; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Tan0007071 (gene) of Snake gourd v1 genome

Gene IDTan0007071
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
Descriptionmultiprotein bridging factor 1B
Genome locationLG02:1532596..1536176
RNA-Seq ExpressionTan0007071
SyntenyTan0007071
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001387 - Cro/C1-type helix-turn-helix domain
IPR010982 - Lambda repressor-like, DNA-binding domain superfamily
IPR013729 - Multiprotein bridging factor 1, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572392.1 Sec1 family domain-containing protein MIP3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-6496.48Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_022148069.1 multiprotein-bridging factor 1a [Momordica charantia]5.9e-6597.89Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_022930773.1 multiprotein-bridging factor 1a [Cucurbita moschata]1.7e-6497.89Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+HE+VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_022952433.1 multiprotein-bridging factor 1b-like [Cucurbita moschata]3.8e-6496.48Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

XP_023532017.1 multiprotein-bridging factor 1a [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-6497.18Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+HE+VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D2X2 multiprotein-bridging factor 1a2.9e-6597.89Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARR+GAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1EWB8 multiprotein-bridging factor 1a8.4e-6597.89Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+HE+VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1GKJ7 multiprotein-bridging factor 1b-like1.9e-6496.48Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEP+VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETL+KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1HZG6 multiprotein-bridging factor 1b-like7.1e-6496.48Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIET +KSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTH+RVPTELKKAIMQART+KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

A0A6J1JEK2 multiprotein-bridging factor 1a8.4e-6597.89Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASS TSLNTRKLDDETENL+HE+VPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5ZMC0 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog1.0e-2755.64Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P+AA  K ++AV AA+R G ++ET KK  AG NK      + NT KLD ETE L H+RVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        PQ+I +YESG+AIPN Q++ K+ERA+G KLRGK
Subjt:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q6GPQ6 Endothelial differentiation-related factor 1 homolog4.6e-2854.89Show/hide
Query:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK
        DW+ V V+RKK P AA  K ++A+ AA+R G E+ET KK +AG NK    + + NT KLD ETE L H+RVP E+ K I Q R  K +TQ  LA  INEK
Subjt:  DWEPV-VIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLINEK

Query:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        PQ+I +YE GKAIPN Q++ K+ER +G KLRGK
Subjt:  PQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q9LV58 Multiprotein-bridging factor 1c1.2e-2848.2Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    +RV  E++  I +AR +KK++Q+ LA
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        + INE+ Q++QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

Q9LXT3 Multiprotein-bridging factor 1b5.1e-5983.8Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAG+NKAASS TSLNT+KLDD+TENL+H+RVPTELKKAIMQAR +KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LA LINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

Q9SJI8 Multiprotein-bridging factor 1a4.6e-6085.92Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAGTNKAASS TSLNT+ LDD+TENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQ+INEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42680.1 multiprotein bridging factor 1A3.2e-6185.92Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRKK  NAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAGTNKAASS TSLNT+ LDD+TENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LAQ+INEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK

AT3G24500.1 multiprotein bridging factor 1C8.6e-3048.2Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    +RV  E++  I +AR +KK++Q+ LA
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLA

Query:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK
        + INE+ Q++QEYE+GKA+PNQ ++ K+E+ LG KLRGK
Subjt:  QLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGK

AT3G24500.2 multiprotein bridging factor 1C2.6e-1041.57Show/hide
Query:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQAR
        G ++QDWEPVV+ K    +   +D KAVNAA R G  ++T+KK +AG+NK   S+    +NT+KL++ETE    +RV  E++  + + R
Subjt:  GPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSST--SLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQAR

AT3G58680.1 multiprotein bridging factor 1B3.6e-6083.8Show/hide
Query:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ
        M+GIGPI+QDWEPVVIRK+APNAAAK+DEK VNAARR+GA+IET++K NAG+NKAASS TSLNT+KLDD+TENL+H+RVPTELKKAIMQAR +KKLTQSQ
Subjt:  MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQ

Query:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK
        LA LINEKPQ+IQEYESGKAIPNQQI++KLERALG KLRGKK
Subjt:  LAQLINEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTGGAATTGGACCGATTTCACAGGATTGGGAACCTGTTGTCATCAGGAAGAAGGCTCCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAAGCCGTAAACGCCGCC
CGCCGCGCCGGCGCTGAGATTGAAACCTTAAAGAAATCTAATGCTGGAACAAATAAAGCCGCCTCCAGCAGTACCAGTTTGAATACCAGGAAGTTAGATGATGAG
ACAGAAAATCTCACTCATGAAAGGGTACCGACTGAGCTGAAGAAGGCCATTATGCAGGCCCGAACCGATAAGAAGCTTACCCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATC
AACGAGAAGCCACAAATCATTCAGGAGTATGAGTCTGGAAAAGCCATTCCAAATCAACAAATAATCACCAAGCTTGAGAGAGCTCTTGGAACTAAGCTTCGTGGA
AAAAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CACGTATCTTCGAACCCTAAGCCACCGCGGCAAATCGTTTCAGATAGCAGAGAGAGTTGCAGGAGCAGGAAGACGAGAGGAAAATGTCTGGAATTGGACCGATTT
CACAGGATTGGGAACCTGTTGTCATCAGGAAGAAGGCTCCCAACGCCGCCGCCAAGAAGGACGAGAAAGCCGTAAACGCCGCCCGCCGCGCCGGCGCTGAGATTG
AAACCTTAAAGAAATCTAATGCTGGAACAAATAAAGCCGCCTCCAGCAGTACCAGTTTGAATACCAGGAAGTTAGATGATGAGACAGAAAATCTCACTCATGAAA
GGGTACCGACTGAGCTGAAGAAGGCCATTATGCAGGCCCGAACCGATAAGAAGCTTACCCAGTCTCAGCTTGCTCAATTGATCAACGAGAAGCCACAAATCATTC
AGGAGTATGAGTCTGGAAAAGCCATTCCAAATCAACAAATAATCACCAAGCTTGAGAGAGCTCTTGGAACTAAGCTTCGTGGAAAAAAGTAGGAGGCCTCGCAAT
GTAAGTGGTGAATTTGGCTATAAGAGCTTCTGGCCTGAGATAATGACTTATATTGTGTAGTTGCTCTTTGATGGTGATCTGAGTATGTAGTGTGAATTAATTTAG
CATGTTTGTCTCTTGTATCTACTTTGACTTCTAATGAACGCTCTAATATTTTCGAGTCGTTTTTTTTTGGGATTATACATTGCATGGTTTTCTCACCTCGTGAAT
CGAAATAGAATCTTCGAGATGAAGGTTTTTGTTTGCTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGIGPISQDWEPVVIRKKAPNAAAKKDEKAVNAARRAGAEIETLKKSNAGTNKAASSSTSLNTRKLDDETENLTHERVPTELKKAIMQARTDKKLTQSQLAQLI
NEKPQIIQEYESGKAIPNQQIITKLERALGTKLRGKK