; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0004247 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0004247
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL80-like
Genome locationLG01:116655370..116656675
RNA-Seq ExpressionTan0004247
SyntenyTan0004247
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608649.1 RING-H2 finger protein ATL80, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-9593.55Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MRPFRYLA  NSS+ISDTVEP+RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD GG+ASTRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILV SQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVK+EGEDK NRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

XP_004145558.1 RING-H2 finger protein ATL8 [Cucumis sativus]3.2e-9594.09Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD GG+ STRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVKEEG+DKTNRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

XP_008453009.1 PREDICTED: RING-H2 finger protein ATL80 [Cucumis melo]7.2e-9594.09Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD  G+ STRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVKEEG+DKTNRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

XP_022941514.1 RING-H2 finger protein ATL80-like [Cucurbita moschata]1.5e-9593.55Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MR FRYLA  NSS+ISDTVEP+RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD GG+ASTRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVK+EGEDK NRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

XP_023523429.1 RING-H2 finger protein ATL8-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-9694.09Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MRPFRYLA  NSS+ISDTVEP+RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD GG+ASTRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVK+EGEDK NRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L5Y2 RING-type domain-containing protein1.6e-9594.09Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD GG+ STRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFH+SCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVKEEG+DKTNRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

A0A1S3BWC1 RING-H2 finger protein ATL803.5e-9594.09Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD  G+ STRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVKEEG+DKTNRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

A0A5A7VGL3 RING-H2 finger protein ATL803.5e-9594.09Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MRPFRYLAGVNSSA SDT EP RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD  G+ STRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF+AQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVKEEG+DKTNRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

A0A6J1FNK0 RING-H2 finger protein ATL80-like7.0e-9693.55Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MR FRYLA  NSS+ISDTVEP+RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD GG+ASTRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVK+EGEDK NRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

A0A6J1IVW2 RING-H2 finger protein ATL807.8e-9593.55Show/hide
Query:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
        MRPFRYLA  NSS+ISDTVEP+RYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGD GG+ASTRPPPPP SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF
Subjt:  MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQF

Query:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP
        SDCAICLAEF VGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSS+GGTESRVK +GEDK NRFLP
Subjt:  SDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22755 Probable E3 ubiquitin-protein ligase ATL442.3e-3558.16Show/hide
Query:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAE-----FAAQFSD---CAICLAEFAVGDEI
        +SD V+IL+ALLCALICV GL AV RCAWLR      GG +       P  NKGLKKK L+SLP+ TFTA       AA+  D   CAICL +FA G+EI
Subjt:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAE-----FAAQFSD---CAICLAEFAVGDEI

Query:  RVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG
        RVLP CGH FHV CID W  S SSCPSCR+IL   +C +CG
Subjt:  RVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG

Q8LC69 RING-H2 finger protein ATL82.9e-5460Show/hide
Query:  FRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--AAQFS
        FR L   NS++ ++   P  ++SD V+ILA LLCAL C++GL+AV+RCAWLR +A  N  S  T PPP   +NKGLKKK+LRSLPK T++ +   A +  
Subjt:  FRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--AAQFS

Query:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVK--EEGED
        +CAICL EFA GDE+RVLPQCGHGFHVSCIDTW  SHSSCPSCRQILVV++C KCGG P SSSS    ++R+K  E+G D
Subjt:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVK--EEGED

Q9FLC6 RING-H2 finger protein ATL739.6e-2642.17Show/hide
Query:  NSSAISDTVEPDR----YDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSN-----KGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQFS
        N   + D+V  ++     D+  VIILAALLCALIC LG+ +V RC  LR        +    P   PV       KG+KK+ L+ +P  +++ E   + +
Subjt:  NSSAISDTVEPDR----YDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSN-----KGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQFS

Query:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSG
        +C ICL +F  G+ +RVLP+C HGFHV CIDTW  SHSSCP+CRQ L+  Q       PA+ S  G
Subjt:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSG

Q9LM69 RING-H2 finger protein ATL802.0e-5558.85Show/hide
Query:  FRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNG--GSASTRPPPPPV--SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--A
        FR L   N+ + +        +SD V+ILAALLCALICVLGL+AV+RC WLR LA  N     + T+ P PPV  +NKGLKKK+L+SLPK TF+ E   +
Subjt:  FRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNG--GSASTRPPPPPV--SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--A

