; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0004498 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0004498
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionRemorin_C domain-containing protein
Genome locationLG03:71689080..71692654
RNA-Seq ExpressionTan0004498
SyntenyTan0004498
Gene Ontology termsGO:0006950 - response to stress (biological process)
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InterPro domainsIPR005516 - Remorin, C-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6595034.1 Remorin 4.1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.2e-20191.77Show/hide
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KAG7027057.1 Remorin 4.1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-20292.27Show/hide
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A0A0A0KLC7 Remorin_C domain-containing protein9.5e-19188.56Show/hide
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A0A6J1KX88 uncharacterized protein LOC1114971872.4e-20292.02Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q7XII4 Remorin 4.13.1e-0531.9Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G30320.1 Remorin family protein4.4e-0725.45Show/hide
Query:  RTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSRSLQSHLQRRPKSKSGPIGSPGVSNYSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGGSIERGQSYPECII
        R +PSKW DAE+WI           S Q+ + R+           G  N  P    P+N G+  +K              + +C    ++  + +P  + 
Subjt:  RTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSRSLQSHLQRRPKSKSGPIGSPGVSNYSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGGSIERGQSYPECII

Query:  QRLASAPRWSDILNESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSS-----------VVSQRNVATQMSP----EDFTPSSPLGN----GSLSSSSPSTHQSVVGKESDH
            SAP    +  E    S  D+    +D A DSS            V  R++ T+M+P    E     +P+G      S +SS PST +    +ES  
Subjt:  QRLASAPRWSDILNESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSS-----------VVSQRNVATQMSP----EDFTPSSPLGN----GSLSSSSPSTHQSVVGKESDH

Query:  CSKQEVRDVEVDKR---------ATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNLNENAEEA-------GTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAA
         SK   R++  ++          A  +Q  K N    + +        N +AEEA         +  + AE +   ++ +REE +I AWE+ +KAK EA 
Subjt:  CSKQEVRDVEVDKR---------ATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNLNENAEEA-------GTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAA

Query:  IRKLEMKLERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMR
        +R++E K+E+ ++ +  KI+KK+  A+ ++ + R
Subjt:  IRKLEMKLERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMR

AT1G45207.2 Remorin family protein1.3e-4337.97Show/hide
Query:  ERSCSSSHNFSAFPSPGVPNYWEINVMNQRGCSSERIPQPNSNTRRRNASVAALTPFYGRTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSR-SLQSHLQRRPKSKSG
        +R+  S++  S FPSPG P Y       Q+G SSER+P   SN  R   +   L  + GRT+PSKWEDAERWI SP+     +R S  +  +RRPK+KSG
Subjt:  ERSCSSSHNFSAFPSPGVPNYWEINVMNQRGCSSERIPQPNSNTRRRNASVAALTPFYGRTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSR-SLQSHLQRRPKSKSG

Query:  PIGSPG---VSNYSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGGSIERGQSYPECIIQRLASAPRWSDILNESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSSV
        P+G PG    S YSPA+     G        S  S GVL     ++   GS     ++P+ I   +A +             S +D  +   D A D+  
Subjt:  PIGSPG---VSNYSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGGSIERGQSYPECIIQRLASAPRWSDILNESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSSV

Query:  VSQRNVATQMSPEDFTPSSPLGNGSLSSSSPSTHQSVVGKESDHCSKQEVRDVEVDKRATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNLNENAEEAGTSTLDIAEA
        VS+R++ATQMSPE     SP    S S SSPS    +    + H ++ EV+D++VD++ TV + SK ++      G      + ++     T+  D+  A
Subjt:  VSQRNVATQMSPEDFTPSSPLGNGSLSSSSPSTHQSVVGKESDHCSKQEVRDVEVDKRATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNLNENAEEAGTSTLDIAEA

Query:  AIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLE-----MKLERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDR
                 EEA+I +WENLQKAKAEAAIRKLE     MKLE+ RSSSM+KI++K++ A+ +A +MR S   +R
Subjt:  AIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLE-----MKLERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDR

AT2G02170.1 Remorin family protein1.2e-0923.53Show/hide
Query:  YGRTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSRSLQSHLQRRPKSKSGPIGSPGVSNYSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGG----SIERGQS
        + +  PSKW+DA++WI+SP      +  +Q      P SK GP  S G  +    ++  E+      +  +       V   +   +G     S     S
Subjt:  YGRTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSRSLQSHLQRRPKSKSGPIGSPGVSNYSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGG----SIERGQS

