNKYSVFILFSIITSLLFEVLAISLLKDPAVNLVTSGPYGLLFASFVPFFFDIPVSTRFRVFGVRFSDKSFIYLAGL
QLLLSSWRRSILPGLCGILAGSLYRLNVFGIRKAKFPEFISSFFSRFSLPSVGNPPAAPNRDVRGNMPSFMGRQVERNYTPVPTATEPPEDSIATLVSMGFDRNSARQAL
VRARNDVNMATNILLESQSH