; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0003010 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0003010
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description30S ribosomal protein S11, chloroplastic
Genome locationLG01:45287376..45287792
RNA-Seq ExpressionTan0003010
SyntenyTan0003010
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001971 - Ribosomal protein S11
IPR018102 - Ribosomal S11, conserved site
IPR036967 - Ribosomal protein S11 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AHM89651.1 ribosomal protein S11 [Lagenaria siceraria]2.1e-5988.15Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A1S4EU37 30S ribosomal protein S11, chloroplastic1.0e-5988.15Show/hide
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A0A249RZ89 30S ribosomal protein S11, chloroplastic1.0e-5988.15Show/hide
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A0A410HFC3 30S ribosomal protein S11, chloroplastic1.0e-5988.15Show/hide
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A0A6H0EVI9 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.5e-6088.89Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0ZZ68 30S ribosomal protein S11, chloroplastic4.4e-6083.7Show/hide
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Q0G9S9 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.4e-6083.7Show/hide
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Q0ZIY6 30S ribosomal protein S11, chloroplastic3.1e-6185.19Show/hide
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Q4VZK2 30S ribosomal protein S11, chloroplastic4.7e-6288.15Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31817.1 Ribosomal L18p/L5e family protein2.1e-0428.21Show/hide
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AT2G36160.1 Ribosomal protein S11 family protein9.0e-0832.74Show/hide
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AT3G11510.1 Ribosomal protein S11 family protein9.0e-0832.74Show/hide
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AT3G52580.1 Ribosomal protein S11 family protein6.9e-0833.63Show/hide
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ATCG00750.1 ribosomal protein S118.6e-5981.48Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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