Query:  YPECIIQRLASAPRWSDILN-----ESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSSVVSQRNVATQMSPEDFTP------------SSPLGNGSLSSSSPSTHQSVVGK
        Y + ++    S    +  +N      S   +F          +M         +A+Q    + TP            S P   G  +S+SP +++ +  K
Subjt:  YPECIIQRLASAPRWSDILN-----ESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSSVVSQRNVATQMSPEDFTP------------SSPLGNGSLSSSSPSTHQSVVGK

Query:  ESDHCSKQE--VRDVEVDKRATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNL--NENAEEAGTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLEMKL
        E    +++E  V   ++ K       SK ++ + +        +L  +++  EA  +  + AE A  +++ +REE KI AWEN QKAK+EA ++K E+K+
Subjt:  ESDHCSKQE--VRDVEVDKRATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNL--NENAEEAGTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLEMKL

Query:  ERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDRNQRVCNT
        ER +  + D+++KKL   + KA + R ++   ++ +   T
Subjt:  ERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDRNQRVCNT

AT2G02170.2 Remorin family protein1.2e-0923.53Show/hide
Query:  YGRTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSRSLQSHLQRRPKSKSGPIGSPGVSNYSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGG----SIERGQS
        + +  PSKW+DA++WI+SP      +  +Q      P SK GP  S G  +    ++  E+      +  +       V   +   +G     S     S
Subjt:  YGRTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSRSLQSHLQRRPKSKSGPIGSPGVSNYSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGG----SIERGQS

Query:  YPECIIQRLASAPRWSDILN-----ESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSSVVSQRNVATQMSPEDFTP------------SSPLGNGSLSSSSPSTHQSVVGK
        Y + ++    S    +  +N      S   +F          +M         +A+Q    + TP            S P   G  +S+SP +++ +  K
Subjt:  YPECIIQRLASAPRWSDILN-----ESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSSVVSQRNVATQMSPEDFTP------------SSPLGNGSLSSSSPSTHQSVVGK

Query:  ESDHCSKQE--VRDVEVDKRATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNL--NENAEEAGTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLEMKL
        E    +++E  V   ++ K       SK ++ + +        +L  +++  EA  +  + AE A  +++ +REE KI AWEN QKAK+EA ++K E+K+
Subjt:  ESDHCSKQE--VRDVEVDKRATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNL--NENAEEAGTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLEMKL

Query:  ERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDRNQRVCNT
        ER +  + D+++KKL   + KA + R ++   ++ +   T
Subjt:  ERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDRNQRVCNT

AT4G36970.1 Remorin family protein3.1e-5342.39Show/hide
Query:  SSHNFSAFPSPGVPNYWEINVMNQRGCSSERIPQPNSNT---------RRRNASVAALTPFY-GRTLPSKWEDAERWISSPV----MGNVFSRSLQSHLQ
        SS++F  F SPG P+Y      + +G SSER+P P+S T         R   +S A  TPFY GR +PSKWEDAERWI SPV     G   + S+ S  Q
Subjt:  SSHNFSAFPSPGVPNYWEINVMNQRGCSSERIPQPNSNT---------RRRNASVAALTPFY-GRTLPSKWEDAERWISSPV----MGNVFSRSLQSHLQ

Query:  RRPKSKSGPIGSP--------------GVSNYSP-----AIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGGSIERGQSYPECIIQRLASAPRWSDIL
        RR KSKSGPI  P              G  +YSP     ++  P  G       GS  STGVL AD V   + GS+  G             +  W D++
Subjt:  RRPKSKSGPIGSP--------------GVSNYSP-----AIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGGSIERGQSYPECIIQRLASAPRWSDIL

Query:  NE--SPLPSFED-EKDGGSDTAMDSSVVSQRNVATQMSPEDFTPSSPLGNGSLSSSSPSTHQSVVGKESDHCSKQEVRDVEVDKRATVIQRSKGNKL--R
        +E  S L S  D E+     TAM S VVS+R++ATQMSPE+ +P++       ++ SP    SV+  E   C + EVR+V++DK A +I+R K   +  R
Subjt:  NE--SPLPSFED-EKDGGSDTAMDSSVVSQRNVATQMSPEDFTPSSPLGNGSLSSSSPSTHQSVVGKESDHCSKQEVRDVEVDKRATVIQRSKGNKL--R

