; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0004739 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0004739
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionL-ascorbate peroxidase
Genome locationLG05:2325424..2328302
RNA-Seq ExpressionTan0004739
SyntenyTan0004739
Gene Ontology termsGO:0000302 - response to reactive oxygen species (biological process)
GO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0042744 - hydrogen peroxide catabolic process (biological process)
GO:0098869 - cellular oxidant detoxification (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0016688 - L-ascorbate peroxidase activity (molecular function)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002016 - Haem peroxidase
IPR002207 - Class I peroxidase
IPR010255 - Haem peroxidase superfamily
IPR019793 - Peroxidases heam-ligand binding site
IPR019794 - Peroxidase, active site
IPR044831 - Heme-binding peroxidase Ccp1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
APO14272.1 L-ascorbate peroxidase [Luffa aegyptiaca]9.2e-13091.16Show/hide
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KAG6605507.1 L-ascorbate peroxidase, cytosolic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-13090.76Show/hide
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XP_022947666.1 L-ascorbate peroxidase, cytosolic-like [Cucurbita moschata]1.1e-13090.76Show/hide
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XP_023007423.1 L-ascorbate peroxidase, cytosolic-like [Cucurbita maxima]7.1e-13089.96Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1L5JHV1 L-ascorbate peroxidase4.5e-13091.16Show/hide
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A0A4D6EXD1 L-ascorbate peroxidase2.3e-12689.56Show/hide
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A0A6J1CY69 L-ascorbate peroxidase3.4e-13089.56Show/hide
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A0A6J1G730 L-ascorbate peroxidase5.3e-13190.76Show/hide
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A0A6J1L7M0 L-ascorbate peroxidase3.4e-13089.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2XFC7 L-ascorbate peroxidase 1, cytosolic7.4e-11478.4Show/hide
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P48534 L-ascorbate peroxidase, cytosolic2.8e-12182.4Show/hide
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Q05431 L-ascorbate peroxidase 1, cytosolic6.7e-11577.2Show/hide
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Q10N21 L-ascorbate peroxidase 1, cytosolic8.7e-11578.8Show/hide
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Q1PER6 L-ascorbate peroxidase 2, cytosolic1.6e-11377.64Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07890.1 ascorbate peroxidase 14.7e-11677.2Show/hide
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AT1G07890.4 ascorbate peroxidase 14.7e-11677.2Show/hide
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AT1G07890.5 ascorbate peroxidase 14.7e-11677.2Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAAGAGCTATCCAACTGTTAGCGAGGAATACCAGAAGGCGATCGTGAAGGCGAGGAGGAAGATTAGAGCTCTCGTTGCTGAGAAGAGCTGCTCTCCTCTAATGCT
TCGTCTCGCATGGCACTCCGCCGGAACGTATGACGTTAAGACTAAGACGGGAGGTCCCTTCGGCACGATGAAGCACGCAGCGGAGCTCGCTCATGGTGCTAACAACGGCC
TTGACATCGCTGTTAAGCTGTTGGAGCCGATTAAGGAACAGTTGCCGATCCTTTCATACGGCGACTTCTATCAGCTCGCCGGGGTTGTTGCTGTTGAAGTTACCGGTGGA
CCTGAGATTCCGTTCCATCCTGGCAGAGAGGACAAGCCTGAGCCACCGCCTGAAGGCCGCCTTCCCGATGCCGGAAAAGGATGTGATCATATCAGGGATGTTTTCTACAC
AATGGGTCTCAGTGACCAGGAAATCGTTGCTCTGTCTGGCGCTCACACTCTGGGAAAAGCTCATAAGGATCGATCAGGATTTGAAGGTCCTTGGACAACCAATCCTCTTG
TCTTCGACAACTCTTACTTTAAGGAGCTCTTATCTGGAGAGAAGGAAGGGCTCCTTCAGCTGCCATCTGATAAGGCGCTTCTGACTGATCCTGTCTTCCGTCCTCTTGTT
GACAAATATGCTGCGGATGAAGATGCTTTTTTTGACCATTATGGGGAAGCTCACCTGAAGCTCTCAGAGCTGGGATTTGCCGATGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTTCTGTATCCTGTGCCTGCCTCGTGCCATCTTTGTGAACAAATCTCTCTCGTTTCATTTTGTGCTTCAAGAATCTCAGCCATGGGGAAGAGCTATCCAACTGTTAGCGA
GGAATACCAGAAGGCGATCGTGAAGGCGAGGAGGAAGATTAGAGCTCTCGTTGCTGAGAAGAGCTGCTCTCCTCTAATGCTTCGTCTCGCATGGCACTCCGCCGGAACGT
ATGACGTTAAGACTAAGACGGGAGGTCCCTTCGGCACGATGAAGCACGCAGCGGAGCTCGCTCATGGTGCTAACAACGGCCTTGACATCGCTGTTAAGCTGTTGGAGCCG
ATTAAGGAACAGTTGCCGATCCTTTCATACGGCGACTTCTATCAGCTCGCCGGGGTTGTTGCTGTTGAAGTTACCGGTGGACCTGAGATTCCGTTCCATCCTGGCAGAGA
GGACAAGCCTGAGCCACCGCCTGAAGGCCGCCTTCCCGATGCCGGAAAAGGATGTGATCATATCAGGGATGTTTTCTACACAATGGGTCTCAGTGACCAGGAAATCGTTG
CTCTGTCTGGCGCTCACACTCTGGGAAAAGCTCATAAGGATCGATCAGGATTTGAAGGTCCTTGGACAACCAATCCTCTTGTCTTCGACAACTCTTACTTTAAGGAGCTC
TTATCTGGAGAGAAGGAAGGGCTCCTTCAGCTGCCATCTGATAAGGCGCTTCTGACTGATCCTGTCTTCCGTCCTCTTGTTGACAAATATGCTGCGGATGAAGATGCTTT
TTTTGACCATTATGGGGAAGCTCACCTGAAGCTCTCAGAGCTGGGATTTGCCGATGCTTGAATGCCCCAGAAGTTCAAGCGCCGACGCCCGTATGCTTAGTTTTAACTGG
TTTTAATTTTTTTGAAATTGTTGGCATTTGGATAGTTGCTTTATGTTAAGGATGTTTGTGGATGGCTTTATTGGTCCTAGCTTTTGGCGGTAGTACAATGAAAGCTATTG
CATTACTTTCCTCGTGAAAAATAATTTTTCACCCACTAGCTATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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