; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0005140 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0005140
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionReverse transcriptase domain-containing protein
Genome locationLG06:3344488..3344808
RNA-Seq ExpressionTan0005140
SyntenyTan0005140
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR000477 - Reverse transcriptase domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7644128.1 Reverse transcriptase zinc-binding domain [Arabidopsis suecica]4.2e-2357.29Show/hide
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        MNCI +VSFSIL+NGSP G +TP+RG+RQGDPLSPYLF+LC E LS ++K   +  +L G+ IS+++P + HL FADD LFF  AN      +KTI
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PNY15111.1 ribonuclease H [Trifolium pratense]4.2e-2355.21Show/hide
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        M CI TVS+ IL+NG P+ L TP RGLRQGDPLSPYLF+LC + LS LVK +++   + G+ I+ ++PK++HLFFADD L F RA+A E G++  +
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XP_023914298.1 uncharacterized protein LOC112025844 [Quercus suber]1.1e-2351.96Show/hide
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        + CI TVS+S+L+NG P+ ++ PSRGLRQGDPLSPYLFL+C EGL  L++  +D  ++ GV+I  K P++THLFFADD L F RA+ +E   ++T+ +  
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Query:  SK
         K
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XP_030963556.1 uncharacterized protein LOC115984674 [Quercus lobata]2.5e-2358.95Show/hide
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        +CI +VSFS+L+NG P G  TP+RGLRQGDPLSPYLFLLC EGL +L++       + GV++ S SPKV+HLFFADD L F RAN++E G +  I
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XP_030970329.1 uncharacterized protein LOC115990658 [Quercus lobata]2.5e-2356.25Show/hide
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        M+C+ TVS+ + +NG P G + PSRG+RQGDPLSPYLFLLCVEGLSAL+K E +  RL GVA+  + P ++HLFFADD L F +A+  E   L+ +
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A2N9EMZ0 Reverse transcriptase domain-containing protein9.1e-2461.8Show/hide
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        M CI TVS+SIL+NG P G + PSRGLRQGDPLSPYLFLLC EGL +L++ E     L GV+IS   PK+THLFFADD L F +A  ++
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A0A2N9FT83 Reverse transcriptase domain-containing protein3.1e-2461.8Show/hide
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        M CI TVS+S+L+NG PTG +TPSRGLRQGDP+SPYLFL+C EGL+ L+   +    + GV+IS +SPK+THLFFADD L F RA   E
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A0A2N9GC56 Reverse transcriptase domain-containing protein7.0e-2460.22Show/hide
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        MNCI +VS+S+++NG P G++ PSRGLRQGDPLSPYLFLLC EGLSAL+    +   L GVA S   PK++HLFFADD L F  A   E G+L
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A0A2N9GDB5 Reverse transcriptase domain-containing protein2.4e-2458.33Show/hide
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        M CI TVS+SIL+NG P G + PSRGLRQGDPLSPYLFLLC EGL +L++ E +   L GV+IS   PK+THLFFADD L F +A   +   +++I
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A0A2N9HYE3 Reverse transcriptase domain-containing protein9.1e-2461.8Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P92555 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg012508.5e-1961.19Show/hide
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        ++NG+P GLVTPSRGLRQGDPLSPYLF+LC E LS L +   +  RL G+ +S+ SP++ HL FADD
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATMG01250.1 RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)6.0e-2061.19Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATTGTATTTATACGGTTTCGTTCTCGATTCTGCTGAATGGCTCGCCAACAGGTTTAGTCACACCATCTCGAGGACTACGACAAGGTGATCCTTTGTCCCCCTATCT
CTTCCTTTTATGTGTTGAAGGTTTGTCTGCACTAGTAAAGGCAGAGTCAGATTGTGAGCGACTATCAGGGGTGGCTATTTCATCTAAAAGTCCCAAGGTAACCCACCTAT
TCTTCGCTGATGATGGCCTTTTTTTTATACGGGCAAATGCAAATGAATTTGGGTTGTTAAAGACTATTTTTATTTGTATGAGCAAGCGTCTGGTCAGTTAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNCIYTVSFSILLNGSPTGLVTPSRGLRQGDPLSPYLFLLCVEGLSALVKAESDCERLSGVAISSKSPKVTHLFFADDGLFFIRANANEFGLLKTIFICMSKRLVS