; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0002827 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0002827
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptioncalmodulin-like
Genome locationLG06:77468048..77468893
RNA-Seq ExpressionTan0002827
SyntenyTan0002827
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
GO:0032440 - 2-alkenal reductase [NAD(P)] activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6574954.1 hypothetical protein SDJN03_25593, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-6475.15Show/hide
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        YISANEL HV +MLN+GEKLT+EEV ++I+EADLNGDG VDY EFVK+MT+H       SEIL KR FF
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XP_022930395.1 calmodulin-like protein 8 [Cucurbita moschata]1.1e-6275.61Show/hide
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        YISANELS VL MLN+GE+LT EE+ QMI +ADL+GDGHVDY+EFV MMTE+W   DD SEILP
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XP_022958889.1 calmodulin-like [Cucurbita moschata]3.5e-6475.74Show/hide
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XP_023548669.1 calmodulin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-6576.92Show/hide
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        YISANEL HV +MLN+GEKLT+EEV ++I+EADLNGDG VDY EFVK+MTEH       SEIL KR FF
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XP_038907158.1 calmodulin-2/4-like [Benincasa hispida]3.7e-6676.92Show/hide
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        ME GEGLTKEQMDQL E FL FDKN+DGCIT+D+LRTEIR  GQNPTEEELK MI+EVDA+GNG I+FWEF KLM+K M+EETE+KLKEAFKVFD+NQDG
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        YISANELSHV +MLN+GEKLTDEEV QMI++ADL+GDG VDY+EFV MM      T DVS+ILPKR FF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLM7 Uncharacterized protein2.3e-6176.65Show/hide
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        ANELSHV  MLN G EKLTDEEVF MI EADLNGDGHVDY+EFVK+MT+      DVS+ILP+  FF
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A0A6J1CB59 calmodulin-like protein 81.2e-5776.62Show/hide
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        GEGL KEQMD+L+E F LFDKN+DGCIT D+LRT  IR+ G NPTE+ELKDMI EVDA+GNGTIEF EFL LM+K MKEE E+KLKEAFKVFD+NQDGYI
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        SANELSHV VMLN+GEKLT+EEV QMI+EADL+GDG V+Y EFVK+MTE W  T
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A0A6J1EWT4 calmodulin-like protein 85.5e-6375.61Show/hide
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A0A6J1H6E9 calmodulin-like1.7e-6475.74Show/hide
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        YISANEL HV +MLN+GEKLTD+EV ++I EADLNGDG VDY EFVK+MTEH       SEIL KR FF
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A0A6J1KG52 calmodulin-like protein 84.6e-6275Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23320 Calmodulin-like protein 81.0e-4565.28Show/hide
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        LTK+Q+ + +E F LFDK+ DGCIT+++L T IR   QNPTE+EL D+I E+D++ NGTIEF EFL LM K ++E + E++LKEAFKVFD++Q+GYISA+
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        ELSH  VM+N+GEKLTDEEV QMIKEADL+GDG V+Y EFVKMM
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P04464 Calmodulin1.2e-4363.19Show/hide
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        LT EQ+ + +E F LFDK+ DGCIT  +L T +R  GQNPTE EL+DMINEVDA+GNGTI+F EFL LM + MK+ ++E++LKEAF+VFD++QDG+ISA 
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        EL H  VM N+GEKLTDEEV +MI+EAD++GDG ++Y EFVK+M
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P0DH95 Calmodulin-11.2e-4363.19Show/hide
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        EL H  VM N+GEKLTDEEV +MI+EAD++GDG ++Y EFVK+M
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P0DH96 Calmodulin-41.2e-4363.19Show/hide
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        LT EQ+ + +E F LFDK+ DGCIT  +L T +R  GQNPTE EL+DMINEVDA+GNGTI+F EFL LM K MK+ ++E++LKEAF+VFD++Q+G+ISA 