Query:  AQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVK---EEGEDKTNRFLP
         +F++CAICLAEF+ GDE+RVLPQCGHGFHV+CIDTW  SHSSCPSCRQILVV++C KCGG P SSSS   +E  ++   ++GED  N FLP
Subjt:  AQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVK---EEGEDKTNRFLP

Q9ZT49 Probable E3 ubiquitin-protein ligase ATL451.4e-3748.21Show/hide
Query:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAA----------------QFSDCAICLA
        ++D V+IL+ALLCAL+CV GL AVARCAWLR L G N  +    PPP    NKGLKKK L++LPK T+TA  +                   ++CAIC+ 
Subjt:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAA----------------QFSDCAICLA

Query:  EFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEE
        EF+ G+EIR+LP C H FHV+CID W  S SSCPSCR+ILV  +C +CG   +++      E++VK++
Subjt:  EFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G20823.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-5658.85Show/hide
Query:  FRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNG--GSASTRPPPPPV--SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--A
        FR L   N+ + +        +SD V+ILAALLCALICVLGL+AV+RC WLR LA  N     + T+ P PPV  +NKGLKKK+L+SLPK TF+ E   +
Subjt:  FRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNG--GSASTRPPPPPV--SNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--A

Query:  AQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVK---EEGEDKTNRFLP
         +F++CAICLAEF+ GDE+RVLPQCGHGFHV+CIDTW  SHSSCPSCRQILVV++C KCGG P SSSS   +E  ++   ++GED  N FLP
Subjt:  AQFSDCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVK---EEGEDKTNRFLP

AT1G76410.1 RING/U-box superfamily protein2.0e-5560Show/hide
Query:  FRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--AAQFS
        FR L   NS++ ++   P  ++SD V+ILA LLCAL C++GL+AV+RCAWLR +A  N  S  T PPP   +NKGLKKK+LRSLPK T++ +   A +  
Subjt:  FRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEF--AAQFS

Query:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVK--EEGED
        +CAICL EFA GDE+RVLPQCGHGFHVSCIDTW  SHSSCPSCRQILVV++C KCGG P SSSS    ++R+K  E+G D
Subjt:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVK--EEGED

AT2G17450.1 RING-H2 finger A3A1.6e-3658.16Show/hide
Query:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAE-----FAAQFSD---CAICLAEFAVGDEI
        +SD V+IL+ALLCALICV GL AV RCAWLR      GG +       P  NKGLKKK L+SLP+ TFTA       AA+  D   CAICL +FA G+EI
Subjt:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAE-----FAAQFSD---CAICLAEFAVGDEI

Query:  RVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG
        RVLP CGH FHV CID W  S SSCPSCR+IL   +C +CG
Subjt:  RVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCG

AT4G35480.1 RING-H2 finger A3B1.0e-3848.21Show/hide
Query:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAA----------------QFSDCAICLA
        ++D V+IL+ALLCAL+CV GL AVARCAWLR L G N  +    PPP    NKGLKKK L++LPK T+TA  +                   ++CAIC+ 
Subjt:  DSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAA----------------QFSDCAICLA

Query:  EFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEE
        EF+ G+EIR+LP C H FHV+CID W  S SSCPSCR+ILV  +C +CG   +++      E++VK++
Subjt:  EFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEE

AT5G05280.1 RING/U-box superfamily protein6.9e-2742.17Show/hide
Query:  NSSAISDTVEPDR----YDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSN-----KGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQFS
        N   + D+V  ++     D+  VIILAALLCALIC LG+ +V RC  LR        +    P   PV       KG+KK+ L+ +P  +++ E   + +
Subjt:  NSSAISDTVEPDR----YDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSN-----KGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQFS

Query:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSG
        +C ICL +F  G+ +RVLP+C HGFHV CIDTW  SHSSCP+CRQ L+  Q       PA+ S  G
Subjt:  DCAICLAEFAVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGTCCCTTTAGGTACCTCGCCGGTGTGAACTCCTCCGCCATCTCCGACACGGTGGAGCCCGATAGGTATGATTCCGATTTCGTCATAATCCTCGCCGCTCTTCTCTG
CGCCTTGATATGCGTTCTCGGTCTCGTTGCTGTTGCCCGATGCGCCTGGCTACGCCACCTCGCCGGCGATAATGGTGGCTCTGCTTCCACTCGTCCTCCTCCGCCTCCTG
TCTCCAACAAAGGTCTCAAGAAGAAGATCCTGAGGTCTCTTCCGAAGTACACCTTCACTGCCGAGTTTGCTGCTCAGTTCTCAGATTGCGCGATCTGCCTCGCGGAGTTC
GCTGTCGGTGATGAAATTCGCGTGCTGCCTCAGTGCGGCCATGGATTTCACGTGTCCTGCATCGACACATGGTTCCGATCTCACTCCTCCTGTCCTTCGTGCCGTCAGAT
TCTTGTGGTAAGTCAGTGCCAAAAGTGCGGCGGTTTTCCGGCGAGCTCGAGTTCGAGCGGTGGGACCGAATCCAGAGTAAAAGAGGAAGGAGAAGATAAGACGAATAGGT
TCTTACCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAAAACGAAAGCCGATTCCCGTGTCCAGTATAAAACCCCCCAAAATCCCCTCGAAACGACAGACGTTACGGCCACGGTTGATGCAAAAAGACTGCTCTTCTCAG
TTCTTATCTTATACGTTATACCCCCTACCCTTGTCTCGCCGCTTCAGATGCGTCCCTTTAGGTACCTCGCCGGTGTGAACTCCTCCGCCATCTCCGACACGGTGGAGCCC
GATAGGTATGATTCCGATTTCGTCATAATCCTCGCCGCTCTTCTCTGCGCCTTGATATGCGTTCTCGGTCTCGTTGCTGTTGCCCGATGCGCCTGGCTACGCCACCTCGC
CGGCGATAATGGTGGCTCTGCTTCCACTCGTCCTCCTCCGCCTCCTGTCTCCAACAAAGGTCTCAAGAAGAAGATCCTGAGGTCTCTTCCGAAGTACACCTTCACTGCCG
AGTTTGCTGCTCAGTTCTCAGATTGCGCGATCTGCCTCGCGGAGTTCGCTGTCGGTGATGAAATTCGCGTGCTGCCTCAGTGCGGCCATGGATTTCACGTGTCCTGCATC
GACACATGGTTCCGATCTCACTCCTCCTGTCCTTCGTGCCGTCAGATTCTTGTGGTAAGTCAGTGCCAAAAGTGCGGCGGTTTTCCGGCGAGCTCGAGTTCGAGCGGTGG
GACCGAATCCAGAGTAAAAGAGGAAGGAGAAGATAAGACGAATAGGTTCTTACCTTAGCCCTAAGTTTTTCGTTGTTCCTTCCTTCCTTCCTTCGTCCGTGTTGTAAATA
ACTTTCTTAATCAAAATTCATGTAATTAGTATAAATTGTGGATGTATTCAAGTTGTAAGCGAAGGCGATTTTCCCTGAATTTGAAATCGGCCGCTCCGGTAAGTTGTGTT
GTGAAAATTGACTTAAAATCAATCTGTAAGTCGATTTTCAGGCTGGGAATGTAACGGAGATGGCATAACTTTAAGAGTAGTACAGGCGATGAAATCAAAAGGGGGAACAG
TATCAGTATCATGTGGATGGATGGTGGACATTGTTTTATGTCGACAACAGCCAATGTGATGATTTGTTTATTTGCATCTTTGGATCGCATTTTTCGGCTTCCTCTGCATC
TCTCTTCACAATGCCAATTTTTCTCTTTCCTCTGCCAGGAAAAATATTACATGTGAAAAGTTTTGAAAATGGAATAATTCTGCAACTGCAAATGCAACTGCTCCGTTTCT
GATTAAAAAAATTGTAAATCAAGAATCCATTTTTTTACCTTCCATTGCCATGCCTGCTGCATTCTGCCCTTTTCGCTTTCAGTTCTCTTCTCACCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRPFRYLAGVNSSAISDTVEPDRYDSDFVIILAALLCALICVLGLVAVARCAWLRHLAGDNGGSASTRPPPPPVSNKGLKKKILRSLPKYTFTAEFAAQFSDCAICLAEF
AVGDEIRVLPQCGHGFHVSCIDTWFRSHSSCPSCRQILVVSQCQKCGGFPASSSSSGGTESRVKEEGEDKTNRFLP