CuGenDBv2

Gene ID	Tan0006117
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	Sec-independent protein translocase protein TatB-like
Genome location	LG07:7254284..7263277
RNA-Seq Expression	Tan0006117
Synteny	Tan0006117
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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KAA0043466.1 sec-independent protein translocase protein TatB-like [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_023551431.1 uncharacterized protein LOC111809244 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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TrEMBL top hits

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A0A0A0KN15 Uncharacterized protein

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A0A1S3ATI2 sec-independent protein translocase protein TatB

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A0A5A7TN47 Sec-independent protein translocase protein TatB-like

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A0A6J1E2P5 uncharacterized protein LOC111430283

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E5GCU4 Uncharacterized protein

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SwissProt top hits

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A4G9I1 Sec-independent protein translocase protein TatB

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Q0C0V9 Sec-independent protein translocase protein TatB

5.8e-04

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Arabidopsis top hits

e value

%identity

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AT5G43680.1 unknown protein

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         E  +GSD+MLEAVLEAEVAH AK FF+  + +    +G
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AT5G43680.2 unknown protein

1.1e-42

46.44

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTGGGCATTTCATATGGAGAACTCTTCCTCCTTATTGGAGCTACTGCTGCCTTCATTGGACCAAAGGATCTCCCAGTGATAGCAAGAATGGCTGGACGGATGGCTGG
CAGAGCAATTGGATATGTTCAGTTAGCTCGAGGTCAGTTTGACTCTGTCATGCAACAAACCCAAGCTCGCCAGGTTCACAAGGAATTGCAAGACACTATGGCTCAGCTTG
ATGCTATTCGTCATGAAATTCGAAGCATATCGATCCTGAATCCTGGGCCATTGACTCGGAGGCTTGTGGACAATCCTGAGCTCACAGCAGCTGATAGTGGTGTAGCTAGT
GATTCAGCCGAAGAAAAACCTACTGTGGAGACTACATCAGCAGCTAGCATCCTCAAGGTTGCAACTTCACAAATATCAAATGAACACAGCCGAGCGACCACGTTTGCAAG
GTTGGCTGAATCACCAACCATAAAGAATGGTTTCTCTGCCTCATTTCCAATTTCTACAGACGTTGAAAAGCTTAATGATGAGTTTGGACTTCCTTCCGTTTTACCTGTAT
CTGCTGAAAATACTGGGCTGTTACCTAAACGCACGGAGGAGTTAAAAGGGTCTGACATAATGTTAGAAGCAGTATTGGAAGCAGAGGTGGCTCACAATGCAAAAGAATTT
TTCTCACATCATCAAAGTCAAATGAAACAGGAACAAGGATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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GCAATCGCCGGCTCGTCCCCTTTCGTCCTCTCCGCCGACTGGCCGACACTGCACGCCGCCCCCTGCGTCTTCTTCTTCGTCTTTTTCAGTTCCCAGCCGGACATCTTCCT
CTTCTTCGGGTTTCCGCCGCCGGCTCTTCCTGCATCCTCCGGTCGTCTTCCATCCATCCGATCTGTCGCCGGCAGCACGTCTCCGACCAGCCCACGCCCACAGCAAGCCC
AGCCCAGCCCGCCGATCGGGCCACAGGAATCCCGGATCTGTATTTCACGCTCAGCCGCCGGTAAGGAGCACGCTCGTGTTAAGGGAGTGTGTGGAACTTGGGATCGAACT
CCTAAACCTTTGATACCAATCAATGAAGAGGCTGAATTGAGTGAAAGTTATTGCATCTGAGATCATTCTCAATCTCTAGGCCTGGCTTGATTGCTATTCTGAGTTCCTGT
GAGAGACGCTACGAAACTTAAATGTTGGGCATTTCATATGGAGAACTCTTCCTCCTTATTGGAGCTACTGCTGCCTTCATTGGACCAAAGGATCTCCCAGTGATAGCAAG
