; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0004714 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0004714
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionHomeobox-leucine zipper protein like
Genome locationLG01:12640020..12643204
RNA-Seq ExpressionTan0004714
SyntenyTan0004714
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0045893 - positive regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000047 - Helix-turn-helix motif
IPR001356 - Homeobox domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7031239.1 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-40 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-9688.32Show/hide
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XP_038877287.1 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like [Benincasa hispida]4.7e-9890.19Show/hide
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        N CIYG+EW NPYI
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWL3 Homeobox domain-containing protein1.7e-8580.37Show/hide
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A0A1S3BY52 homeobox-leucine zipper protein ATHB-401.6e-9183.87Show/hide
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A0A6J1C5L6 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like4.7e-8883.63Show/hide
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A0A6J1FTB2 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like2.3e-9587.38Show/hide
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A0A6J1J034 homeobox-leucine zipper protein ATHB-40-like2.6e-9486.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XDK5 Homeobox-leucine zipper protein HOX121.2e-2747.65Show/hide
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        +VV++ C LETE+LKLKE+L+DVE+EK +L     A        G  SSS  S S S     P   G+FG
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O23208 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-401.1e-4954.05Show/hide
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         +FY +PENS I   EW + YI
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Q10QF2 Homeobox-leucine zipper protein HOX121.2e-2747.65Show/hide
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        + K R+RR++    EA AA          AKKR+L+  Q   LE +F  E KLE+ RK +LA+ELGLD +QVAVWFQNRRAR KSK +EEE++ L+  H+
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Query:  SVVVEKCRLETEILKLKEQLSDVEKEKERLMMAERA-------DGPLSSSSPSPSMSMDAVDPTCLGEFG
        +VV++ C LETE+LKLKE+L+DVE+EK +L     A        G  SSS  S S S     P   G+FG
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Q9LVR0 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-532.4e-3343.29Show/hide
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        +A ELGLDPRQVAVWFQNRRARWK+KKLEEEY+ LK  H++VV+ +C+LE++ILKL EQLS+ + E  +L  +ER +  + ++S S S+S++A + PT  
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             +  ++ +YM +N+ +  +E W   Y+
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Q9ZU70 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-212.4e-4448.23Show/hide
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           ++   Y P+   I G++W + ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18550.1 homeobox protein 211.7e-4548.23Show/hide
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AT3G01470.1 homeobox 14.9e-2154.64Show/hide
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AT4G36740.1 homeobox protein 407.8e-5154.05Show/hide
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         +FY +PENS I   EW + YI
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AT5G03790.1 homeobox 511.7e-1852.17Show/hide
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