; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0006983 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0006983
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionF-box protein PP2-A15
Genome locationLG08:69909178..69912811
RNA-Seq ExpressionTan0006983
SyntenyTan0006983
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_023540673.1 F-box protein PP2-A15 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-16896.92Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LB87 F-box domain-containing protein4.7e-16393.15Show/hide
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A0A6J1F609 F-box protein PP2-A15-like isoform X24.9e-16896.58Show/hide
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A0A6J1L0D7 F-box protein PP2-A15 isoform X25.7e-16997.26Show/hide
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A0A6J1L396 F-box protein PP2-A15 isoform X11.4e-16796.93Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9CAN4 F-box protein PP2-A113.0e-8252.38Show/hide
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         SAK ++ITGIDDRRYW+ IP+++SRF  VAY+QQIWWF+VDG + FPFPA  Y++ FRL LG+  KR G +    E  HGW++KPVRF++ST DGQ ++
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         +  L E            G W  Y  G+F+V KS  S+T+I+FSM QIDCTH+KGGLCVDSV + PS  K+R
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Q9FJ80 F-box protein PP2-A144.2e-7648.53Show/hide
Query:  GLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQ-------NLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRIT
        GL D+PE+C+  +F+Y+ PPEIC LAR+N++F  A+ SD+VWE KLPSNY+ L+  +  ++ Q          KK+IYA L RP  FD G KE WLD+ +
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Query:  GRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTS
        G++ ++IS KAM ITGIDDRRYW  I ++ESRF  + YL+QIWW E  G ++F F    Y+L F++ LG+  ++ GR+ CS +  HGWD+KPVRF++STS
Subjt:  GRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTS

Query:  DGQQATHEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP
        DGQ A  E  LDE            G W+ +  G+F+V+   S   ++FSM QIDCTH+KGGLC+D V I P
Subjt:  DGQQATHEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP

Q9LEX0 F-box protein PP2-A132.5e-8455.85Show/hide
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        L D+PE+CVA +   L PPEIC LARLNR FR A+S+D +WESKLP+NY+ +   +  E     L KKD+YA LS+P  FDDG KE+W+D+ TGR+C+SI
Subjt:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGRICMSI

Query:  SAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATH
        S+KA+ ITGIDDRRYW+ IPT+ESRF   AY+QQIWWFEV G  +  FP+  Y+L FR+ LG+  KRLGRR C+ EH HGWD+KPVRF+++TSD QQA  
Subjt:  SAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATH

Query:  EFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP
           L+ +           G W  Y VG+F V     +T I+FSM QIDCTH+KGGLC+DSV I+P
Subjt:  EFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP

Q9LF92 F-box protein PP2-A153.7e-13374.4Show/hide
Query:  MGASLSNLSDVANGSTIGPGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFD
        MG+SLSNL+D  NG  +GPGLGDIPESCVACVF+YLTPPEICNLA LNR+FRGAASSDSVWE KLP NYQDLLDLLPPERY +LSKKDI+A+LSRP+PFD
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Query:  DGNKEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGW
        D NKEVW+DR+TGR+CM+ISA+ M+ITGI+DRRYWNWIPTEESRF+VVAYLQQIWWFEVDGTV+F  P  +Y+L+FR+HLGRF KRLGRR C FE THGW
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        D+KPVRF +STSDGQ+A+ E+ LD+    +  G  KRG WIEY+VGEF+V+ S  +TEI++SMKQIDCTHSKGGLCVDSVFI P   +KE K+
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Q9LN77 F-box protein PP2-A123.1e-8752.67Show/hide
Query:  MGASLSNL-SDVANGSTIG------PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQNLSKKDIYALL
        MG + S+L +D+++ S  G      PGLGD+PE+CVA +   L P EIC  ++LNRAFRGA+ +D VWESKLP NY+D+L+ +     +NL K+ +YA L
Subjt:  MGASLSNL-SDVANGSTIG------PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQNLSKKDIYALL

Query:  SRPVPFDDGNKEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACS
        SR   FDD  K+VW+D+ T  +C+SISAK ++ITGIDDRRYW+ IPT+ESRF+ VAYLQQIWWFEVDG + FPFP   Y++ FRL LGR  K  GRR C+
Subjt:  SRPVPFDDGNKEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACS

Query:  FEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSG-SATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKERKK
         E  HGWD+KPVRF++ T DGQ ++ +  L E           RG WI Y  G+ +V +S  S+T+I+FSM QIDCTH+KGGL +DSV + PS  K++ K
Subjt:  FEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSG-SATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKERKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12710.1 phloem protein 2-A122.2e-8852.67Show/hide
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        MG + S+L +D+++ S  G      PGLGD+PE+CVA +   L P EIC  ++LNRAFRGA+ +D VWESKLP NY+D+L+ +     +NL K+ +YA L
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        SR   FDD  K+VW+D+ T  +C+SISAK ++ITGIDDRRYW+ IPT+ESRF+ VAYLQQIWWFEVDG + FPFP   Y++ FRL LGR  K  GRR C+
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Query:  FEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSG-SATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKERKK
         E  HGWD+KPVRF++ T DGQ ++ +  L E           RG WI Y  G+ +V +S  S+T+I+FSM QIDCTH+KGGL +DSV + PS  K++ K
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AT1G63090.1 phloem protein 2-A112.1e-8352.38Show/hide
Query:  PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGRICMS
        PGLGD+PESCVA +   L P EIC  ++LN AF GA+ +D VWESKLP +Y+ +L+ +      NL K+DI+  LSR   FD+GNK+ W+D+ TG +C+ 
Subjt:  PGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGRICMS

Query:  ISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQAT
         SAK ++ITGIDDRRYW+ IP+++SRF  VAY+QQIWWF+VDG + FPFPA  Y++ FRL LG+  KR G +    E  HGW++KPVRF++ST DGQ ++
Subjt:  ISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQAT

Query:  HEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKS-GSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKER
         +  L E            G W  Y  G+F+V KS  S+T+I+FSM QIDCTH+KGGLCVDSV + PS  K+R
Subjt:  HEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKS-GSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKER

AT3G53000.1 phloem protein 2-A152.7e-13474.4Show/hide
Query:  MGASLSNLSDVANGSTIGPGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFD
        MG+SLSNL+D  NG  +GPGLGDIPESCVACVF+YLTPPEICNLA LNR+FRGAASSDSVWE KLP NYQDLLDLLPPERY +LSKKDI+A+LSRP+PFD
Subjt:  MGASLSNLSDVANGSTIGPGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFD

Query:  DGNKEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGW
        D NKEVW+DR+TGR+CM+ISA+ M+ITGI+DRRYWNWIPTEESRF+VVAYLQQIWWFEVDGTV+F  P  +Y+L+FR+HLGRF KRLGRR C FE THGW
Subjt:  DGNKEVWLDRITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGW

Query:  DVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP-SILKERKK
        D+KPVRF +STSDGQ+A+ E+ LD+    +  G  KRG WIEY+VGEF+V+ S  +TEI++SMKQIDCTHSKGGLCVDSVFI P   +KE K+
Subjt:  DVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP-SILKERKK

AT3G61060.1 phloem protein 2-A131.7e-8555.85Show/hide
Query:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGRICMSI
        L D+PE+CVA +   L PPEIC LARLNR FR A+S+D +WESKLP+NY+ +   +  E     L KKD+YA LS+P  FDDG KE+W+D+ TGR+C+SI
Subjt:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGRICMSI

Query:  SAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATH
        S+KA+ ITGIDDRRYW+ IPT+ESRF   AY+QQIWWFEV G  +  FP+  Y+L FR+ LG+  KRLGRR C+ EH HGWD+KPVRF+++TSD QQA  
Subjt:  SAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATH

Query:  EFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP
           L+ +           G W  Y VG+F V     +T I+FSM QIDCTH+KGGLC+DSV I+P
Subjt:  EFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP

AT3G61060.2 phloem protein 2-A134.3e-8455.64Show/hide
Query:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNK-EVWLDRITGRICMS
        L D+PE+CVA +   L PPEIC LARLNR FR A+S+D +WESKLP+NY+ +   +  E     L KKD+YA LS+P  FDDG K E+W+D+ TGR+C+S
Subjt:  LGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPE-RYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNK-EVWLDRITGRICMS

Query:  ISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQAT
        IS+KA+ ITGIDDRRYW+ IPT+ESRF   AY+QQIWWFEV G  +  FP+  Y+L FR+ LG+  KRLGRR C+ EH HGWD+KPVRF+++TSD QQA 
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Query:  HEFCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVP
            L+ +           G W  Y VG+F V     +T I+FSM QIDCTH+KGGLC+DSV I+P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGGCCTCGCTTTCGAACTTGAGTGACGTTGCCAATGGCTCCACCATCGGTCCTGGCCTCGGCGACATACCGGAGAGTTGCGTCGCCTGTGTTTTTCTTTACCTTAC
TCCGCCGGAGATTTGCAACCTCGCTCGCCTTAACAGGGCGTTTCGCGGCGCCGCCTCGTCGGATTCCGTTTGGGAATCGAAATTGCCCTCGAATTATCAAGATCTTCTCG
ATTTGTTGCCCCCTGAACGGTACCAAAATCTGTCAAAAAAGGATATATATGCTCTGCTATCTCGTCCGGTTCCATTCGATGATGGAAATAAGGAGGTGTGGCTGGATAGA
ATCACTGGAAGGATTTGCATGTCGATATCAGCAAAGGCCATGGCTATTACTGGAATTGATGATAGAAGATACTGGAATTGGATTCCTACTGAAGAGTCTCGGTTCAATGT
TGTGGCATATCTGCAGCAAATTTGGTGGTTTGAAGTAGACGGGACGGTAAAATTCCCATTTCCTGCTGATATCTACACACTTACCTTCAGGCTTCACCTGGGGAGGTTCT
ATAAGCGGCTTGGTCGACGTGCATGCAGCTTCGAGCATACTCACGGTTGGGATGTAAAGCCAGTACGGTTCGAAATGTCTACTTCTGATGGACAGCAAGCAACACATGAA
TTCTGTTTAGACGAGCACAGGTTTATTGATGTAAGTGGACACCGTAAGCGCGGGTGTTGGATAGAATACAAGGTAGGTGAATTTTTGGTCGACAAGTCGGGATCAGCCAC
GGAAATTAGATTTTCCATGAAACAGATCGACTGCACGCATTCTAAAGGTGGGCTTTGTGTAGATTCTGTATTTATCGTTCCCAGTATCTTGAAAGAGCGTAAAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CAAAATCATCACATACCCAAAATGTCTAAACAAAAAAAGTACAACAAAAGATCTTTCCTTCCATTGGCTTTACATGATCACAAAACTTCATAACCCATTAACAAGACACA
GACGATCACAATCAAACCCCTCCACTTGCTCTTCATCCACGATTCATAGTTAGTGTCGCAGTGGGGATTCGAAGTTCAACAATGGCTGAAACCACAAAAAAAAAAAAAAA
AACCCAAATTCAATTTCCAACTCATCCTAATGCTGTAAATTTCATCCACCCACCACTCGCCTCCTTCCACGTCGTTTTCCTACTCTGTTCTGAATTTCTCTCGGTCCATT
TCCGTGCCCACATGTCGCACCGAACCCATCTGCGCTAGCCCTTGAAAGAGCTCCGAAATTCTTCTTCCATTTGGTGGTTTCTTTATCCTAATCCGACTCGTCGTTTCGTT
