; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0006207 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0006207
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionProlamin_like domain-containing protein
Genome locationLG11:8698852..8699250
RNA-Seq ExpressionTan0006207
SyntenyTan0006207
Gene Ontology termsGO:0110165 - cellular anatomical structure (cellular component)
InterPro domainsIPR008502 - Prolamin-like domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046835.1 hypothetical protein E6C27_scaffold216G001330 [Cucumis melo var. makuwa]2.0e-5177.6Show/hide
Query:  MRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRFPGLE
        MRA+VILL AINL+ LVQ S  ++DYNS IW+ WVDEDRGY LRPCLD M+SAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVK+MGK CA+ F  WY+FPGLE
Subjt:  MRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRFPGLE

Query:  ILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF
        I EPNPM VY NC  RLDA PPAPF
Subjt:  ILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF

KAA0046841.1 hypothetical protein E6C27_scaffold216G001410 [Cucumis melo var. makuwa]9.1e-5276.3Show/hide
Query:  MAKRTNTMRA-MVILLLAINLAALVQPSMA--NDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKF
        MA  TNT+   + ILLLA+NLA LV PSMA  +DDYNS IWN WVDEDR  NLRPCLDMMKSAKCQV+LYNYYFNISKKELDL CCVFVKIMGK CA  F
Subjt:  MAKRTNTMRA-MVILLLAINLAALVQPSMA--NDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKF

Query:  AGWYRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF
        AGWY FPGLE+ EPNPM VY NC  RL ALPP PF
Subjt:  AGWYRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF

KAE8646662.1 hypothetical protein Csa_004797, partial [Cucumis sativus]1.2e-4375.68Show/hide
Query:  RTNTMRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRF
        +TN MRAM+ILL  INLA LVQP   ++DYNSSIWN W+DEDR + LRPCLD M+SAKCQVELYNYYFNISK+ELDLNCCVFVK+MGK CA+ F  WY+F
Subjt:  RTNTMRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRF

Query:  PGLEILEPNPM
        PGLEI EPNPM
Subjt:  PGLEILEPNPM

KAG6575249.1 hypothetical protein SDJN03_25888, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.1e-4464.62Show/hide
Query:  MAKRTNTMRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGW
        MAK T+T+ AMV+LLLA+NL   V+ + A+ DYNS IW+RW+DEDR Y LRPCL++MKSAKCQV+LYN YFN+SK+ELDLNCCVFVK+MGKNCA  FAGW
Subjt:  MAKRTNTMRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGW

Query:  YRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRL-DALPP
        + +P  E+ +PNPMN+Y  C  RL  ++PP
Subjt:  YRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRL-DALPP

KAG6578867.1 hypothetical protein SDJN03_23315, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.0e-5583.2Show/hide
Query:  MRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRFPGLE
        M AMVILLLAINLA L QPS A+DDYNS IW+RWVDEDRG NLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVK+MGK CAR FAGW+RFP  E
Subjt:  MRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRFPGLE

Query:  ILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF
        + E NPM VY NC  RLDALPPAPF
Subjt:  ILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KEB8 Prolamin_like domain-containing protein5.2e-5376.34Show/hide
Query:  MAKRTNTMRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGW
        MA +TN MRAMVILL AINLA LVQ S  ++DYNSSIWN W+DEDR + LRPCLD M+SAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVK+MGK CA+ F  W
Subjt:  MAKRTNTMRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGW

Query:  YRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAP
        Y+FPGLEI EPNPM VY NCA RL A PP P
Subjt:  YRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAP

A0A0A0KQ41 Prolamin_like domain-containing protein3.4e-3658.33Show/hide
Query:  MAKRTNTMRAMVIL-LLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAG
        M   T  +  +V+L LL ++  ALVQPS  +D+  SSIW+ W+DEDR   L PCL MM+S KCQVELYNYYFNISKKELDL+CCV+V  MGK CA  F  
Subjt:  MAKRTNTMRAMVIL-LLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAG

Query:  WYRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAP
        W+ FP LE L+PNPM VY NC +RL    P P
Subjt:  WYRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAP

A0A0A0L535 Prolamin_like domain-containing protein8.1e-3049.63Show/hide
Query:  MAKRTNTMRAMVIL----LLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARK
        M K +N+  A++++    LL ++  ALV PS+ +D+  SSIW+ W+D+DR   L  CL +MKS KCQVELYNYYFN SKKE+DL+CCV+V  +G+ CA  
Subjt:  MAKRTNTMRAMVIL----LLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARK

Query:  FAGWYRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAP
        F  W+   G + L+PNPM +Y NC +RL    PAP
Subjt:  FAGWYRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAP

A0A5A7TZR1 Prolamin_like domain-containing protein4.4e-5276.3Show/hide
Query:  MAKRTNTMRA-MVILLLAINLAALVQPSMA--NDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKF
        MA  TNT+   + ILLLA+NLA LV PSMA  +DDYNS IWN WVDEDR  NLRPCLDMMKSAKCQV+LYNYYFNISKKELDL CCVFVKIMGK CA  F
Subjt:  MAKRTNTMRA-MVILLLAINLAALVQPSMA--NDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKF

Query:  AGWYRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF
        AGWY FPGLE+ EPNPM VY NC  RL ALPP PF
Subjt:  AGWYRFPGLEILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF

A0A5D3C280 Prolamin_like domain-containing protein9.8e-5277.6Show/hide
Query:  MRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRFPGLE
        MRA+VILL AINL+ LVQ S  ++DYNS IW+ WVDEDRGY LRPCLD M+SAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVK+MGK CA+ F  WY+FPGLE
Subjt:  MRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRFPGLE

Query:  ILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF
        I EPNPM VY NC  RLDA PPAPF
Subjt:  ILEPNPMNVYTNCARRLDALPPAPF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAAAAAGAACTAACACAATGAGAGCAATGGTGATTCTCTTATTGGCAATAAACTTGGCAGCCTTAGTTCAACCCTCAATGGCAAATGATGACTACAATTCATCGAT
ATGGAATAGATGGGTAGACGAAGATAGAGGATATAATCTACGACCGTGTTTGGATATGATGAAGAGTGCAAAATGTCAGGTGGAACTTTATAATTATTACTTCAATATAA
GTAAGAAGGAATTGGATCTAAATTGTTGCGTTTTTGTCAAAATCATGGGAAAGAATTGTGCTCGAAAGTTTGCTGGTTGGTATAGGTTTCCTGGTTTAGAAATCTTGGAA
CCTAATCCTATGAATGTTTACACAAATTGTGCTAGAAGACTCGATGCTCTCCCACCTGCACCATTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAAAAAGAACTAACACAATGAGAGCAATGGTGATTCTCTTATTGGCAATAAACTTGGCAGCCTTAGTTCAACCCTCAATGGCAAATGATGACTACAATTCATCGAT
ATGGAATAGATGGGTAGACGAAGATAGAGGATATAATCTACGACCGTGTTTGGATATGATGAAGAGTGCAAAATGTCAGGTGGAACTTTATAATTATTACTTCAATATAA
GTAAGAAGGAATTGGATCTAAATTGTTGCGTTTTTGTCAAAATCATGGGAAAGAATTGTGCTCGAAAGTTTGCTGGTTGGTATAGGTTTCCTGGTTTAGAAATCTTGGAA
CCTAATCCTATGAATGTTTACACAAATTGTGCTAGAAGACTCGATGCTCTCCCACCTGCACCATTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKRTNTMRAMVILLLAINLAALVQPSMANDDYNSSIWNRWVDEDRGYNLRPCLDMMKSAKCQVELYNYYFNISKKELDLNCCVFVKIMGKNCARKFAGWYRFPGLEILE
PNPMNVYTNCARRLDALPPAPF