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| Q15287 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 1.2e-18 | 42.64 | Show/hide |
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+ +HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
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+R RRS SGS SSSRSRS S S S S S S S S S S S S SRS SSSSS S S+SS S SP P R+ + RR+R+ KR ++ SP
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P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
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| Q4R5N1 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 1.2e-18 | 42.64 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S+SS S SP P R+ + RR+R+ P KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSRSRSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRT-VNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVAAAPKR
+ +HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
Subjt: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRT-VNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVAAAPKR
Query: DGPKPENVGAEAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGAEAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
|
|
| Q99M28 RNA-binding protein with serine-rich domain 1 | 1.2e-18 | 42.64 | Show/hide |
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+R RRS SGS SS+RSRS S S S SS+ + S S S S S S SRS SSS+S S S+SS S SP P R+ + RR+R+ P KR ++ SP
Subjt: SRGRRSPPSGSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSRSRSRSVSVSRSRSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPPRKPSPVR
Query: ESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRT-VNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTVAAAPKR
+ +HI L+RNV + H+ EIFS +G++ +++ ++R +L KGY YVEF+ +AEKA +MDG QIDG I A L P PP + P+R
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Query: DGPKPENVGAEAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
P P M R+ P RR+ SPRRRSPV RR SP R+ R S
Subjt: DGPKPENVGAEAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQPDSPRRRPES
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| Q9SEE9 Serine/arginine-rich splicing factor SR45 | 9.8e-111 | 67.91 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSR S SRS+S SRSRSRS+SSSSSPSRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
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Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
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Query: AAAPKRDGPKPENVGAEAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
+AAPKRD PK +N A+AEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
Subjt: AAAPKRDGPKPENVGAEAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRS-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSASPSPRKVVRR
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRRS PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS+SPSPR++ R+
Subjt: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRS-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSASPSPRKVVRR
Query: V--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
+ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: V--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G16610.1 arginine/serine-rich 45 | 7.0e-112 | 67.91 | Show/hide |
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MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSR S SRS+S SRSRSRS+SSSSSPSRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
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Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: AAAPKRDGPKPENVGAEAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
+AAPKRD PK +N A+AEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
Subjt: AAAPKRDGPKPENVGAEAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRS-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSASPSPRKVVRR
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRRS PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS+SPSPR++ R+
Subjt: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRS-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSASPSPRKVVRR
Query: V--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
+ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: V--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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| AT1G16610.2 arginine/serine-rich 45 | 6.5e-110 | 67.29 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSR---SRSRSVSVSRSRSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSR S SRS+S SRSRSRS+SSSSSPSRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSR---SRSRSVSVSRSRSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: AAAPKRDGPKPENVGAEAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPL
+AAPKRD PK +N A+AEKD R+ PR + SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG SP
Subjt: AAAPKRDGPKPENVGAEAEKDDMKRQREPSPRRKPPSPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPSPL
Query: ARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRS-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSASPSPRKVVRRV-
RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRRS PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+GR AGRRGRSSSYS+SPSPR++ R++
Subjt: ARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRS-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRRGRPAAAGRRGRSSSYSASPSPRKVVRRV-
Query: -SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: -SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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| AT1G16610.3 arginine/serine-rich 45 | 1.1e-109 | 66.14 | Show/hide |
Query: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSR---SRSRSVSVSRSRSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPP
MAKPSRGRRSP S SGS SRSSSRSR S SRS+S SRSRSRS+SSSSSPSRS SS SRSPP + KSP ARR R+ PPP + + P
Subjt: MAKPSRGRRSPPSGSGSSSRSRSYSGSDSRSSSRSR---SRSRSVSVSRSRSRSISSSSSPSRSASSRSRSPPPQRKSPTETARRTRASPPPAKRSSPPP
Query: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
K + V+ESLVLH+D+LSRNV+E HL+EIF NFGEV++VE+AMDR VNLP+G+GYVEFK R+DAEKAQ+YMDGAQIDG V++A FTLP RQK+ +PP+ V
Subjt: RKPSPVRESLVLHIDALSRNVHEGHLREIFSNFGEVVNVELAMDRTVNLPKGYGYVEFKTRSDAEKAQVYMDGAQIDGNVIRARFTLPQRQKMPTPPRTV
Query: AAAPKRDGPKPENVGAEAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
+AAPKRD PK +N A+AEKD +R RE SP+RK SPRRRSP+ RRG SPRR+ PDSP RRRP SP RRR ++ PPRRRPASP RG S
Subjt: AAAPKRDGPKPENVGAEAEKD-DMKRQREPSPRRKPP-SPRRRSPVARRGGSPRRQ-PDSP-RRRPESPPRRRVESPFRRDSPPPRRRPASPMRGGRSPS
Query: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRS-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPAAAGRRGRSSSYSA
P RR+RSPPR SPRRIRGSPVRRRSP P RRRS PPRR RSPPRRSP +RRRSRSPIRRP RSRS S SPR+ G AGRRGRSSSYS+
Subjt: PLARRHRSPPRPSPRRIRGSPVRRRSPPPPRRRS-PPRRARSPPRRSPVVRRRSRSPIRRPARSRSRSFSPRR----------GRPAAAGRRGRSSSYSA
Query: SPSPRKVVRRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
SPSPR++ R++ SRSP+RPLRG RSSS SSSSSSPP P
Subjt: SPSPRKVVRRV--SRSPRRPLRG-RSSSRSSSSSSPPRKP
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