| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0048153.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.2e-25 | 59.35 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
G DV+ + LHVP+G IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+ VKM +EKL +L+DGT ++KR SKFDLRVIH
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKE
PLTKLL G +I+K + K+
Subjt: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKE
|
|
| KAA0063387.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 7.8e-24 | 47.9 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
G DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFT+H+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+ VKMA+EKL +L+D TE++KR SKFDLRVIH
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKEKVPQVVDPNMAILQAIQGMMEMMREEREERRTQQQREERILQED
PLTKLL G ++ TK ++ P + M MM + + +++ EE L+++
Subjt: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKEKVPQVVDPNMAILQAIQGMMEMMREEREERRTQQQREERILQED
|
|
| KAA0067206.1 hypothetical protein E6C27_scaffold418G00080 [Cucumis melo var. makuwa] | 5.3e-20 | 68.67 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKK
G DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ E K FEPK LYNVS+ SQ+E+E+KMA EKL SL+DGT D+K
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKK
|
|
| TYK08102.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.9e-26 | 60.98 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
G DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+ VKMA+EKL +L+DGT ++KR SKFDLRVIH
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKE
PLTKLL G +I+K + K+
Subjt: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKE
|
|
| TYK26105.1 F15O4.13 [Cucumis melo var. makuwa] | 2.6e-19 | 67.47 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKK
G DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+EVKMA+EKL +L+DGT ++K
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TX19 Reverse transcriptase | 1.5e-25 | 59.35 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
G DV+ + LHVP+G IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+ VKM +EKL +L+DGT ++KR SKFDLRVIH
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKE
PLTKLL G +I+K + K+
Subjt: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKE
|
|
| A0A5A7V8R2 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 3.8e-24 | 47.9 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
G DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFT+H+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+ VKMA+EKL +L+D TE++KR SKFDLRVIH
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKEKVPQVVDPNMAILQAIQGMMEMMREEREERRTQQQREERILQED
PLTKLL G ++ TK ++ P + M MM + + +++ EE L+++
Subjt: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKEKVPQVVDPNMAILQAIQGMMEMMREEREERRTQQQREERILQED
|
|
| A0A5A7VL78 RT_RNaseH_2 domain-containing protein | 2.5e-20 | 68.67 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKK
G DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ E K FEPK LYNVS+ SQ+E+E+KMA EKL SL+DGT D+K
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKK
|
|
| A0A5D3C9X5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.4e-26 | 60.98 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
G DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+ VKMA+EKL +L+DGT ++KR SKFDLRVIH
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKKRSRSDHPYSKFDLRVIH
Query: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKE
PLTKLL G +I+K + K+
Subjt: PLTKLLCGEVLIKKTKMSQDNKE
|
|
| A0A5D3DRJ1 F15O4.13 | 1.3e-19 | 67.47 | Show/hide |
Query: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKK
G DV+ + LHVPEG IT+ KAKKIQEAFTLH+QKL NAQ ETK FE K LYNVS+ SQ+E+EVKMA+EKL +L+DGT ++K
Subjt: GADVNQTIDPLHVPEGAITRSKAKKIQEAFTLHLQKLVNAQGETKIFEPKILYNVSTTSQDENEVKMAQEKLSSLKDGTEDKK
|
|
