; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0004379 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0004379
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionATP citrate synthase
Genome locationLG09:2205008..2211011
RNA-Seq ExpressionTan0004379
SyntenyTan0004379
Gene Ontology termsGO:0000166 - nucleotide binding (molecular function)
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InterPro domainsIPR013650 - ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type
IPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like
IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050962.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-23897.64Show/hide
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A0A5A7U535 ATP citrate synthase7.6e-23997.64Show/hide
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A0A5D3CJ91 ATP citrate synthase2.0e-23997.87Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 37.4e-22389.52Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVKARLG +VEM GCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGG+EIEENWDKVKTIFLP EK   LE CAPLIATLPLE+R KIG+FIMG F VFQDLDFSF+EMN
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        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG++EFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIM
        V+GPEATMTGICK+AI+CIM
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIM

Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 31.6e-22288.89Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLL+EHLKRLA IDL I SAQV +STDF EL N EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQV +FVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGG+EIEENWDKVKT+FLPTEK    +ACAPLIATLPLE+R KIGDFI GV++VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGN++FPLPFGRVL+P+ESF+H LDEKTS+SLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRALREKESKLKAARM+IYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICKQAI+CIM+ A
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 25.4e-22690.54Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGG+EIEENWDKVKTIFLPTEKP   +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF VFQDLDFSFLEMN
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        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGN+EFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E
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        V+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q53JY8 ATP-citrate synthase subunit alpha chain protein 18.7e-20885.14Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLA IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+VEMGGCKA
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        PITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGG+EIEENWDKVKTIFL TEKP   +ACAPLIATLPLE RGKIGDFI GVF VFQDLDFSFLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFK-KWGNLEFPLPFGRVLTPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELG
        PFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFK  + KWGN+EFPLPFGRVL+ TE F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGG                 EL 
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        NYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+
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Query:  EVFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        EV+GPEATMTGICKQAIEC+M+AA
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Q9SGY2 ATP-citrate synthase alpha chain protein 13.4e-20480.61Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGG+EIEENWDKVKTIFLPT      E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +FT+FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09430.1 ATP-citrate lyase A-35.2e-22489.52Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVKARLG +VEM GCKA
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        PFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG++EFPLPFGRVL+ TE+F+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKE++LKA+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIM
        V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-12.4e-20580.61Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGG+EIEENWDKVKTIFLPT      E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +FT+FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-12.4e-20580.61Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGG+EIEENWDKVKTIFLPT      E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +FT+FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-12.4e-20580.61Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +VEM GCK 
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        PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGG+EIEENWDKVKTIFLPT      E CAPL+ATLPLEI+ +I +FI  +FT+FQDLDF+FLEMN
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        PFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFPLPFGRV++PTESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
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        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
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AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-22.1e-20479.91Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL+  +L I S Q+NQ TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A VA FVK RLG +VEM GCK 
Subjt:  MARKKIREYDSKRLLKEHLKRLANIDLQICSAQVNQSTDFAELTNNEPWLSSTRLVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQVAEFVKARLGVQVEMGGCKA

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        PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC+ISFSECGG++IEENWDKVKTI +PT      E CAPL+ATLPLEI+G++ DFI  +FT+F+DLDF+FLEMN
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Query:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNLEFPLPFGRVLTPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
        PFTLV+G+PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFP+PFGRV++ TESF+H LDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN
Subjt:  PFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNLEFPLPFGRVLTPTESFVHSLDEKTSASLKFTVLNPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGN

Query:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        YAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE+KLKAARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMR+LG+E+GVP+E
Subjt:  YAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKESKLKAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE

Query:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA
        V+GPEATMTGICK+AI+ I +AA
Subjt:  VFGPEATMTGICKQAIECIMSAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTAGGAAGAAGATTCGAGAGTATGACTCTAAGAGGCTTCTGAAGGAACATCTCAAACGCCTCGCTAACATCGACCTCCAGATCTGCTCTGCTCAGGTAAATCAATC
GACCGACTTTGCCGAGCTGACAAATAATGAACCATGGCTGTCATCCACTAGGTTGGTAGTGAAACCAGACATGTTATTTGGGAAACGTGGAAAGAGTGGCTTGGTAGCTT
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GTTCCCCATGATCAAGAATATTACCTATCTATTGTCTCTGAAAGGCTTGGCTGCACAATAAGTTTTTCAGAGTGTGGGGGGATGGAAATTGAAGAGAACTGGGATAAAGT
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