; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0004976 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0004976
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionPrefoldin subunit 4
Genome locationLG08:3857076..3858666
RNA-Seq ExpressionTan0004976
SyntenyTan0004976
Gene Ontology termsGO:0006457 - protein folding (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0016272 - prefoldin complex (cellular component)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002777 - Prefoldin beta-like
IPR016661 - Prefoldin, subunit 4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6599316.1 putative prefoldin subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.6e-5186.51Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSDE++IRF IGEVFAHVPREEVEGRL+EM+ ENVKN+EKL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELKKILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

KAG7030312.1 putative prefoldin subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.6e-5186.51Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSDE++IRF IGEVFAHVPREEVEGRL+EM+ ENVKN+EKL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELKKILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

XP_022946140.1 probable prefoldin subunit 4 [Cucurbita moschata]5.6e-5186.51Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSDE++IRF IGEVFAHVPREEVEGRL+EM+ ENVKN+EKL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELKKILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

XP_022999107.1 probable prefoldin subunit 4 [Cucurbita maxima]5.6e-5186.51Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSDE+VIRF IGEVFAHVPREEVEGRL+EM+ ENVKN+EKL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELK+ILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

XP_023521156.1 probable prefoldin subunit 4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-5187.3Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSDE+VIRF IGEVFAHVPREEVEGRL+EM+ ENVKN+EKL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELKKILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFH2 Prefoldin subunit 41.4e-5084.13Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET++NLEDASNELILSD++VIRFQIGEVFAH+P+EEVEGRL++M+ ENV+N+EKLK EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELKKILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

A0A1S3C216 Prefoldin subunit 41.5e-4982.54Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSD++VIRFQIGEVFAH+P+EEVEGRL++M+ ENV++++KL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELKKILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

A0A5D3D4H6 Prefoldin subunit 41.5e-4982.54Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSD++VIRFQIGEVFAH+P+EEVEGRL++M+ ENV++++KL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELKKILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

A0A6J1G2Y9 Prefoldin subunit 42.7e-5186.51Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSDE++IRF IGEVFAHVPREEVEGRL+EM+ ENVKN+EKL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELKKILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

A0A6J1K9X7 Prefoldin subunit 42.7e-5186.51Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQGGGSE+EVTWEDQ NINKFSRLNNR HELEDEIR AKET+DNLEDASNELILSDE+VIRF IGEVFAHVPREEVEGRL+EM+ ENVKN+EKL+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SIVA+MAELK+ILYGKFK+SINLEDD
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2TBR6 Prefoldin subunit 45.2e-1538.28Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEE--VIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNE
        M++    +  VT+EDQ  INKF+R  +R+ EL++EI + K+   NLEDA  +++L+D++  +I +QIG+VF    +EE +  L+E +    + ++ L++ 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEE--VIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNE

Query:  KYSIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
          SI   +A+LK  LY KF  +INLE D
Subjt:  KYSIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

Q54TB7 Probable prefoldin subunit 41.6e-1136.97Show/hide
Query:  ETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEE-VIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKYSIVAEM
        ETEV   DQ  IN F RLNNR HEL  E +  +E  +   D+ ++L ++D++   ++ +GE F  V +E+ E  +++   +  ++++K+ ++   I  + 
Subjt:  ETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEE-VIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKYSIVAEM

Query:  AELKKILYGKFKESINLED
         ELK ILY KFK SINLE+
Subjt:  AELKKILYGKFKESINLED

Q9M4B5 Probable prefoldin subunit 44.7e-4066.67Show/hide
Query:  MQQGG---GSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKN
        MQQ G   GSE EVTWEDQ NIN FSRLNNR+H+L+D+I+ AKE  +NLEDA NELIL+DEE++RFQIGEVFAHVPR++VE +++EM+    K++EKL+ 
Subjt:  MQQGG---GSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKN

Query:  EKYSIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        EK SIV +MA LKK+LY KFK+SINLE+D
Subjt:  EKYSIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