TCGTTTCGTTTTTCTGTGTTGCTTTTCGTAGCTCGCCACGCCCTTTTGCTCCCATTTGCTTTTCCCCCACTTTCCTGTCCGGAAAAGGCAAAAGTTTCCTTTCCAAATTG
TATTTATTTTGTGGGTTTTCATCGAAATCCGTGTCCGGATTTCAAGGTCCTGAAACCGCCGGACGAGGGTCGTGGTTTTTTGTTTTGTTTTTAAATCCAATCTTGAATGG
GTTTCCGCCGGTGATAATGATGCGATGACCTGAAGAAATTTCTGGGAATTTTGAAGTTTTGATTTGGGACTCTGCCGTCGGCGGCGATGGGGGCCTCGCTTTCGAACTTG
AGTGACGTTGCCAATGGCTCCACCATCGGTCCTGGCCTCGGCGACATACCGGAGAGTTGCGTCGCCTGTGTTTTTCTTTACCTTACTCCGCCGGAGATTTGCAACCTCGC
TCGCCTTAACAGGGCGTTTCGCGGCGCCGCCTCGTCGGATTCCGTTTGGGAATCGAAATTGCCCTCGAATTATCAAGATCTTCTCGATTTGTTGCCCCCTGAACGGTACC
AAAATCTGTCAAAAAAGGATATATATGCTCTGCTATCTCGTCCGGTTCCATTCGATGATGGAAATAAGGAGGTGTGGCTGGATAGAATCACTGGAAGGATTTGCATGTCG
ATATCAGCAAAGGCCATGGCTATTACTGGAATTGATGATAGAAGATACTGGAATTGGATTCCTACTGAAGAGTCTCGGTTCAATGTTGTGGCATATCTGCAGCAAATTTG
GTGGTTTGAAGTAGACGGGACGGTAAAATTCCCATTTCCTGCTGATATCTACACACTTACCTTCAGGCTTCACCTGGGGAGGTTCTATAAGCGGCTTGGTCGACGTGCAT
GCAGCTTCGAGCATACTCACGGTTGGGATGTAAAGCCAGTACGGTTCGAAATGTCTACTTCTGATGGACAGCAAGCAACACATGAATTCTGTTTAGACGAGCACAGGTTT
ATTGATGTAAGTGGACACCGTAAGCGCGGGTGTTGGATAGAATACAAGGTAGGTGAATTTTTGGTCGACAAGTCGGGATCAGCCACGGAAATTAGATTTTCCATGAAACA
GATCGACTGCACGCATTCTAAAGGTGGGCTTTGTGTAGATTCTGTATTTATCGTTCCCAGTATCTTGAAAGAGCGTAAAAAATGAGGAATCCCAAAGAGTAGTCAACAGA
AGATGTTTCTGTAATTCTTCTTAGTTACCCCAAAAGATTATAACATGGAAATTTACAGGTTATACCATTTTTAGGCTTTTGATATGTCGGAGGCTGTCGTCCTGGTTTTC
CCCGGTAGGTATGCGTTCTTTCGTTTTTTGTTATGTACATTCTGTTGTCATACAAACCGATCAGTTTTGTTACATTCTGTACAATTAACTTGAGGCAGACAAGATGTAGG
AGGGTTCGACTGATTTCATTCCTTATTTGAACTGGTTTATCTCTGTCTTTCTGTTCGGTTTATCGAGTATTATCAGTTTTCCAGATAGAAACATAGACTTTAATCCCTCT
ATCTTCTCTGATGTGAACGCTCTGGAGTTAGCTGATGCTTTGTTATCTTTTATCACCTCTGATTTAGAAGTTCTACAAAACCTCTCCTTAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGASLSNLSDVANGSTIGPGLGDIPESCVACVFLYLTPPEICNLARLNRAFRGAASSDSVWESKLPSNYQDLLDLLPPERYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDR
ITGRICMSISAKAMAITGIDDRRYWNWIPTEESRFNVVAYLQQIWWFEVDGTVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRACSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATHE
FCLDEHRFIDVSGHRKRGCWIEYKVGEFLVDKSGSATEIRFSMKQIDCTHSKGGLCVDSVFIVPSILKERKK