Query:  LSKEGFPHLGNLNENAEEAGTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLEMKLERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDRNQ
        + +   P + + +E    A +S+ DI+E A+ +SKLQREEAKI AWENLQKAKAEAAIRKLE+KLE+ +S+SMDKIL KL+ A++KA +MR SS    ++
Subjt:  LSKEGFPHLGNLNENAEEAGTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLEMKLERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDRNQ

Query:  R
        +
Subjt:  R


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGGAAAGAAGTTGCAGTTCTTCCCACAATTTCAGTGCGTTTCCAAGCCCTGGAGTCCCTAATTACTGGGAAATCAATGTCATGAACCAAAGGGGTTGCAGCTCCGA
GCGAATACCTCAGCCTAATAGCAACACCCGCCGGAGGAATGCCTCCGTCGCCGCTTTGACGCCATTTTACGGCAGGACACTGCCCTCCAAGTGGGAGGATGCCGAGCGAT
GGATTAGTAGCCCTGTTATGGGCAACGTCTTCAGCAGGAGTTTGCAGTCTCACCTACAGAGAAGACCCAAGTCCAAGAGTGGCCCTATTGGGTCGCCTGGAGTTTCTAAT
TATTCTCCTGCAATTCAAACTCCCGAAAATGGGGGTTTCGCCACCTCCAAATTAGGCTCTGCTCTTTCCACTGGAGTGTTGGTTGCTGATGGGGTTTCTATCTGCTATGG
CGGTAGCATCGAAAGGGGGCAGTCTTATCCTGAGTGTATTATCCAACGATTAGCTTCTGCACCCAGATGGTCAGATATACTGAACGAGTCGCCACTGCCAAGCTTTGAGG
ATGAAAAAGATGGTGGTTCTGACACGGCAATGGATTCGAGCGTTGTTTCGCAACGAAATGTGGCAACACAAATGAGCCCTGAAGATTTCACACCTTCATCTCCTCTGGGC
AACGGTTCGCTTTCCTCTTCATCCCCTTCGACACACCAATCTGTGGTTGGAAAGGAGAGCGATCATTGTTCTAAACAAGAAGTGAGAGATGTTGAGGTAGACAAGAGAGC
CACGGTGATACAGAGATCCAAAGGGAATAAACTCAGATTGAGCAAGGAAGGCTTTCCACACCTTGGAAACTTGAATGAAAATGCTGAAGAAGCTGGAACTTCAACTTTGG
ATATTGCAGAGGCAGCTATTCAGGTTTCCAAGTTGCAGAGAGAGGAAGCCAAGATCACAGCATGGGAGAATTTGCAGAAGGCAAAAGCTGAAGCTGCGATACGCAAACTT
GAGATGAAACTTGAAAGGGCAAGATCATCATCAATGGATAAGATATTGAAGAAGCTGAGGAAGGCACAGATGAAAGCACACAAAATGAGGAACTCGTCTGCGGGCGATCG
GAACCAGAGAGTTTGCAACACTAACAACTTTCTTCCGTTCCACAAGCTCGTGTGGATTGGTTCGCTCAAGCGCTGGTTCATCTGCCATGCTTCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACCGAAAGCATAAGCAGAGTTGCCATTCCCAGAAAACAGAAAACAAAAGAAAACAAAAAACAAATCTTTCTTTGTATCAATTGAATCTTCCACTTTATCCGAAATTCAA
TGATCCATTGTCTTTTTCCTTTACCAAAACACCTTCTAAATTGGCTTGATTTGATTCCAACAATTACATATATTACCCCTTGTACATCGTAACTTTAAATCTCAACAAAT
TATATATGATAGACATAAAAACTTCTTCTTCAAATCATAAAAACAACACAATTTTGCTATCAAACAAATTCTTGATTGAAATTAAAGGTTGGGAAATGGGAATTTTCCCA
TCTCCTAAACTCAACCAAAACTAGAAGACAATTGATCCATCTATCCGTCGGGTCGGGCAAAGATGAACGACAAAAAGAGAAAGCATGATCCAAATTGGTAGAAGTGGTTT
