; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0002508 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0002508
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG07:3914631..3915531
RNA-Seq ExpressionTan0002508
SyntenyTan0002508
Gene Ontology termsGO:0016874 - ligase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7017064.1 hypothetical protein SDJN02_22176, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-1672.37Show/hide
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XP_022928978.1 uncharacterized protein LOC111435715 [Cucurbita moschata]7.9e-1775.34Show/hide
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XP_022970120.1 uncharacterized protein LOC111469109 [Cucurbita maxima]1.6e-1782.09Show/hide
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XP_023520510.1 uncharacterized protein LOC111783933 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-1678.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KM75 Uncharacterized protein6.3e-1278.43Show/hide
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A0A1S3AUP0 uncharacterized protein LOC1034828831.7e-1280.39Show/hide
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A0A6J1DZC9 uncharacterized protein LOC1110259998.0e-1590.38Show/hide
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A0A6J1EQP1 uncharacterized protein LOC1114357153.8e-1775.34Show/hide
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        MMLVSV+AE+LEEYTVLL EVLRQLF+SAPFPRRVRFLILHNLPFA+N         SSSAL HSNR SG  A
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A0A6J1I1Z0 uncharacterized protein LOC1114691097.7e-1882.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33055.1 unknown protein2.2e-0952.94Show/hide
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        M+LV+++AE+++EYTV+LA V+  LF+ APFPRR+R  IL++LPF  +++S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGCTCGTGTCGGTAGTAGCGGAGCTTCTGGAGGAGTACACGGTGCTGCTCGCGGAGGTGCTCCGACAGCTCTTCAATTCCGCGCCATTTCCTCGCCGAGTCCGATT
TCTCATCCTTCACAATCTTCCTTTCGCCGATAACTCCTCCTCTGCCCTAACTCACTCCAATCGGCGAAGCGGCGTAGCCGCGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACTGCTTGAAAGTTCCATCAAATCAAGATCAAGATCAAATTCAAAATCAAAATCAAATCATCTTTCTACACGCCGAGGAAAAGGATTTTGAGACGATTTCATAATTGCG
ATTACTTTTGCAGATTGATTAGAGAGCCCTAATTTGACGCCGGAGATGATGCTCGTGTCGGTAGTAGCGGAGCTTCTGGAGGAGTACACGGTGCTGCTCGCGGAGGTGCT
CCGACAGCTCTTCAATTCCGCGCCATTTCCTCGCCGAGTCCGATTTCTCATCCTTCACAATCTTCCTTTCGCCGATAACTCCTCCTCTGCCCTAACTCACTCCAATCGGC
GAAGCGGCGTAGCCGCGTAGGCGATTTTTGTAATTCTCTTCTCTCACAGCTTGTATCATATATTATAGCTCGAGTTTCTTCTTCGTCTTGTTCTGGTTTGTATCTGGATT
GTTCTTCGAATTTGAGATTATGCCGATTTTGTTCTTTTTTAATCTTGTTCTTCGAATTTGAGTGAGGAGTTTGAGCGCAGTTCTTTTTTGGATTTCGATTTTTTCGGATG
AAGGTTAATTGGATTAGAAGTAATTGATTTTGAGAATTTGGATCTCTGTTTTCCTCTGTTTGAATTTGGAAACGGATTGGGGGCTGGCAACTGAGATGGCCACTGATTAA
TCGGCGGATCTTTTTCATTGGAAAAATTAATCAACAAGCTGAGGTTGAATTCAAATTTAGTCCGACGACTTTGAAGTTTGATGATGGAATCTTAACAGTTATCAGCTCCT
GAACTTCAACAACTTTTGAATGATTATCATTAATTTCTCAAGAATTCGGGTCGTTAATATCATTATTTTTCTAAATATAAAATATATTTTTTAATACCATAGAACTTGGG
AGATTTGGCCCACAAGAGGAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMLVSVVAELLEEYTVLLAEVLRQLFNSAPFPRRVRFLILHNLPFADNSSSALTHSNRRSGVAA