CuGenDBv2

Gene ID	Tan0006650
Organism	Trichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description	UPF0613 protein PB24D3.06c
Genome location	LG10:7484565..7490019
RNA-Seq Expression	Tan0006650
Synteny	Tan0006650
Gene Ontology terms	GO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR013744 - Fusarinine C esterase SidJ IPR029058 - Alpha/Beta hydrolase fold

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6597471.1 hypothetical protein SDJN03_10651, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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TYK17158.1 UPF0613 protein PB24D3.06c [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_022936878.1 UPF0613 protein PB24D3.06c [Cucurbita moschata]

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XP_022973669.1 UPF0613 protein PB24D3.06c [Cucurbita maxima]

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XP_023540798.1 UPF0613 protein PB24D3.06c-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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Alignment

A0A0A0L7R4 Uncharacterized protein

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A0A1S3AX38 UPF0613 protein PB24D3.06c

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A0A5D3D0X8 UPF0613 protein PB24D3.06c

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A0A6J1FEG6 UPF0613 protein PB24D3.06c

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A0A6J1IF85 UPF0613 protein PB24D3.06c

4.5e-184

94.93

Show/hide

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Query:  KKALVDRLCKAMGGADKVEIQHGNHSLSNRVNEAVDAIIDFVKREGPKGWDDPWH
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SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q4WF56 Fusarinine C esterase sidJ

7.7e-24

30.03

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        K    G+L  Y    +   + T   ++   ++F+GGL DG   T YL  LA AL   +WSL  + L+SSY  +G   L++D  E+ Q + Y+        
Subjt:  KNHFRGLLFKYGPKPIQVAFKTGDYKQ--QVIFIGGLTDGFMATEYLEPLAIALDNEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLEQDAKELDQLVSYLI-------

Query:  -NKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVYYM-RTNAAC-------------SRAVRGAILQAPVSDREY----------RATLPETAAMIDLASTMISEG-----R
             S  +VL+GHSTG Q +++Y+ R N                   + GAI+QAPVSDRE             T  E   + +  ++M  E       
Subjt:  -NKEDSEGVVLLGHSTGCQDIVYYM-RTNAAC-------------SRAVRGAILQAPVSDREY----------RATLPETAAMIDLASTMISEG-----R

Query:  GLDLMPREADPS------SPITATRYYSLCS-----YMGSDDMFSSDLSDDQLRMRLG-----HMANTPCQVIFSMGDEYVPEYVDKKALVDRLCKAMGG
        G D++   A  S      +P++A R+ SL S         DD+FSSDLSD+QL    G      +      V+FS  D+ VP +VDK  L+ R   A   
Subjt:  GLDLMPREADPS------SPITATRYYSLCS-----YMGSDDMFSSDLSDDQLRMRLG-----HMANTPCQVIFSMGDEYVPEYVDKKALVDRLCKAMGG

Query:  ADKVE--------IQHGNHSLSN
          +          I + +H+LSN
Subjt:  ADKVE--------IQHGNHSLSN

Q9C0Y8 UPF0613 protein PB24D3.06c

2.0e-27

34.5

Show/hide

Query:  VIFIGGLTDGFMATEYLEPLAIALDNEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLEQDAKELDQLVSYLIN----KEDSEGVVLLGHSTGCQDIVYYMRTNAACSRA
        ++F+GGL DG +   Y++ L   LD   WS+VQ+   SSY G+GT SL++D ++L + V Y ++       +  +VL+GHSTG Q+++YY+  +   +  
Subjt:  VIFIGGLTDGFMATEYLEPLAIALDNEKWSLVQILLSSSYSGYGTSSLEQDAKELDQLVSYLIN----KEDSEGVVLLGHSTGCQDIVYYMRTNAACSRA

Query:  VRGAILQAPVSDRE--YRATLPE-TAAMID-LASTMISEGRGLDLMPREADPS----SPITATRYYSLCSYMGSDDMFSSDLSDDQLRMRLGHM------
        + G I QAPVSDRE  Y+    E T  ++D + +  + +G G D++PR    +     P +A R   L    G+DD FSSDLS D      G++      
Subjt:  VRGAILQAPVSDRE--YRATLPE-TAAMID-LASTMISEGRGLDLMPREADPS----SPITATRYYSLCSYMGSDDMFSSDLSDDQLRMRLGHM------

Query:  -ANTPCQVIFSMGDEYVPEYVDKKALVDR
         A++   ++ S  DE+V    DK  L++R
Subjt:  -ANTPCQVIFSMGDEYVPEYVDKKALVDR

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G19050.1 alpha/beta-Hydrolases superfamily protein

2.0e-152

77.01

Show/hide

Query:  MNLSLSSSSPSSLPSASASSSSSSP----SSSSTTSWFSGIVRGRAERSSSMKMPANSPSA---PTAGDPPGPVVRKNHFRGLLFKYGPKPIQVAFKTGD
        M+LSL SSS ++  +AS S SSSSP    SSS+TTSWFSGIVRGR ++S + K+  +S  A     +GD  GP+  KN FRG+LFKYGPK IQVAFKTG+
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        YKQQVIFIGGLTDG +AT+YLEPLAIALD EKWSLVQ+L+SSSYSG+GTSSL+QDA+E+DQL+++LINKE+SEGVVLLGHSTGCQDIVYYM TNAACSRA
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        VR AILQAPVSDREY+ATLPET AMIDLA+ MI EGRG +LMPREADP +PI+A RY+SLC+YMG DDMFSSDLSDDQL+ RLGHMANTPCQVIFSMGDE
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Query:  YVPEYVDKKALVDRLCKAMGGADKVEIQHGNHSLSNRVNEAVDAIIDFVKREGPKGWDDPW
        YVP+YVDKKALV+RL KAMGGA+KVEI+HGNHSLSNRV+EAV AII FVKREGP GWDDPW
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Sequences

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TGCGTACAAATGCAGCTTGCTCTCGAGCAGTTCGTGGCGCCATTTTGCAGGCTCCAGTTAGTGATCGAGAGTATAGAGCAACTCTTCCTGAAACAGCAGCCATGATTGAC
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mRNA sequence

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TCCCTCTTCACTTCCTTCCGCTTCTGCATCTTCTTCTTCTTCCTCCCCCTCTTCGTCTTCCACAACTTCATGGTTCTCCGGCATAGTTCGCGGCCGTGCCGAAAGGTCTT
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TTGAATTCTTCTTGTGTTGTCCACATCTTTGATACTTAATTACAGAAAGCT

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VNEAVDAIIDFVKREGPKGWDDPWH

Tan0006650 (gene) of Snake gourd v1 genome