; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0003158 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0003158
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRING-type domain-containing protein
Genome locationLG05:13927380..13931550
RNA-Seq ExpressionTan0003158
SyntenyTan0003158
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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AT4G39140.1 RING/U-box superfamily protein5.4e-9949.78Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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AGGAATTTATCCACAGATGTGAGTTTAGAACAGGTGAAGGAGGCTACAGAATCTCCCACAGCTTCATACAAGTCGCCTGCAAAATTGTCACATTCATTGCCTTCAACCTC
ATCTTTGTCAACATCTCCTTTGTCATCACAGAGTTATCTGCCTCCAACCAATTCATCTCTAACTAGATGTTCCCATCGATCGCCAGGACATCAGCTGTTGCGTCAAGTGT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CTTGAGAGTCATGGTGCTGGGATTATTATAGGAGTTCTAATTTTGAAGAGCTTCAGCAACTCTTCTGGTGAAGTCATAAAATCCAAAATCTTGGTCCTTCTCCAGCATGG
GATCTGCTTGTTGTGTTGCTGCTAGGGACAAGACTATAGTAAGTGGATCTGGAAGTGAAACCTTATGTAGGAATATAAGGTATTCACCTAGTTGGAGCTTTCGATGGGAT
AATCGTGGACGAGTAGCAGGTGAAGAGACTTCGATAAATTGGTTTTCTGATAGTGTTAGCCGCAATGATAGAGTGGAACTGAAATGTGAGTCAGCGTATGCGTCAGAGGA
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CAGCCAAATCCGTGGATTAAAATCTCCAAGTAGCTATTTAGCTTCTGAAGATAGACCAAGGCTTCCGTCTTGGAGCAATGAATCGGTCCGGGACTCACAGGCAGGATCCT
CAGATTGTTGGTCTGTGCACGCTTTCTCTGAACTCATGGCCACTTCTCATAGAGAAAGGTGGTCTTTTGATAGTGACTCGTTTGGCTTTAATGGTGAGAAAATAGCCAGA
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ATTTGTGTAAAACAGATTCCAATACTAATCTTCCTATGATCTCTGAGCTGCATGC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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