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Tan0004250 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0004250
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationLG11:26364991..26365334
RNA-Seq ExpressionTan0004250
SyntenyTan0004250
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
CAB4295610.1 unnamed protein product [Prunus armeniaca]4.1e-1056.32Show/hide
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KAG2664121.1 hypothetical protein I3760_16G064500 [Carya illinoinensis]5.5e-1560.23Show/hide
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KAG6579195.1 hypothetical protein SDJN03_23643, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.2e-2377.65Show/hide
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KAG6672509.1 hypothetical protein I3842_16G060900 [Carya illinoinensis]1.2e-1459.09Show/hide
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KGN45959.1 hypothetical protein Csa_005610 [Cucumis sativus]1.1e-1871.95Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KAV1 Uncharacterized protein5.2e-1971.95Show/hide
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A0A2H5P3Q3 Uncharacterized protein2.0e-1053.41Show/hide
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        MSA FDL LIGA L+L +SSSS      ++   CM+LC F+QS NL   SVSM     RTC G  CFG FH K+  F L LF RG FT
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A0A5D2MYL6 Uncharacterized protein2.6e-1048.39Show/hide
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A0A6J5TMY7 Uncharacterized protein2.0e-1056.32Show/hide
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        MSA F L +IGALL+L + +SS +FS C     M+LC F+Q  N + SSVSM   P RTCSG   FGAFH KRFSF L LF RG  T
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A0A6J5W1Y9 Uncharacterized protein2.0e-1056.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGGCTGGGTTTGACTTGACTCTGATTGGAGCTCTGTTGCAGCTCTCTCTTTCTTCTTCCTCTTTGGCTTTCTCTTGCTGTATGATTCTCTGCTCTTTCAAGCAGAG
CTTCAATCTCCTCTTCTCGTCTGTTTCGATGCCTTTCACTCCCAACAGGACTTGTTCTGGATTCAACTGCTTTGGGGCTTTTCATACAAAACGTTTCTCATTTCTTCTTT
TGCTCTTCAGAAGAGGGGGTTTCACCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCGGCTGGGTTTGACTTGACTCTGATTGGAGCTCTGTTGCAGCTCTCTCTTTCTTCTTCCTCTTTGGCTTTCTCTTGCTGTATGATTCTCTGCTCTTTCAAGCAGAG
CTTCAATCTCCTCTTCTCGTCTGTTTCGATGCCTTTCACTCCCAACAGGACTTGTTCTGGATTCAACTGCTTTGGGGCTTTTCATACAAAACGTTTCTCATTTCTTCTTT
TGCTCTTCAGAAGAGGGGGTTTCACCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSAGFDLTLIGALLQLSLSSSSLAFSCCMILCSFKQSFNLLFSSVSMPFTPNRTCSGFNCFGAFHTKRFSFLLLLFRRGGFT