; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0005488 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0005488
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionCysteine synthase
Genome locationLG08:51473958..51481336
RNA-Seq ExpressionTan0005488
SyntenyTan0005488
Gene Ontology termsGO:0006535 - cysteine biosynthetic process from serine (biological process)
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GO:0010310 - regulation of hydrogen peroxide metabolic process (biological process)
GO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0090322 - regulation of superoxide metabolic process (biological process)
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InterPro domainsIPR001216 - Cysteine synthase/cystathionine beta-synthase, pyridoxal-phosphate attachment site
IPR001926 - Pyridoxal-phosphate dependent enzyme
IPR005856 - Cysteine synthase
IPR005859 - Cysteine synthase CysK
IPR036052 - Tryptophan synthase beta subunit-like PLP-dependent enzyme


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0053928.1 putative S-sulfocysteine synthase [Cucumis melo var. makuwa]4.5e-17088.37Show/hide
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XP_022151992.1 probable S-sulfocysteine synthase, chloroplastic isoform X1 [Momordica charantia]8.3e-17292.49Show/hide
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XP_022151995.1 probable S-sulfocysteine synthase, chloroplastic isoform X2 [Momordica charantia]5.4e-17192.71Show/hide
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XP_038903208.1 S-sulfo-L-cysteine synthase (O-acetyl-L-serine-dependent), chloroplastic-like isoform X1 [Benincasa hispida]2.2e-17291.88Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B861 Cysteine synthase1.5e-16689.6Show/hide
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A0A5D3DP99 Cysteine synthase2.2e-17088.37Show/hide
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A0A6J1DCQ3 Cysteine synthase2.6e-17192.71Show/hide
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A0A6J1DEQ0 Cysteine synthase4.0e-17292.49Show/hide
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E5GBY2 Cysteine synthase1.5e-16689.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22682 S-sulfo-L-cysteine synthase (O-acetyl-L-serine-dependent), chloroplastic7.1e-12678.6Show/hide
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O81155 Cysteine synthase, chloroplastic/chromoplastic2.1e-10965.54Show/hide
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P31300 Cysteine synthase, chloroplastic/chromoplastic9.0e-11367.83Show/hide
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Subjt:  SINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKET

Query:  VQIVGVEPAERSVISGENAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF
        ++I+GVEP E +V+SG   G++P  LD  ++DEVI++++DEA+E A++LAL EGLLVGISSGAAA+A I +A+RPENAGKLI V F
Subjt:  VQIVGVEPAERSVISGENAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF

P32260 Cysteine synthase, chloroplastic/chromoplastic1.6e-10961.28Show/hide
Query:  PINVMVQSCSAVRQRPVLAKA--RSTYATWEGLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDK
        P ++   +   V   P+  KA   S  +T EGL   NIA++V+QLIG+TPM+YLN V++G VAN+AAKLESMEPC SVKDRIGYSMI  AE+ G I+P K
Subjt:  PINVMVQSCSAVRQRPVLAKA--RSTYATWEGLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDK

Query:  TVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMPASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWE
        T LVEPT+GNTG+G+AFIAA +GYK+ +TMPAS+++ERR++L+AFGAE+VLTDP KG++GA+ KAEEIL  TP++YMLQQFDN AN K+H+ETTGPEIWE
Subjt:  TVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMPASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWE

Query:  DTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKETVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVG
        DT G VDIFVAGIGTGGTI+G GRYL  R   VQ++G+EP E +++SG            AG+VP  LD+ ++DEVI+V+++EA+EMA++LA+ EGLLVG
Subjt:  DTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKETVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVG

Query:  ISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF
        ISSGAAA A + + +RPENAGKLI V F
Subjt:  ISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF

Q43725 Cysteine synthase, mitochondrial1.1e-11065.32Show/hide
Query:  GLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMP
        G D +NIADNV+QLIG+TPM+YLN + +GCVAN+AAKLE MEPC SVKDRIGYSM++ AE+ G ISP K+VLVEPT+GNTG+G+AFIAA++GY+L++TMP
Subjt:  GLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMP

Query:  ASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKE
        AS+++ERR+LL+AFGAE+VLTDP KG+ GA+ KAEEIL +TP+AYMLQQFDN AN K+H+ETTGPEIW+DT G VDIFVAGIGTGGTITG GR++  +  
Subjt:  ASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKE

Query:  TVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF
          Q++GVEP E  ++SG            AG++P  LD K++DEVI ++++EAIE A++LAL EGL+VGISSGAAA A I +A+RPENAGKLI V F
Subjt:  TVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G43750.1 O-acetylserine (thiol) lyase B7.3e-11058.15Show/hide
Query:  LSPSPSRPFPL-------PLAFSSKRHSVAPINVMVQSCSAVRQRPVLAKARSTYATWEGLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESM
        L+P  SR  P         L+ SS++ +   ++    +     +  V+ KA S      G++ +NIADN  QLIG+TPM+YLN V +GCVA+VAAKLE M
Subjt:  LSPSPSRPFPL-------PLAFSSKRHSVAPINVMVQSCSAVRQRPVLAKARSTYATWEGLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESM

Query:  EPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMPASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLST
        EPC SVKDRIGYSMI+ AEE G I+P K+VLVE T+GNTG+G+AFIAA+KGYKL++TMPAS+++ERR+LLRAFGAE+VLT+P KG+ GAI KAEEIL  T
Subjt:  EPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMPASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLST

Query:  PNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKETVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKL
        PN+YMLQQFDN AN K+H+ETTGPEIWEDT G +DI VAGIGTGGTITG GR++  RK  ++++GVEP E +++SG            AG+VP  LD+ +
Subjt:  PNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKETVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKL

Query:  LDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF
        +DE I ++++EAIE +++LAL EGLLVGISSGAAA A I +A+RPENAGKLI V F
Subjt:  LDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF

AT3G03630.1 cysteine synthase 265.1e-12778.6Show/hide
Query:  DSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMPAS
        ++VNIA++VTQLIG TPM+YLN+VT+GC+A++AAKLESMEPCRSVKDRIG SMI+ AE SGAI+P KTVLVEPTTGNTGLGIAF+AA KGYKL+VTMPAS
Subjt:  DSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMPAS

Query:  INVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKETV
        IN+ERR+LLRA GAEIVLT+PEKGL+GA+ KA+EI+L T NAYM QQFDN ANTK+HFETTGPEIWEDTMG+VDIFVAGIGTGGT+TGTG +L M  + +
Subjt:  INVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKETV

Query:  QIVGVEPAERSVISGENAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF
        ++VGVEP+ERSVISG+N GY+P ILDVKLLDEV KV+N EAIEMARRLAL+EGLLVGISSGAAAVA +SLA+R ENAGKLI V F
Subjt:  QIVGVEPAERSVISGENAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF

AT3G59760.1 O-acetylserine (thiol) lyase isoform C7.8e-11265.32Show/hide
Query:  GLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMP
        G D +NIADNV+QLIG+TPM+YLN + +GCVAN+AAKLE MEPC SVKDRIGYSM++ AE+ G ISP K+VLVEPT+GNTG+G+AFIAA++GY+L++TMP
Subjt:  GLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMP

Query:  ASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKE
        AS+++ERR+LL+AFGAE+VLTDP KG+ GA+ KAEEIL +TP+AYMLQQFDN AN K+H+ETTGPEIW+DT G VDIFVAGIGTGGTITG GR++  +  
Subjt:  ASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKE

Query:  TVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF
          Q++GVEP E  ++SG            AG++P  LD K++DEVI ++++EAIE A++LAL EGL+VGISSGAAA A I +A+RPENAGKLI V F
Subjt:  TVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF

AT3G59760.2 O-acetylserine (thiol) lyase isoform C4.6e-11265.1Show/hide
Query:  GLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMP
        G D +NIADNV+QLIG+TPM+YLN + +GCVAN+AAKLE MEPC SVKDRIGYSM++ AE+ G ISP K+VLVEPT+GNTG+G+AFIAA++GY+L++TMP
Subjt:  GLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMP

Query:  ASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKE
        AS+++ERR+LL+AFGAE+VLTDP KG+ GA+ KAEEIL +TP+AYMLQQFDN AN K+H+ETTGPEIW+DT G VDIFVAGIGTGGTITG GR++  +  
Subjt:  ASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKE

Query:  TVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQFF
          Q++GVEP E  ++SG            AG++P  LD K++DEVI ++++EAIE A++LAL EGL+VGISSGAAA A I +A+RPENAGKLI V  F
Subjt:  TVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQFF

AT3G59760.3 O-acetylserine (thiol) lyase isoform C7.8e-11265.32Show/hide
Query:  GLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMP
        G D +NIADNV+QLIG+TPM+YLN + +GCVAN+AAKLE MEPC SVKDRIGYSM++ AE+ G ISP K+VLVEPT+GNTG+G+AFIAA++GY+L++TMP
Subjt:  GLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIGYSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMP

Query:  ASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKE
        AS+++ERR+LL+AFGAE+VLTDP KG+ GA+ KAEEIL +TP+AYMLQQFDN AN K+H+ETTGPEIW+DT G VDIFVAGIGTGGTITG GR++  +  
Subjt:  ASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFETTGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKE

Query:  TVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF
          Q++GVEP E  ++SG            AG++P  LD K++DEVI ++++EAIE A++LAL EGL+VGISSGAAA A I +A+RPENAGKLI V F
Subjt:  TVQIVGVEPAERSVISGE----------NAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISLARRPENAGKLIVVQF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGGTTTCTTCCTTTCTATCGCCATCTCCTTCGCGTCCATTTCCTCTTCCCCTTGCTTTCTCCTCAAAGCGACATTCAGTGGCACCAATCAATGTTATGGTTCAGAG
CTGTTCTGCTGTAAGACAGAGACCGGTGCTCGCGAAAGCTCGCTCAACCTACGCGACATGGGAAGGACTAGACTCCGTCAACATTGCCGACAACGTAACCCAGTTGATTG
GAAGAACGCCCATGATATATCTCAACAAAGTAACAGAAGGATGCGTGGCAAATGTTGCTGCAAAACTTGAATCAATGGAACCATGCCGAAGTGTCAAAGACAGGATTGGT
TACAGTATGATATCCAGTGCTGAGGAGAGTGGTGCAATTTCTCCGGATAAGACCGTATTAGTTGAACCAACTACTGGGAATACGGGACTCGGCATAGCTTTCATTGCTGC
AACAAAAGGGTACAAACTTGTAGTCACCATGCCTGCATCTATAAATGTTGAAAGGAGGATCCTACTACGTGCTTTTGGTGCTGAGATTGTTTTGACAGATCCAGAGAAAG
GCCTCCAAGGGGCTATTGCCAAAGCTGAAGAAATTCTACTTAGTACTCCCAATGCCTACATGCTGCAACAGTTTGATAACATTGCTAATACGAAGGTCCACTTTGAAACC
ACGGGACCTGAGATATGGGAGGATACCATGGGTAGTGTTGACATATTTGTTGCTGGAATTGGAACTGGTGGTACCATTACAGGCACCGGTCGTTACCTAAATATGAGGAA
AGAAACGGTTCAGATAGTTGGTGTGGAACCTGCAGAACGAAGTGTAATCTCAGGAGAAAATGCTGGTTATGTGCCCCCTATTCTGGATGTCAAGTTGCTGGATGAGGTGA
TCAAGGTAACCAACGATGAAGCTATAGAAATGGCCAGGAGATTAGCATTGGATGAAGGCCTACTGGTTGGCATTTCATCAGGAGCTGCTGCAGTAGCAGGGATAAGTTTG
GCAAGGAGGCCTGAAAATGCTGGAAAACTCATTGTGGTGCAATTTTTCAGGGCACTAGAAGAATCAGAAAGTAGAGTTGTAAATGGAGCGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGGCCATTAGCTATGGTGGTTTCTTCCTTTCTATCGCCATCTCCTTCGCGTCCATTTCCTCTTCCCCTTGCTTTCTCCTCAAAGCGACATTCAGTGGCACCAATCAATGT
TATGGTTCAGAGCTGTTCTGCTGTAAGACAGAGACCGGTGCTCGCGAAAGCTCGCTCAACCTACGCGACATGGGAAGGACTAGACTCCGTCAACATTGCCGACAACGTAA
CCCAGTTGATTGGAAGAACGCCCATGATATATCTCAACAAAGTAACAGAAGGATGCGTGGCAAATGTTGCTGCAAAACTTGAATCAATGGAACCATGCCGAAGTGTCAAA
GACAGGATTGGTTACAGTATGATATCCAGTGCTGAGGAGAGTGGTGCAATTTCTCCGGATAAGACCGTATTAGTTGAACCAACTACTGGGAATACGGGACTCGGCATAGC
TTTCATTGCTGCAACAAAAGGGTACAAACTTGTAGTCACCATGCCTGCATCTATAAATGTTGAAAGGAGGATCCTACTACGTGCTTTTGGTGCTGAGATTGTTTTGACAG
ATCCAGAGAAAGGCCTCCAAGGGGCTATTGCCAAAGCTGAAGAAATTCTACTTAGTACTCCCAATGCCTACATGCTGCAACAGTTTGATAACATTGCTAATACGAAGGTC
CACTTTGAAACCACGGGACCTGAGATATGGGAGGATACCATGGGTAGTGTTGACATATTTGTTGCTGGAATTGGAACTGGTGGTACCATTACAGGCACCGGTCGTTACCT
AAATATGAGGAAAGAAACGGTTCAGATAGTTGGTGTGGAACCTGCAGAACGAAGTGTAATCTCAGGAGAAAATGCTGGTTATGTGCCCCCTATTCTGGATGTCAAGTTGC
TGGATGAGGTGATCAAGGTAACCAACGATGAAGCTATAGAAATGGCCAGGAGATTAGCATTGGATGAAGGCCTACTGGTTGGCATTTCATCAGGAGCTGCTGCAGTAGCA
GGGATAAGTTTGGCAAGGAGGCCTGAAAATGCTGGAAAACTCATTGTGGTGCAATTTTTCAGGGCACTAGAAGAATCAGAAAGTAGAGTTGTAAATGGAGCGTAATTGCA
TCTATATTAGGTAAACAATTGTTATTCCAAAAGATTGAGAAGTAAAAAAGGGCAGAATAAGGGCTTGAAATGCAAAGAGAAATGGTGTAATATGAAGTTAATAGAACACA
GGAAAGTGCTAATAGAAGTAGGATAAGCACTTTTTAAATATCGAACTATTTTGCAGGTTTCTCACTCATAATATCACGAACTATTTTTTTTCTTTACTGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVVSSFLSPSPSRPFPLPLAFSSKRHSVAPINVMVQSCSAVRQRPVLAKARSTYATWEGLDSVNIADNVTQLIGRTPMIYLNKVTEGCVANVAAKLESMEPCRSVKDRIG
YSMISSAEESGAISPDKTVLVEPTTGNTGLGIAFIAATKGYKLVVTMPASINVERRILLRAFGAEIVLTDPEKGLQGAIAKAEEILLSTPNAYMLQQFDNIANTKVHFET
TGPEIWEDTMGSVDIFVAGIGTGGTITGTGRYLNMRKETVQIVGVEPAERSVISGENAGYVPPILDVKLLDEVIKVTNDEAIEMARRLALDEGLLVGISSGAAAVAGISL
ARRPENAGKLIVVQFFRALEESESRVVNGA