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        EL H  VM N+GEKLTDEEV +MI+EAD++GDG ++Y EFVK+M
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Q9LIK5 Calmodulin-like protein 116.5e-4564.58Show/hide
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        LT+EQ+ + +E F LFDK+ DGCIT D+L T IR   QNPTE+EL+DMI E+D++GNGTIEF EFL LM   ++E + +++LKEAFKVFD++Q+GYISA+
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        EL H  VM+N+GEKLTDEEV QMIKEADL+GDG V+Y EFV+MM
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G66410.1 calmodulin 48.6e-4563.19Show/hide
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        LT EQ+ + +E F LFDK+ DGCIT  +L T +R  GQNPTE EL+DMINEVDA+GNGTI+F EFL LM K MK+ ++E++LKEAF+VFD++Q+G+ISA 
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        EL H  VM N+GEKLTDEEV +MI+EAD++GDG ++Y EFVK+M
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AT2G41110.1 calmodulin 21.9e-4462.5Show/hide
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        LT +Q+ + +E F LFDK+ DGCIT  +L T +R  GQNPTE EL+DMINEVDA+GNGTI+F EFL LM + MK+ ++E++LKEAF+VFD++Q+G+ISA 
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        EL H  VM N+GEKLTDEEV +MIKEAD++GDG ++Y EFVK+M
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AT3G22930.1 calmodulin-like 114.6e-4664.58Show/hide
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        LT+EQ+ + +E F LFDK+ DGCIT D+L T IR   QNPTE+EL+DMI E+D++GNGTIEF EFL LM   ++E + +++LKEAFKVFD++Q+GYISA+
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        EL H  VM+N+GEKLTDEEV QMIKEADL+GDG V+Y EFV+MM
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AT4G14640.1 calmodulin 87.1e-4765.28Show/hide
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        LTK+Q+ + +E F LFDK+ DGCIT+++L T IR   QNPTE+EL D+I E+D++ NGTIEF EFL LM K ++E + E++LKEAFKVFD++Q+GYISA+
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Query:  ELSHVLVMLNMGEKLTDEEVFQMIKEADLNGDGHVDYYEFVKMM
        ELSH  VM+N+GEKLTDEEV QMIKEADL+GDG V+Y EFVKMM
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AT5G37780.1 calmodulin 18.6e-4563.19Show/hide
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        LT EQ+ + +E F LFDK+ DGCIT  +L T +R  GQNPTE EL+DMINEVDA+GNGTI+F EFL LM K MK+ ++E++LKEAF+VFD++Q+G+ISA 
Subjt:  LTKEQMDQLQEVFLLFDKNKDGCITIDDLRTEIRKWGQNPTEEELKDMINEVDANGNGTIEFWEFLKLMTKTMKE-ETEQKLKEAFKVFDENQDGYISAN

Query:  ELSHVLVMLNMGEKLTDEEVFQMIKEADLNGDGHVDYYEFVKMM
        EL H  VM N+GEKLTDEEV +MI+EAD++GDG ++Y EFVK+M
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTTTGGAGAAGGTCTGACCAAAGAACAAATGGATCAGCTTCAAGAAGTTTTTCTTCTATTTGACAAGAACAAAGATGGTTGCATAACCATTGATGACCTGCGAAC
AGAGATCAGAAAATGGGGTCAAAATCCAACAGAGGAAGAACTCAAGGACATGATCAATGAAGTTGATGCTAATGGAAATGGAACCATAGAGTTCTGGGAATTCCTCAAAT
TGATGACCAAAACCATGAAGGAAGAAACAGAGCAGAAGCTCAAAGAAGCCTTCAAAGTGTTCGACGAAAACCAAGATGGATATATATCAGCAAACGAGCTGAGCCATGTT
CTTGTGATGCTTAATATGGGGGAGAAGTTAACAGATGAGGAAGTTTTTCAGATGATCAAAGAGGCTGATTTAAATGGAGACGGGCACGTTGATTACTACGAGTTCGTCAA
GATGATGACCGAACATTGGACAACAACTGATGATGTCTCTGAAATCCTACCAAAAAGAAGCTTTTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGTTTATCTTTGAAGCTTTTGTTTTAGTTCTCTTTCTAAGATTTCCATGGAGTTTGGAGAAGGTCTGACCAAAGAACAAATGGATCAGCTTCAAGAAGTTTTTCTTCTA
TTTGACAAGAACAAAGATGGTTGCATAACCATTGATGACCTGCGAACAGAGATCAGAAAATGGGGTCAAAATCCAACAGAGGAAGAACTCAAGGACATGATCAATGAAGT
TGATGCTAATGGAAATGGAACCATAGAGTTCTGGGAATTCCTCAAATTGATGACCAAAACCATGAAGGAAGAAACAGAGCAGAAGCTCAAAGAAGCCTTCAAAGTGTTCG
ACGAAAACCAAGATGGATATATATCAGCAAACGAGCTGAGCCATGTTCTTGTGATGCTTAATATGGGGGAGAAGTTAACAGATGAGGAAGTTTTTCAGATGATCAAAGAG
GCTGATTTAAATGGAGACGGGCACGTTGATTACTACGAGTTCGTCAAGATGATGACCGAACATTGGACAACAACTGATGATGTCTCTGAAATCCTACCAAAAAGAAGCTT
TTTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEFGEGLTKEQMDQLQEVFLLFDKNKDGCITIDDLRTEIRKWGQNPTEEELKDMINEVDANGNGTIEFWEFLKLMTKTMKEETEQKLKEAFKVFDENQDGYISANELSHV
LVMLNMGEKLTDEEVFQMIKEADLNGDGHVDYYEFVKMMTEHWTTTDDVSEILPKRSFF