; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0005383 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0005383
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
Genome locationLG02:22502392..22503930
RNA-Seq ExpressionTan0005383
SyntenyTan0005383
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_038887408.1 poly [ADP-ribose] polymerase 1-like isoform X1 [Benincasa hispida]1.6e-7444.39Show/hide
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        +A   QE ET LLLQADD P IGSST+++    S S S SR+   RG       RRTRG+SRN+ LDRHV+ +GRI+IEI E VGKP+CANAT+FS AIG
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        TIARN IPL CKDW +VSKEV+D  +D+LL                                                                      
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                                                                   K KEGRD+DQV+LF +SHF  KD WVN+NA++AYLEMQ+L+
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        EAS QE  TPM+S E+CKQVLGHRS +IKGLG +PKPSSSSSVTS  Q +KELEK++++M+D+M+QMK NYE MKE N+ LT+QLS WE RWAEIQ MLG
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Query:  QGNREGGPSN
        +G  + G SN
Subjt:  QGNREGGPSN

XP_038887409.1 poly [ADP-ribose] polymerase 1-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.2e-7747.52Show/hide
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        +A   QE ET LLLQADD P IGSST+++    S S S SR+   RG       RRTRG+SRN+ LDRHV+ +GRI+IEI E VGKP+CANAT+FS AIG
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Query:  TIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLL----------------------------------------------------------------------
        TIARN IPL CKDW +VSKEV+D  +D+LL                                                                      
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Query:  --------------------------------KQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCH
                                        K KEGRD+DQV+LF +SHF  KD WVN+NA++AYLEMQ+L+EAS QE  TPM+S E+CKQVLGHRS +
Subjt:  --------------------------------KQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCH

Query:  IKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLGQGNREGGPSN
        IKGLG +PKPSSSSSVTS  Q +KELEK++++M+D+M+QMK NYE MKE N+ LT+QLS WE RWAEIQ MLG+G  + G SN
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XP_038887410.1 poly [ADP-ribose] polymerase 1-like isoform X3 [Benincasa hispida]1.1e-5438.05Show/hide
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        +A   QE ET LLLQADD P IGSST+++    S S S SR+   RG       RRTRG+SRN+ LDRHV+ +GRI+IEI E VGKP+CANAT+FS AIG
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Query:  TIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLL----------------------------------------------------------------------
        TIARN IPL CKDW +VSKEV+D  +D+LL                                                                      
Subjt:  TIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLL----------------------------------------------------------------------

Query:  -----------------------------------------------------------KQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLV
                                                                   K KEGRD+DQV+LF +SHF  KD WVN+NA++AYLEMQ+L+
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Query:  EASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLG
        EAS QE  TPM+S E                                  +KELEK++++M+D+M+QMK NYE MKE N+ LT+QLS WE RWAEIQ MLG
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Query:  QGNREGGPSN
        +G  + G SN
Subjt:  QGNREGGPSN

XP_038887411.1 poly [ADP-ribose] polymerase 1-like isoform X4 [Benincasa hispida]1.5e-3061.54Show/hide
Query:  MARPEQEHETHLLLQADDPPVIGSSTQQEGIETSSSSSRSRRCRGRGRNSSSLGRRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIG
        +A   QE ET LLLQADD P IGSST+++    S S S SR+   RG       RRTRG+SRN+ LDRHV+ +GRI+IEI E VGKP+CANAT+FS AIG
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Query:  TIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLL
        TIARN IPL CKDW +VSKEV+D  +D+LL
Subjt:  TIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLL

XP_038887411.1 poly [ADP-ribose] polymerase 1-like isoform X4 [Benincasa hispida]8.9e-0465.71Show/hide
Query:  LKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAY
        +K KEGRD+DQV+LF +SHF  KD WVN+NA++AY
Subjt:  LKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAY

XP_038887413.1 uncharacterized protein LOC120077557 isoform X5 [Benincasa hispida]1.6e-7444.39Show/hide
Query:  MARPEQEHETHLLLQADDPPVIGSSTQQEGIETSSSSSRSRRCRGRGRNSSSLGRRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIG
        +A   QE ET LLLQADD P IGSST+++    S S S SR+   RG       RRTRG+SRN+ LDRHV+ +GRI+IEI E VGKP+CANAT+FS AIG
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Query:  TIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLL----------------------------------------------------------------------
        TIARN IPL CKDW +VSKEV+D  +D+LL                                                                      
Subjt:  TIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLL----------------------------------------------------------------------

Query:  -----------------------------------------------------------KQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLV
                                                                   K KEGRD+DQV+LF +SHF  KD WVN+NA++AYLEMQ+L+
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Query:  EASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLG
        EAS QE  TPM+S E+CKQVLGHRS +IKGLG +PKPSSSSSVTS  Q +KELEK++++M+D+M+QMK NYE MKE N+ LT+QLS WE RWAEIQ MLG
Subjt:  EASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLG

Query:  QGNREGGPSN
        +G  + G SN
Subjt:  QGNREGGPSN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UJI4 Uncharacterized protein2.5e-2837.78Show/hide
Query:  RSRRCRGRGRNSSSLGRRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLLKQKEGRDI
        + RRC G    +   GR  RGY RNI LD+ V  +G+IK EI+E  GKP+   A +   +IGT  RN IPLSC++W+ V   V+   IDRL K+K+G D+
Subjt:  RSRRCRGRGRNSSSLGRRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLLKQKEGRDI

Query:  DQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQM
        D++E+FHE+HF  K+ W+ND  R            S++ G   ++SA+ C+ VLG RS        +P+   S     SS  EKE               
Subjt:  DQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQM

Query:  KTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRW
        K     +KEAN  LT +L+ WE  +
Subjt:  KTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRW

A0A5D3B974 DUF4216 domain-containing protein2.3e-2631.77Show/hide
Query:  GYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRL-----------------------------
        GY RNI LD+ V  +G++KIEI E  GKP+   A   +  IGT  RN IPLSC++ + V  +V++  IDR+                             
Subjt:  GYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRL-----------------------------

Query:  -------------------LKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSS
                           LK+K+G D+D+VE+FHE+HF  K+ W+ND A+NAY    +++  S++ G   ++SA+ C+ VLG RS        +PK   
Subjt:  -------------------LKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSS

Query:  SSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLGQG------NREGGPSN
        S     SS  EKE               K     +KE N  LT +L+ WE RW ++++ L  G        +  PSN
Subjt:  SSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLGQG------NREGGPSN

A0A5D3BKN7 DUF4218 domain-containing protein1.2e-2738.91Show/hide
Query:  RNSSSLG-----RRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLLKQKEGRDIDQVE
        RN S LG     R  RGY RNI LD+ V  +G+IKIEI+E  GKP+   A +    IGT  RN IPLSC++W+ V   V+   IDRL K+K+G D+D++E
Subjt:  RNSSSLG-----RRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLSCKDWREVSKEVQDHAIDRLLKQKEGRDIDQVE

Query:  LFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNY
        +FHE+HF  K+ W+ND  R            S++ G   ++SA+ C+ VLG RS        +P+   S     SS  EKE               K   
Subjt:  LFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNY

Query:  EEMKEANMLLTTQLSTWEDRW
          +KEAN  LT +L+ WE  +
Subjt:  EEMKEANMLLTTQLSTWEDRW

A0A5D3E0V3 Uncharacterized protein2.5e-2833.45Show/hide
Query:  LQADDPPVIGSSTQQEGIETSSSSSRSRRCRGRGRNSSSLGRRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLSCKD
        LQ+ D       T  E  +T++ S       G    +   GR  RGY RNI LD+ V  +G+IKIEI+E  GKP+     + +  IGT  RN IPLSC++
Subjt:  LQADDPPVIGSSTQQEGIETSSSSSRSRRCRGRGRNSSSLGRRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLSCKD

Query:  WREVSKEVQDHAIDRL-------------------------------LKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPM
        W+ V   V++  ID L                               LK+K+G D+D++E+FHE+HF  K+ W+ND A++AYLEMQ+++  S++ G   +
Subjt:  WREVSKEVQDHAIDRL-------------------------------LKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPM

Query:  TSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRW
        ++A+ C+ VLG RS        +P+   S     SS  EKE               K     +KEAN  LT +L+ WE  +
Subjt:  TSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQYEKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRW

A0A6J1DUH3 uncharacterized protein LOC1110232121.2e-3050.96Show/hide
Query:  LKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPS-----SSSSVTSSSQYEKEL
        LK KEG DI  V+LF ESH++ KD  VNDNA +AY  MQ L++A +QEG  P+T  E C++VLG R  H+KGLG+ P+P+     SSS+VTSS+ YEKEL
Subjt:  LKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPS-----SSSSVTSSSQYEKEL

Query:  EKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLGQGNREGGPSN
        EK+++ M+ +M +MKT  + +KE+       +STWEDRW EI R +  G +  GPSN
Subjt:  EKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLGQGNREGGPSN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACGCCCTGAGCAAGAGCATGAGACACATTTGCTACTTCAGGCGGATGACCCTCCAGTTATTGGTTCCTCCACTCAGCAGGAGGGGATAGAGACATCGAGTTCTAG
TTCACGCTCAAGGCGATGTCGAGGTCGAGGTCGAAACTCAAGCTCACTAGGAAGGAGAACTAGAGGATATAGTCGAAACATCGGATTGGACCGCCATGTCCATACTTATG
GGAGGATTAAGATTGAGATTCATGAGAATGTGGGAAAACCTTTATGTGCTAACGCCACGAGATTTAGTAAAGCCATTGGTACTATTGCTCGAAACATAATTCCATTAAGT
TGTAAAGATTGGAGGGAGGTATCAAAAGAAGTACAAGACCATGCCATAGATCGATTATTGAAGCAGAAAGAGGGTCGTGACATTGACCAGGTGGAGTTGTTCCATGAAAG
TCACTTCAGCATAAAAGATAGTTGGGTGAACGACAATGCAAGAAATGCATATCTGGAAATGCAAAAACTCGTAGAAGCATCATCTCAAGAAGGGTCTACACCGATGACCA
GTGCAGAGATTTGTAAACAGGTTTTGGGGCATCGATCGTGCCATATTAAAGGTCTTGGTTGGGACCCAAAACCTAGCTCATCGTCCAGCGTCACATCTTCCTCACAATAT
GAAAAAGAATTGGAAAAGCAACTGGATCAGATGAAAGATGACATGGTGCAGATGAAAACAAATTATGAGGAGATGAAGGAAGCAAATATGTTGTTAACTACTCAGTTATC
AACATGGGAAGATAGATGGGCTGAAATCCAACGAATGTTGGGCCAAGGGAATCGTGAGGGTGGACCTTCAAACGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARPEQEHETHLLLQADDPPVIGSSTQQEGIETSSSSSRSRRCRGRGRNSSSLGRRTRGYSRNIGLDRHVHTYGRIKIEIHENVGKPLCANATRFSKAIGTIARNIIPLS
CKDWREVSKEVQDHAIDRLLKQKEGRDIDQVELFHESHFSIKDSWVNDNARNAYLEMQKLVEASSQEGSTPMTSAEICKQVLGHRSCHIKGLGWDPKPSSSSSVTSSSQY
EKELEKQLDQMKDDMVQMKTNYEEMKEANMLLTTQLSTWEDRWAEIQRMLGQGNREGGPSNA