; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0006997 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0006997
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Description40S ribosomal protein S5-like
Genome locationLG03:42232235..42234622
RNA-Seq ExpressionTan0006997
SyntenyTan0006997
Gene Ontology termsGO:0000028 - ribosomal small subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000235 - Ribosomal protein S5/S7
IPR005716 - Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal
IPR020606 - Ribosomal protein S7, conserved site
IPR023798 - Ribosomal protein S7 domain
IPR036823 - Ribosomal protein S7 domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6596652.1 40S ribosomal protein S5-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.9e-10696.19Show/hide
Query:  MDAAVA--LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        MDAAVA  +DAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
Subjt:  MDAAVA--LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

XP_022157995.1 40S ribosomal protein S5-like [Momordica charantia]1.7e-10598.04Show/hide
Query:  VALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
        V ++A QELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
Subjt:  VALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII

Query:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
        HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
Subjt:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA

Query:  KANR
        KANR
Subjt:  KANR

XP_022941674.1 40S ribosomal protein S5-like [Cucurbita moschata]5.9e-10696.19Show/hide
Query:  MDAAVA--LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        MDAAVA  +DAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
Subjt:  MDAAVA--LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

XP_023005183.1 40S ribosomal protein S5-like [Cucurbita maxima]1.0e-10595.28Show/hide
Query:  MDAAVA----LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
        MDAAVA    +DAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
Subjt:  MDAAVA----LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI

Query:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
        IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
Subjt:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK

Query:  KDEIERVAKANR
        KDEIERVAKANR
Subjt:  KDEIERVAKANR

XP_023540376.1 40S ribosomal protein S5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.6e-10594.34Show/hide
Query:  MDAAVA----LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
        MDAAV     ++AGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
Subjt:  MDAAVA----LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI

Query:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
        IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
Subjt:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK

Query:  KDEIERVAKANR
        KDEIERVAKANR
Subjt:  KDEIERVAKANR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DIA2 40S ribosomal protein S54.2e-10597.55Show/hide
Query:  VALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
        VA++A QELT+ HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
Subjt:  VALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII

Query:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
        HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
Subjt:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA

Query:  KANR
        KANR
Subjt:  KANR

A0A6J1DU15 40S ribosomal protein S5-like5.4e-10597.06Show/hide
Query:  VALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
        VA++A QELT+ HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
Subjt:  VALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII

Query:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
        HLLTDLNPIQVI+DAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
Subjt:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA

Query:  KANR
        KANR
Subjt:  KANR

A0A6J1DUK1 40S ribosomal protein S5-like8.4e-10698.04Show/hide
Query:  VALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
        V ++A QELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII
Subjt:  VALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEII

Query:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
        HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA
Subjt:  HLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVA

Query:  KANR
        KANR
Subjt:  KANR

A0A6J1FP41 40S ribosomal protein S5-like2.9e-10696.19Show/hide
Query:  MDAAVA--LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        MDAAVA  +DAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
Subjt:  MDAAVA--LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

A0A6J1L1H1 40S ribosomal protein S5-like4.9e-10695.28Show/hide
Query:  MDAAVA----LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
        MDAAVA    +DAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVND+SL DY+GVAP+KHATYVPHTAGRYS+KRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI
Subjt:  MDAAVA----LDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI

Query:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
        IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK
Subjt:  IKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKK

Query:  KDEIERVAKANR
        KDEIERVAKANR
Subjt:  KDEIERVAKANR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65731 40S ribosomal protein S5 (Fragment)3.1e-9794.21Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        +VKLFNRW+FDDVQ++D+SL+DY+GV P+KHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTD NPIQVIVD
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIK+IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P46782 40S ribosomal protein S53.3e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

P51427 40S ribosomal protein S5-26.8e-9787.86Show/hide
Query:  AVALDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME
        A A D   E+ Q   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAME
Subjt:  AVALDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME

Query:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
        IIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
Subjt:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER

Query:  VAKANR
        VAKANR
Subjt:  VAKANR

Q5E988 40S ribosomal protein S53.3e-8380.53Show/hide
Query:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD
        D+KLF +W+ DDVQ+NDISL DY+ V   K+A Y+PH+AGRY+ KRFRKAQCPIVERLTNS+MMHGRNNGKKLM VRI+KHA EIIHLLT  NP+QV+V+
Subjt:  DVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVD

Query:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        A++NSGPRED+TRIG AG VRRQAVD+SPLRRVNQAI+LL TGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDE+ERVAK+NR
Subjt:  AVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR

Q9ZUT9 40S ribosomal protein S5-11.8e-9787.62Show/hide
Query:  MDAAVALDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        M A+  +DA   Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+K
Subjt:  MDAAVALDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37270.1 ribosomal protein 5B1.3e-9887.62Show/hide
Query:  MDAAVALDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        M A+  +DA   Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+K
Subjt:  MDAAVALDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

AT2G37270.2 ribosomal protein 5B1.3e-9887.62Show/hide
Query:  MDAAVALDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK
        M A+  +DA   Q+LT   ++VKLFNRW+FDDV V DISLVDY+GV P+KHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+K
Subjt:  MDAAVALDA--GQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIK

Query:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
        HAMEIIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+LLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD
Subjt:  HAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKD

Query:  EIERVAKANR
        EIERVAKANR
Subjt:  EIERVAKANR

AT3G11940.1 ribosomal protein 5A4.9e-9887.86Show/hide
Query:  AVALDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME
        A A D   E+ Q   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAME
Subjt:  AVALDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME

Query:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
        IIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
Subjt:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER

Query:  VAKANR
        VAKANR
Subjt:  VAKANR

AT3G11940.2 ribosomal protein 5A4.9e-9887.86Show/hide
Query:  AVALDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME
        A A D   E+ Q   ++VKLFNRWT+DDV V DISLVDY+GV  AKHAT+VPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRI+KHAME
Subjt:  AVALDAGQELTQP-HHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAME

Query:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
        IIHLL+DLNPIQVI+DA+VNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAI+L+TTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER
Subjt:  IIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIER

Query:  VAKANR
        VAKANR
Subjt:  VAKANR

ATCG01240.1 ribosomal protein S74.7e-0835.29Show/hide
Query:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT
        RL N L+     +GKK +A +II  A++ I   T+ NP+ V+  A+    P     A R+G  G   +  ++I   +    AI  L   +R+   RN   
Subjt:  RLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDLNPIQVIVDAVVNSGP--REDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKT

Query:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR
        +A  L+ EL++AAKGS +  AI+KK+E  R+A+ANR
Subjt:  IAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATGCTGCGGTTGCGTTGGATGCGGGTCAGGAACTCACCCAGCCCCACCACGATGTGAAGCTCTTCAACCGTTGGACCTTTGATGATGTCCAGGTTAATGACATCTC
TCTGGTGGATTACGTTGGAGTTGCCCCTGCCAAGCATGCAACCTATGTTCCACACACAGCTGGTCGATACTCTGTGAAGCGTTTCAGGAAAGCTCAATGCCCAATTGTGG
AGAGACTTACAAACTCCCTCATGATGCATGGTAGAAACAATGGAAAGAAACTAATGGCTGTGAGGATTATCAAGCATGCGATGGAGATCATCCATCTACTAACTGACCTT
AATCCAATTCAAGTTATCGTCGACGCTGTTGTCAACAGTGGACCCCGTGAAGATGCTACTCGAATTGGTTCAGCTGGTGTTGTTAGGCGTCAAGCTGTGGATATATCCCC
TCTGCGACGTGTAAATCAAGCAATATACCTTCTCACAACTGGTGCTCGGGAGGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACAATCGCTGAATGTTTGGCTGATGAACTCATCAACG
CTGCTAAGGGCTCATCGAACAGTTACGCTATCAAGAAAAAAGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCCAACCGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCCTGGCAGCGTTGTGTGAATCAACCCTGCAATCTTAAAAGCAAGTTTTATTGTCTTTCTCATTTAGCCCTAGCCGCCGCTTCCAGCCTTTCTTCTCTCTGCCTTTCAG
TTTTTCGGATCTCCATCAAACTTGCAGTCGGAAAATGGATGCTGCGGTTGCGTTGGATGCGGGTCAGGAACTCACCCAGCCCCACCACGATGTGAAGCTCTTCAACCGTT
GGACCTTTGATGATGTCCAGGTTAATGACATCTCTCTGGTGGATTACGTTGGAGTTGCCCCTGCCAAGCATGCAACCTATGTTCCACACACAGCTGGTCGATACTCTGTG
AAGCGTTTCAGGAAAGCTCAATGCCCAATTGTGGAGAGACTTACAAACTCCCTCATGATGCATGGTAGAAACAATGGAAAGAAACTAATGGCTGTGAGGATTATCAAGCA
TGCGATGGAGATCATCCATCTACTAACTGACCTTAATCCAATTCAAGTTATCGTCGACGCTGTTGTCAACAGTGGACCCCGTGAAGATGCTACTCGAATTGGTTCAGCTG
GTGTTGTTAGGCGTCAAGCTGTGGATATATCCCCTCTGCGACGTGTAAATCAAGCAATATACCTTCTCACAACTGGTGCTCGGGAGGCTGCCTTCAGAAACATCAAGACA
ATCGCTGAATGTTTGGCTGATGAACTCATCAACGCTGCTAAGGGCTCATCGAACAGTTACGCTATCAAGAAAAAAGATGAGATTGAGAGAGTTGCAAAGGCCAACCGTTA
AGGATAGTTGTGGAATAGAGAGGGCTCAATGGTACAACAGGAGTTTTGTTTTGTTGTTCTTTCTGGAAGTGTTTATGGACATGGTTGCATTTTTCTAGTGGCGAGAATTC
ATTTAGTACTTAATTAAGGTTTAAGAGTTTTGATATGGATGAGATATTAGTTTATATTTAATTGTGGGTAAATTGCAAAAGATATTTCTGCATTTAAGGAGTTTGTATTT
GTATGTGATTTATCTCTATTGTAGTTTCTTTTGAATCATAAATCTTAAGATAGCAAATTTTCATCGACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDAAVALDAGQELTQPHHDVKLFNRWTFDDVQVNDISLVDYVGVAPAKHATYVPHTAGRYSVKRFRKAQCPIVERLTNSLMMHGRNNGKKLMAVRIIKHAMEIIHLLTDL
NPIQVIVDAVVNSGPREDATRIGSAGVVRRQAVDISPLRRVNQAIYLLTTGAREAAFRNIKTIAECLADELINAAKGSSNSYAIKKKDEIERVAKANR