| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6581189.1 THO complex subunit 4C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.6e-133 | 86.17 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGG+ V IGSVRRGPL +NARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN + PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-------------GLGGGGRGRGRGRGRG---------GRGQGRKKPVEKSSDELDKE
SESGRTGSSN NPFPGPSHRGGLR+ GRGRGRGGWSRGLG GLGGGGRGRGRG G G GRGQGRKKPVEKSS ELDKE
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-------------GLGGGGRGRGRGRGRG---------GRGQGRKKPVEKSSDELDKE
Query: LENYHAEAMQT
LENYHAEAMQT
Subjt: LENYHAEAMQT
|
|
| XP_022935328.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita moschata] | 1.1e-134 | 90.85 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR V IGSVRRGPL +NARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN + PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRG-GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
SESGRTGSS+ NPFPGPSHRGGLR+ GRGRGRGGWSRGLG GLGGGGRGRGRG G G GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRG-GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_022982649.1 THO complex subunit 4D-like [Cucurbita maxima] | 3.8e-135 | 88.2 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR V IGSVRRGPL +NARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN + PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGG-----------GGRGRGRGRGRG-------GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
SESGRTGSSN NPFPGPSHRGGLR+GRGRGRGGWSRGLGG GG GGRGRGRGRG G GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHA
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGG-----------GGRGRGRGRGRG-------GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAMQT
Subjt: EAMQT
|
|
| XP_023527122.1 THO complex subunit 4D [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 2.9e-135 | 91.19 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR V IGSVRRGPL +NARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN + PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRG-GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
SESGRTGSSN NPFPGPSHRGGLR+ GRGRGRGGWSRGLG GLGGGGRGRGRG G G GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRG-GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| XP_038896761.1 THO complex subunit 4D-like [Benincasa hispida] | 2.2e-135 | 92.33 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKK+NREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGV +GSVRRGPL +NAR SAYSI KPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGV+KEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDG+PMKIEMLGDN EMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGRT SSNV NPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW+RG G+GGGG GRGRGRGR GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0L717 RRM domain-containing protein | 1.7e-96 | 92 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGV IGSVRRGPL +NAR SAYSI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDI+ELFSEIGD+KRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN EMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
|
|
| A0A1S3C452 THO complex subunit 4D | 1.4e-132 | 90.24 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
M TPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGV IGSVRRGPL +NAR SAYSI KPP RMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGI+IGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN EMPVSARINVTG NGR+RRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
ESGR + NV NPFPGPSHRGGLRN RGRGRG W+RG+ GLGG G GRGRGRGR GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1CP51 THO complex subunit 4D-like | 4.8e-128 | 89.55 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLED+IKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGR V IGS+RRGPLS+N RPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIE+LGDN EMPVSARINVTG+NGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
SESGRT SS V N FPGPS+RG LR GRGRGRGGWSRG G +GG GRGRGRGR GRG GRKK VEKSSDELDK+LENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1FAB9 THO complex subunit 4D-like | 5.3e-135 | 90.85 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR V IGSVRRGPL +NARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN + PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRG-GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
SESGRTGSS+ NPFPGPSHRGGLR+ GRGRGRGGWSRGLG GLGGGGRGRGRG G G GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHAEAMQT
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRN--GRGRGRGGWSRGLG-----GLGGGGRGRGRGRGRG-GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| A0A6J1J564 THO complex subunit 4D-like | 1.8e-135 | 88.2 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGS+NGGR V IGSVRRGPL +NARPSA+SISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKLY
Query: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFA+HYDKNG SGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN + PVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Subjt: VSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSRRTVVLT
Query: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGG-----------GGRGRGRGRGRG-------GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
SESGRTGSSN NPFPGPSHRGGLR+GRGRGRGGWSRGLGG GG GGRGRGRGRG G GRGQGRKKPVEKSS ELDKELENYHA
Subjt: SESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGG-----------GGRGRGRGRGRG-------GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
Query: EAMQT
EAMQT
Subjt: EAMQT
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B5FXN8 THO complex subunit 4 | 3.7e-32 | 40.14 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVGIGSVRRGPL---SLNARPSAYSISKPPRRMKNV--QWQHDLFEDSLRASGIS
MA +DMSL+D+IK N ++ +RG R GRG GG+ GG GVG G GP+ + AR + P R K + +WQHDLF+ A +
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGG----RGVGIGSVRRGPL---SLNARPSAYSISKPPRRMKNV--QWQHDLFEDSLRASGIS
Query: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNG
G+E G KL VSNLD+GV+ DI+ELF+E G LK+ A+HYD++G S G+A+V + R++DA A+K+YN V LDG+PM I++ VT
Subjt: GIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNG
Query: RSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPS-HRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRG-RGRGRG-GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
RR P S +RGG+ RG LGG GGGG RG RG RG GRG GR + S++ELD +L+ Y+A
Subjt: RSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPS-HRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRG-RGRGRG-GRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHA
|
|
| Q6NQ72 THO complex subunit 4D | 9.8e-70 | 55.56 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--GEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+A+HYDKNG SG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--GEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTSESGR----TGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGR-GRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ G G P P S R + N +G GG G GG GRG GRGRG GGRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTSESGR----TGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGR-GRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q8L719 THO complex subunit 4B | 4.6e-43 | 45.07 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS ++ + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTG
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ +HYD++G S G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P +
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTG
Query: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW---SRGLGGLGGGGRGRGRG-RGRGGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
+ +G G+ N F G + N RGRGRGG+ RG GG GGG GRG RGRGGRG GR + S+++LD EL+ YH E
Subjt: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW---SRGLGGLGGGGRGRGRG-RGRGGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
Query: AMQT
AM+T
Subjt: AMQT
|
|
| Q8L773 THO complex subunit 4A | 1.8e-42 | 43.88 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNG-GRGVGIGSVRR-GPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIE
M+T LDMSL+D+I KN R+ RG G G G G G G RR P + R + Y +K P W HD+F ED +GIE
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNG-GRGVGIGSVRR-GPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF----EDSLRASGISGIE
Query: IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSR
GTKLY+SNLDYGV EDI+ELF+E+G+LKR+ +H+D++G S G+AEVVY+RR DA AA+K+YN+V LDGKPMKIE++G N
Subjt: IGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTGVNGRSR
Query: RTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
+T S G+SN A P+ G RGG + RG GRGG GG GGGGRGR G+G P EK S+++LD +L+ YH+ M+T
Subjt: RTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEK-SSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| Q94EH8 THO complex subunit 4C | 1.1e-65 | 52.41 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGSFNG--GRGVGIGSVRRGPLSLNARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASG
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG NG G G G G VRRGPL++N RP S++SI+K RR +++ W Q+DL+E++LRA G
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGSFNG--GRGVGIGSVRRGPLSLNARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASG
Query: ISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGE-MPVSARINVTG
+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+A+HYDKNG SGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG
Subjt: ISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGE-MPVSARINVTG
Query: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRG--------------RGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELD
+NGR +R+V F G RGG R GRGRG +GG + G GG G GRG G GRG G+G KKPVEKS+ +LD
Subjt: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRG--------------RGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELD
Query: KELENYHAEAM
K+LE+YHAEAM
Subjt: KELENYHAEAM
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G66260.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.0e-67 | 52.41 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGSFNG--GRGVGIGSVRRGPLSLNARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASG
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG NG G G G G VRRGPL++N RP S++SI+K RR +++ W Q+DL+E++LRA G
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGSFNG--GRGVGIGSVRRGPLSLNARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASG
Query: ISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGE-MPVSARINVTG
+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+A+HYDKNG SGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG
Subjt: ISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGE-MPVSARINVTG
Query: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRG--------------RGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELD
+NGR +R+V F G RGG R GRGRG +GG + G GG G GRG G GRG G+G KKPVEKS+ +LD
Subjt: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRG--------------RGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELD
Query: KELENYHAEAM
K+LE+YHAEAM
Subjt: KELENYHAEAM
|
|
| AT1G66260.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.0e-67 | 52.41 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGSFNG--GRGVGIGSVRRGPLSLNARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASG
M+ L+M+L++++KK+ E+ A +G +R+ GRG GG NG G G G G VRRGPL++N RP S++SI+K RR +++ W Q+DL+E++LRA G
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRA-----RGRARR-GRGAGGSFNG--GRGVGIGSVRRGPLSLNARP-SAYSISKPPRRMKNVQW--QHDLFEDSLRASG
Query: ISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGE-MPVSARINVTG
+SG+E+GT +Y++NLD GVT EDIREL++EIG+LKR+A+HYDKNG SGSAEVVY RRSDA A+++YNNVLLDG+PMK+E+LG N E PV+AR+NVTG
Subjt: ISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGE-MPVSARINVTG
Query: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRG--------------RGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELD
+NGR +R+V F G RGG R GRGRG +GG + G GG G GRG G GRG G+G KKPVEKS+ +LD
Subjt: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRG--------------RGGWSRGLGGLGGGGRGRGRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELD
Query: KELENYHAEAM
K+LE+YHAEAM
Subjt: KELENYHAEAM
|
|
| AT5G02530.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.3e-44 | 45.07 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
M+ LDMSL+D+I K+NR+ +RGR G G GG G G RR + AR + YS ++ + WQ+D+F + S+ A+
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRARRGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLF--EDSLRAS----------
Query: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTG
G S IE GTKLY+SNLDYGV+ EDI+ELFSE+GDLKR+ +HYD++G S G+AEVV++RR DA AA+KRYNNV LDGK MKIE++G N P +
Subjt: GISGIEIGTKLYVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDNGEMPVSARINVTG
Query: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW---SRGLGGLGGGGRGRGRG-RGRGGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
+ +G G+ N F G + N RGRGRGG+ RG GG GGG GRG RGRGGRG GR + S+++LD EL+ YH E
Subjt: VNGRSRRTVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGW---SRGLGGLGGGGRGRGRG-RGRGGRGQ-GRKKPVEKSSDELDKELENYHAE
Query: AMQT
AM+T
Subjt: AMQT
|
|
| AT5G37720.1 ALWAYS EARLY 4 | 7.0e-71 | 55.56 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--GEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+A+HYDKNG SG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--GEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTSESGR----TGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGR-GRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ G G P P S R + N +G GG G GG GRG GRGRG GGRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTSESGR----TGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGR-GRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
| AT5G37720.2 ALWAYS EARLY 4 | 4.8e-72 | 56.66 | Show/hide |
Query: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
M+ L+M+L++++K+ + RG +R RGRG GG GGRG G RRGPL++NARPS+++I+KP RR++++ WQ LFED LRA+G SG+E+GT+L
Subjt: MATPLDMSLEDVIKKNNREKLRARGRAR-RGRGAGGSFNGGRGVGIGSVRRGPLSLNARPSAYSISKPPRRMKNVQWQHDLFEDSLRASGISGIEIGTKL
Query: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--GEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
+V+NLD GVT EDIRELFSEIG+++R+A+HYDKNG SG+AEVVY RRSDAF ALK+YNNVLLDG+PM++E+LG N E P+S R +NVTG+NGR +R
Subjt: YVSNLDYGVTKEDIRELFSEIGDLKRFALHYDKNGSSSGSAEVVYTRRSDAFAALKRYNNVLLDGKPMKIEMLGDN--GEMPVSAR--INVTGVNGRSRR
Query: TVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGR-GRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
TVV+ GR G P P S R + N +G GG G GG GRG GRGRG GGRG G KKPVEKS+ +LDK+LE+YHA+AM T
Subjt: TVVLTSESGRTGSSNVANPFPGPSHRGGLRNGRGRGRGGWSRGLGGLGGGGRGR-GRGRGRGGRGQGRKKPVEKSSDELDKELENYHAEAMQT
|
|