TCAACTTTCCCATCATCTTCAATGGGAAGTTCGTCGATTTTCATACATTCTAATAAATCTGTTGTGAATCGTATCCTTGCTTGATGACCCTTTATTCCAAATGGCTCTAA
TTCACTCCAATTTATAGTAACCAAAGGAAAGTTAGGCTTGCTGCTAGCCTCCCGCCAAAAGAAAGAAAAGAGAAAGAGGTTTCTGAAACTCCCCCACAGGAAGGCCACAG
CTGTATTGGACAAAAATGGACGGAAGAAAGAATAGTGTCAAAAGCAAAATTCTATCGATAGGGACGTAGGGAAAAACCAATACGCAAAGACCCTTGTTACTTACTGTTAC
TGTGTTGTACTGTTCATAATGAAGGAAAGAAGTTGCAGTTCTTCCCACAATTTCAGTGCGTTTCCAAGCCCTGGAGTCCCTAATTACTGGGAAATCAATGTCATGAACCA
AAGGGGTTGCAGCTCCGAGCGAATACCTCAGCCTAATAGCAACACCCGCCGGAGGAATGCCTCCGTCGCCGCTTTGACGCCATTTTACGGCAGGACACTGCCCTCCAAGT
GGGAGGATGCCGAGCGATGGATTAGTAGCCCTGTTATGGGCAACGTCTTCAGCAGGAGTTTGCAGTCTCACCTACAGAGAAGACCCAAGTCCAAGAGTGGCCCTATTGGG
TCGCCTGGAGTTTCTAATTATTCTCCTGCAATTCAAACTCCCGAAAATGGGGGTTTCGCCACCTCCAAATTAGGCTCTGCTCTTTCCACTGGAGTGTTGGTTGCTGATGG
GGTTTCTATCTGCTATGGCGGTAGCATCGAAAGGGGGCAGTCTTATCCTGAGTGTATTATCCAACGATTAGCTTCTGCACCCAGATGGTCAGATATACTGAACGAGTCGC
CACTGCCAAGCTTTGAGGATGAAAAAGATGGTGGTTCTGACACGGCAATGGATTCGAGCGTTGTTTCGCAACGAAATGTGGCAACACAAATGAGCCCTGAAGATTTCACA
CCTTCATCTCCTCTGGGCAACGGTTCGCTTTCCTCTTCATCCCCTTCGACACACCAATCTGTGGTTGGAAAGGAGAGCGATCATTGTTCTAAACAAGAAGTGAGAGATGT
TGAGGTAGACAAGAGAGCCACGGTGATACAGAGATCCAAAGGGAATAAACTCAGATTGAGCAAGGAAGGCTTTCCACACCTTGGAAACTTGAATGAAAATGCTGAAGAAG
CTGGAACTTCAACTTTGGATATTGCAGAGGCAGCTATTCAGGTTTCCAAGTTGCAGAGAGAGGAAGCCAAGATCACAGCATGGGAGAATTTGCAGAAGGCAAAAGCTGAA
GCTGCGATACGCAAACTTGAGATGAAACTTGAAAGGGCAAGATCATCATCAATGGATAAGATATTGAAGAAGCTGAGGAAGGCACAGATGAAAGCACACAAAATGAGGAA
CTCGTCTGCGGGCGATCGGAACCAGAGAGTTTGCAACACTAACAACTTTCTTCCGTTCCACAAGCTCGTGTGGATTGGTTCGCTCAAGCGCTGGTTCATCTGCCATGCTT
CCTGATTTGTGATTTCTCAAGGTAGCATCTGGTAGTTTCATTGTCTTAGAAATTTACACTAGCTTAGCTTGGTTGGTTCTGTATCATCGTAGCTCTTTCACTGTACACAT
GTTGTAGAATAAGAAATCATAGCTGTTTTATGGTTTTTTGAGCAGGAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKERSCSSSHNFSAFPSPGVPNYWEINVMNQRGCSSERIPQPNSNTRRRNASVAALTPFYGRTLPSKWEDAERWISSPVMGNVFSRSLQSHLQRRPKSKSGPIGSPGVSN
YSPAIQTPENGGFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGGSIERGQSYPECIIQRLASAPRWSDILNESPLPSFEDEKDGGSDTAMDSSVVSQRNVATQMSPEDFTPSSPLG
NGSLSSSSPSTHQSVVGKESDHCSKQEVRDVEVDKRATVIQRSKGNKLRLSKEGFPHLGNLNENAEEAGTSTLDIAEAAIQVSKLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKL
EMKLERARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSAGDRNQRVCNTNNFLPFHKLVWIGSLKRWFICHAS