; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0003346 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0003346
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionTropomyosin-like
Genome locationLG02:31555431..31574003
RNA-Seq ExpressionTan0003346
SyntenyTan0003346
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136872.1 uncharacterized protein LOC101218756 isoform X1 [Cucumis sativus]5.6e-6693.92Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEM SNL+SLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
XP_022963475.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X1 [Cucurbita moschata]1.0e-6796.62Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGGKE
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
XP_022963476.1 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X2 [Cucurbita moschata]7.3e-6696.55Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLG
XP_022967634.1 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X1 [Cucurbita maxima]1.9e-6695.27Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
XP_038886855.1 uncharacterized protein LOC120077075 isoform X1 [Benincasa hispida]6.6e-6796.62Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCS QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQ+AAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELR KQEEI+KRD+DIKLLEAIIQTLGGKE
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K2J2 Uncharacterized protein2.7e-6693.92Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVANLTEM SNL+SLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAIT+AAHARSEKRQAEAAQ+AAE+HVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVT+ELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGG+E
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
A0A6J1HG82 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X23.5e-6696.55Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLG
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLG
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLG
A0A6J1HI40 uncharacterized protein LOC111463800 isoform X14.9e-6896.62Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWSGAVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGGKE
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
A0A6J1HXA5 uncharacterized protein LOC111467076 isoform X19.3e-6795.27Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRWS AVAN+TEMASNLESLQK+L+KKAVYVDDETFARASLCS+QARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
A0A6J1JEJ3 uncharacterized protein LOC1114861883.5e-6695.27Show/hide
Query:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
        MEDKGKGTDRW+GAVANLTEMASNLE  QKLLLKKAVYVDDETFARASLCS QARTIKVL+QRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ
Subjt:  MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQ

Query:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRD+DIKLLEAIIQTLGGK+
Subjt:  EVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64180.1 unknown protein8.1e-5576.51Show/hide
Query:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV
        ME++  G+D RW G++ N+TEMASNL+SLQKLLLKKAV+V+++TF+RASL S+QARTIKVLEQRV+TLERELDAAITAAAHARSEKRQAE++QKAAE   
Subjt:  MEDKGKGTD-RWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHV

Query:  QEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE
        Q+VT+ELENTTKVF+LHM+ELR  QE+I+KRD +IKLLEAIIQTLGGKE
Subjt:  QEVTRELENTTKVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGGACAAGGGAAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCCGTAGCCAATCTCACAGAGATGGCCTCCAATCTAGAATCACTTCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGT
CTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTCCGATCAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTG
CTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGGCTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAACTACATGTGCAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACTACA
AAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGCGCGAAGCAAGAAGAAATCAACAAACGTGATAGGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAGACTCTTGGTGGGAA
AGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTGGTCCTCTCCTACCAAATATCAATATCACGGAAAAATCAAAAGCTCTTATTGAATGCATTGCATGATCGGGTGGGTTCTTAGCTCCCTCGGCAAGTCTCTACACGG
ATCATGAAGTTGAACGATAGTTGAATTGCGAATTTGCAGAAGTGCAAGCGTCGAACCAGATTCGGATCATGGAGGACAAGGGAAAAGGAACGGACAGATGGAGCGGTGCC
GTAGCCAATCTCACAGAGATGGCCTCCAATCTAGAATCACTTCAGAAGCTTTTACTGAAGAAAGCCGTCTATGTAGACGACGAGACGTTTGCCAGAGCTTCATTGTGCTC
CGATCAAGCAAGGACGATCAAGGTTCTTGAACAAAGGGTTGAGACTTTGGAAAGAGAACTTGATGCTGCTATCACTGCTGCTGCTCATGCTCGTTCAGAAAAACGTCAGG
CTGAGGCAGCACAAAAAGCTGCTGAACTACATGTGCAGGAGGTCACTAGAGAGCTCGAGAACACTACAAAGGTATTTCAACTGCATATGGATGAATTGCGCGCGAAGCAA
GAAGAAATCAACAAACGTGATAGGGATATTAAGCTCTTGGAAGCAATAATTCAGACTCTTGGTGGGAAAGAATGACGTTCTGCAAATGTGTGAGGATTTGATTTTGATAA
TTAGAGCCGCCTTGGTACTTTTCTTTTTTCTTCTTTTCTCTCTCTCGTTTGTTTGTGTAGCATTAGTGTAAAATTTGTATGGATAATATGATCGAGTCTAATTAGGAATA
TGGTGTATAATATATTGTTTTGAATTTGTAGAGAAATATCTAGTTTATAAAATATGGATAAATAAAATTCAAATTATATTTGATTGGATAACAATTGAGAAGTTATTTGC
TCGCAATGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEDKGKGTDRWSGAVANLTEMASNLESLQKLLLKKAVYVDDETFARASLCSDQARTIKVLEQRVETLERELDAAITAAAHARSEKRQAEAAQKAAELHVQEVTRELENTT
KVFQLHMDELRAKQEEINKRDRDIKLLEAIIQTLGGKE