; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0003711 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0003711
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRAB GTPase homolog A1F
Genome locationLG01:108486580..108488819
RNA-Seq ExpressionTan0003711
SyntenyTan0003711
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591929.1 Ras-related protein RABA1f, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.8e-11295.85Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVD+KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTR VT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADL+HLRAVST+DA+AFAEKENTFFMETSALE+LNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAA+PKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GNRDDVSAVKKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

XP_004146038.1 ras-related protein RABA1f [Cucumis sativus]2.1e-11497.7Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GN+DDVSA+KKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

XP_022139663.1 ras-related protein RABA1f [Momordica charantia]2.4e-11396.77Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDA+AFAE+ENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GN+DDVSAVKKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

XP_022935729.1 ras-related protein RABA1f-like [Cucurbita moschata]3.4e-11296.31Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVD+KVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTR VT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADL+HLRAVST+DA+AFAEKENTFFMETSALE+LNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GNRDDVSAVKKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

XP_038897555.1 ras-related protein RABA1f [Benincasa hispida]2.8e-11497.7Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDA+AFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GN+DDVSAVKKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L041 Uncharacterized protein1.0e-11497.7Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GN+DDVSA+KKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

A0A1S3CJW4 ras-related protein RABA1f1.0e-11497.7Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GN+DDVSA+KKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

A0A5D3DVT8 Ras-related protein RABA1f1.0e-11497.7Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GN+DDVSA+KKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

A0A6J1CG72 ras-related protein RABA1f1.1e-11396.77Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YR DDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDA+AFAE+ENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GN+DDVSAVKKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

E5GBG0 GTP-binding protein1.0e-11497.7Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIY VVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        GN+DDVSA+KKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1PEX3 Ras-related protein RABA1h2.8e-10183.49Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        M +Y+ +DDYDYLFKVVL GDSGVGKSNLLSRFTRN+FS +S+STIGVEFATRSI+VDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDP-AALPKGQTIN
        FENVERWLKELRDHTD+N VIMLVGNKADL HLRA+STE+ + FAE+ENTFFMETSALE++NVENAFTEVLTQIY VV +KAL+ G+DP  ALPKGQ IN
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDP-AALPKGQTIN

Query:  VGNRDDVSAVKKVGCCSS
        VG+RDDVSAVKK GCC++
Subjt:  VGNRDDVSAVKKVGCCSS

Q40521 Ras-related protein Rab11B2.8e-10992.06Show/hide
Query:  YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVTFEN
        YR +DDYDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRF+RNEF+LESKSTIGVEFATRSIRVDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGAL+VYD+TRHVTFEN
Subjt:  YRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVTFEN

Query:  VERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINVGNR
        VERWLKELRDHTD NIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDA+AFAE+ENTFFMETSALESLNVENAFTEVLT+IY VVCRKALE+G+DPAALPKGQTINVG +
Subjt:  VERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINVGNR

Query:  DDVSAVKKVGCCSS
        DDVSAVKKVGCCSS
Subjt:  DDVSAVKKVGCCSS

Q9FJH0 Ras-related protein RABA1f6.7e-11191.71Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YR DD+YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSI VDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTD+NIVIM VGNKADLRHLRAVSTEDA+AFAE+ENTFFMETSALES+NVENAFTEVL+QIY VV RKAL+IG+DPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        G++DDVSAVKKVGCCS+
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

Q9LK99 Ras-related protein RABA1g1.7e-10688.02Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YR DDDYD+L+KVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSI VD+K+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHT++NIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDA+AFAE+ENTFFMETSALE+LNVENAFTEVL+QIY V  +KAL+IG+D   LPKGQ+INV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        G++DDVS VKKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

Q9S810 Ras-related protein RABA1i5.1e-10384.86Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        M +YR +DDYDYLFKVVL GDSGVGKSNLLSRFTRN+FS +S++TIGVEFATRSI+ DDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDP-AALPKGQTIN
        FENVERWLKELRDHTD+NIVIMLVGNKADLRHLRA+STE+A+AFAE+ENTFFMETSALE++NV+NAFTEVLTQIY VV +KALE G+DP  ALPKGQ IN
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDP-AALPKGQTIN