AATGGCTGGACGGATGGCTGGCAGAGCAATTGGATATGTTCAGTTAGCTCGAGGTCAGTTTGACTCTGTCATGCAACAAACCCAAGCTCGCCAGGTTCACAAGGAATTGC
AAGACACTATGGCTCAGCTTGATGCTATTCGTCATGAAATTCGAAGCATATCGATCCTGAATCCTGGGCCATTGACTCGGAGGCTTGTGGACAATCCTGAGCTCACAGCA
GCTGATAGTGGTGTAGCTAGTGATTCAGCCGAAGAAAAACCTACTGTGGAGACTACATCAGCAGCTAGCATCCTCAAGGTTGCAACTTCACAAATATCAAATGAACACAG
CCGAGCGACCACGTTTGCAAGGTTGGCTGAATCACCAACCATAAAGAATGGTTTCTCTGCCTCATTTCCAATTTCTACAGACGTTGAAAAGCTTAATGATGAGTTTGGAC
TTCCTTCCGTTTTACCTGTATCTGCTGAAAATACTGGGCTGTTACCTAAACGCACGGAGGAGTTAAAAGGGTCTGACATAATGTTAGAAGCAGTATTGGAAGCAGAGGTG
GCTCACAATGCAAAAGAATTTTTCTCACATCATCAAAGTCAAATGAAACAGGAACAAGGATGACAATTTCATGAGCATCATAGCATTGATGAATGGCCCATAAATGAAGT
TCAGTCGGTTCAAAATGCGAATCCCAGGTATTCCCCTGGCTTCATATGTGTCATTTGTGTAAGCGAATGAATTATTACTACATAGAAAGTTACACTTCGAAGGCATACTT
GTGAAAGTATATTTAACTTACTTTTGCAAGTCAGAAAGAAAAGGGGAAATGAAACACGTACTCTGCTCATACTTGTTGATCTGTGGTGCCCCTATATATTATAGTGAAGT
CATATGCTTGCATACATCAATTGTTTTCACTGTTTTTTATCAGTTATGTACAGAAGCATGTGGTGGGTCACTGCTTCACAATGCTGCTTGTCACTTAGGCTTATGTTTTC
AGCAACGTATCTTCTTATATCGTGGCCTGGATCTGTAGTTACGATACTCATTAGTATGTTAAGTGGCTTTGTTACTTATCTGTAGTGATAGAAATGGATATGTATCGCAG
TTTCATGATTTTTTCTACCCTGTAGTTTGTGTTTGAAATGAAAAGAAGTCATTTGTCTGATGGTACATAGTTATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACAGCCGTTCGTTT
GATCATTTTGAAGGGATTTAACGTTTTGACATCAAACGAGTTTCTGAAATTCTTGAACTAAGTTTAAAGTGATCATTTCATCCTTTAATATTTTTGTTTTGTTTATCTGT
GCGCACACCCCAACTAATCTTATAGGACAATTGTCCGACTCTACTACATGTAGTTGTCAAGAAAACTCGTAGGATATTAAGTTTTAGGTAGGTAACAATCAGAGATTGAA
TTCATTACCCTTTATTATTCTCCTGACTAACCCATGATGGATCATATGTAATAGGCGTGTTTGAGGATTAGTTATAGTACCTATGCTAGTTTGCATACCCGTTGTTAAAA
AAAAGGAGATTATTTGTAAAATCTCTGAATGAGTAATTCCCCTTTGGTCATGTCTAACAAAATAATAATAAGAATAACAATAATATAAAAAAATAAAATTTGACCGTGGG
CTTTTTAAAAAATAGAGAAAAATATCTTTTTAGTCTTCATGTTTCAAATTTGTGTATATTTAGTACTTGTGTTTTAAAATTAGACAATCAAGTCCTCTAAACTTATATAA
TAGTTCTATTGAGTCCATATTTGTGTATATTTAGTCATTGTATTTTAAATTAGACAATCAAGTCCCCGAAATTTATAAAATAGTTCTATTGAGTCCATATGCAATTAACT
TTTGACTGTGGCATTTTTTAATATATTAAAAATATAAAATAATAACTGAAATAATAATTAAGAAAAGAGAGAAAATCTCTCCCCTCTTTTCCTTTCCCCTTTGCGTTGTG
ATCAGACAAGTAACCAGGAGATGATTTTGCCAACATCCTCAAAAACAACAAATATCTTTGGGCATAAAATGGCAAAATAACAAAGGAGGAAAAATGAAGAATGCAATCGA
AAAACCTTAGAAACAATGGGTTTGAATCTGCAGCAAAGAATCGAGCAACAAGCGATTTGAAAACGAAAAACAGAAGTGAAGAGAGGCCATGGGAGGGAGATGAAGAACTT
GGAATCACATTTGAAAGAGATGGGTAACTCAAATTTAAATTGCCATCGAAACAGAGAGTGAAATTGAGATGACTGGGGTTGGTGGGCACACTAAGATTGGGGGATGAAGC
CAAATGAAAATTGAAAAGAGAATGGGTCGACACGTACAGAAACGAGTTCAAATTTTTTTAATTTCTAGCAAAATTTCATGTATAATTGTTTATGATTTTGGAGGGAAAAG
ATTGTGTGACCCATGTTCGGTGAGGTTGCGCCTTGATCTAACTCGAGCTGCTGTAGTGAGGCTCGAGTCGGCAGCTTGCAACGTCGATGGCAGCAGATCAAGGGAAGAGG
CGGTCGGGTAAGACTTCGCGGCCGATACACTGTTGGTTACAGGTTTGAGTCGTTCATTTTCTAGCGATCACTAACGGCGTGTGAAGAGGCCTACACGGTGAGGGAAGAAG
AAAGGGGAGAGGAAGGGGCACGAAGAGAAGGAGAAGAAAGGGAGAGGGGAAGGAGAAGGAGAAGGAGGAAAAAG

Protein sequence

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MLGISYGELFLLIGATAAFIGPKDLPVIARMAGRMAGRAIGYVQLARGQFDSVMQQTQARQVHKELQDTMAQLDAIRHEIRSISILNPGPLTRRLVDNPELTAADSGVAS
DSAEEKPTVETTSAASILKVATSQISNEHSRATTFARLAESPTIKNGFSASFPISTDVEKLNDEFGLPSVLPVSAENTGLLPKRTEELKGSDIMLEAVLEAEVAHNAKEF
FSHHQSQMKQEQG

Tan0006117 (gene) of Snake gourd v1 genome