; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0002679 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0002679
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionReverse transcriptase
Genome locationLG04:17665562..17665939
RNA-Seq ExpressionTan0002679
SyntenyTan0002679
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_019172756.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC109168170 [Ipomoea nil]2.1e-2658.91Show/hide
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        M L++IVK LANNT QFQQETR  +Q LGNQ++QLATS+SKLEAQ SGKLPSQ EVNP+ENV+AI LRSGK++    P  V   KE   +E S ST   K
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              S +    +S PPFPSRLAK KE+
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XP_019180076.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC109175288 [Ipomoea nil]9.6e-2758.91Show/hide
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        M L++IVK LANNT QFQ+ETR  +Q LGNQ++QLATS+SKLEAQ SGKLPSQ EVNP+ENV+AI LRSGK++    P  V   KEE  +E S ST   K
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              S +    +S PPFPSRLAK KE+
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XP_022156327.1 uncharacterized protein LOC111023248 [Momordica charantia]1.2e-2962.79Show/hide
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        M LE+IVK LAN+TLQFQQETRVGMQNLGNQITQLATS+S+LEAQ+SG LPSQ EVNP+    E +SA+MLR+ ++IP   IP K  E +EE+  +S   
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          G+NFD  L +SS+TSPPPFPSR  + K
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XP_031112037.1 uncharacterized protein LOC116016008 [Ipomoea triloba]3.7e-2659.69Show/hide
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        M L++IVK LANNT QF QETR G+Q LGNQI+QLATS+SKLEAQ S KLPSQ EVNP+ENVSAI LRSGK++ P   +P +EE EE+S    ++    N
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           S   S    ++S PPFPSRLAK KE+
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XP_031131881.1 uncharacterized protein LOC116033267 [Ipomoea triloba]4.3e-2761.24Show/hide
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        M L++IVK LANNT QFQQET  G+Q LGNQI+QLATS+SKLEAQ S KLPSQ EVNP+ENVSAI LRSGK++ P   +P +EENEE+S    +  A K 
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Query:  VNFDSSLYVSSHTSP-PPFPSRLAKPKED
            S   V  + S  PPFPSRLAK KE+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DRS5 uncharacterized protein LOC1110232485.9e-3062.79Show/hide
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        M LE+IVK LAN+TLQFQQETRVGMQNLGNQITQLATS+S+LEAQ+SG LPSQ EVNP+    E +SA+MLR+ ++IP   IP K  E +EE+  +S   
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          G+NFD  L +SS+TSPPPFPSR  + K
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A0A6N2NBX1 Uncharacterized protein4.5e-2252.27Show/hide
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        M LEDIVK+LA NT  FQQETR  +QNL  Q++QLATS+ K++A N GKLP+QPEVNPREN +AI+LRSGKE+    P   +P    KE N    S   K
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Query:  APKGVNFDSSLYVSSHTSPPPFPSRLAKPKED
        +   V+ +S+++  +    PPFPSRLAK K++
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A0A6P6SET8 uncharacterized protein LOC1136905522.5e-2050.76Show/hide
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        M LEDIVK+LA NT QFQQET+  + NL NQ++QLA+++++LE+Q SGKLPSQ  VNP++N SAI LRSGKE+P    P K+      E E E   +   
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Query:  PKGVNFDSSLYVSSH--TSPPPFPSRLAKPKE
        P+ +        S+   T PPPFPSRLAK K+
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A0A6P6WXZ3 uncharacterized protein LOC1137355112.5e-2050.76Show/hide
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        M LEDIVK+LA NT QFQQET+  + NL NQ++QLA+++++LE+Q SGKLPSQ  VNP++N SAI LRSGKE+P    P K+      E E E   +   
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Query:  PKGVNFDSSLYVSSH--TSPPPFPSRLAKPKE
        P+ +        S+   T PPPFPSRLAK K+
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A0A6P6X8T1 Reverse transcriptase3.2e-2050.76Show/hide
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Query:  PKGVNFDSSLYVSSH--TSPPPFPSRLAKPKE
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTTTGGAAGATATTGTTAAGACCCTAGCTAACAATACTCTTCAATTTCAACAGGAGACAAGAGTAGGCATGCAAAATTTAGGTAACCAAATTACTCAATTGGCTAC
GTCAATCAGTAAGTTGGAAGCCCAAAATTCTGGAAAGTTGCCTTCACAACCAGAGGTGAATCCAAGGGAGAACGTCAGTGCAATAATGCTCAGAAGCGGGAAAGAAATTC
CCTCTGGAGTGATTCCACCTAAGGAGGAAAATGAAGAAGAATCTTCTTCTTCCACCAAAGCACCAAAAGGGGTAAATTTTGATTCTTCTCTATATGTTTCTTCACATACT
TCACCTCCCCCTTTTCCTAGCAGGTTAGCAAAGCCAAAAGAAGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGTTTGGAAGATATTGTTAAGACCCTAGCTAACAATACTCTTCAATTTCAACAGGAGACAAGAGTAGGCATGCAAAATTTAGGTAACCAAATTACTCAATTGGCTAC
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TCACCTCCCCCTTTTCCTAGCAGGTTAGCAAAGCCAAAAGAAGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCLEDIVKTLANNTLQFQQETRVGMQNLGNQITQLATSISKLEAQNSGKLPSQPEVNPRENVSAIMLRSGKEIPSGVIPPKEENEEESSSSTKAPKGVNFDSSLYVSSHT
SPPPFPSRLAKPKED