Q9M4C4 Probable prefoldin subunit 43.4e-4368.25Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY
        MQQG G+E +VTWEDQ NIN+F RLNNR HEL DEIR+AKE ++NLEDA NELIL DE+V+RFQIGEVFAH+P ++VE RL++M+ +  K +E+L+ EK 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKY

Query:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        SI+A+MAELKKILYGKFK++INLE+D
Subjt:  SIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

Q9NQP4 Prefoldin subunit 44.0e-1538.28Show/hide
Query:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEE--VIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNE
        M++    +  VT+EDQ  INKF+R  +R+ EL++EI + K+   NLEDA ++++L+D++  +I +QIG+VF    +EE +  L+E +    + ++ L++ 
Subjt:  MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEE--VIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNE

Query:  KYSIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
          SI   +A+LK  LY KF  +INLE D
Subjt:  KYSIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G08780.1 ABI3-interacting protein 33.3e-4166.67Show/hide
Query:  MQQGG---GSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKN
        MQQ G   GSE EVTWEDQ NIN FSRLNNR+H+L+D+I+ AKE  +NLEDA NELIL+DEE++RFQIGEVFAHVPR++VE +++EM+    K++EKL+ 
Subjt:  MQQGG---GSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKN

Query:  EKYSIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD
        EK SIV +MA LKK+LY KFK+SINLE+D
Subjt:  EKYSIVAEMAELKKILYGKFKESINLEDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGCAGGGCGGAGGATCTGAAACGGAGGTCACATGGGAGGACCAACTGAATATCAACAAATTTAGTAGGTTGAACAATCGGTTACACGAGCTTGAAGACGAGATTAG
GATCGCCAAGGAAACACATGATAATCTAGAGGATGCGAGTAATGAATTGATTCTCAGTGATGAGGAGGTGATTCGTTTTCAGATTGGGGAAGTTTTTGCCCATGTACCAA
GGGAAGAAGTGGAAGGCAGGTTGCAAGAAATGGAAGTGGAGAATGTTAAGAACATGGAGAAACTTAAGAACGAAAAGTACTCTATTGTGGCCGAGATGGCTGAGTTGAAG
AAAATTCTGTACGGGAAGTTCAAAGAGTCCATCAATCTAGAAGATGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGTCATTTCAATCAGGTCAATTTCGTTTACCTGGCTCATTCCCCTTCCCTCTAACCGGAGCTTTCGTTCTCTTTCTTTTCACTACGGGCGATTGACTGTTCGAACATGCA
GCAGGGCGGAGGATCTGAAACGGAGGTCACATGGGAGGACCAACTGAATATCAACAAATTTAGTAGGTTGAACAATCGGTTACACGAGCTTGAAGACGAGATTAGGATCG
CCAAGGAAACACATGATAATCTAGAGGATGCGAGTAATGAATTGATTCTCAGTGATGAGGAGGTGATTCGTTTTCAGATTGGGGAAGTTTTTGCCCATGTACCAAGGGAA
GAAGTGGAAGGCAGGTTGCAAGAAATGGAAGTGGAGAATGTTAAGAACATGGAGAAACTTAAGAACGAAAAGTACTCTATTGTGGCCGAGATGGCTGAGTTGAAGAAAAT
TCTGTACGGGAAGTTCAAAGAGTCCATCAATCTAGAAGATGATTGATGCAGATAAGTTTTTCTGAAGCTGTTTTGATTCTATGTTCTTTGGATCTTGATGTCGTATTCTC
TCATGTTGTCCATGTAGTTTTGGAATCCTCTGGATTTTAATTTGAGAAAGTGACCTGATGGAAAGTTGATAGTTTACTCAAAGATCAATAGATGTTTGTATTAGCATTCT
TGTCTCTATAACATACATGAATATCTGATGTTCCTTGACTAGTCTTGTTAAATGGATGGATTTACTAACTGGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQQGGGSETEVTWEDQLNINKFSRLNNRLHELEDEIRIAKETHDNLEDASNELILSDEEVIRFQIGEVFAHVPREEVEGRLQEMEVENVKNMEKLKNEKYSIVAEMAELK
KILYGKFKESINLEDD