; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0005283 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0005283
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionPectin lyase-like superfamily protein
Genome locationLG02:48258806..48260278
RNA-Seq ExpressionTan0005283
SyntenyTan0005283
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0004650 - polygalacturonase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000743 - Glycoside hydrolase, family 28
IPR006626 - Parallel beta-helix repeat
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004142576.2 polygalacturonase [Cucumis sativus]4.9e-17073.45Show/hide
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XP_022156860.1 polygalacturonase-like [Momordica charantia]2.3e-17577.38Show/hide
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XP_031736043.1 polygalacturonase-like [Cucumis sativus]9.2e-16972.94Show/hide
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        ILIDQNYCPN+Q C L+SSGVKI++VTYK+I+GTSAT EA+TFDCS ++PCSDI+L+DI LTYKNK   SSCKNIGGS++G+++PE+C
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XP_038876456.1 polygalacturonase-like [Benincasa hispida]1.3e-17075.26Show/hide
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        M +P  S  IIFF +  IQ SSA +YNV+  GA  DGKTDST SF+KAW+ ACSS T S I++P GRFLLT  TF+GPCKN  TFR+NG+LVAPLDYR L
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         NSGYWILF KV+ VS IGGNID     YW CK S KNCP GARSITFNWAN I+ISGLTS+NSQQ+H+VIN CNNV+V+NVK++APDQSPNTDGIH+QS
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        ILIDQNYCPNNQGCPL+SSGVKIS+VTYKNI+GTSAT +A+TFDCS +NPCSDIRLQDI LTYKNKAATSSCKN+ GS++G+L+P +C
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XP_038888873.1 polygalacturonase-like [Benincasa hispida]1.0e-17578.57Show/hide
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        FFLYL+IQTSSA ++NV++FGA GDGKTDST SF+KAW  ACSS T STI++P GRFLLT  TF+GPC N  TFR+NG+LVAPLDYRAL NSGYWILF K
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        V+ VS  GGNIDA GAGYWACK++ K CPVGARS+TFNWAN I +SG+TS+NSQQ HLVIN C NV+V+NVKV+APDQSPNTDGIH+QSS NVTI G+ L
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        QTGDDCISIGDGT +L MS +KCGPGHGVSIGSLGKEFNE GV+NVTL NA+F GSDNGVRIKTWP  SNGFVKNVLFQNIIM NV+NPILIDQNYCPNN
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        +GCP +SSGVKIS VTY+NIQGTSAT EAMTFDCSP+NPCSDI+LQDI LTYKNK  TSSCKNIGGS++G+L+PESCL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M0F3 Uncharacterized protein2.4e-17073.45Show/hide
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        MANP  S   I F +L IQ S+A+NYNV++FGA  DGKTDST SF+KAW  ACSS T STI++P GRFLLT  TF+GPCKN  TF +NG+LVAPLDYRAL
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         +SGYWILF KV+ VS +GG ID  G  YWACK S KNCP GARSITFNWAN I++SGLTS+NSQQ H+VIN CNNV+V+NVK++APDQSPNTDGIH+QS
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        STNVTI G+ ++TGDDCISIGDGT NLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKE NE GV+NVTL+NA+FT SDNGVRIKTWP  SNGFV++V+FQNI+M NV+NP
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Query:  ILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESC
        ILIDQNYCPN+Q C L+SSGVKI++VTYK+I+GTSAT EA+TFDCS +NPCSDI+L+DI LTYKNK  TSSCKNIGGS++G+++PE+C
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A0A1S3CD98 polygalacturonase-like2.1e-16673.52Show/hide
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        MAN R S   I F +L IQ SSA +YNV+ FGA  DGKTDST SF+KAW+ ACSS T STI++P GRFLLT  TF+GPCKN    F +NG+LVAPLDY A
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Query:  LKNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQ
        L +SGYWILFTKVN VS IGGNID  G  YWACK S K CP GARSITFNWA+ I+ISGLTS+NS+Q H+VIN CNNV+V+NVK++APDQSPNTDGIH+Q
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        SST VTI GT ++TGDDCISIGDGT NLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKE NE GV+NVTL+NA+FT SDNGVRIKTWP  SNGFVK+V+F+NIIM++V++
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        PILIDQNYCPNNQ C ++ SGVKIS+VTYKNI+GTSAT E +TFDCS  +PCS+IRLQDI LTYKNKAATSSCKNI GST+G++ P+SC
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A0A5A7VB33 Polygalacturonase-like2.1e-16673.52Show/hide
Query:  MANPRTSSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPT-TFRINGSLVAPLDYRA
        MAN R S   I F +L IQ SSA +YNV+ FGA  DGKTDST SF+KAW+ ACSS T STI++P GRFLLT  TF+GPCKN    F +NG+LVAPLDY A
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Query:  LKNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQ
        L +SGYWILFTKVN VS IGGNID  G  YWACK S K CP GARSITFNWA+ I+ISGLTS+NS+Q H+VIN CNNV+V+NVK++APDQSPNTDGIH+Q
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Query:  SSTNVTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVEN
        SST VTI GT ++TGDDCISIGDGT NLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKE NE GV+NVTL+NA+FT SDNGVRIKTWP  SNGFVK+V+F+NIIM++V++
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Query:  PILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESC
        PILIDQNYCPNNQ C ++ SGVKIS+VTYKNI+GTSAT E +TFDCS  +PCS+IRLQDI LTYKNKAATSSCKNI GST+G++ P+SC
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A0A6J1DRI6 polygalacturonase-like1.1e-17577.38Show/hide
Query:  MANPRTSSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRAL
        MAN + S    FF +L  Q SSA +YNV++FGA  DGKTDST  F+KAW+ AC+SPT STI +P GRFLLT+TTF+GPC +  TFR+NG+LVAPLDYRAL
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Query:  KNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQS
         NSGYWILF KV+ VS++GGNIDA GAGYWACK+S  NCP GARS+TFNWAN I+ISGLTS+NSQQ HLVIN CNNV V+NVKV+APDQSPNTDGIH+QS
Subjt:  KNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQS

Query:  STNVTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENP
        STNV I G+ LQTGDDCISIGDGT NLFMS+IKCGPGHGVSIGSLGKE  E GV+NVTL NA+F GSDNGVRIKTWPR S GFVKNVLFQNIIM+NV+NP
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Query:  ILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        I+IDQNYCPNNQGCPL SSG+KIS V+YKNI+GTSAT EA+TFDCSPT PCSDIRL+DI LTYKNKAATSSCKNIGGST+G+L+PESCL
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A0A6J1EMF9 polygalacturonase-like2.3e-16572.21Show/hide
Query:  RTSSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSG
        +T   II  +Y  +Q SSA+ YNV+ +GA  +GKTDST  F+KAW  ACSS T STI++P GRFLL   TF+GPC N  TFR+NG+LVAPLDYRAL +SG
Subjt:  RTSSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSG

Query:  YWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNV
        YWILF KVN VS  GGNIDA GA YWAC+ S K+CP GARSITFNWAN I++SGLTS+NS+Q+H+ IN CNNVLV+NVK++APDQSPNTDGIH+QSST+V
Subjt:  YWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNV

Query:  TIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILID
        TI GT +QTGDDCISIGDGT NLFM+ IKCGPGHGVSIGSLGKEF+E GVQNVTLMNA+FT SDNGVRIKTW R  NGFVK+V+FQNI+M+NV+NPI+ID
Subjt:  TIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILID

Query:  QNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        QNYCP+N+GCP +S+GVKIS+V YKNI GTSAT EA+TFDCSPTNPC DIRL+DI LTY NKA TS+C N+GGS++G+L+P+SCL
Subjt:  QNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22818 Probable polygalacturonase At2g438604.3e-10049.86Show/hide
Query:  SNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKG-PCKN-PTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWILFTKVNRVSIIGGN
        S  NV+++GA  DG  DST +F+ AW +AC+S   +TI +P GRFL+    F G  CK  P + RI GS+VAP D+R + +S +WI F  V  VSI GG 
Subjt:  SNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKG-PCKN-PTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWILFTKVNRVSIIGGN

Query:  IDANGAGYWACKRS-RKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIKGTALQTGDDCISI
        +DA G   W CK +   NCP GA+S+ F+ +N I ISGLTS+NSQ+ H+VI++ NNV ++ VKV A + SPNTDGIH++SS +V I  + + TGDDCISI
Subjt:  IDANGAGYWACKRS-RKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIKGTALQTGDDCISI

Query:  GDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNYCPNNQGCPLESSG
        G G+ N+F+  I+CGPGHG+SIGSLG+   E GV NVT+ N  F G++NGVRIKTW + SN F +N++FQ+I M  V+NPI+IDQ+YC  ++ CP + SG
Subjt:  GDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNYCPNNQGCPLESSG

Query:  VKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        VK+S V Y++I GTS T+ A+  DCS   PC+ I + D+NL   ++ A +SC N  GS   ++    CL
Subjt:  VKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL

O23147 Polygalacturonase ADPG14.4e-8143.58Show/hide
Query:  TSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGR-FLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWILFTKVNRVSII
        T  AS  +V NFGA GDGKTD T +F KAW+ ACS+   +T  +P G+ +LL +T F+GPCK+   F+I G+L A       K+  +W++   VN +SI 
Subjt:  TSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGR-FLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWILFTKVNRVSII

Query:  GGN---IDANGAGYW--ACKRSR-KNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIKGTALQ
        GG+   I+ NG  +W  +CK  + K C     ++T      + +  L   N+QQ  + I  CN V V NV++ AP  SPNTDGIH+ ++ N+ +  + + 
Subjt:  GGN---IDANGAGYW--ACKRSR-KNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIKGTALQ

Query:  TGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNYCPNNQ
        TGDDCISI DGT NL + D+ CGPGHG+SIGSLG + ++  V  + +  A F+ SDNGVRIKT+ +  +G  KN+ FQNI M+NV+NPI+IDQ+YC  ++
Subjt:  TGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNYCPNNQ

Query:  GCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPE
         C  + S V++  V YKNI GTSAT  A+T +CS   PC  I L+++    K K  T+SCKN      G + P+
Subjt:  GCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPE

P48979 Polygalacturonase6.5e-11752.93Show/hide
Query:  MANPRT--SSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCK-NPTTFRINGSLVAPLDY
        MAN R+  S ++IF   +    +S   YNV + GA  DGKTDST +F+ AW  AC+S     I +P G F L    F GPCK N  TFRI G+LVAP DY
Subjt:  MANPRT--SSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCK-NPTTFRINGSLVAPLDY

Query:  RALKNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSR-KNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGI
        R + N+  WI F  VN V+I GG +D  G   WACK    ++CP GA ++ F+ +N I++SGL S+NSQ  H+VIN   NV ++ V+V     SPNTDGI
Subjt:  RALKNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSR-KNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGI

Query:  HLQSSTNVTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDN
        H+Q S+ VTI  + + TGDDC+SIG GT+NL++  + CGPGHG+SIGSLGKE  E GVQNVT+    F+G+ NG+RIK+W R S GF +N+LFQ+  M N
Subjt:  HLQSSTNVTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDN

Query:  VENPILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        VENPI+IDQ+YCP+N+GCP + SGV+IS+VTY++I GTSAT+ A+ FDCSP +PC +I+L+D+ LTYKN+AA SSC +  G+T G++ P SCL
Subjt:  VENPILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL

Q39766 Polygalacturonase8.1e-8343.63Show/hide
Query:  VMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGA
        V  FGA  DGKTD +  F+ AW+ AC+S T ST+ IP G +LL+    +GPCK P    + G++ AP D  A K+   W+ F  V    + GG I  +G 
Subjt:  VMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGA

Query:  GYWACKRS-------RKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIKGTALQTGDDCISI
        G  A +++       R   PV   +I F++    LI  +TS +S+  H+ +  C N+ +E +K+ APD+SPNTDGIH+  S  V I  + ++TGDDCISI
Subjt:  GYWACKRS-------RKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIKGTALQTGDDCISI

Query:  GDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNYCPNNQGCPLESSG
        GDGT N+ + +I CGPGHG+SIGSLGK  NE  V+ + + N   T + NG RIKTWP    G V  + F++I M+NV +PILIDQ YCP N+    E S 
Subjt:  GDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNYCPNNQGCPLESSG

Query:  VKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKN-KAATSSCKNIGGSTVGMLIPESC
        VK+S +++KNI+GTSA  EA+ F CS ++PC ++ L DI++ +   + ATS C N+   T+G L P  C
Subjt:  VKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKN-KAATSSCKNIGGSTVGMLIPESC

Q39786 Polygalacturonase8.9e-8241.69Show/hide
Query:  SSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVM-NFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGY
        S  ++  L++      +  ++V+  FGA  DGKTD +  F+ AW+ AC+S T ST+ IP G +LL+    +GPCK P    + G++ AP D  A K+   
Subjt:  SSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVM-NFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGY

Query:  WILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRS-------RKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHL
        W+ F  V    + GG I  +G G  A +++       R   PV   +I F++    LI  +TS +S+  H+ +  C N+ +E +K+ APD+SPNTDGIH+
Subjt:  WILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRS-------RKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHL

Query:  QSSTNVTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVE
          S  V I  + ++TGDDCISIGDGT N+ + +I CGPGHG+SIGSLGK  NE  V+ + + N   T + NG RIKTWP    G V  + F++I M+NV 
Subjt:  QSSTNVTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVE

Query:  NPILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKN-KAATSSCKNIGGSTVGMLIPESC
        +PILIDQ YCP N+    E S VK+S +++KNI+GTSA  EA+ F CS ++PC ++ L DI++ +   + ATS C N+   T G L P  C
Subjt:  NPILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKN-KAATSSCKNIGGSTVGMLIPESC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05650.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.9e-13358.22Show/hide
Query:  IIFFLYLVIQTSSASN--YNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWI
        +IF L   I  SS+++  +NV++FGA  DG TDST +F+KAW+ AC S   +T+ +P G FLL   TF GPCK+  TF++ G++VAP DYR   NSG WI
Subjt:  IIFFLYLVIQTSSASN--YNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWI

Query:  LFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIK
        LF KVNR S++GG  DA G+G+W+C++S +NCP G RSI+FN A  ++ISG+ S+NSQ +H+ +N C NV V N++++AP  SPNTDG  +Q ST VT+ 
Subjt:  LFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIK

Query:  GTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNY
        G+ +QTGDDC++IG GT N  +S + CGPGHGVSIGSL K+ NE GV+NVT+ +++FTGS NGVRIK+W R S GFV+NV FQN+IM NV+NPI+IDQNY
Subjt:  GTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNY

Query:  CPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTY-KNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        CP+NQGCP E SGVKI++VTYKNIQGTSATQEAM   CS +NPC+ I LQDI LTY K   ATS C N  G  +G++ P SCL
Subjt:  CPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTY-KNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL

AT1G05660.1 Pectin lyase-like superfamily protein2.8e-13158.07Show/hide
Query:  TIIFFLYLVIQTS-SASN-YNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYW
        +++F L   I  S SASN +NV++FGA  DG TDST +F+KAW+ AC S + +T+ +P G FLL   TF GPCK+  TF++ G+++AP DYR   NSG+W
Subjt:  TIIFFLYLVIQTS-SASN-YNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYW

Query:  ILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTI
        ILF KVNR S++GG  DA   G+W+C++S +NCP G RSI+FN A  ++ISG+ S+NSQ  H+ +N C NV+V NVK++AP  SPNTDG H+Q ST VT 
Subjt:  ILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTI

Query:  KGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQN
         G+ +QTGDDC++IG GT NL ++ + CGPGHGVSIGSL KE  E GV+NVT+ +++FTGS NGVRIK+W R SNGFV+ V FQ+++M NVENPI+IDQN
Subjt:  KGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQN

Query:  YCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTY-KNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        YCP ++GCP E SGVKIS+VTYKNIQGTSATQEAM   CS ++PC+ I LQDI LTY K   ATS C N  G ++G++ P SCL
Subjt:  YCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTY-KNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL

AT2G43880.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.7e-12854.43Show/hide
Query:  IIFF---LYLVIQTSSA-SNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGY
        IIFF   ++ +I++S A  ++NV  +GA GDG+ D+T SF+ AW LAC S   + + +P G +L+    F GPCKN  TF+ +G+LVAP +Y  + NSGY
Subjt:  IIFF---LYLVIQTSSA-SNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGY

Query:  WILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVT
        WILF KVNR+S+ GG IDA GAGYW+C++   +CP GARSI+F+W N +L+SGL+S NSQ  H+ ++H +NV +ENV++ AP  SPNTDGIH+QSS+ VT
Subjt:  WILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVT

Query:  IKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQ
        I G  + TGDDCI++  G+ N+++  + CGPGHG+SIGSLG   NE GVQNVT+ +++FT + NGVRIKTW R S GFV NV+F+N+IM+NVENP++IDQ
Subjt:  IKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQ

Query:  NYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        NYCPN +GCP +SSGVKIS VT+ NI+GTS T  AM  DCS +N C+ +RLQDI LTY  +++ S C+N  G   G+++P +C+
Subjt:  NYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL

AT2G43890.1 Pectin lyase-like superfamily protein1.2e-15061.95Show/hide
Query:  NPRTSSTIIFFLYLVIQTSS--ASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRAL
        N   +  ++FF   ++  SS  ASNYNV++FGA  DG+TDST +F+ AW+ AC S    T+ +P G FLL    F+GPC++  TF+I G++VAP DYR L
Subjt:  NPRTSSTIIFFLYLVIQTSS--ASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRAL

Query:  KNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQS
         NSGYWILF KVNR+SIIGG +DA GA +WAC++S K+CPVGARS+TFNWAN +++SGLTS+NSQ  HLVIN CNNV+V  VK++APDQSPNTDG+H+Q 
Subjt:  KNSGYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQS

Query:  STNVTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENP
        S  VT+      TGDDCISIG GT NL+MS + CGPGHG+SIGSLG++ NE GV+N+TL+N++F+GSDNGVRIKTW R+S GFV+NVLFQN+IM NV+NP
Subjt:  STNVTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENP

Query:  ILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        I++DQNYCP+NQGCP + SGVKIS+V Y+NIQGTS TQ+A+TFDCS +NPC  IRL DI LT+  ++ATS+CKNI G   G+++P+ CL
Subjt:  ILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL

AT3G59850.1 Pectin lyase-like superfamily protein3.7e-12354.4Show/hide
Query:  SSTIIFFLYLV-IQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKG-PCKNPT-TFRINGSLVAPLDYRALKNS
        SS +I  L+L+ + +SSA  YN++++GA  DGKTDST +F   W  AC+S    TI +P GRFLL +  F G  CK  + TFRI G+LVAP DYR +   
Subjt:  SSTIIFFLYLV-IQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKG-PCKNPT-TFRINGSLVAPLDYRALKNS

Query:  GYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTN
         YWILF  ++ +S+ GG +DA GA  W+CK+S KNCP GA SI F  +  ++ISGLTS+NSQ  H+ IN C+NV ++ VKV A   SPNTDGIH+QSS+ 
Subjt:  GYWILFTKVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTN

Query:  VTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILI
        V+I  + + TGDDC+SIG GTN L++ ++ CGPGHG+SIGSLGKE  E+GVQN+T+  A FTG++NGVRIK+W R SNGF KN+ FQ+ +M+NV+NPI+I
Subjt:  VTIKGTALQTGDDCISIGDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILI

Query:  DQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL
        DQNYCP N+ CP + SG+KIS+V + +I GTSAT+  +  DCS   PC+ IR+QD+ LTY+NK AT+ C + GGS  G   P SCL
Subjt:  DQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKNIQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAACCCAAGGACAAGTTCAACCATCATCTTCTTCCTCTATTTGGTCATTCAAACATCAAGTGCAAGCAACTATAATGTGATGAATTTTGGGGCCATAGGTGATGG
AAAAACTGATTCAACCTTGTCATTTGTAAAGGCATGGAGATTAGCTTGCAGCTCCCCAACAGAGTCCACCATCGATATCCCAAATGGAAGGTTTCTACTAACAACCACAA
CATTCAAAGGCCCATGCAAGAACCCAACTACCTTTCGCATCAACGGGTCTCTTGTAGCACCTCTTGATTATCGTGCCCTTAAAAACTCTGGGTATTGGATCTTATTCACC
AAAGTTAATAGAGTTTCTATCATCGGTGGCAACATTGACGCAAACGGCGCTGGGTATTGGGCCTGCAAGAGATCTAGAAAGAATTGTCCAGTAGGAGCTCGGTCAATAAC
ATTTAATTGGGCAAATGGAATTTTGATTAGTGGGTTAACTTCGGTTAATAGCCAACAGGCTCATCTTGTAATCAATCATTGCAACAATGTATTGGTTGAAAATGTGAAGG
TGATAGCTCCAGATCAAAGTCCCAACACTGACGGCATTCATCTCCAGTCTTCCACTAATGTAACAATCAAGGGAACCGCCCTCCAAACTGGGGATGATTGTATATCCATT
GGAGATGGAACTAATAATCTGTTTATGAGTGATATCAAATGTGGGCCTGGCCATGGTGTAAGCATTGGAAGCTTGGGAAAAGAGTTTAACGAAATTGGAGTACAAAATGT
AACATTGATGAATGCAATGTTCACTGGATCCGATAATGGTGTGCGGATAAAGACATGGCCAAGGCGTAGCAATGGTTTTGTGAAAAATGTTCTCTTTCAGAACATCATTA
TGGACAATGTCGAAAATCCAATTTTAATTGATCAAAATTATTGTCCAAACAACCAAGGTTGTCCTCTAGAGAGTTCTGGAGTAAAGATTAGTGAAGTGACATACAAAAAC
ATTCAAGGAACGTCAGCAACACAAGAAGCTATGACATTTGATTGTAGTCCCACAAACCCATGTAGTGATATACGATTACAAGACATCAACCTTACATATAAGAATAAGGC
AGCAACATCTTCCTGCAAGAATATTGGTGGATCGACTGTGGGAATGCTCATACCTGAAAGTTGCTTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAACCCAAGGACAAGTTCAACCATCATCTTCTTCCTCTATTTGGTCATTCAAACATCAAGTGCAAGCAACTATAATGTGATGAATTTTGGGGCCATAGGTGATGG
AAAAACTGATTCAACCTTGTCATTTGTAAAGGCATGGAGATTAGCTTGCAGCTCCCCAACAGAGTCCACCATCGATATCCCAAATGGAAGGTTTCTACTAACAACCACAA
CATTCAAAGGCCCATGCAAGAACCCAACTACCTTTCGCATCAACGGGTCTCTTGTAGCACCTCTTGATTATCGTGCCCTTAAAAACTCTGGGTATTGGATCTTATTCACC
AAAGTTAATAGAGTTTCTATCATCGGTGGCAACATTGACGCAAACGGCGCTGGGTATTGGGCCTGCAAGAGATCTAGAAAGAATTGTCCAGTAGGAGCTCGGTCAATAAC
ATTTAATTGGGCAAATGGAATTTTGATTAGTGGGTTAACTTCGGTTAATAGCCAACAGGCTCATCTTGTAATCAATCATTGCAACAATGTATTGGTTGAAAATGTGAAGG
TGATAGCTCCAGATCAAAGTCCCAACACTGACGGCATTCATCTCCAGTCTTCCACTAATGTAACAATCAAGGGAACCGCCCTCCAAACTGGGGATGATTGTATATCCATT
GGAGATGGAACTAATAATCTGTTTATGAGTGATATCAAATGTGGGCCTGGCCATGGTGTAAGCATTGGAAGCTTGGGAAAAGAGTTTAACGAAATTGGAGTACAAAATGT
AACATTGATGAATGCAATGTTCACTGGATCCGATAATGGTGTGCGGATAAAGACATGGCCAAGGCGTAGCAATGGTTTTGTGAAAAATGTTCTCTTTCAGAACATCATTA
TGGACAATGTCGAAAATCCAATTTTAATTGATCAAAATTATTGTCCAAACAACCAAGGTTGTCCTCTAGAGAGTTCTGGAGTAAAGATTAGTGAAGTGACATACAAAAAC
ATTCAAGGAACGTCAGCAACACAAGAAGCTATGACATTTGATTGTAGTCCCACAAACCCATGTAGTGATATACGATTACAAGACATCAACCTTACATATAAGAATAAGGC
AGCAACATCTTCCTGCAAGAATATTGGTGGATCGACTGTGGGAATGCTCATACCTGAAAGTTGCTTGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MANPRTSSTIIFFLYLVIQTSSASNYNVMNFGAIGDGKTDSTLSFVKAWRLACSSPTESTIDIPNGRFLLTTTTFKGPCKNPTTFRINGSLVAPLDYRALKNSGYWILFT
KVNRVSIIGGNIDANGAGYWACKRSRKNCPVGARSITFNWANGILISGLTSVNSQQAHLVINHCNNVLVENVKVIAPDQSPNTDGIHLQSSTNVTIKGTALQTGDDCISI
GDGTNNLFMSDIKCGPGHGVSIGSLGKEFNEIGVQNVTLMNAMFTGSDNGVRIKTWPRRSNGFVKNVLFQNIIMDNVENPILIDQNYCPNNQGCPLESSGVKISEVTYKN
IQGTSATQEAMTFDCSPTNPCSDIRLQDINLTYKNKAATSSCKNIGGSTVGMLIPESCL