CuGenDBv2

Gene ID	Tan0002867
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	Unknown protein
Genome location	LG05:75391746..75392939
RNA-Seq Expression	Tan0002867
Synteny	Tan0002867
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6607465.1 hypothetical protein SDJN03_00807, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7037120.1 hypothetical protein SDJN02_00741 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

3.7e-93

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XP_022948859.1 uncharacterized protein LOC111452392 [Cucurbita moschata]

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XP_022997987.1 uncharacterized protein LOC111492777 [Cucurbita maxima]

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        KD+KISQLLQQVAQLNRS+L AQQKVLPSN
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XP_023524923.1 uncharacterized protein LOC111788705 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

1.9e-97

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LVK1 Uncharacterized protein

3.3e-79

75.33

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        FSDDE SHP  PKPSD QI+K M AS W+  GVQILR RITAMASTIWSNA    AFW FSPAGRIGLLVTL WLYKRAR+RRLR+S+EQL+MM KEKDE
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A0A1S3BA65 uncharacterized protein LOC103487835

2.7e-81

77.53

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        MA DE R VFDW N P  NSYQSS             SMVVIRDS PKDDFSVFPPS HENLQPPSI EDERGSPVSFQSNSP SSFRSSQSSSSFSSFS
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        FSDDE SHP  PKPS  QI+K M  S W+ +GVQILR RITAMASTIWSNA    AFW FSPAGRIGLLVTL WLYKRAR+RRLR+ST QL+MM KEKDE
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        KISQL+QQVAQLNRSL+LAQQKVLPSN
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A0A6J1C560 uncharacterized protein LOC111008581

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83.7

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        FSDDETSH   PKPSDCQIRKSMAAS WM +GVQILR+RITAMASTIWSN AR TAFW FSPAGRI L+VTLWWLYKRARQRRLRQS+EQLRM+ KEKD+
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A0A6J1GB64 uncharacterized protein LOC111452392

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        KISQLLQQVAQLNRS+LLAQQKVLPSN
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A0A6J1K6L4 uncharacterized protein LOC111492777

6.1e-94

84.35

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        +AG E R VFDWENF SLN   SYQSSSSSQ  KI+LKEWSMV IRDSLPKDDFSVFPPSNHENL  PSIE +ERGSPVSFQSNSP SSFRSSQSSSSFS
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Query:  SFSFSDDETSHPQWPKPSDCQIRKSMAASSWMAFGVQILRSRITAMASTIWSNAARTTAFWFFSPAGRIGLLVTLWWLYKRARQRRLRQSTEQLRMMFKE
        SFS SDDETSHPQ P PSD QIRKSMAAS WMAFGVQILRSRI AM STIW NAAR TA W FSPAGRIGLL+TLWWLYKR RQRRLR STEQL+MM KE
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        KD+KISQLLQQVAQLNRS+L AQQKVLPSN
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G07730.1 unknown protein

2.6e-04

31.36

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Query:  SMVVIRDS--LPKDDFSVFPPSNHENLQ-PPSIEEDERGSPVSFQSNSPLSSFRSSQSSSSFSSFSFSDD----------------ETSHPQWP------
        SMVVIR+S    KDD  VFPP  HENL    S+   +R      +S+SP SS R S SSSSFS F    D                ET     P      
Subjt:  SMVVIRDS--LPKDDFSVFPPSNHENLQ-PPSIEEDERGSPVSFQSNSPLSSFRSSQSSSSFSSFSFSDD----------------ETSHPQWP------

Query:  -KPSDC-------QIRKSMAA----------SSWMAFG------VQILRSRITAMASTIWSNAARTTAFWF------FSPAGRIGLLVTLWWLYKRARQR
          PSD        QI   + +          S     G      V +L      +   ++S   +    WF      F P   I +    WW+  RA ++
Subjt:  -KPSDC-------QIRKSMAA----------SSWMAFG------VQILRSRITAMASTIWSNAARTTAFWF------FSPAGRIGLLVTLWWLYKRARQR

Query:  RLR-QSTEQLRMMFKEKDEKISQLLQQVAQLNRSLL
        R++ ++ + LR + KE+DE+I QLL Q+AQ+N  LL
Subjt:  RLR-QSTEQLRMMFKEKDEKISQLLQQVAQLNRSLL

AT5G61360.1 unknown protein

5.1e-08

31.31

Show/hide

Query:  EWSMVVIRDS--LPKDDFSVFPPSNHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPLSSFRSSQSSSSFSSFSFS-DDETSHPQWPKPSDCQIRKSMAASSWMA-F
        ++ MV +R+S    KDD ++FPP NHENL    +E             SP  S  SS SSS  S  SFS  D     Q+ + S  Q  + +  S W +  
Subjt:  EWSMVVIRDS--LPKDDFSVFPPSNHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPLSSFRSSQSSSSFSSFSFS-DDETSHPQWPKPSDCQIRKSMAASSWMA-F

Query:  GVQILRSRITAMASTIWSN------AARTTAFWFFSPAGR--IGLLVTLWWLYKRARQRRLRQSTE----QLRMMFKEKDEKISQLLQQVAQLNRSLL
         + I++     + + + SN           +   FS   R    ++V   W +KR R RR  +  E     LR   KE+DE+I+QLL Q+ Q+N  L+
Subjt:  GVQILRSRITAMASTIWSN------AARTTAFWFFSPAGR--IGLLVTLWWLYKRARQRRLRQSTE----QLRMMFKEKDEKISQLLQQVAQLNRSLL

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCGGGTGATGAACCCAGAGGGGTTTTCGACTGGGAAAATTTCCCTTCATTGAATTCCTATCAGTCGTCTTCTTCATCTCAGCCGCGGAAAATCGAATTGAAAGAATG
GTCAATGGTGGTGATTAGGGATTCCCTTCCCAAAGATGATTTCTCTGTTTTCCCACCTTCAAATCACGAGAATCTACAGCCCCCATCGATTGAAGAAGACGAACGAGGAA
GCCCAGTTTCATTTCAATCGAATTCGCCATTGTCGTCATTTAGGTCGTCCCAGTCATCGTCATCGTTCTCATCTTTCTCATTTTCTGATGACGAGACTTCACATCCACAG
TGGCCGAAGCCATCTGATTGTCAAATTCGAAAATCCATGGCGGCTTCTAGCTGGATGGCTTTTGGGGTTCAAATTCTACGCTCACGGATTACTGCAATGGCTTCCACAAT
TTGGTCCAATGCTGCGCGTACGACGGCTTTTTGGTTTTTTTCCCCTGCTGGAAGGATTGGGTTATTGGTGACGCTTTGGTGGCTGTACAAGAGAGCTCGTCAGCGCCGTT
TGCGTCAAAGTACAGAACAATTAAGGATGATGTTCAAGGAGAAAGACGAGAAAATCAGTCAACTACTGCAACAAGTTGCACAATTGAATAGATCACTGTTATTAGCCCAA
CAGAAAGTACTGCCTTCAAATTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAGDEPRGVFDWENFPSLNSYQSSSSSQPRKIELKEWSMVVIRDSLPKDDFSVFPPSNHENLQPPSIEEDERGSPVSFQSNSPLSSFRSSQSSSSFSSFSFSDDETSHPQ
WPKPSDCQIRKSMAASSWMAFGVQILRSRITAMASTIWSNAARTTAFWFFSPAGRIGLLVTLWWLYKRARQRRLRQSTEQLRMMFKEKDEKISQLLQQVAQLNRSLLLAQ
QKVLPSN

Tan0002867 (gene) of Snake gourd v1 genome