| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0064834.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo var. makuwa] | 2.4e-117 | 95.24 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSK RGRSRSRSPRSRHRDDYRD+DYRRRSRSRSRERY DRPHRSERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDADVS
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
|
|
| KAG6598682.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.0e-117 | 95.22 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRD+DYRRRSRSRSRER+ DRPHRSERER+RSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSPARHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
PDTRRSISPRRT PSRGRSDDEHSP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
|
|
| XP_008445340.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo] | 2.0e-116 | 95.2 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSK RGRSRSRSPRSRHRDDYRD+DYRRRSRSRSRERY DRPHRSERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| XP_011649457.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X2 [Cucumis sativus] | 2.6e-116 | 94.8 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSK RGRSRSRSPRSRHRDD+RD+DYRRRSRSRSRERY DRPHRSERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPR+T PSR RSDDEHSPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| XP_022997247.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 [Cucurbita maxima] | 2.6e-116 | 94.82 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRD+DYRRRSRSRSRER+ DRPHRSERER+RSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSPARHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+EHSP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LQG4 RRM domain-containing protein | 1.3e-116 | 94.8 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSK RGRSRSRSPRSRHRDD+RD+DYRRRSRSRSRERY DRPHRSERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPR+T PSR RSDDEHSPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| A0A1S3BCG4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 9.7e-117 | 95.2 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSK RGRSRSRSPRSRHRDDYRD+DYRRRSRSRSRERY DRPHRSERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.1e-117 | 95.24 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSK RGRSRSRSPRSRHRDDYRD+DYRRRSRSRSRERY DRPHRSERER+RSRSRSASPDR+KDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+E SPK DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDADVS
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADVS
|
|
| A0A6J1HFJ8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 2.8e-116 | 94.82 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRD+DYRRRSRSRSRER+ DRPHRSERER+RSRSRSASPDR KDR RGRDD ERRSASHSDRSMSPARHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
PDTRRSISPRRT PSRGRSDDEHSP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
|
|
| A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 1.3e-116 | 94.82 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRD+DYRRRSRSRSRER+ DRPHRSERER+RSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSPARHS
Subjt: IRKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERY--DRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
PDTRRSISPRRT PSRGRSD+EHSP+RDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
Subjt: PDTRRSISPRRT-PSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDADV
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 2.9e-25 | 44.49 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDT
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R R R RSRSRS S R+ R + + RS S S RS S +R P T
Subjt: RKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDT
Query: RRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGS
S R + SR RS + G+
Subjt: RRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGS
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.9e-25 | 44.05 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDT
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R R R RSRSRS S R+ R + + RS S S RS S +R P
Subjt: RKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDT
Query: RRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGS
+S R + SR RS + G+
Subjt: RRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGS
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.9e-25 | 44.05 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDT
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R R R RSRSRS S R+ R + + RS S S RS S +R P
Subjt: RKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDT
Query: RRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGS
+S R + SR RS + G+
Subjt: RRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGS
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 4.9e-25 | 44.05 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDT
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R R R RSRSRS S R+ R + + RS S S RS S +R P
Subjt: RKGRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDT
Query: RRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGS
+S R + SR RS + G+
Subjt: RRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGS
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 9.8e-66 | 64.55 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---------------------SSSKPRGRS--RSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERE-RHRSRSRSASPDRNKDRRRG
I KGRV+E S S PR RS RSRSPR R RDDYR+KDYR+RSRSRS +R +R +R+ R R+RSRSASPD K R RG
Subjt: IRKGRVME---------------------SSSKPRGRS--RSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERE-RHRSRSRSASPDRNKDRRRG
Query: RDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
R D+E RS S S S SPAR SP RS SP++T SP R+ SP DK + RSPSP +S
Subjt: RDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 1.3e-12 | 39.84 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESS------
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V FA+ N +K + R E
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESS------
Query: ---SKPRGRSRSRSP-----RSRHRD-DYRDKDYRR---RSRSRSRERYD--RPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSD-RSMSPA
+ PR SRSRSP RSR R DY RR RS S ERYD R + SR RS +P R K R RRS S S RS SP
Subjt: ---SKPRGRSRSRSP-----RSRHRD-DYRDKDYRR---RSRSRSRERYD--RPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSD-RSMSPA
Query: RHSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSP
SP RS+SPRR+ SR SP+R S +P SRS SP
Subjt: RHSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSP
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 7.1e-11 | 36.25 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
FG S D+ SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG +L GRE+ V F AE+ RK
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
Query: GRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDY-RDKDYRRRSRSRSRER-YDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSD---RSMSPAR--
+ GRS R R Y R RR RSRSR R Y+ P R +SRS SP +DRR ++ RS H+ RS SP R
Subjt: GRVMESSSKPRGRSRSRSPRSRHRDDY-RDKDYRRRSRSRSRER-YDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRRRGRDDDERRSASHSD---RSMSPAR--
Query: -HSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDA
HS RRS+SPR+ S ++P++ S P SRSP+P A
Subjt: -HSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKSDA
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 5.4e-11 | 31.88 | Show/hide |
Query: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKPRGRS
LL+ N+ +DL F+++G + D+++PR+ TG+ RGF FV+Y+YA++A +A+ +++ +++ GREI + FA+ E+ P+
Subjt: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKPRGRS
Query: RSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRR-RGRDDD----ERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRR---
+ RH DY+R S HRS R R+RS SRS SP R + R + R+DD RRS S S + +R SPR
Subjt: RSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERERHRSRSRSASPDRNKDRR-RGRDDD----ERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRR---
Query: -TPSRGR
TP R R
Subjt: -TPSRGR
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.9e-67 | 64.55 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---------------------SSSKPRGRS--RSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERE-RHRSRSRSASPDRNKDRRRG
I KGRV+E S S PR RS RSRSPR R RDDYR+KDYR+RSRSRS +R +R +R+ R R+RSRSASPD K R RG
Subjt: IRKGRVME---------------------SSSKPRGRS--RSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERE-RHRSRSRSASPDRNKDRRRG
Query: RDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
R D+E RS S S S SPAR SP RS SP++T SP R+ SP DK + RSPSP +S
Subjt: RDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 6.9e-67 | 64.55 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---------------------SSSKPRGRS--RSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERE-RHRSRSRSASPDRNKDRRRG
I KGRV+E S S PR RS RSRSPR R RDDYR+KDYR+RSRSRS +R +R +R+ R R+RSRSASPD K R RG
Subjt: IRKGRVME---------------------SSSKPRGRS--RSRSPRSRHRDDYRDKDYRRRSRSRSRERYDRPHRSERE-RHRSRSRSASPDRNKDRRRG
Query: RDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
R D+E RS S S S SPAR SP RS SP++T SP R+ SP DK + RSPSP +S
Subjt: RDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPSRGRSDDEHSPKRDNGSPDDKPVDSRSPSPAKS
|
|