Query:  VGNRDDVSAVKKVGCCSS
        VG RDD+SAVKK GCCS+
Subjt:  VGNRDDVSAVKKVGCCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28550.1 RAB GTPase homolog A1I3.6e-10484.86Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        M +YR +DDYDYLFKVVL GDSGVGKSNLLSRFTRN+FS +S++TIGVEFATRSI+ DDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDP-AALPKGQTIN
        FENVERWLKELRDHTD+NIVIMLVGNKADLRHLRA+STE+A+AFAE+ENTFFMETSALE++NV+NAFTEVLTQIY VV +KALE G+DP  ALPKGQ IN
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDP-AALPKGQTIN

Query:  VGNRDDVSAVKKVGCCSS
        VG RDD+SAVKK GCCS+
Subjt:  VGNRDDVSAVKKVGCCSS

AT2G33870.1 RAB GTPase homolog A1H2.0e-10283.49Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        M +Y+ +DDYDYLFKVVL GDSGVGKSNLLSRFTRN+FS +S+STIGVEFATRSI+VDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDP-AALPKGQTIN
        FENVERWLKELRDHTD+N VIMLVGNKADL HLRA+STE+ + FAE+ENTFFMETSALE++NVENAFTEVLTQIY VV +KAL+ G+DP  ALPKGQ IN
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDP-AALPKGQTIN

Query:  VGNRDDVSAVKKVGCCSS
        VG+RDDVSAVKK GCC++
Subjt:  VGNRDDVSAVKKVGCCSS

AT3G15060.1 RAB GTPase homolog A1G1.2e-10788.02Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YR DDDYD+L+KVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSI VD+K+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHT++NIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDA+AFAE+ENTFFMETSALE+LNVENAFTEVL+QIY V  +KAL+IG+D   LPKGQ+INV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        G++DDVS VKKVGCCSS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS

AT4G18430.1 RAB GTPase homolog A1E6.4e-10180.56Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        M +YR DDDYDYLFK+VLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFS+ESKSTIGVEFATRS+ VD+K++KAQ+WDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYD+TRH+T
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTD+N+VIMLVGNKADLRHLRAV TE+A++F+E+EN FFMETSAL++ NVE AFT VLTQIY V+ RKAL+   DP +LPKGQTI++
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCS
        GN+DDV+AVK  GCCS
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F4.7e-11291.71Show/hide
Query:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
        MA+YR DD+YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSI VDDK+VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT
Subjt:  MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVT

Query:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV
        FENVERWLKELRDHTD+NIVIM VGNKADLRHLRAVSTEDA+AFAE+ENTFFMETSALES+NVENAFTEVL+QIY VV RKAL+IG+DPAALPKGQTINV
Subjt:  FENVERWLKELRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINV

Query:  GNRDDVSAVKKVGCCSS
        G++DDVSAVKKVGCCS+
Subjt:  GNRDDVSAVKKVGCCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCGTATAGAACGGACGACGATTACGATTACCTCTTTAAAGTGGTTCTCATCGGTGACTCGGGTGTGGGCAAATCCAATCTCCTCTCCAGGTTTACGCGCAATGA
GTTCAGTCTTGAGTCCAAATCCACAATCGGCGTCGAATTCGCCACTCGTAGTATTCGAGTCGATGATAAGGTCGTCAAGGCTCAGATTTGGGACACCGCCGGTCAAGAAA
GATACCGTGCAATCACAAGTGCATACTATCGAGGAGCTGTTGGTGCATTGCTGGTCTATGATGTCACACGACACGTGACATTCGAAAATGTTGAGAGATGGTTGAAAGAG
CTTAGGGATCATACTGATTCCAATATTGTGATAATGCTAGTCGGTAACAAGGCAGATTTGCGACATCTGCGTGCTGTTTCGACTGAGGATGCGCAGGCCTTTGCAGAGAA
GGAGAACACATTCTTCATGGAAACATCTGCCCTCGAGTCTCTGAATGTCGAGAATGCTTTTACCGAAGTGCTAACCCAAATCTATCATGTAGTTTGCAGAAAAGCGCTCG
AGATTGGGGAGGATCCCGCAGCCTTGCCTAAAGGACAAACCATTAACGTCGGAAACAGGGATGATGTTTCTGCAGTGAAGAAAGTTGGTTGCTGCTCTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCGCCTTCAAAAATTTCAAAACCTCTCTCTGTTTTCTTATGCCTTGGAGCTCCACTTCCTGATCCATTTTCAGACCCATCGAATTCCAAGCGAAAACCAGAGTCATCCGA
TCCGACCTCAATAAGTATGGCTTCGTATAGAACGGACGACGATTACGATTACCTCTTTAAAGTGGTTCTCATCGGTGACTCGGGTGTGGGCAAATCCAATCTCCTCTCCA
GGTTTACGCGCAATGAGTTCAGTCTTGAGTCCAAATCCACAATCGGCGTCGAATTCGCCACTCGTAGTATTCGAGTCGATGATAAGGTCGTCAAGGCTCAGATTTGGGAC
ACCGCCGGTCAAGAAAGATACCGTGCAATCACAAGTGCATACTATCGAGGAGCTGTTGGTGCATTGCTGGTCTATGATGTCACACGACACGTGACATTCGAAAATGTTGA
GAGATGGTTGAAAGAGCTTAGGGATCATACTGATTCCAATATTGTGATAATGCTAGTCGGTAACAAGGCAGATTTGCGACATCTGCGTGCTGTTTCGACTGAGGATGCGC
AGGCCTTTGCAGAGAAGGAGAACACATTCTTCATGGAAACATCTGCCCTCGAGTCTCTGAATGTCGAGAATGCTTTTACCGAAGTGCTAACCCAAATCTATCATGTAGTT
TGCAGAAAAGCGCTCGAGATTGGGGAGGATCCCGCAGCCTTGCCTAAAGGACAAACCATTAACGTCGGAAACAGGGATGATGTTTCTGCAGTGAAGAAAGTTGGTTGCTG
CTCTTCATGATCATCAACATTAGACTATGAGGTACATCATCAAAGGAGTAAAAGGACGAGTTCATTATGCTATGTCTTGAGTTTCCACTCCTGCTGGATTTGCTCAAAGA
AACATTTAGTTTATGGTCATTTTTAATGGTGCTGGAGCTTCTCGGAGGGTTGGATTCATATTTGGAGTCTTTTGAAATGGAAACACCTTCTTATTGTACTCTCTTAAATT
GTTTTAATTTTTGTAATGCCCCATAGTCTTAATTGTATCAGATTGTTCTAGATAGAGAGATCTGTTAAACTGAAGTAGTGTGTAGGTAAAGTTCAGTTGTTCAATGGGAG
CAGAATTTTTTTAGTTTCTTCAATTTTACATGTTCTGCCAGGATCAAGAGGTTTTATTCCTCCACAGAATTTACTTTTTTCTTGTAAGCCACCCTATTCTGCTCAAACTG
TTCACACACATACATGTGTATATATTGTTAAAGTACTGGAATGGGCAAAATAAATTTTTGAAGGATAAACTTCAGTTTTTTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASYRTDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFSLESKSTIGVEFATRSIRVDDKVVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGAVGALLVYDVTRHVTFENVERWLKE
LRDHTDSNIVIMLVGNKADLRHLRAVSTEDAQAFAEKENTFFMETSALESLNVENAFTEVLTQIYHVVCRKALEIGEDPAALPKGQTINVGNRDDVSAVKKVGCCSS